Bartonella machadoae: LNM86_00105
Help
Entry
LNM86_00105 CDS
T08469
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
bmac
Bartonella machadoae
Pathway
bmac01501
beta-Lactam resistance
bmac01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bmac00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
LNM86_00105
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
LNM86_00105
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bmac02000
]
LNM86_00105
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
bmac01504
]
LNM86_00105
Transporters [BR:
bmac02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
LNM86_00105
Antimicrobial resistance genes [BR:
bmac01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
LNM86_00105
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UNE54363
LinkDB
All DBs
Position
23086..26220
Genome browser
AA seq
1044 aa
AA seq
DB search
MSQELSTTPPTTQGEQGGFIALFIRRPVFTFVLNAMIMIAGFSAWLNVDVRELPDVDIPV
LTIMTIFSGASAETIDREVTKNIEDAVSRVSGVKTISSSSSFGRSRVEINFNVGVDLNVA
ASDIRDALSRIAYSLPKNADTPLIIKADSNAAAMMYLVVTSPTMSIDDLTEVVNDQIVNA
LSAVDGVGDVQVDSARTKIFQIDVDQAKLASYGLTVADISRALADMTTDVPVGSLRNSKQ
TLIVRATARLTTPEAFEQVALKPHVYLGDVAHVTLSPDVETVILRVNGKTGIGLGIVRKA
QSNTLNISQGVREVLSHLKSIVPSSVHMDIISDDAVFIKSALHEVEVALVIAILSVILVI
FLFLRDIRVTLIPALSIPVTLIGTIAAIYLVGFSLNILTFLGLVLATGLVVDDAIVVLEN
IVRRRNMGLGSRAAAVLGTREVFFAVVATTLTLVAVFVPISFLPGQVGGLFREFGFVLAI
SILLSSIVALTLCPMLTSRFLKGHVESEREGAHYLTFLHKLGSFFSKGYAYSLHKCLQRP
WAVILASFIFAGLCIGGYTKLQQELTPAEDRALIFLLITGPQGISTQYLNEQVKQIETRL
QPLRDSGEIANSYSIAGIGGSSNTAFLVLLLSSWDKRVRSQQEILEDVNAKVRQFPAVFV
FAVQGNSLGVRGTGQGLQFAILGNDYTKLQPIANKLVSALQADPHFIRPRLTVDETQPQF
FVEINREKASDLGVDITNLGNTLQAMLDGKKIGSVYVDDHSYDVKLTSWHNPVNNPHDLE
NIFLKTKSNKYIPLSVIAHLQEKAIAPQLKREKRMSAVILSANLAPGVVLGDAYQTVQKI
ATPLLSGENYIVPLGEAATLGETSSNFMIVFGIAFVIILLVLAAQFESFISGFIIMATVP
LGIGCAVIAMLLSGVSLNIYSQIGLILLVGVMAKNGILIVEFADQLRDQGRNVREAIEEA
ANIRLRPVCMTMICALLGGIPLVLAKGAGAEARVALGWVIVGGLGLATVFTLYVTPVVYL
FLGRFVRTKAEEAVRLTKELSQVE
NT seq
3135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcaggaattgagcacgaccccccctacaacacagggagagcaaggcggtttcatt
gccttatttattcgcaggccagtttttacctttgttttaaatgccatgatcatgattgcg
gggttttctgcttggttgaacgttgatgttcgcgaattgccagatgttgatattcctgtg
ctaactattatgacgattttttctggtgcatcagcagaaacaattgatcgtgaagttaca
aaaaatatcgaagatgctgtttctcgtgtttcaggtgttaaaacaatttcttcaagttct
tcttttggtcgttcccgtgtagagattaattttaatgtcggtgttgatttgaatgttgca
gcatctgatattcgcgatgccctttctcgtattgcttattctttacccaaaaacgccgat
acccctttgattattaaagcagattcgaatgctgctgcaatgatgtatttagttgtcact
tcaccaacgatgagtattgatgatttaacagaagttgtaaacgatcaaattgttaatgcg
ctttctgctgttgatggtgttggtgatgtgcaggttgatagtgcacgcacgaagattttt
caaattgatgttgatcaagcaaagcttgccagctatggcttaactgtagcggatatttca
cgtgctcttgcggatatgacaacggatgtaccagtagggtcattacgcaattctaagcaa
actttaattgtacgtgctaccgcgcgtttaacaacaccagaagcttttgaacaagttgct
ttaaaaccgcatgtgtatcttggtgatgttgcacatgttactttatcgcctgatgtggaa
acagtgattcttcgtgtcaatggaaaaacgggaatcgggttaggaattgtgcgtaaagca
caatccaacacccttaatatttctcaaggagttcgagaagttcttagtcacctcaaaagt
attgtcccttcttctgtccatatggatatcattagtgatgatgcagtttttattaaaagt
gcacttcatgaggttgaggtagcattggttattgctattctcagtgttattttggttatt
ttcctttttttaagagatattcgtgtaacgctcattcccgcattatctattcctgtcact
ttgattggtacaattgctgctatttaccttgttggattttcattaaatattctcacattc
ttaggtcttgttttagcaacagggcttgtggtggatgacgcaattgttgttcttgagaat
attgttcggaggcgtaatatgggcttaggttccagagcagcagcggttctaggaacacga
gaagtcttttttgctgttgtagcaacaacattgactttagttgctgtttttgtgcctatt
tcgtttcttcctgggcaagtgggaggactgtttagagaatttggttttgtattggcaatt
tctatccttctttcttccattgttgctttaacactttgccctatgttgacttcgcgtttt
ctcaaaggacatgtggaaagcgagagagaaggggcacattatcttacttttttgcataag
ttaggttctttttttagcaaagggtatgcttatagtttgcataagtgtttgcaaagacct
tgggctgttattttggcttcgtttattttcgcaggtctttgtattggaggctatacgaaa
ttacaacaggagttaacgccagcagaggatagagcgttgatctttttgcttattactgga
ccacaaggtatttcaacacaatatttgaatgagcaagtgaagcagattgaaacgcgttta
cagccattacgtgattctggagagattgcgaatagttattctattgccggcattggtggt
tcatcaaatacagcttttttggttttgttgctttcttcttgggataagcgcgtgcgctct
caacaagagattttagaggatgttaatgcaaaggtgagacagtttccagccgtttttgtg
tttgctgtgcagggaaattctttaggcgttagaggaacgggacaaggtttacaatttgca
attcttggcaatgactatacaaaattacagccgatagctaataagcttgtgagtgctttg
caagctgatccacattttattcgtccacggcttactgttgatgaaacacaaccacagttt
tttgttgaaattaacagggaaaaagcctctgatttaggggttgatatcaccaatttgggc
aatacattgcaagcaatgttggatggtaaaaaaattggttccgtttatgtcgatgaccat
tcttatgatgtaaaactcacttcgtggcacaatccagttaacaatcctcatgatttggaa
aatatttttttaaaaaccaagagcaataaatacattcctttatcagttattgcacattta
caggaaaaagccattgcacctcaactaaaacgagaaaaacgcatgagtgctgttatttta
agcgcaaatcttgctccaggtgtcgttttaggggacgcttatcagactgtacagaaaatc
gctactcctttattatcaggggaaaattatattgttcctttaggggaagcggctaccctt
ggtgaaacatcctccaattttatgattgtctttggaatagcctttgtgattattttattg
gtcttagctgctcaatttgagagttttatttcaggatttattatcatggcgactgtacca
ttaggcattggttgtgcggttattgctatgcttttgagtggagtaagtctgaatatttac
agtcaaataggtttaattttgttggtgggggttatggctaaaaatgggattcttattgtt
gagtttgcagatcaattacgtgatcaagggagaaatgtgcgtgaagctattgaagaagcg
gcaaatattcgtcttcgtccagtttgtatgacgatgatttgtgctcttttagggggcatt
cctttggttttagccaaaggtgctggtgcagaggcacgtgttgctttgggttgggttatt
gttggcggtttgggtttagcaactgtttttacgctttatgtcacaccggtggtttatctt
tttctcggacgttttgtaaggacaaaagcagaagaagctgtacgtttaacaaaagaactc
agccaagttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
