Clostridium botulinum BKT015925: CbC4_0727
Help
Entry
CbC4_0727 CDS
T01475
Name
(GenBank) RND efflux transporter, putative
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
cbn
Clostridium botulinum BKT015925
Pathway
cbn01501
beta-Lactam resistance
cbn01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbn00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
CbC4_0727
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
CbC4_0727
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cbn02000
]
CbC4_0727
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
cbn01504
]
CbC4_0727
Transporters [BR:
cbn02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
CbC4_0727
Antimicrobial resistance genes [BR:
cbn01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
CbC4_0727
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
GidB
HMA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEB75407
LinkDB
All DBs
Position
799064..802126
Genome browser
AA seq
1020 aa
AA seq
DB search
MTVLILVFGLGIYRVIPKQENPDASVGIARVLTIYPGGTPEDVKNLVTKKLEDAASEIDG
FDYVESYSKNSVSVLIVYLKDTADDDKAWRELRDKINDKKAELPAECFPSQINTDLVSTA
GMIISLSGDNYSYDQLDSYAEEINRKLSKIEGVTSFDIDGKLDKQVKVDVDMDKLKNYPI
SLEDVTKALKVQNVKIPPGAIESKTSKIDVITSNGFDSIKDIENVVVYVSEDSGAIVRLK
DIAKIYMDYNQDDVKYKQDGKKSILLTGHFEDNKNVVLIGKDVRREIEKIKKTLPNDLNF
YEVLYQPTDVDNAVSDFMTNLIEGIILVIVVIFAGVGVRNSIVVSAALPISILLSFIMMH
FAGIKVHQISTMALIIALGILVDNAIVISDVVQVKINQGVDNVRAALEGAKESSIPIFTS
TLTTVASFAPLLTIPGVPGKYVESIPKVVIISLIASYICAMLITPALAAVFYKKATDAKQ
GKVMKKVEVFFENLLNLGLKKRKMTILISVGMLIIAGIIGTTLGLQFFPYANKSMMYINT
SIEKKGDIKATEDIAKIVERVLKSQPEITNYSTGVGDGLPKFWVAMPPAVPSNDFAQTKI
DFNLKKGGRFKNNAQFANYLQEKLDAEIVGAKCTVYPLQYALPKEAPIGIRVIGDDMEKL
YAASEKLQSVIREFDGATKVRDDAADRTYQYKVDIDSDMASQLGIIKYDIERQINISLRG
TEASVYKKNGKEFSIMVKSDIDSKEKLENLAIKSTLAGHKVLLKEIATIKLETQIDTIKR
YNKEDCINVYADIKPGGNAVDLQDKIEEKLKSVDLPGVRLEFFGEKADIVRYFGTLGQSA
GVAIFFIYIILLIQFNSFMQPFIIFLTIPLSLIGSIFGLFIFRQPLSLMALMGIVSLVGV
VVKNAILLIEYINKARKEGYSLDDSCMDAMKKRFSPIILSAFTTVMGLAPIIPSGNPMFV
PMAVALMCGLIVSTLLTLIIIPVLYNLIESSIDNFKGNHKGGFKFKFGRRKMNKGNTLEG
NT seq
3063 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgactgtattaatactagtctttggattaggaatatatagagtaatacccaaacaagaa
aatcctgatgcttctgttggaatagcaagagttttaactatatatccagggggaactcca
gaggatgttaaaaatttagttactaagaagttagaagatgcggcatcagaaattgatggg
tttgattatgtggaatcatattctaaaaacagtgtgtctgttttaattgtttatttaaaa
gatactgcagatgatgataaagcttggagagaacttagagataagataaatgataaaaaa
gcagaactacctgccgaatgttttccaagtcaaataaatacagatttagtttcaacggct
ggaatgataataagtttatcaggagataactattcttatgatcaattggatagttatgca
gaagaaatcaatagaaagctaagtaagatagaaggcgtaacaagctttgatattgatggt
aaacttgataaacaagttaaagttgatgttgatatggataaacttaaaaattatccaata
tcattggaagatgtaacaaaggcacttaaggtgcaaaatgtaaaaataccaccaggagct
attgaaagtaaaacttcaaaaatagatgtaattacaagtaatggatttgattctataaag
gatattgaaaatgtagttgtttatgtatcagaagatagtggtgctatagtaagacttaaa
gatattgctaaaatatatatggactataatcaggatgatgttaagtataaacaggatggt
aagaaatctattttgcttacaggtcattttgaagataataaaaatgtagttttaattggt
aaggatgttagacgcgaaatagaaaaaataaagaaaacactacctaatgatttaaacttc
tatgaagttttatatcaaccaacagatgttgataatgcagtttctgattttatgactaac
cttatagaaggtattatattagttattgtagtaatatttgcaggggttggagttagaaac
tctatagtagtttcagcggcactgccaatatcaatactgttaagttttattatgatgcac
tttgctggaataaaagtacatcaaatatcaactatggctcttattattgccctgggaata
ttagttgataatgctatagtaataagtgatgttgttcaagttaaaataaatcaaggtgta
gataatgtaagggcagcattagaaggtgctaaggaatcatcaatacctatatttacatct
acactcacaactgtagcctcttttgcaccattacttacaataccgggtgttccagggaaa
tatgttgaaagtatacctaaggttgttataatttcacttattgcatcttatatttgtgca
atgcttataacacctgcacttgcagctgtattttataagaaagctacagatgcaaaacaa
ggtaaagttatgaaaaaagttgaagttttctttgaaaacttactaaatttgggacttaaa
aagaggaagatgacaattttaatttctgtaggaatgcttataatagcaggaattattgga
acaacgttaggacttcaatttttcccatatgctaacaagagtatgatgtatataaatact
tcaatagagaaaaaaggagatataaaagctacagaagatatagcaaagattgtagaaagg
gtattaaaatcacaaccagaaattacaaactattcaacaggagttggagacggacttcca
aagttctgggttgcaatgccaccggcagtaccatctaatgattttgctcaaactaagatt
gattttaatcttaaaaagggcggaagatttaagaataatgcacaatttgcaaattacctt
caagaaaaattggatgctgaaattgttggtgctaagtgtacagtatatcctcttcaatat
gcattacctaaagaagcacctattggtataagagttataggggatgatatggaaaaattg
tatgcagcgtcagaaaaacttcaaagtgtaattagagaatttgatggtgccactaaggtt
cgtgatgatgcagcggatagaacatatcaatataaagtagatattgattctgatatggca
tcacaacttggaattatcaaatatgatatagaaagacaaataaatatttcattaagagga
acagaagcttcagtatataaaaagaatggtaaagaatttagtattatggtaaagagtgat
attgatagtaaagaaaaacttgaaaatttagctataaaatcaactcttgctggacataag
gtactattaaaagaaattgctactattaaactagaaacacaaatagatactataaaaaga
tataacaaagaagattgtataaatgtatatgcagatattaaaccgggtggaaatgcagtt
gatcttcaagataaaatagaagaaaaattaaaaagtgtagatttaccaggtgttagatta
gagttctttggagaaaaggcagatatagtaagatactttggtacactaggtcaatcagca
ggtgttgctattttcttcatatatataatcttgcttatacagtttaattcgtttatgcaa
ccatttattattttcttaactataccattgtcattgataggatctatatttggattattt
atatttagacaaccgttatcacttatggcacttatgggaattgtaagtttggttggtgta
gttgttaagaatgcaatacttttaattgaatatattaataaagcaagaaaagaaggatat
tctttagatgattcttgtatggatgctatgaaaaagagattcagtcctattatattaagt
gcgtttacaacagttatgggacttgcacctataataccatctggaaatcctatgttcgtt
cctatggcagttgccttgatgtgtggacttatagtatctacattattaacacttattatt
atacctgtgttatataacttaattgaaagttcaatagataactttaaaggaaaccataaa
ggtggatttaagtttaaatttggtcgtagaaaaatgaacaagggaaatactttagaggga
tga
DBGET
integrated database retrieval system
