Bufo bufo (common toad): 120985829
Help
Entry
120985829 CDS
T07950
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
bbuf
Bufo bufo (common toad)
Pathway
bbuf04350
TGF-beta signaling pathway
bbuf04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bbuf00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
120985829 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
120985829 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
bbuf00536
]
120985829 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
bbuf00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
120985829 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120985829
NCBI-ProteinID:
XP_040269935
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(661970741..662232176)
Genome browser
AA seq
2874 aa
AA seq
DB search
MRLATLLGLALGFTVLFSFGASQGADKEVTSDTVKESRASRAKRRGGGTGVGHDILKGPN
VCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPTGQTAPSCGSKSIQ
QCNIRCMNGGTCSDEHCMCQKGYTGTHCGQPVCEHGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQC
ERDYRTGPCFSVVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIP
NIRTGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEITQKCEDIDECNTITG
ICESGECANTVGSYFCKCPPGFFTSADGSRCIDTRPGYCFTSVTNGRCINQLPQLLPKRQ
CCCDSGRCWSAGAAVAPEMCPFRGTDEYRKLCTVTWPPPGPFPLPDHIQPGFPGGPEYPP
PLGPQVPPVGPFFPVPPVPGFRHPTPASGVTTLNFTQDYCLLYRNLCIHGRCIPTPGSYR
CECNKGFHLDGRGECIDVEECERNPCLHAECVNTQGSYICQCHPGFQSTSTRTECRDIDE
CLQNGRICNNGRCVNTDGSFHCVCNAGFQVSSDGKNCQDMDECSVKNMCLNGMCINEDGS
FKCICKPGFQLAPNGRFCTDIDECETAGLCMNGQCVNTDGSFRCECFPGLAVGLDGRVCV
DTHMRSTCYGGYKRGQCVRPLLDAVTKSECCCANTEFAFGEPCRPCPAKTSDEYQALCSS
GPGMTSVGTDINECALDPDICPNGICENLRGTYKCICNSGYDVDNTGKNCIDIDECALNR
LLCDNGQCRNTPGSFSCTCLNGYVYKPELKTCEDIDECESNPCINGLCKNIPGSFVCECS
FGSTLDQTRTICIETLKGTCWKDIVNGRCEININGATLRSQCCSTLGVAWGSPCQPCDVD
HVCGKGFARTKGNICQDVNECEVFPGICTNANCRNTVGSFICECPPGMKVDASGRTCIDI
RVETCYLKHEEEECSAAISGRHRMDACCCSIGAAWGPDCEECPPKATPEFEILCPRGPGF
ATKEITPGKTFSKDINECKMISSLCKYGRCRNTIGSFKCRCDNGFALDAEERNCTDIDEC
RISPDVCGQGICINTPGDFECDCFEGYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGFCLNTEG
SFKCECPPGHEVAPDSSACLDINECGLSTDLCRNGRCVNLIGRYQCACDVGYQPSPDKLS
CVDIDECEHYNGGCDSNCTNSEGSYECSCLEGYALMPDQRTCTDIDECESNPNICDGGQC
TNIPGEYRCLCYDGYMSSIDMKSCLDVDECELHLNICLSGSCENTKGSFICHCNPGYSGK
KGITGCTDVNECEIGAHNCDRHAMCTNLPGSFKCSCNPGWVGNGIKCSDLDECSNGTHRC
SQDAICKNTMGSYRCLCKEGYSGDGFECKDIDECTDNVHLCGNGQCLNTPGGYRCDCDMG
FLPSVDGKTCEDIDECALPNICVFGTCKNLPGLFRCDCDTGYELDKSGGNCTDVDECADP
TACISGTCENTPGSYNCECPPDFQLNPTRVGCVDTRSGSCYLEVKPRGDNGDLACSNEIG
VSISKASCCCSRGKAWGTPCEHCPPVNSSDYKVLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECLELP
GLCQGGKCVNTFGSFQCHCPTGFFLNEETRVCDDINECEQPGICGPGTCYNTVGNYTCIC
PPDFMPINGGNNCMDMRRSLCFRNFNADNQTCDGELLYNMTKKMCCCSYNIGRAWNRPCE
ECPLPSTDDFEALCGSARPGFVIDIYTGQPIDIDECREIPGVCENGICINMIGSFRCECP
MGFFYNDKLLICEDIDECQNGPVCQRNADCINTPGSYRCDCKPGYKFTSTGQCVDRNECQ
ENPNLCSHGECHDRTGGYYCVCHNGFKTSEDETMCLDINECERDPCGNGTCRNTVGSYNC
RCFDGFILSHNNDCIDIDECSTLNGQLCRNGQCINVIGSFKCVCNAGYEMAVDGRTCLDI
NECALDPGKCAPGTCQNLDGSYRCICPPGYLLKNDTCEDIDECAEEPETCALGTCNNVLG
SFICLCPEGFVLTSTGKRCQDVRVGVCFTKFEDGKCTSPKARNHTKTECCCSFKQAGWGY
PCEICPVEGDAGFGEICPYGFGNEVGPNGERIDMDECVDPDKCKNGLCINTDGSYRCECS
FGYVLTGEECIDIDECSVGNPCGNGTCKNVIGGFECTCEDGFEPGPMMACEDVNECAQNP
LLCAFRCVNTYGSYECKCPAGYVLREDKRMCRDQDECEEGLHDCEEKQMTCKNLIGTFMC
ICGPGYQRRPNGEGCMDLNECSKPGLCENGKCLNTVGSYKCECVDGFNASITETECIDNR
LGYCFTEVLHTMCQLGSSTQNSVTKSECCCNSGRGWGITCEICPFPGTVQFKKLCPYGRG
FTTGGEDIDECHVLHGICRNGQCINERGSYKCECNPGYIPDVTGTSCIDLDECTQSPKPC
NFICKNTDGSFQCSCPRGYILQEDRRSCKDLDECATKQHNCQFICVNTIGGFTCKCPPGF
TQHHTACIDNNECASDVSLCGAKGICQNTPGSYACDCQRGFSLDQSGNTCEDVDECDGSH
RCQHGCQNIVGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECMSSQICGGATCHNTLGSFKCICPT
GFQFEHFGGSCHDINECGSSQAPCSFGCSNTEGGYVCGCPPGYFRVGQGHCVTGAGMSRV
QDMATSGEIDDNSLSPEACYDCKINGYPKRGRKRRSANDTATEDEEKLELESLVNLASWD
LEKPAILSFNISHINTRDRILELTPALTTLQHHNRYVIDSGNKDGIFRLNQKDGISYLHL
TKKKPVPGVYDLEISSFPLYKEKELIQLEDKHDRDYLTGELGDILKMKIKILFH
NT seq
8625 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggctggctactctgctggggttggcactgggatttacagtgttgttctccttcggt
gccagtcaaggtgctgacaaggaggtgacatctgatacagtgaaggaatccagagccagc
agagccaagagaagaggtggaggtactggagtgggtcatgatatcctgaaaggacccaat
gtttgtggatccagatacaatgcgtactgttgtcctgggtggaaaacattaccgggaggg
aaccaatgcatcgtccccatttgtcgccattcctgcggtgatggattctgttcacgacct
aatatgtgcacatgtcccaccggtcaaacagcaccatcttgcggatctaaatcaattcag
cagtgtaacatcagatgtatgaacggtggcacctgcagcgacgagcactgtatgtgccag
aagggttatactggaacacactgtggccagcccgtctgtgaacatgggtgtctaaatggt
ggacgatgtgtcgctccaaatcgatgcgcctgcacatacggctttacaggacctcagtgt
gaaagagattacagaacgggaccttgcttttctgttgtaagcaaccaaatgtgtcaagga
cagctgagcggtatagtgtgcacgaagacgctgtgctgcgccacagtggggagagcatgg
ggacacccgtgcgagatgtgcccagcccaaccacatccctgccgtcgtggctttattcca
aacatccgaacaggagcgtgtcaagatgtggatgaatgccaagcaatccctgggttatgt
caaggaggaaattgtattaatactgtcggatcttttgagtgcaaatgcccagctggacac
aagtttaatgaaataacacaaaaatgtgaagatattgatgaatgtaataccataacaggc
atctgtgaatcaggtgaatgtgctaacactgtgggcagctacttttgtaaatgtccccca
ggattctttacatcagcagatggatcacgttgtatagatactcgaccaggatattgcttc
acatccgtgactaatggacgctgtatcaatcaactccctcaactcctaccgaaaagacag
tgttgctgtgatagcggaagatgctggtcggcaggagcagcagtggcacccgaaatgtgc
cctttccgaggaacagatgaatatcgcaagctgtgcacagtgacctggcctccacctggt
ccatttcctctgccagatcatatacaaccaggttttcctgggggaccagagtatccacct
cctctaggtcctcaggtaccacctgtaggtccatttttccccgtaccacctgtcccagga
ttccgtcatcccactcctgcatctggtgttaccacattaaattttacacaagattactgt
ttattgtaccgaaacttgtgtatacatggccgctgcatccccactcctggaagttatcgt
tgtgagtgcaacaagggattccatttagacggtagaggagagtgcatagatgttgaagag
tgtgaaagaaacccttgccttcatgcggaatgtgtaaatacccagggatcatacatttgc
cagtgtcaccctggattccagagcacatcaacacgaacagaatgcagagacattgacgaa
tgcttacaaaatggtcgcatctgcaacaatggacggtgtgtgaacacagatggcagtttc
cattgtgtgtgcaatgcaggctttcaagtttcatccgatggaaagaattgtcaagatatg
gatgaatgtagtgtaaagaacatgtgcttaaatggaatgtgcatcaatgaggatggaagt
tttaaatgcatctgcaaaccaggctttcagcttgcacctaatgggcggttttgcacagat
attgatgaatgtgaaacagcaggcctttgcatgaatggccaatgtgttaacaccgatggg
tccttcaggtgcgaatgtttccctggccttgcagttggacttgatggacgggtgtgtgta
gatactcacatgaggagcacatgttatggtggctacaagaggggtcagtgtgtgcgacct
ttactggatgccgtgacaaaatcagagtgctgctgtgccaacacagaatttgcttttggt
gaaccatgccgtccatgccctgcaaaaacatcagatgagtatcaagcattatgcagcagt
ggcccaggaatgacatctgtaggaaccgatatcaatgaatgtgctctggatcctgatatc
tgtccaaatggaatatgcgaaaacctccgtggaacatacaaatgcatctgtaattctgga
tatgatgtggacaatactggaaagaattgcattgatattgatgaatgcgccttgaacagg
ctactctgtgacaatggacaatgtcggaacactccaggaagcttctcctgcacttgctta
aatggatatgtctacaaacctgaactaaaaacttgcgaagatattgatgaatgtgaatca
aacccctgcataaatggtctgtgcaagaatatcccagggtcctttgtgtgtgaatgttct
tttggaagtacattggatcagactaggacgatctgtattgaaaccttaaagggcacatgc
tggaaagacatagtaaatggaagatgcgaaataaacataaatggagctactttgaggtct
cagtgttgttcaacgttaggagtagcttggggaagtccatgtcaaccttgtgacgtcgat
catgtctgcggtaaaggttttgccagaaccaaaggcaatatttgtcaagatgttaatgaa
tgtgaggtatttcccggaatatgcaccaatgccaattgcagaaacacagtcgggtccttt
atctgtgaatgcccccctggaatgaaggttgatgcttctggacgcacatgcattgacatt
cgtgtggagacctgctacttgaagcatgaggaggaggagtgttctgccgcaatttctggc
cgccataggatggatgcctgctgctgctctattggggctgcatggggtcctgactgtgaa
gagtgtccacctaaagcaacaccagagtttgagatcctttgcccaagaggccctggcttt
gccactaaagagattacaccaggaaaaacattctctaaagacatcaatgaatgtaaaatg
atttcaagtctttgcaagtacggtagatgcagaaacactatcggtagctttaagtgtcgg
tgtgacaacggttttgccctagacgctgaggaaagaaactgcacagatattgatgaatgc
agaatatcccctgatgtttgtggacaaggaatatgcattaacactccgggagactttgag
tgtgactgcttcgaaggctatgaaagtggtttcatgatgatgaagaactgtatggatatt
gatgagtgtgaaaggaacccactgttgtgtcgtggtggcttctgcctgaacacagaggga
agttttaaatgtgaatgccctcctggacatgaagtggcacctgatagctctgcttgccta
gatatcaatgagtgcgggctcagcactgatctgtgcagaaatggtcgatgtgtaaatttg
atcggacgataccagtgtgcatgtgatgtgggataccaaccttcccctgataaactctcc
tgtgttgatattgatgagtgtgaacattacaatggtggatgtgactccaactgtaccaac
tccgaaggaagttatgagtgcagctgcttagaaggttatgctttaatgccagatcaaaga
acctgtaccgacattgatgagtgtgaatcgaatccaaacatctgcgatggaggccagtgc
acgaacatacctggagagtaccgctgcctttgctatgatggttacatgtcatccattgat
atgaaaagttgtctagatgttgatgagtgtgaactccatttgaacatctgtctaagtgga
agctgcgagaacaccaaaggctcgttcatctgtcattgtaatcctggttactctggcaag
aaaggaataaccggatgtacagatgtcaatgaatgtgaaattggcgcccacaactgtgac
aggcatgccatgtgcacaaacctccctggaagctttaaatgtagctgcaaccctggatgg
gtaggaaacggcatcaagtgctcagatcttgatgaatgttcaaatggaactcatcggtgt
agtcaagatgcaatctgcaagaacaccatgggatcataccgatgtctgtgcaaggaaggt
tattcaggagatgggtttgaatgcaaagatattgatgaatgtacagacaacgtgcatcta
tgtggaaatggtcagtgccttaatactcccggaggatatcgttgtgactgcgacatggga
ttcttaccaagcgttgatgggaaaacatgtgaagatatcgatgaatgtgctcttccaaac
atctgtgtttttggaacttgcaaaaaccttccgggtctcttcaggtgtgactgtgatact
ggatatgaattggacaaaagtggcggcaactgcacagatgtggatgaatgtgctgatcca
acagcctgtataagcggaacatgtgagaatactccaggcagttacaactgtgaatgcccc
ccagatttccagcttaacccaactcgagttggatgtgttgatacgcggtctggcagttgt
tacctggaagtgaaaccacgaggagataatggagacctggcctgcagtaatgagattggt
gttagcatctctaaggcctcatgttgttgctcacgtggcaaagcctggggaactccatgt
gaacactgcccacctgtaaactccagtgattataaagtattgtgtcctggaggagaaggt
ttcagaccaaatccaattactgttattttggaagatatcgatgaatgtctggagttaccc
ggtctatgtcaaggaggaaagtgcgtcaatacctttggcagtttccagtgtcattgtcca
actggcttcttccttaatgaagagacacgagtttgtgatgatatcaatgaatgtgaacag
cctggaatatgtggacctggaacatgctacaacactgttggaaactatacctgtatatgc
ccacctgacttcatgccgatcaatggaggaaacaactgtatggacatgagaagaagtcta
tgctttagaaactttaatgccgataatcaaacttgtgacggagagttgctttacaacatg
acgaaaaagatgtgttgctgttcttataatattggacgtgcatggaacagaccctgtgag
gaatgtccattgccaagtactgatgactttgaagcactctgtggaagcgctcgtccaggc
tttgtcattgatatctacacaggacaaccaattgatatcgatgaatgcagagagattcct
ggagtttgtgagaacggcatttgtataaacatgatcgggagcttccgttgtgaatgtccc
atgggatttttctacaatgacaaactgctgatctgtgaagatattgatgaatgccagaat
ggaccagtatgtcaaagaaatgcagactgtattaacactccagggagctaccgctgtgac
tgcaaacctggctacaaattcacttctactggacaatgtgttgatcgtaatgagtgtcag
gaaaatccgaacctttgcagccacggagaatgtcatgacaggactggaggatattactgt
gtttgtcataatggatttaaaaccagtgaagatgagaccatgtgtctggatattaatgag
tgtgaaagagatccctgcggtaatggaacgtgtaggaacaccgtcggctcttacaactgc
cgctgtttcgatgggttcattctgtcccacaataacgactgtatagatattgatgaatgt
tccactctgaatggtcagctatgtagaaacggacagtgtattaacgtcattgggtccttt
aagtgtgtatgtaatgcaggatatgagatggcggttgatggcagaacatgtctcgatatc
aatgaatgcgctcttgatcctgggaaatgtgctcctggaacttgtcaaaacttggacggc
tcgtaccgctgcatttgtcctccaggatatcttttgaaaaatgacacatgcgaagacatt
gatgagtgcgctgaagagccagaaacctgtgccttggggacatgcaacaacgttctaggc
agctttatctgtctttgtccagagggctttgtgctaacctctactggaaagagatgccaa
gatgtcagagttggagtctgcttcactaagtttgaagatggaaaatgtacctcgcccaag
gctagaaatcacacaaagacagaatgctgctgttcttttaaacaggctggatggggatat
ccatgtgaaatctgcccagtggaaggagatgcgggtttcggagagatctgcccatatgga
tttgggaatgaagttggaccaaatggggaacgaattgatatggacgaatgcgttgatccg
gacaaatgcaagaatggactgtgtattaacacagacggctcctaccgctgtgaatgttcc
tttggctatgtcctcacaggggaagaatgtatcgatattgacgagtgctctgttggaaac
ccttgtggaaatggaacctgcaagaatgtgattggtgggtttgagtgcacatgtgaagac
ggttttgagcctggtccaatgatggcatgtgaagatgttaatgaatgtgctcagaatccc
ctgctatgtgctttccgctgtgtgaacacctacggttcatatgaatgcaagtgtccggcc
ggctacgtgctcagagaagacaaaaggatgtgcagggatcaagatgagtgtgaagaaggt
cttcatgattgtgaagaaaaacagatgacctgcaagaatctgatagggacatttatgtgt
atatgtggaccaggatatcagcgcagacccaatggtgaaggatgcatggatttgaacgag
tgcagtaaacctggattatgtgaaaatggaaaatgtctgaacaccgtgggcagctacaag
tgtgagtgtgtggatggattcaatgccagtattactgagacagaatgcattgataacagg
cttggatattgcttcactgaagttctacataccatgtgtcaacttggttcttccacccag
aactccgtcaccaagtccgaatgttgttgtaactcaggcagaggatggggtattacatgt
gagatctgccccttccccggtacagtacagtttaaaaagctttgtccttatggccgaggg
ttcacaacaggaggagaagatatagatgagtgtcatgtactacatggtatctgccggaat
ggacaatgtatcaacgagagaggctcatataagtgtgaatgcaatcctggctacattcca
gacgtgactggtacttcttgcatcgatcttgatgaatgtactcagtctcccaaaccctgt
aactttatctgtaaaaatactgatggcagtttccagtgttcctgccctcgtggctacatt
ttacaagaggataggagaagctgtaaagatcttgatgaatgtgcaaccaaacagcacaat
tgtcagtttatttgcgtcaacaccattggaggatttacatgcaaatgtccaccgggattc
acccagcatcatactgcttgtattgataacaatgagtgtgcctcagatgtgagcttatgt
ggagctaagggcatatgccagaatactccaggaagttatgcttgtgactgccagcgtgga
ttttcacttgatcagagtggaaatacgtgtgaagatgtggatgaatgtgatggaagccat
cgctgccagcatggatgccagaacatcgtgggtggatataggtgtagttgtccacaaggc
tatcttcaacattaccagtggaatcagtgtgtggatgagaacgagtgcatgagcagtcaa
atatgcggaggagccacatgtcacaacaccctggggagctttaagtgcatatgtccaaca
ggatttcagtttgaacattttggaggttcttgccatgatatcaatgagtgtggttcttcc
caggctccatgtagctttggctgttccaatacagaaggaggttatgtgtgcggctgtcca
ccagggtacttcagggtaggacaaggacactgtgtaactggagcaggaatgagcagagtt
caggatatggcaaccagtggggaaatagatgacaactctttatccccagaagcatgctac
gattgtaagatcaatggctatcccaaaagagggaggaaacggagaagtgccaatgacaca
gctacagaggacgaggagaaactggagttggaatccttggttaacctcgcaagttgggat
cttgaaaaaccagcaattctttcttttaacatctcccatataaacaccagagaccgtatt
cttgagctcactccagcgctcacaactctacagcatcacaatagatatgtaatagactct
ggaaacaaagatggcatatttaggctcaaccaaaaagatggaatcagttacctgcatctg
accaagaagaagccagtccctggtgtttatgacctagagattagcagttttcctctttat
aaggagaaagagcttatccagcttgaagataaacatgacagagactacctcactggtgaa
ctgggtgacattcttaaaatgaaaattaagatcttatttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
