Bartonella bacilliformis: BARBAKC583_0306
Help
Entry
BARBAKC583_0306 CDS
T00456
Name
(GenBank) RND transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
bbk
Bartonella bacilliformis
Pathway
bbk01501
beta-Lactam resistance
bbk01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bbk00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
BARBAKC583_0306
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
BARBAKC583_0306
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bbk02000
]
BARBAKC583_0306
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
bbk01504
]
BARBAKC583_0306
Transporters [BR:
bbk02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
BARBAKC583_0306
Antimicrobial resistance genes [BR:
bbk01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
BARBAKC583_0306
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABM45283
UniProt:
A1URM4
LinkDB
All DBs
Position
293733..296867
Genome browser
AA seq
1044 aa
AA seq
DB search
MSQQLETKQLLAKLQQNDIMAFFIRRPVFTFVLNAMIMIAGFSAWMGVDVRELPDIDIPV
TTVMTNFAGASAETIDREITKIVEDAVSRVSGVKTISSTSSFGRSRVEIQFNVGVDLNVA
ASDIRDALSRVAYSLPKDADSPLIIKADSNAAAMMYLVVTSPTMNIDDLTTIVNDQIVDV
LSAVEGVADVEVDSARKKIFQIDIDQVKLANYGLSVADISSALSDMMVDVPVGSLRNAKQ
ALIVRATAHLATPEDFERVLLKPHVLIGDVARVTLSPDIETVILRVNGEEGIGLGIVRKA
QSNTLNISKDVRITLDRLKMIIPPSVQISIISDDSIFIKSALHEVEIALVIAVLSVIFVI
FIFLRDIRITLIPALSIPVALIGTIAAIYLAGFSLNILTFLGLVLATGLVVDDAIVVLEN
IVRWRNKGHGSRSAAVLGTREVFFAVVATTLTLVAVFVPISFLPGQVGGLFREFGFVLAI
SVLLSSVVALTLCPMLAARFLKEHVEENKEDVRRFIILDKLGAFFSRNYAYYLHKCLGRP
WTVILISFVFFGLCIGGYMKLQQELTPAEDRGMIFLVIRGPQGISTQYLNEQVKQIEESL
QPLRDAGEIVNSYSIAGAGGASNNAFLILLLSSWDKRSRSQQEIVNDINSKIRQFPAVFV
FAAQGNSLGVRGTGQGLRFAILGNNYEKLQSIADQLVNALQADQRFIRPQLASDATQPQF
FIEINREKATDLGVDITNLGNTLQTMLDGRKIGSIYVDDHSYDVKLTSREKFIDNPADLE
NILLKAKNNKYVPLSMIAHLHEKAIAPQLKREQRMNAVILSTNFAPNITLGDAYQIVQEI
SSPLLSEGSYVVPLGEVATLSETSSNLMVVFGIAFLIILLILAAQFESFVSGFIIMATVP
LGLGCAVIAMLLSGVSLNIYSQIGLILLIGVMAKNGILIVEFADQLRDQGRSVREAVEEA
ANVRLRPVCMTMICAILGGIPLILAKGAGAEARIALGWVIVGGLGLATIFTLYVTPVVYL
LLGRFIRPKIEEAKQLERELNQAT
NT seq
3135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcaacaacttgagacaaaacagcttttagcaaagttgcagcaaaacgatatcatg
gcgttttttattcgtaggccggtttttacttttgttttaaatgccatgattatgattgca
ggtttttcggcatggatgggcgttgatgtacgtgagttgcccgatattgatattcctgta
acaacggttatgacgaattttgctggtgcttcagcggaaacaatagatcgtgaaattacg
aaaattgtagaagatgctgtttctcgtgtctcgggggttaaaacgatttcttcaacgtct
tcttttggccgttctcgtgtagagattcagtttaatgttggggttgatttgaatgttgca
gcatctgacattcgtgatgctctttctcgtgttgcttattctttaccgaaagatgcagat
tcacctctaatcattaaagccgattcgaatgcagcggcaatgatgtatttggttgtgacc
tcaccgacaatgaatattgatgatctgacgaccattgtaaatgatcaaattgttgacgtt
ctttccgctgttgagggggttgctgatgtagaagttgatagtgctcgcaaaaaaattttt
cagattgatatcgatcaagtaaagcttgctaattatggattaagtgtagcagatatttca
agtgctctttctgatatgatggttgatgtgcctgtggggtcattgcgtaatgctaaacag
gccttaattgttcgtgctacagctcatttggcaacaccggaagattttgagcgagtttta
ttaaagccacatgtgcttattggcgatgttgcccgtgttactttatcgcctgatatagaa
acagttattttgcgtgttaacggcgaagaggggatagggctaggtattgtgcgtaaggca
caatctaatactcttaatatttctaaagatgttcgaataactcttgaccgtcttaaaatg
attattcctccttctgtgcagatcagtattatcagtgatgattctatttttattaagagc
gctcttcatgaggttgagattgcgttagtgattgctgtgctgagtgttatttttgttatt
tttattttcctgagagatattcgtataacgctgattcctgctttatcgataccagttgct
ttaattggaacaattgctgcgatttatcttgcaggtttttccttaaatattcttacattt
ttagggcttgttttagcaacagggcttgttgtagatgacgcaattgttgtgctggagaat
attgttcggtggcgcaataagggacacggttctcggtctgcagcggtgttaggaacacgt
gaagtattttttgctgttgttgcaacaacattaacattggtagctgtttttgtacctatc
tcttttcttcctgggcaagttggggggctttttagggaatttggttttgtattggcaatt
tctgttctactttcttcagtggttgctttaactctttgtcctatgcttgctgcgcgtttt
cttaaagaacatgttgaagagaataaagaagacgtacgtcgtttcattatattggataaa
ttgggtgctttttttagcaggaattatgcttattatttgcataaatgtttgggacggccc
tggactgttatacttatttcatttgttttttttggcctttgtattggaggctatatgaaa
ttacaacaggagctaacaccagcagaagatagaggaatgatttttttggtcattcgtggg
ccccagggtatttcaacgcaatatttgaatgagcaagtaaagcaaattgaagagagttta
caaccgttgcgtgatgctggtgaaattgttaacagctattctattgcaggagctggaggc
gcatctaataatgcttttcttatcttgttgctttcatcttgggataaacgctcgcgtagt
caacaagaaattgtgaacgatattaattccaagattaggcaattcccagcagtatttgta
tttgctgcacaaggtaattctcttggggtcaggggaaccggccaaggattacggtttgca
attcttgggaataattatgaaaaattacaatcaattgctgatcagcttgtaaatgcttta
caggctgatcaacgttttattcgtccacagcttgctagtgatgcaacacaaccacaattt
tttattgaaattaatcgagaaaaagccactgatttgggggttgatattactaatttaggt
aatacattgcagacaatgttagatggaagaaaaattggttccatttatgtggatgatcat
tcttacgatgtcaaactgacatcgcgtgaaaagtttattgataatcctgctgatttagaa
aatattcttttgaaagcaaaaaataacaaatatgtgcctttatcaatgattgcacatttg
catgaaaaagctattgcgcctcaattaaaacgggagcaacgcatgaatgctgttatttta
agcacgaattttgctccaaatattactttaggggatgcgtatcaaattgtacaagaaatt
tcttctcctctcttatcagaggggagttatgttgttcctttaggagaagtcgccactctt
agtgaaacatcttctaatttaatggttgtttttggtattgcttttttgattattttgtta
attttggcggcacagtttgaaagttttgtttcgggttttataataatggctactgttccg
ttaggattaggttgcgcagtaattgctatgcttttgagtggtgttagccttaatatttat
agtcaaattggtttaattttattgattggtgttatggctaaaaatggtattttgattgtt
gaatttgcagatcaattgcgtgatcaaggtagaagcgtgcgtgaagctgtagaagaagct
gctaatgtccgtttgcgtccagtgtgtatgacgatgatttgcgctattttagggggaatt
cctctaattttagcaaaaggtgctggtgcagaggcgcgtatagctttaggttgggttatt
gtgggtggtttgggtttggcgaccatctttactttgtatgtaacaccagttgtttacctt
ttgcttgggcgttttataagaccaaaaatagaagaagccaagcaattagaaagagaatta
aaccaagctacatga
DBGET
integrated database retrieval system