Bartonella sp. Raccoon60: Bra60_001220
Help
Entry
Bra60_001220 CDS
T05326
Name
(GenBank) hydrophobic/amphiphilic exporter-1, HAE1 family
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
barr
Bartonella sp. Raccoon60
Pathway
barr01501
beta-Lactam resistance
barr01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
barr00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
Bra60_001220
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Bra60_001220
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
barr02000
]
Bra60_001220
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
barr01504
]
Bra60_001220
Transporters [BR:
barr02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
Bra60_001220
Antimicrobial resistance genes [BR:
barr01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
Bra60_001220
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX26144
LinkDB
All DBs
Position
133841..136975
Genome browser
AA seq
1044 aa
AA seq
DB search
MSQELQTKQFVTEPEQGSMIALFIRRPVFTFVVNAMIIITGLSAWMNVDVRELPDVDIPV
TTIMTIFSGASAETIDREITKVIEDAVARVSGVKTISSTSSFGRSRVQINFNVGVDLNVA
ASDIRDAISRITYSLPKDADSPLIIKADSNAASMMYLVVTSPTMNIDDLTTIVNDQIIDT
LSAVDGVGDVQVDSARTKIFQIDVDQVKLASYGLTVGDISRVLADMTTDAPVGSLRNSRQ
TLIVRATARLTTPEAFEQVILKPHVKLGDVARVTLSPDVETVILRVNGKTGIGIGIVRKA
QSNTLNISKGVRTVLEQLKGVLPPSVHMSILSDDAIFIQSALYEVEVALAIAILSVILVI
FLFLRDIRATLIPILSIPVALIGTIAAIYLAGFSLNILTFLGLVLATGLVVDDAIVVLEN
IVRRRNMGLGSRSAAVVGTQEVFFAVLATTLTLVAVFVPISFLPGQVGGLFREFGFVLAI
SILLSSVVALTLCPMLASRFLKRYVEDSKEKAHYFALLDKLGTFFSRNYAYSLHKCLERP
WTAVLVSFVFASLCLGGYMKLQQELTPTEDRAVVFLVINGPQGISVQYLNEQVKQIEESL
EPLRDAGEIVNSYSVAGVGGSPNSAFLVLLLSSWDQRSRSQQEIVEDINVKVKAFPAVFV
FAAQGNSLGVRGTGQGLQFAILGDNYTKLQSIAGELIKLLQSDTRFIRPRLTVDATQPQF
FIEIDREKASDLGIDITNLSNTLQAMLDGRKIGSIYVDDHSYDVKLTSRKNPITDPSDLE
NVFFKTTDNKYVPLSVIANLHEKAIAPQLKREKRMSAVVLSTNLAPGVSLGNAYQAIENI
ASPLLVEGNYIIPLGEAATLSETSSSFMSVFGIAFVIILLVLAAQFESFISGFIIIATVP
LGLGCAVIAMLFSGVSLNIYSQIGLILLVGVMAKNGILIVEFADQLREQGKSVREAVEDA
ANIRLRPVCMTMICAILGGIPLVLAKGAGAEARIALGWVIVGGLGLATIFTLFMTPVVYL
LLGRFVQPKAEQALRLKDDLSHID
NT seq
3135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcaagagcttcaaacaaaacaatttgtaacagagccagaacaaggtagtatgatc
gcattatttattcggaggccagttttcacttttgttgtgaatgctatgatcataattaca
ggactttctgcatggatgaatgttgatgtacgcgaattgcccgatgttgatattccagta
acgacgattatgacaattttttctggtgcatcagcagaaacaattgatcgtgagattacg
aaagttatagaagatgctgttgctcgtgtttcaggagttaaaacaatttcttcaacttct
tcttttggtcgttctcgtgtacaaattaattttaatgttggtgttgatttaaatgttgca
gcatctgatattcgtgatgctatttctcgcattacttattctctaccaaaagatgcagat
tcacctttaattattaaagcagattcaaatgctgcttcgatgatgtatttagttgtgact
tcaccaacaatgaatattgatgatttaacaacgattgtaaatgatcaaattattgatacg
ctttccgctgttgatggtgttggtgatgtgcaagttgatagtgctcgcacgaaaattttt
cagattgatgtcgatcaagtgaagcttgctagctatggattgactgtgggtgatatttcg
cgtgttcttgctgatatgacaactgatgctcctgtaggatcattgcgcaattctagacaa
accttaattgtacgtgcgactgctcgcttgacaacacctgaagcttttgaacaagttatc
ttaaagcctcatgtgaaacttggagatgttgcacgtgttactttatcccctgatgtggaa
acagttattcttcgcgttaatgggaaaacagggattgggatagggattgtgcgtaaagcg
caatccaatactctcaatatttctaaaggtgttcgcacggttcttgaacaacttaaaggt
gttttgcctccctctgtgcatatgagtattcttagtgatgatgctatttttattcaaagt
gctctttatgaagtcgaggttgctttagccatcgctatattaagtgttattttagttatt
tttctttttcttagagatattcgtgcaacacttattcctattttgtctattccagttgct
cttatagggacaattgcagcgatttatcttgcagggttttcattgaatatcttgacattt
ttaggacttgttttggcaacgggacttgttgtggatgatgcaattgttgttcttgagaat
attgttcgaaggcgtaatatgggattaggatctcgatcagcagcagtagtaggaacacaa
gaagtattttttgctgttttagcaacgacattaactttagttgctgtttttgtacctatt
tcttttcttcctggacaggttggaggactttttagagaattcggttttgttttagctatt
tccattttgctttcttcagttgttgctttgacgctttgtcctatgcttgcttcacgcttt
cttaaacgatatgttgaagacagtaaagaaaaagcgcattattttgctcttttggataaa
ttaggtactttttttagcaggaactacgcttatagtttacataaatgtttagaacgtcct
tggactgctgtactggtttcgtttgtttttgcaagcctttgtcttggaggctacatgaaa
ttacaacaggaattaacaccaacagaagatagagccgttgtttttttagttattaatggg
ccacaagggatttcagtgcaatatttgaatgagcaggtgaagcagattgaagagagctta
gagcctttgcgtgatgctggtgagattgttaatagttactctgttgctggagttggtggt
tcacctaatagtgcttttcttgttttgttgctttcatcttgggatcaacgttctcggagc
cagcaagagattgtagaagatattaatgtgaaggttaaagcatttccggcagtattcgta
tttgcagctcaaggaaattcattaggagtccgaggaactggtcaaggattacaattcgca
attctcggagataattatacaaaattacaatctattgctggcgagctgattaagcttttg
caatctgatacgcgctttattcgtccgcggcttacggtagatgcaacacaaccacaattt
tttattgaaattgatcgagaaaaagcttctgatttaggtattgatattactaatttgagt
aatacgctacaagcaatgttagatggaagaaagatcggttctatttatgtagatgatcat
tcttacgatgttaaactgacatcgcgtaagaaccccattactgatccgtctgatctggag
aatgttttttttaaaactacagacaataaatatgttcctttatccgttattgcaaatttg
cacgaaaaagctattgcaccacagttaaaacgagaaaaacgtatgagtgcagttgtgttg
agtacaaatcttgctccgggtgtttctttgggaaatgcgtatcaagctatagaaaatatt
gcttctcctttattagtggaaggaaattatattattcctttgggtgaagctgcaacactt
agtgagacatcttctagtttcatgagtgtttttggtatcgcctttgtgattattctgttg
gttttagctgcgcagtttgagagttttatttcaggttttattataatagctactgtacca
ttaggacttggttgtgctgtaattgctatgctttttagcggtgttagtctgaatatttat
agtcaaattggtttgattttattggtgggagttatggcaaaaaatggtattttaattgtt
gaatttgcagatcagttacgtgagcaaggtaaaagtgtgcgtgaagctgtagaagatgcg
gcaaatattcgtcttcgcccagtatgtatgacaatgatttgcgctatcttaggaggaatt
cctttagttttagcaaaaggtgctggcgcagaagcacgtatagctttaggatgggttatt
gttggtggtttaggtctagcaacgatttttactctttttatgacgccagttgtttatctc
ttacttggacgttttgtacaaccaaaagcagaacaagctctgcgtttaaaagacgatctt
agccacattgactga
DBGET
integrated database retrieval system