Bacterioplanoides sp. SCSIO 12839: KFF03_04520
Help
Entry
KFF03_04520 CDS
T08310
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
bacz
Bacterioplanoides sp. SCSIO 12839
Pathway
bacz01501
beta-Lactam resistance
bacz01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bacz00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
KFF03_04520
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
KFF03_04520
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bacz02000
]
KFF03_04520
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
bacz01504
]
KFF03_04520
Transporters [BR:
bacz02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
KFF03_04520
Antimicrobial resistance genes [BR:
bacz01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
KFF03_04520
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
DUF4763
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UTW49174
UniProt:
A0A9J7ANU8
LinkDB
All DBs
Position
975427..978495
Genome browser
AA seq
1022 aa
AA seq
DB search
MQLPALAIRNHQFTLVMFLLLVLLGGVSFFTMPRSEDPQFDFSAAIIKVVNPGTTPLDME
KLVVDPIESAINELDDLKDIKTSVEDGLAVIRVEFLYGTDPEDKYDDVVSAVAQVRDQLP
DGIVDLSINKISPSDVNTLQLALVSEIVSYKELKRHAEALEQRLERVSGVKRVDVDALPK
LEVQIQVNQQTVNGMGISLDEIQRAVATAAQNLPGGHANAGPRRFTVRTSGDYESLDAIG
ETVVRARSLNAGNDSTVGRFIYLRDIAEISLTESLPSYRAKLNGRRAVFISVVQREGTQI
FDVMAGIQAALDQYVEKRLSDNIEVHTVMDQSQSVKKQISGFFDNLNQGLILVAVLSVVV
LGFKPALVVVTAIPLSIFIAIGWVDLTGFGLQQMSIVGLVIALGLLVDNAIVVVENVARH
LRDGDSPKEAAIAGSSQVAWAVASGTLTTVLSFFPMLLMQNGSGTFMRAMPVTVVLTLFA
SLLIALTLTPLIASRLGSAASKTTKAQAKLETIAAGPYNHWLNRALRHPAKVLVISFALL
FGSLSLFPFIGVSLFPKAEKPMILVNIDMPEGTGFEQTQIMADRVEAIVSEHELVVDIAQ
NVGRGNPRMYYNIFPARQTVNYAQLFVTLKQGDLPTVEPMVAALRNELGNIAGAQIIVKE
LLQGPPVEAPVAIRIIGEDLDKIQAVSRDIADIMDRTPGIVGVDNPVGKFKVDLKVDINR
DKAAMLGIPLNSIDRTIRTALVGLPMGVYRDDDGEEYDLVLRLSEYPRPELATFDDIQIA
TATGQLVPLRQVAEVKPETSIARFQHYDTERMARITADVLPGFTTEVVTNKVIEQLDQYA
WPDGVRYAVGGEQANRKEAFGGMAKALILAVFGIFAVLVLQFRSFIQPLIVFAAIPFALI
GAFLALFLTGYTFSFTAFIGLTSLVGIVVNNSIILVDYANQMRREGMEQLEAIAASARTR
FVPIVLTTLTTIGGLLPLTLSGSSMWSPMGWAIIGGLLVSTLLTLIVVPVLYRYLGKMPD
QD
NT seq
3069 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagttaccggcgttagctattcgtaatcaccagtttactctggtgatgtttttattg
ttggtgttgttggggggggtgtcgtttttcaccatgcctcgttctgaagatccacaattc
gatttttcggcagccattattaaagtcgtgaacccgggcaccacacctctggatatggaa
aagctggtggtcgatccgattgaatctgccattaatgagttggatgacctgaaagatatt
aaaaccagtgttgaagatggcctggcggttattcgggtggagtttttatacggtactgat
cccgaagataaatacgatgacgtcgtgtcggccgttgctcaggtgcgggatcaattgcca
gacggtattgtcgatttaagcattaataaaatttcaccctcagatgtgaatacattgcag
ctggcattggtgtctgagattgtcagctataaagaattaaaacgtcacgctgaagcactg
gagcagcgacttgagcgagtttctggtgttaagcgggtggatgttgatgcgctgcctaaa
ttagaagttcagattcaggtcaatcagcaaaccgttaatggtatgggcatcagcctggat
gaaattcagcgtgcggttgcaacggctgcgcaaaatttaccgggcggtcatgccaacgcc
gggccacgacgcttcacggttcgtaccagtggcgattatgaatcactggatgccattggt
gagacggtcgttcgtgcccgtagcctcaatgctggcaacgacagtactgttggacgtttt
atttatttgcgcgatattgcagagatttcgttaaccgaaagtttgcccagttaccgcgcc
aaattaaatggccgccgggcggtgtttatctcggtggtgcagcgtgaaggcacacaaatt
tttgatgtgatggcaggtattcaggcggcattggatcagtatgttgaaaaacgcctgtct
gacaatattgaagttcatacggtcatggatcagagccagagcgttaaaaaacaaatcagt
ggcttttttgataatttaaatcaggggctgattctggtcgctgtgctgtctgtggttgtg
ctcggttttaaaccggcactggtcgtggtgacggcgattcctctgtcgatttttattgcc
attggttgggtggatttaaccggctttggcctgcaacaaatgtcgattgtagggctggtg
attgcactagggttattggtcgataacgccatcgtggtggtggaaaatgtagcacgccat
ttacgcgatggtgactctccgaaagaagcagcaattgcaggcagttctcaggtggcctgg
gccgttgccagtggtacgttaaccacggttttatcgtttttcccgatgttattaatgcaa
aacggctctggtacgtttatgcgggcgatgccggttactgtggtattaacattgtttgct
tcattgttaattgctttaacgctgacgccactcattgccagtcgtttaggttcggcagcg
agcaaaaccactaaagcacaagccaagctggaaaccatagctgctggcccttataaccat
tggctgaatcgtgctctcagacatccggccaaagtgttggttatttcttttgctttatta
tttggcagtttatcgctattcccgtttattggcgtgagcctgtttccgaaagctgaaaaa
ccaatgattctggtgaatattgatatgccggaaggcacgggttttgaacaaactcaaatc
atggctgaccgggttgaagccattgtttctgagcatgaattggtcgtggatattgctcag
aacgttggccgtggtaatccacgtatgtattacaacattttcccggcacgacaaacggtg
aattatgctcagctgtttgtcaccttaaagcagggagatttgccaacggttgagcctatg
gtagcagccttgcgcaacgagttgggtaatattgccggtgcacaaattatcgtaaaagaa
ctgctgcaaggccctccggttgaagccccggtggctattcgtattattggggaagacctg
gataaaattcaggcggtttcaagagatattgccgatattatggatcgaacgccgggcatt
gtgggtgtggataatccagttggcaaattcaaagtcgatttaaaggtggatattaatcgc
gataaagccgccatgctgggtattccgctgaacagtatcgaccgaacaattcgtaccgca
ctggtggggttaccaatgggtgtataccgtgatgatgacggtgaagaatacgacctggta
ttacgcctatccgaatacccacgccctgaattagcgacctttgatgatattcagatcgcc
acggccacaggccagctggtgccattgcgacaagttgctgaagtgaagcctgaaaccagt
attgctcgcttccaacattacgatactgaacgtatggctcgtatcacggcggatgtgttg
cccggtttcacaactgaggtggtcactaataaggtgattgagcaattggatcaatacgcc
tggccggatggcgtacggtatgccgtgggcggtgaacaggcaaaccgtaaagaagcattt
ggtggtatggcaaaagcgctgattctggccgtgtttggtatcttcgcggtattggtgttg
cagttccgctcatttattcagccactgattgtttttgctgccattccgtttgcgttaatt
ggtgcatttttagcgctgttcctaaccggctataccttcagttttaccgcctttattggt
ttaacgtcgctggtgggaattgtagtaaataactcgattattctggtcgattatgcaaac
cagatgcgccgcgaaggcatggagcaattagaagcgattgccgcctctgcccgtacgcgg
tttgtaccgattgtattaacgacattaacgacaattggtggtttattaccgctgacatta
tccggttccagtatgtggtcaccgatgggctgggccattattggtggcttactggtatca
actttactgactctgattgtggtgccggtgctgtaccgttatctggggaaaatgcctgac
caggactaa
DBGET
integrated database retrieval system
