Borreliella yangtzensis: QIA34_01250
Help
Entry
QIA34_01250 CDS
T09301
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
byn
Borreliella yangtzensis
Pathway
byn01501
beta-Lactam resistance
byn01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
byn00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
QIA34_01250
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
QIA34_01250
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
byn02000
]
QIA34_01250
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
byn01504
]
QIA34_01250
Transporters [BR:
byn02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
QIA34_01250
Antimicrobial resistance genes [BR:
byn01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
QIA34_01250
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
CbiG_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKC74048
LinkDB
All DBs
Position
complement(138253..141468)
Genome browser
AA seq
1071 aa
AA seq
DB search
MLVKRVVGKPITMLILFSLLMMISLYTFSRLKVDLLPGIDIPQISINTVYPGASPKEVEE
SISRVLESGLSSVKNLKNIYSISSKENSTVSLEFYHGTDLDLVLNEIRDAIELVKSSLPS
KSQAPRIFRYNLKNIPVMEIIINSARPISELKRYAEEIIKPGLERLDGIAIVTVNGGSKK
RVLIEVSQNRLESYGLSLSRISSIIASQNFELSAGNILENNLEYLVQVSGKFKSIEEIGN
VVIAYKMPDISSSGINSSAIEIKLKDIANIKTDFEDLSEYVEYNGLPSISLSVQKRSDAN
SVAVSNIVRSEIEKLKLSMPKDIRLEIASDSTNFIKSSIATVVNSAYFGALLAIFVIFFF
LRSFRATIIIGISIPIAIILTFCLMYFVNISLNIMSLAGLALGIGMVVDCSIVVIDNIYK
YRQKGAKLISSSILGAQEMMLPITSSTFTSICVFGPFLIFKSELGVYGDFFKDFSFTIVI
SLGVSLLVAIFLVPVLSSHYVGLYTSFQKNIKSAFIRKIDAFFASIYYFLEFLYINLLNI
VLNHKLIFGLIVFFSFIGSLLLGLLLDVTTFNRGKDNSIFINLNFPHKTNLEYAKFYSNR
FLEIVKSEAKGYKSIISTLSAERITFNVLFPLKEEVKDKLIKSIDYDAIKYKVMNRIGNL
YPEFNIDSSSGNALGGGDSIKIKISANDFEYIKDYGKTLVFMLKKEIPELVNPRLSVSDS
QLQISVEIDRALAYNYGIDMNTILNELKANVNGVVAGQYVENGLNYDIVLKLDRMDVKNL
KDLEKIFITNPSGVKIPFSSIATFEKTNKEESIYRENQALTIYLNAGISPNDNLTQVTAK
VIDFINNKVPHKEGTVLKVEGEYNEFSNIMSQFKIIIIMAVIVVFGIMASQFESLLKPFI
IIFTIPLTTIGVVLIHFLAGEKLSIFAAIGMLMLVGVVVNTGIVLVDYTGLLIKRGFGLR
EAIIESCRSRFRPILMSSLTSIIGLIPMAFSSGSGNELLKPIAFTFIGGMTASTFLTLFF
IPMLFEIFSNIVSNFKLRLKRVASNLDIEKSFKINNSTKSSYDNLFEEDGD
NT seq
3216 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttggtaaagagagtagttggcaaaccaataacaatgttaattttattttcattgtta
atgatgataagtttgtataccttttcaagattgaaagtagaccttttgcctgggattgat
atcccccaaataagtatcaatactgtttatcctggtgcttctcctaaagaagttgaagag
agtatttctagagttcttgaaagtggtttgagttcagtaaaaaatttaaaaaacatatat
agcatttcttctaaagaaaatagtactgtttcacttgaattttatcatggaactgatttg
gacttggttctaaatgaaattcgagatgctattgaattggtaaaatcttcattacctagt
aaatcgcaggcacctagaatttttagatacaatcttaaaaatattcctgtaatggaaatt
atcattaattctgcaaggccaatttctgagcttaaaagatatgccgaagagatcattaaa
cctggacttgaaaggcttgatgggattgcaattgttactgttaatggcggaagcaaaaaa
cgtgttttaattgaagtttctcaaaatagattagagtcttatgggctttctttgtcaaga
atatcttcgattatagcatctcaaaattttgaactttcagctggtaatatattggaaaac
aacttagaatatttggttcaagtatctggaaaatttaaatcaattgaagagataggcaat
gtagttatagcttataagatgcctgatatttcttcttctggtataaattcatctgctatt
gaaataaaacttaaagatattgctaatattaagaccgattttgaagatttgtcagaatat
gttgaatataatggtttgccttcaatttctttatcagttcaaaaacgtagtgatgctaat
tctgttgcagtttctaatattgttaggagtgaaatagaaaaattgaaattatctatgcct
aaagatataagattggaaattgcgtctgatagtactaattttattaaatcgtctattgca
acggttgtaaattcagcttattttggagccttgctagcaatatttgttatttttttcttt
ttaaggagctttagagccacaataattattggaatttctattccaatagcaattattttg
accttttgtttaatgtattttgtaaatatttctcttaatattatgagtcttgcaggtctt
gcacttgggattggaatggttgttgactgctcaattgttgtaatagataatatatacaaa
tacaggcaaaaaggagcaaagcttatttcatcttctattcttggagcccaagagatgatg
ctgcctattacatcttcaacttttacttctatttgtgtttttggcccatttcttattttc
aaatcagaacttggagtatatggagatttttttaaagacttttcatttacaattgttatt
tctttgggggtttctcttttagttgctatttttttggttcccgttttatcaagccattac
gttggcttgtacacaagttttcaaaagaatattaagagtgcttttattaggaaaattgat
gctttttttgctagtatttattattttttagaatttttgtatatcaatttgttaaatata
gttttaaatcacaaattgatttttgggttgattgttttttttagttttattggtagctta
cttttaggattattgctagatgtgacaacttttaatagaggaaaagataactcaattttt
attaatttaaattttccccataaaactaatttagaatatgcaaaattttattctaataga
tttttagaaattgtaaaaagtgaggctaaaggatataaaagtattatttctactttgagt
gctgagagaataacttttaatgtattatttcctcttaaggaagaggtaaaagataagttg
attaaaagtatagattacgatgcaattaagtataaggttatgaatcgcatcgggaatctt
tatcccgaatttaatattgactcttccagtggtaatgctttgggtggtggagattctatt
aaaattaaaatttcagcaaatgattttgagtatataaaggattatggaaaaactttagtt
tttatgttgaaaaaggaaattccagaacttgtaaatccaagacttagtgtaagtgattct
caacttcaaattagtgttgagatagatagagcgctagcttacaattatggcattgacatg
aataccattttaaatgaattgaaggctaatgttaatggtgttgttgctgggcaatatgta
gaaaatggacttaattatgatattgttcttaagcttgatagaatggatgttaaaaattta
aaagatttagaaaaaatatttattacaaatccatctggagttaaaattcctttttcatca
atagccacctttgaaaaaaccaataaagaggaatctatttacagagaaaaccaagctttg
actatttatcttaatgcgggcatttctccaaatgacaatttaactcaagtcactgcaaaa
gttatagattttattaataataaagttccccataaagaaggaacagttcttaaggttgaa
ggagaatataatgaattttcaaatattatgagtcagtttaaaataatcattattatggct
gttattgttgtgtttggcattatggcttctcaatttgaatctcttttaaagccctttatt
attatttttacaattcctttaacgacaataggggttgtacttatacattttcttgcagga
gaaaaactttctatttttgctgcaattggaatgcttatgcttgttggtgttgttgttaat
acgggaattgttcttgtagactataccggtttattgatcaagagagggtttggtctaaga
gaagcaattattgaatcttgtcgatcaagatttagaccaattttaatgtcttctttgact
tcaataataggacttattccgatggcattttctagtggaagtgggaatgagcttttaaag
cctattgcatttacctttattggtggaatgacggctagtacatttcttactttgtttttt
attcccatgctttttgaaattttttccaatattgtttcaaatttcaagcttaggttaaaa
agagtagcgtctaatttagatattgaaaaatcattcaaaattaataattcaactaaaagt
agctatgataatttatttgaagaagatggggattga
DBGET
integrated database retrieval system