Bombus bifarius (two-form bumblebee): 117214233
Help
Entry
117214233 CDS
T07537
Name
(RefSeq) nuclear pore membrane glycoprotein 210 isoform X1
KO
K14314
nuclear pore complex protein Nup210
Organism
bbif
Bombus bifarius (two-form bumblebee)
Pathway
bbif03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bbif00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
117214233
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
bbif03019
]
117214233
Messenger RNA biogenesis [BR:
bbif03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
117214233
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_NUP210_2nd
Ig_NUP210_1st
Ig_NUP210_15th
Ig_NUP210_7th
Ig_NUP210_9th
Ig_NUP210_4th
Ig_NUP210_3rd
NUP210_Ig
Ig_NUP210_6th
Big_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117214233
NCBI-ProteinID:
XP_033316074
UniProt:
A0A6P8N6E9
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1904 aa
AA seq
DB search
MFFSVLFVLFCVTSNALVHRLNVPRVLLPVFNDFAVNFTLEVTDGACYKWSTSRLDIIQL
IPINENVERTCSSAILIQTITRESNRNTAIVLAEDVNNGQFLRCDVIVDVIFSLNLVTTT
RELYIEEAPEAFEVRAYDEQGNEFTTLAGVEFLWSIDNADKHMSDSKAPNDILRFMTYQE
SHYETPPTIAALDVIGKKGHIVLLEGIKTGTAKVSVKLTYPEYKHVPPIEVELIVIANLI
IIPSDTTVMAYDSFKYKIMQARQGRLEEITLPSSQYYLEAENPNILEIDNDRDFAYAKSL
GRTKIFLHDKNVRDEYPVILPSATVNVNDVAYVMLAVLPNRNWGLVLGHTHEIVVELYDN
KDHKFHIGEGVEVSVKLDEHYFEPKMITQNGTYIVGVPITCGTMTVEATLNGIIDKHGRK
VFIASRPTTRAELLIHTPVTIQPKVLAVPWDSKAKSRYDTVLNASGGDGSYVWSSKHPSI
ATISQNGGMRILTAGVTEINVAMTRNQYNKDTTKVYVLPPSKVKVIEYNMEAAVGEQIYL
HIALYGRLINGTDSKEIPFNDCRDINFETYIPDGNFIQNNSNVIEPVGIACAVIAVTSVD
IGTSEVTVVYNGNGQYLTDNVTVSAYEPLIALHPSSKETLLTVGSLRKIVFKGGPHPWSN
KPQSYSRKIQVSEEKIVDVTEHVDSSDGLHDIFVIEVMCRALGEVDVTYKISNVPLLPNC
KSTYAFETVKVICGKPRHIYLQPEFKDKNCPISNLNIERIMAHSDKNLKLITIIKDEEGR
TFDNITSLRIEWNLKPSTVGSVEMPSSSIEETITDMNVILPKSYYQNVIFKKHFGTLILT
ATVTGYQKYILSKLKIIPEWPPFAIETERKIYETPLIETSIEVVLVNDTSVIPDKLMVLN
DPTAKYYLQVSQGSGYYEFVLSSDDIAEVRYIESTKAISLTPKKSGVLHLSLIDLCLPSK
PAEVVIEIQQLAIIEIETVNKIEKGKCIVAALKLYDTNGHAIKLPSLNALEFRAEIDNEY
IEVKQLPASEHGNPPYNQLLYMVYGMAEGESQLIFVNKGAEKEIQSESATIQVFVPLRVF
PKNLTILVGTVYQVQTTGGPSNAEIEFSTQDNDILNVGYNGIFEGKSVGQTKIIVRAIGL
NAKGNKVIYSEDHADIHVLYLEGVKIVVPTSRVKVGAMFPLWAFGIPEHLTPLIIGSMQL
PLTFMWSSSDSNLITLHNMYEGTGINIRYQNEVSLRAKAISPGLATIYLNVTMPSNMLAG
FKGDVTYTTFIKVEIFEELRLMHLGLPLDAPVILMSPNSVLKLETNRDKHGSTIYKVLST
VHGNDSVDLQALTVASKTVTIDKNGIIKAGESIGKIVISITNTEAYNLKQSITVIVEVKP
IHYMMLSLKSILRIRSGEELNMLPKGMELDYILEYYDNIGTKFHAAEVDAKTILNRVDLA
SFTKGSENVVTAKFIENGDLVVKAYNERYPNAMFDYVHMMIGDIVFPTKTTLTVGDIVCF
SMPLLSSDGDPGYWQSSAPEILTVDPITGIGRAKNIGYAVVKHSLATHMQGEIEVHIQPI
AKVSIVPLRGRNITGTETFSVPVVLKSKDEQVKENNILSRGLGGCRTFSLFTLNSFPYTC
NIQFVSSTSSIGIKDLFLVKPRFDIATGFYYCDVIPMGSPNIISSTLESRIQISAQSKDI
EAVPLEVTYLPPVYVDAKEIIFINTHSQTIPTATLEIYGLQSVLNHLTIDVPDGMTVSAR
QYISKSTMQYKLRLMHNQEEIQGQKVVIVNDITKQNISLFVRVTKYENFIPLSGIHWVDY
MYFHRYTFGTFAVVVITFFYIWKNKIANVDLNIKNRSVFADKCPPQLKKVSTPCSSPLNS
TTMSTPRSPVTPTRFTFSAFDPVYGDPRGPYSASKRNRSLNMTQ
NT seq
5715 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttttctcggtactctttgttttattttgtgtaacatcgaatgccttagtacacaga
ttaaatgttcccagagttttattaccagtatttaatgattttgctgtaaattttacactt
gaagttactgatggtgcttgctataaatggtcaacatcgcgattagatattattcaacta
attcctataaatgaaaatgtcgagagaacttgttcttctgctatattgattcaaacaata
acgagagagtccaatagaaatactgcaatagtattagcagaagatgttaataatgggcaa
tttttaagatgtgatgttatagtagatgtgatattttctctaaatcttgtgacaactacc
agagaattatatatagaggaagcaccagaagcatttgaagttagagcatacgatgaacaa
ggaaatgaatttactactcttgctggtgtcgaatttctttggagtatagacaatgctgat
aaacatatgtcagattctaaagcaccaaatgatattttaagatttatgacttatcaagaa
tcacattatgaaactccaccaacaattgccgcattagatgtaattggtaaaaaaggacat
atcgtactgctagaaggaataaaaactggcacagcaaaggtttctgtgaaattaacttat
ccagaatataaacatgttccaccaatagaagttgaattaattgtaatagccaatctaatt
attattccatcagacacaacagttatggcatatgatagttttaaatataaaataatgcaa
gctcgtcaaggtcgtttggaagaaataactttaccatctagccaatactacttagaagca
gaaaatcctaatatattagaaattgataacgatcgtgattttgcatatgctaaatctcta
ggacgtaccaaaatattcttacatgataaaaatgtacgtgacgaatatcccgttatttta
ccatctgctacagttaatgtaaatgatgtagcgtatgtaatgcttgctgttttacccaat
agaaattggggtttagtacttggtcatactcacgaaattgttgttgaattatatgataat
aaagatcataaatttcacattggagaaggtgttgaagtatcagtgaaattagatgaacac
tactttgaaccaaagatgataacacaaaatggcacttatattgttggtgtgcctatcaca
tgtggaacaatgactgttgaagctaccctcaatggtataattgataaacatggtagaaaa
gtgtttattgcttcacgtcctactacaagagctgagcttttgattcatactcctgttact
atacaacctaaggtattggcagttccatgggattctaaggctaaatcaaggtatgacact
gtactaaacgcaagtggaggagatggatcatacgtatggtcaagcaaacatccttctata
gcaacaatttctcaaaatggaggaatgagaattttaacagcaggtgtaacagaaataaat
gttgctatgacaagaaatcagtataataaagacacaacaaaagtgtatgtattacctcct
tccaaagtaaaagtaattgaatataacatggaagctgctgtaggagaacagatttatctt
cacattgcattatatggaagattaattaatggaacagactccaaagaaattcctttcaat
gattgtagagatattaattttgagacatacattccagacggtaattttatacaaaacaat
agtaatgtcatagaacctgtaggaattgcatgtgccgttatagcagttactagcgtggat
attggaacatccgaagtaactgtagtatacaacggtaacggtcaatatttgactgacaac
gttactgtgtcggcctatgaacctttaatagcattacatccaagtagcaaggaaacttta
ttaacagtgggttcattgaggaaaatagtttttaaaggtggaccccatccatggtctaac
aagccacaaagttattcgcgaaaaattcaagtatctgaggaaaaaattgttgatgtaaca
gaacatgtagattcttcagatggattgcacgatatattcgttattgaagtaatgtgtcgt
gcccttggagaggtggatgtaacatataaaatttcaaatgttcctctactgccaaactgt
aaaagtacatatgcatttgaaacagtaaaagtgatttgtggtaaacctagacatatttat
cttcaacctgaatttaaggataagaattgtcctatcagcaatcttaatatagaaaggata
atggcacacagtgataaaaatttgaagcttattacaataataaaggatgaagaaggtaga
acattcgataatattacgagtttacgaattgaatggaatttgaaaccctcgactgtaggt
tctgtagaaatgccttctagttctatagaggaaacaatcacggatatgaatgttatttta
ccaaaaagttactatcaaaatgtcatttttaaaaaacattttggcactcttatattaaca
gctacagttacgggttatcaaaaatatatattgagtaaattaaaaataattcccgaatgg
ccgccattcgcaattgagactgaaagaaaaatctatgaaacgcctcttatagaaacttct
atagaagtagttttagtcaatgatacctctgttatccctgataaattaatggtattaaat
gatcctactgcaaaatattacttgcaagtgagtcagggttctggatattacgaatttgta
ttaagttcagatgatattgcagaagttcgatatatagagtcaacaaaagcaattagtctc
actccaaaaaaatctggagtgcttcatttatcattgatagatctttgtttaccttcaaaa
ccagctgaagttgtgattgaaatacaacaacttgccataatagagatagaaacagtgaat
aaaatcgaaaagggaaagtgcatagtagctgcattgaaactttatgacacgaatggccat
gctataaaattgccttctttgaatgctttagaatttagagcagaaattgataacgaatac
atagaagttaaacagttacctgctagtgaacatggcaatcctccttataatcaattgttg
tatatggtatatggaatggcagaaggcgaatctcaattaattttcgtcaataaaggggcc
gaaaaggagatacagagtgaatcagcaactatccaagtctttgttcctttaagagttttt
ccaaagaatctaacaatactagtagggactgtttatcaagtacaaacaacaggaggtcca
tcaaatgcagaaattgaattctctacacaggataatgatattctgaacgttggctataat
ggtatatttgaaggaaaatcagttggacaaacaaaaattattgttagagccattggtctt
aatgctaaaggcaataaagttatttattctgaggatcatgctgatatacatgtattgtat
cttgaaggagttaaaatcgttgtgccaacaagtagagtaaaagtgggtgcaatgtttcca
ctttgggcatttggtatcccagaacatttaactcctcttattataggttctatgcaatta
ccactaacttttatgtggtcatctagtgattctaatttaataacattgcataatatgtat
gaaggtactggaattaacattagataccaaaatgaggtatctttgagagccaaagcaatt
agtcctggattagcaactatttatttaaatgttacaatgccatctaatatgttagccggt
tttaaaggcgatgtaacatatactacatttataaaagttgaaatttttgaggaattgcgt
ttaatgcatttgggactacctttggatgcaccagtgatactaatgtccccaaattctgtc
ttaaaattagaaacaaatcgtgacaaacatggttcaactatttataaagtattgtctact
gtacatggaaatgattcagtggatttacaggctttaacagttgcatctaaaaccgtcact
attgataaaaatggcatcataaaagctggtgaaagtattggaaaaatagttatttctatt
acaaatactgaagcctataatttgaaacaatcaataactgttattgttgaagtcaagcct
attcattatatgatgttgtctttaaaatcaattttacgaattcggagtggagaagaatta
aatatgttacccaagggtatggaattggattatattcttgaatattatgataatattgga
acaaagtttcatgctgctgaagttgatgctaaaactatattaaatcgggttgatctcgca
tcatttactaaaggttccgaaaatgtagttactgcaaaatttattgaaaatggagacctt
gttgtaaaagcatacaatgaaagatatcctaatgcaatgtttgattatgtacatatgatg
attggtgatatagttttccccacaaagactacactaacagtgggcgatatagtatgcttt
tcaatgccacttttatcttctgacggtgatccaggttattggcaatcttctgctcctgaa
atattaactgtagatcctattacaggaataggtcgagcaaaaaatatcggttatgcagta
gtaaaacatagtcttgcaactcacatgcaaggtgaaatagaagttcacatccaacctatt
gcaaaggtatcaattgtcccattaagaggtcgaaatattactggaactgaaacttttagt
gttcctgttgtacttaaaagcaaagatgaacaagtcaaagaaaacaatatcctatctaga
ggcttaggtggttgtagaacatttagtttatttactttaaattcatttccctatacctgt
aatatacaatttgtttcatcaacttcatctatcggaataaaagacctgtttcttgtcaaa
ccacgatttgatattgcaactggattttattattgtgatgtaatcccaatgggttctcca
aacataatttctagtacattagaaagtcgtattcaaataagtgcacaaagtaaagacatt
gaggctgtgcctttagaagttacatatcttcctcctgtctatgttgatgccaaagaaatt
atttttattaatacccattctcaaaccattccaacagcaacacttgaaatatatgggttg
caatctgtattaaatcatcttactattgatgtaccagatggaatgactgtaagtgctcga
caatatatttcaaaatctacaatgcaatacaaactgcgtttgatgcataatcaggaagaa
atccaaggtcaaaaagttgttattgtaaatgacattacaaagcaaaatatatcccttttt
gtacgtgtaacaaaatatgaaaatttcataccattatctggaatccactgggtagattat
atgtacttccatcgttatacattcggaacatttgctgttgttgtaattactttcttctac
atatggaagaataaaatagcaaatgttgatttaaacataaagaatagatcagtttttgct
gataaatgtccaccacaattaaaaaaggttagtactccatgctcatctccgttaaatagt
acaactatgtcaactccaaggagtccagttacaccaacaagatttacattttctgcgttt
gatcctgtatatggtgatcctcgtggtccttattcggcaagtaaacgaaataggtccttg
aatatgacacaataa
DBGET
integrated database retrieval system