Cygnus atratus (black swan): 118251561 Help Entry 118251561         CDS       T09349                                  Symbol FBN1 Name (RefSeq) fibrillin-1 isoform X1   KO K06825   fibrillin 1 Organism cata  Cygnus atratus (black swan) Pathway cata04350   TGF-beta signaling pathway cata04820   Cytoskeleton in muscle cells Brite KEGG Orthology (KO) [BR:cata00001]  09130 Environmental Information Processing   09132 Signal transduction    04350 TGF-beta signaling pathway     118251561 (FBN1)  09140 Cellular Processes   09142 Cell motility    04820 Cytoskeleton in muscle cells     118251561 (FBN1)  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:cata00536]     118251561 (FBN1) Glycosaminoglycan binding proteins [BR:cata00536]  Heparan sulfate / Heparin   Extracellular matrix molecules    118251561 (FBN1) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  EGF_CA cEGF hEGF FXa_inhibition EGF TB EGF_3 Plasmod_Pvs28 Fibrillin_U_N EGF_FBN_1st EGF_MSP1_1 EGF_Teneurin Motif Other DBs NCBI-GeneID:  118251561 NCBI-ProteinID:  XP_035409668 LinkDB All DBs Position 11:489028..645595 Genome browser AA seq 2869 aa AA seqDB search MWRGRLLGIALGVAVLWASQGGAAAAAGHAEGASGKELRASRAKRRGQGGGGHDALKGPN VCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPNGQIAPSCGSKSIQ HCNIRCMNGGSCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVCESGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQC ERDYRTGPCFTLVTNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIP NIRTGACQDVDECQAIPGICQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEVTQKCDDIDECSTIPG ICDGGECSNTVSSYFCKCPPGFYTAPDGLKCIDVRPGYCFSSLTNGRCSNQLPQPLSKMQ CCCDSGRCWSSGAAGAPEMCPIRSTDEYRKLCTVAALLPARPDIPPGRPEVMPPPILPGV YPPLVPQQPEIVYPSRAPPPHVILPVNFTDYCQLFRHLCLNGRCIPTPGSYRCECNKGFQ LDVRGECIDVDECEKNPCISGDCVNTQGSYICQCRIGYQSTPTRTECRDIDECLQNGRIC NNGRCINTDGSFHCVCNAGFQVAADGKNCEDMDECSIRNMCLNGMCINEDGSFKCICKPG FQLASDGRYCRDIDECETAGICMNGRCVNTDGSFRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHMRSTC YGGYKRGQCVRPLTGAVTKSECCCASTDYAFGEPCQPCPAQNSAEYQALCSSGTGMTAGG NDINECLLDTDLCPNGRCENLHGTYKCICNPGYEVDSTGKNCIDIDECALNMLLCDNGQC RNTPGSFTCTCPKGFVYTPDLKTCEDIDECESNPCVNGVCKNTPGSFACECSPESTLDTT RTICIETVKGTCWQNIVDGRCEININGATLKSQCCSSLGAAWGSPCTPCERDPICQKGYS RIRGTLCEDVNECEVFPGVCTNGQCVNTLGSFVCQCPSGMTLDASGRTCLDIRLESCYLQ HEDEQCTLQIPGRHRMDACCCSVGAAWGFECEECPLKGSPEFEALCPRGSGFSTKIEITG KPFSKDINECKMVPSLCTHGKCRNTIGSFKCRCDSGFALDSEERNCTDIDECRISPDLCG QGICVNTPGDFECECFEGYESGFMMMKNCMDIDECQRNPLLCRGGTCLNTEGSFRCDCPP GHQISPNISACIDINECDLSTNLCRNGHCVNLIGKYQCACNPGYQSTPDKLYCVDIDECS IMNGGCENFCTNSEGSYECSCKQGFALMPDHRTCTDIDECEDNPNICDGGQCTNIPGEYR CLCYDGFMASEDMKTCVDVNECDLHPNICLSGTCENTKGSFICHCDMGYSGKKGTTGCTD INECEIGAHNCDRHAICTNTAGSFKCSCSPGWVGNGIKCTDLDECSNGTHMCSPHADCKN TMGSYRCLCKEGYTGDGFTCTDLDECSENLNLCENGQCLNAPGGYRCECDMGFLPSPDGK ACEDIDECSLPNICVYGTCHNLPGLFRCECEVGYELDRSGGNCTDVNECADPTTCISGTC VNTAGSYTCECPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIKTRGDNGGTFCSNEIGVGVSKASC CCSLGRAWGVPCEQCPPVNTTEYKVLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGKC INTFGSFQCQCPSGYYLNEETRVCDDVNECDTPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDYMQVN GGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNIGRAWNKPCEQCPIPSTD EFSTLCGSQRPGFFIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGICINMVGSFRCECPVGFFYNDK LLICEDIDECQNGPVCQQNAECVNTAGSYRCDCKPGYRFTSTGRCTDRNECQEIPNICSH GQCIDTVGSFYCICHNGFKTNDDRTMCIDINECERDACGNGTCRNTIGSFNCRCNLGFIL SHNNDCIDVDECASGNGMLCRNGQCVNTIGSFQCLCNDGYEVALDGRTCVDVNECALDPG KCSPGTCQNLDGSFRCICPPGYVLQNDKCEDIDECVEQPEICALGTCSNTPGSFKCLCPE GFVLSSTGRRCQDLRVSYCFTKFEDGKCSVPKSRNHSKQECCCALKGQGWGDPCELCPEE ADEAFRQICPFGIGILVGPGDARLDVDECLDPDNCKFGQCINTDGSFRCECPYGYILQET QCVDTDECAVGNPCGNGTCRNVVGGFECTCVDGFEPGPMMTCEDVNECIQNPLLCAFRCV NTYGSYECKCPAGYVLREDRRMCRDQDECEEGIHDCDSKQMECKNLIGTYMCICGPGYQR RPDGEGCIDENECQTKPGICENGRCVNTVGGYRCECNEGFTVSDSQKECLDNREGYCFTE VLQSMCQIGSSNRNSVTKSECCCDGGRGWGPNCEVCPFPGTVAFKKLCPHGRGYMSNGAD IDECKVIHDVCRNGECINERGSYRCHCNLGYTTDITGTLCIDLNECNESPKPCNFICKNT EGSFQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHHTAC IDNNECATEINLCGAKGICQNTPGSFVCECQRGFSLDQTGLSCEDVDECDGNHRCQHGCQ NIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCHNTLGSYKCMCPTGFQYEQF SGGCQDINECGSAQAPCSYGCSNTEGGYVCGCPPGYFRIGQGHCVSGVGLGKGQGQELSL SGEVDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRKRRSTNETANEAEDQQELEPPISLASWDIEKAA VFSINISELSNKDRILKLLPALTTLTNHNRYLIDSGNEDGFFRINKKDGISYLHFTKKKP VPGNYSLQISSIPLYKKKELNQLEEKHDKDYLSGELGDNLKMKIQISLH NT seq 8610 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtggcgggggcggctgctggggatcgccctgggagttgccgtgctgtgggcgtcccag gggggcgccgccgccgccgccgggcacgccgagggggcgagcggcaaggagctgcgggcc agcagggccaagaggcgagggcagggcggcggcgggcacgacgcgctcaaaggaccgaat gtgtgtggatcacgttacaatgcttactgttgccctggatggaaaactttacctggtgga aaccaatgcatagtcccgatttgcagacattcctgtggggatggattttgctctagacca aacatgtgcacatgcccaaatggtcagatagccccctcctgtggttcaaaatcaatacaa cactgtaacatccggtgcatgaatggaggtagctgcagtgatgaccattgcctctgtcag aagggatatacaggaacacactgtggacagcctgtctgtgaaagtggatgtctaaatgga gggagatgtgtggctccgaaccgatgtgcttgcacctatggctttacaggaccccagtgt gaaagagattacaggaccggcccttgcttcactttggtaaccaaccagatgtgccaggga cagctcagtggaatagtctgcacaaaaaccctttgctgtgcaactgttgggagagcgtgg ggccacccctgtgaaatgtgtcctgcccagccgcatccctgtcgccgaggcttcattcca aacattcgaacgggggcctgtcaagacgtggatgaatgccaagccatccctgggatctgt caagggggaaattgcatcaatactgttggatcttttgagtgcaaatgcccagctggacac aagtttaatgaagtgacacaaaaatgtgatgatattgatgaatgcagcaccattcctgga atctgtgatgggggagaatgttcaaacacagtcagtagttatttctgcaagtgtcctcca gggttttatacagctcctgatggcttaaaatgcatagatgtgcgtcctggatactgcttc tcttccctgacgaatgggcgctgcagcaatcagcttccccagcctttgtccaaaatgcag tgttgctgtgacagtggccgatgctggtcttctggtgcagccggtgctcctgaaatgtgc ccgatcagatccactgatgagtatcgcaaattgtgcacagtagctgctctgctgccagca agacctgacattcctccgggtcgtcctgaagtcatgcctccaccaatccttcctggtgtt tatcctcctctggtccctcaacagccagaaattgtctatccatctcgggctccaccacct catgtgatcttgccagtgaacttcactgactattgccagctgttccgacatctctgcctt aatgggcgctgtattcccactcctgggagctaccgctgcgagtgcaacaaaggattccaa ctggatgttagaggggaatgcattgatgttgatgaatgtgagaagaatccatgtatcagt ggagactgtgtgaacacccagggatcctacatatgccagtgtcgtataggatatcagagc acaccaacgagaacagagtgccgagacattgatgaatgtttacagaatggtcgtatctgc aataatggacgatgcataaatacagatggcagttttcactgtgtgtgcaatgctggattt caagtggcagctgatgggaaaaactgtgaagatatggatgaatgcagcataaggaatatg tgcctgaatgggatgtgcatcaatgaggacggcagttttaaatgcatttgtaaaccaggg ttccagttagcatctgatggacgctattgcagagacatcgatgagtgtgagacagctgga atatgcatgaacgggcgctgtgtgaacactgatggctctttcagatgtgaatgcttccct ggccttgcagtaggactggatggacgtgtgtgtgttgatacacatatgcgaagcacgtgc tatggtggctacaagagagggcaatgtgtgagaccattaaccggtgcagttacaaaatcg gaatgttgttgtgccagcactgactatgcctttggggagccttgtcaaccctgtccagca caaaattcagctgaatatcaggctctgtgcagtagtggaactggcatgacagcaggagga aatgatattaatgagtgcttactggatactgatctctgtcccaatggaagatgtgagaat ctgcatggaacatacaaatgtatttgtaaccctgggtatgaagtggattcaactgggaaa aactgcattgacattgatgaatgtgcactgaacatgctgctttgtgacaacgggcaatgc agaaatacgcctgggagtttcacctgcacttgtcccaaaggatttgtatacacaccagac ctaaaaacatgtgaagatattgacgagtgtgaatctaacccctgcgttaatggggtatgc aaaaacacaccaggctcttttgcttgtgaatgttctcctgaaagtactttggatacaaca agaactatctgcatagaaactgttaagggtacctgttggcagaacatagttgatggaaga tgtgaaataaatatcaatggagcaactctgaagtcccagtgctgttcctcactaggtgct gcttggggtagcccatgtacaccatgtgaacgagacccaatatgccaaaagggatattca agaataagaggaacattatgtgaagatgtaaatgaatgtgaggtgtttcctggagtctgt accaatgggcagtgtgtcaataccttgggatcgtttgtttgccagtgccccagtggaatg actttagatgcttctggacggacgtgtcttgacattcgcttggagagttgctacctgcag catgaagatgagcaatgcactttacaaataccaggccgacatcgaatggatgcttgctgc tgttctgtgggggcagcatggggctttgagtgtgaggaatgtcctctgaagggatcgcca gaattcgaagctctttgtcccagaggatctggattctctacaaagatagagattactggg aaacctttttctaaagatatcaatgaatgtaaaatggtccccagcctttgtacccatgga aaatgcagaaacaccattggcagtttcaagtgtagatgtgatagtggatttgcccttgat tctgaagagaggaattgcacagatatcgatgaatgccgcatctctcctgatctgtgtggc caaggcatctgtgtcaatactcctggggactttgaatgtgaatgttttgaaggctatgaa agtggatttatgatgatgaaaaactgcatggacatcgatgagtgtcagcgcaaccccctt ctctgccgaggtggaacctgcctcaacacagagggaagttttcggtgtgattgtcctcca ggccatcagatatcaccaaatatttctgcatgtatagacattaatgaatgtgatctaagc accaacttgtgccgaaatggacattgtgtcaacctgattggaaaatatcaatgtgcttgc aaccctggatatcagtccacacctgacaagttatactgtgttgatattgacgagtgcagc ataatgaatggtggctgtgagaacttctgtacaaactccgagggcagctatgaatgtagc tgtaaacaaggctttgcactcatgccagaccacaggacgtgtaccgatattgacgagtgt gaagacaatcctaatatctgtgatggaggccagtgcacaaacatcccaggagagtacagg tgtctttgctatgatggattcatggcatctgaggacatgaagacttgtgtagatgttaat gagtgtgatctgcatccaaacatttgtctgagtggaacctgtgagaatacaaaaggctca tttatctgtcattgtgatatgggatattcaggcaagaaaggcacaactggttgcacagat atcaacgagtgtgaaattggagcccataactgtgatagacatgccatatgtacgaacaca gcgggaagtttcaaatgtagctgcagccctggctgggttgggaatggtatcaagtgcaca gatctggatgagtgctccaatggaacccacatgtgcagtccacatgctgactgcaagaac acaatgggctcttatcgttgcctgtgtaaagaaggttatactggggatggcttcacttgt acagacctagatgaatgctcagaaaacttaaatctctgtgaaaatgggcagtgcctcaat gccccaggaggatatcgctgtgaatgtgatatgggatttttgccaagtccagatgggaaa gcatgtgaagatattgatgagtgctcacttcctaacatctgtgtctacggtacttgtcat aacctccctggacttttccgatgtgagtgtgaagtgggctatgaactggacagaagtggt ggtaactgcacagatgttaatgaatgtgcagatcccacaacctgcatcagtggcacatgt gtcaatactgctggtagttacacctgtgagtgccctccagattttgagctgaatcctacc cgcgttggctgtgttgatacacgatctggcaactgttacctggacattaaaactcgtgga gataacggtggcaccttctgcagcaatgagatcggagtgggtgtttctaaggcctcctgt tgctgctctctgggcagagcttggggagttccctgtgaacagtgcccacctgtgaacaca actgaatataaggttctttgccctggaggagaaggattccgaccaaatcctattacagtt atattagaggatattgatgaatgtcaagaactgcctgggctctgccaaggaggaaaatgt attaatacatttggtagcttccagtgtcagtgtccatcagggtactatttgaatgaagag acgcgagtatgtgatgatgtgaacgagtgtgatacacctggcatatgtggacctggcacg tgttacaatactgttgggaactacacctgcatctgtcctcctgattacatgcaagtcaat ggagggaacaactgtatggatatgagaagaagtctgtgctacagaaattactatgctgat aaccaaacctgtgatggcgagctactctttaatatgaccaagaaaatgtgctgctgttcc tacaacattggacgtgcatggaataagccttgtgaacagtgtcctatacctagcaccgat gaattctctacgctctgtggaagtcaaaggcctggcttcttcattgacatttatacagga ttaccagttgatattgatgaatgtagagagattcctggagtgtgtgaaaatgggatctgt ataaacatggttggcagcttccgatgcgagtgtcctgtgggtttcttctacaatgacaag ctactgatctgcgaagatattgatgaatgccaaaatggaccagtatgtcagcaaaatgcc gagtgtgtcaacacagcaggtagctaccgttgtgactgtaaacctggctatagattcaca tcaaccggacgctgcactgatcggaacgaatgtcaagaaattccaaatatctgcagccat gggcagtgtattgacactgtcggaagtttttactgtatttgtcacaacggattcaagacc aacgatgacagaacaatgtgtatagatatcaatgagtgtgagagagatgcctgtggcaat ggaacctgcagaaacactattggctctttcaattgccgctgcaatttggggttcatcctc tcacacaacaatgactgcatagacgtggatgaatgtgcaagtggaaatgggatgctctgc aggaatggtcagtgtgtgaacacgattggatctttccagtgtctttgcaatgatggctat gaggtggctctggatggaaggacttgtgttgatgtcaatgagtgtgcactggatcctgga aaatgctcaccgggcacatgccagaacttggatgggtcattcagatgcatttgtcctcct ggatatgtcctgcaaaatgacaaatgtgaagacattgatgagtgtgtggaacagccagaa atttgtgccctgggcacatgcagcaacacaccaggcagtttcaaatgcttgtgtccagaa ggttttgtgttgtcttccacaggaaggcgatgccaagatctgagagtgagttactgcttt accaaatttgaagatggaaaatgttctgtgccgaagtcccgaaaccactccaaacaagag tgttgctgtgccttgaaaggacaagggtggggagatccctgtgaactctgcccagaggaa gcagatgaggcgttcagacagatttgtccatttggaattggcatccttgttggacctggt gatgcaagactggatgtggatgagtgccttgatccagataattgtaaatttgggcagtgt atcaacacagacgggtctttccgctgtgaatgtccatatggttacatcctacaggaaact caatgtgtggatactgatgaatgtgctgttggaaatccgtgcggaaatggaacttgcagg aatgtagtgggaggttttgaatgcacctgtgttgatggatttgagcctggaccaatgatg acgtgtgaagatgtcaacgagtgcattcagaaccctctgctctgtgctttccgctgtgtg aacacttacggatcctacgagtgcaagtgccccgcagggtatgttctgcgagaggaccgg agaatgtgcagagatcaggatgagtgtgaagaaggcattcacgactgtgactcaaaacag atggagtgcaaaaacctaataggtacctatatgtgtatctgtggaccaggttatcagcgt agaccagatggggaaggctgtatagatgagaatgaatgtcagaccaaacctgggatctgt gagaatggccggtgtgtaaacacagtgggaggttacagatgtgaatgcaatgagggattc actgtcagtgacagccagaaagaatgcctcgacaacagggaaggctactgcttcactgaa gtcttacaaagtatgtgtcaaatcggatcaagcaacaggaactctgtcaccaagtctgaa tgctgctgtgatggtggccgaggctgggggccaaactgcgaggtctgccccttcccaggc actgtggcctttaagaagctttgccctcatggtcgaggatatatgtctaatggagcagat attgatgagtgcaaggttattcatgatgtctgtcgtaatggggaatgcatcaatgaaagg ggatcttaccgttgtcattgcaacctgggctacactacagacataactggcactctttgc atagatctgaatgaatgtaacgagtcccccaaaccttgcaatttcatctgcaaaaacaca gaggggagcttccagtgttcatgtccgaaagggtacatccttcaagaagatgggaggagc tgcaaagatcttgatgaatgtgctacaaagcagcacaactgccagttcctttgcgtcaac actattgggggttttacttgtaaatgtcctcctggattcactcagcaccatacagcctgc attgataataatgaatgtgctactgaaatcaacctgtgtggggcaaagggtatttgccag aatacaccaggaagttttgtttgcgaatgtcaacgtggcttctcactagatcaaactggg cttagctgtgaagatgttgatgaatgcgatggaaaccaccggtgtcagcatggctgccaa aatataattggaggatacaggtgtagctgtccgcaaggatacctccagcattaccaatgg aaccaatgtgttgatgaaaatgaatgtctcagtgcacacatttgtggaggagcatcttgc cacaatactttgggaagctataaatgtatgtgccctaccggatttcagtatgaacagttt agtggaggttgccaagatatcaatgaatgcggttctgcacaagccccatgcagttatggt tgttcaaatactgaaggtggctatgtctgtggatgtccacctggttacttcagaatagga caaggacactgtgtttctggagtggggctaggcaaaggtcaaggacaagagctttcactc agtggagaagtagatgacaactcgctctctcctgaagcttgctatgaatgtaaaatcaat ggctatcccaagagaggaaggaagcgcagaagcactaatgaaactgcaaatgaagcagag gatcagcaagagctggagcccccgatcagcctcgccagctgggatattgagaaagcagca gtcttttctatcaacatctccgagctcagtaacaaagatcgcatcctgaaactgcttcct gccctcacaacactgacaaaccataaccgatatttaattgactccggaaacgaagatggt ttctttagaatcaataagaaggacgggataagttaccttcatttcacaaagaagaagcca gtgcctggaaactattcattacaaatcagtagtattccactctataaaaagaaggaactt aaccagcttgaagagaaacatgacaaagactacctcagtggtgagctgggagataatctg aaaatgaaaattcagatatcgcttcattaa

DBGET integrated database retrieval system