Corvus brachyrhynchos (American crow): 103621258
Help
Entry
103621258 CDS
T08418
Name
(RefSeq) fibrillin-1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
cbrc
Corvus brachyrhynchos (American crow)
Pathway
cbrc04350
TGF-beta signaling pathway
cbrc04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbrc00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
103621258
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
103621258
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cbrc00536
]
103621258
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cbrc00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
103621258
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
EGF
TB
FXa_inhibition
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_TEN
EGF_MSP1_1
EGF_PEAR1L
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103621258
NCBI-ProteinID:
XP_017598122
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2359 aa
AA seq
DB search
MCTCPNGQIAPSCGSKSIQHCNIRCMNGGSCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVCENGCLNGG
RCVAPNRCACTYGFTGPQCERDYRTGPCFTLVTNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWG
HPCEMCPAQPHPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGICQGGNCINTVGSFECKCPAGHK
FNEVTQKCDDIDECSTIPGICDGGECSNTVSSYFCKCPPGFYTAPDGLKCIDVRPGFCFS
TLSNGRCGNQLPQPLSKMQCCCDSGRCWASAPATAPEMCPIRSTDEYRKLCTVAAMLPAR
PHDLPPARPDIIPPPRIPDVYPPPHPEIIYPSRAPPPHPILPVNLTDYCQTFRHLCRNGR
CIPTPGSYRCECNKGFQLHGREECIDIDECERNPCIGGDCVNTQGSYICQCRIGYQSTAT
RTECRDIDECLQNGRICNNGRCINTDGSFHCVCNAGFQVAVDGKNCEDMDECSIRNICLN
GMCINEDGSFKCICKPGFQLASDGRYCTDINECETDGICMNGRCVNTDGSFRCECFPGLA
VGLDGRVCVDTHMRSTCYGGYKRGQCVRPLTGAVTKSECCCASTDYAFGEPCQPCPAQNS
AEYQALCSSGTGMTAGGNDINECLLDPDLCPNGRCENLHGTYKCYCDPGYEVDSTGKNCI
DIDECALNMLLCDNGQCRNTPGSFTCTCPKGFVYTPDLKTCEDIDECESNPCVNGVCKNT
PGSFVCECSPESTLDPTRTICIETVKGTCWQNIVNGRCEININGATLKSQCCSSLGAAWG
SPCTPCERDPICQKGYSRIRGTLCEDVNECEVFPGVCTNGQCVNTLGSFVCQCPSGMTLD
ASGRTCLDIRLESCYLQHEDEQCTAQIPGRHRMDACCCSVGAAWGYECEECPLRGTPEFE
ALCPRGPGFSTKIEISGKPFSKDINECKMFPSLCTHGKCRNTIGSFKCRCDSGFALDSEE
RNCTDIDECRISPDLCGQGICVNTPGDFECECFEGYESGFMMMKNCMDIDECQRNPLLCR
GGTCINTEGSFRCDCPPGHQISPNISACVDINECELSTNLCRNGRCVNLIGKYQCACNPG
YQSTQDKLYCVDIDECSIMNGGCENFCTNSEGSYECSCKQGFALMPDHRTCTDIDECEDN
PNICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASEDMKTCIDVNECDLHPNICLSGTCENTKGSFIC
HCDMGYSGKKGTTGCTDINECEIGAHNCDRHAICTNTAGSFKCSCSPGWIGNGIKCTDLD
ECSNGTHMCSPHADCKNTMGSYRCLCKEGYTGDGFTCTDLDECSENLNLCENGQCLNAPG
GYRCECDMGFLPSVDGKACEDIDECSLPNICVYGTCHNLPGLFRCECEVGYELDRSGGNC
TDVNECADPTTCISGTCINTAGSYTCECPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIKTRGDNG
GTFCSNEIGVGVSKASCCCSLGKAWGVPCEHCPLVNTTEYKVLCPGGEGFRPNPITVILE
DIDECQELPGLCQGGKCINTFGSFQCQCPSGYYLNEETRVCDDVNECETPGICGPGTCYN
TVGNYTCICPPDYMQVNGGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNI
GRAWNKPCEQCPIPSTDEFSTLCGSQRPGFFIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGICINM
VGSFRCECPVGFFYNDKLLICEDIDECQNGPVCQQNAECVNTAGSYRCDCKPGYRFTSTG
RCTDRNECQEIPNICSHGQCIDTVGSFYCICHNGFKTNDDRTMCIDINECERDACGNGTC
RNTIGSFNCRCNLGFILSHNNDCIDVDECASGNGMLCRNGQCVNTIGSFQCLCNDGYEVA
LDGRTCVDINECALEPGKCSPGTCQNLDGSFRCICPPGYILQNDKCEDIDECVEQPEICA
LGTCSNTPGSFKCLCPEGFVLSSTGRRCQDLRVSYCFTKFEDGKCSVPKSRNHSKQECCC
ALKGQGWGDPCELCPEEADEAFRQICPFGIGILVGPGDARLDVDECLDPDNCKFGQCINT
DGSFRCECPYGYILQGAECVDTDECAVGNPCGNGTCRNVIGGFECTCVEGFEPGPMMTCE
DVNECIQNPLLCAFRCVNTFGSYECKCPGGYVLREDRRMCRDQNECEEGIHDCDSKQMEC
KNLIGTYMCICGPGYQRRPDGEGCIDENECQTKPGLCENGRCVNTVGSYRCECNEGFTVS
DTQDECLDVTLSFLLLVVFHSQFHSLRTTGRATASPKSYKVCAKSDRATGTLSPSLNAAV
TVAEAGGRTVRSVPSQAPWPSRNFALMAEDTHPVEQILMSARLFTTSAATGSASTRGELT
AVFAIWATPQISLALFVLI
NT seq
7080 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcacatgcccaaatggtcagatagccccctcctgtggttcaaaatcaatccaacac
tgtaacatccggtgcatgaatggaggtagctgcagtgatgaccattgcctctgtcagaag
ggttatacaggaacacactgtggacagcctgtctgtgaaaatggatgtctgaatggaggg
agatgcgtagctccgaaccgatgcgcttgcacgtatggcttcactggaccccagtgtgag
agagattacaggacgggcccttgcttcactttggtaaccaaccagatgtgccagggccag
ctcagtggaattgtctgcacaaaaaccctgtgctgtgcaactgttgggagagcgtggggc
catccctgtgaaatgtgtcctgcccagccgcatccctgccgccgaggcttcattccaaac
attcgaacgggagcctgtcaagatgtggatgaatgccaagccatccctgggatctgtcaa
gggggaaattgtattaatactgttggatcttttgagtgcaaatgcccagctggacacaag
tttaatgaagtaacacaaaaatgtgacgatatcgatgaatgtagcaccattcctggaatt
tgtgatggaggagagtgttcaaacacagttagtagttacttctgcaagtgtcctccaggg
ttttatacagctcctgatggcttaaaatgcatagacgtgcgccctggattctgcttctcc
acgctgagcaacgggcgctgtggcaatcagctgccgcagcccctgtccaagatgcagtgc
tgctgtgacagcggccgctgctgggcctcagctccagccaccgctccagaaatgtgtccc
atcagatccaccgacgagtaccgtaaattgtgcacggtagctgctatgctgccagcaaga
cctcatgaccttcctccggcccgtcctgacatcatccctccaccacgcattcctgatgtt
taccctcctccacatccagaaatcatctatccatctcgggctccaccacctcatccgatc
ttgccggtgaacttaactgactattgccaaacattccggcatctctgccgtaatggacgt
tgtattcccactcctgggagctaccgctgcgagtgcaacaaaggattccaactgcatggt
agagaggaatgcattgatattgatgaatgtgaaaggaatccatgcattggtggagactgt
gtgaacacccagggatcctacatctgccagtgtcgtattggctatcagagcacagcgacc
aggacagagtgccgagacatcgatgaatgtttacagaatggtcgtatctgtaataatgga
cgatgcataaatacagatggcagttttcactgtgtgtgtaatgctggctttcaagtggca
gttgatgggaaaaactgtgaagatatggatgaatgcagcattaggaacatttgcctcaat
gggatgtgcatcaatgaagatggcagctttaagtgcatttgtaaaccaggcttccagcta
gcatctgatggacgctattgcacagacatcaatgagtgtgagacagatggaatatgcatg
aacgggcgctgtgtgaacactgatggctctttcagatgtgaatgcttccctggccttgca
gtaggactggatggacgtgtctgtgttgatacacatatgcggagcacatgctatggtggc
tacaagagaggccaatgtgtgagaccattaacgggtgcagttacaaagtcagagtgctgc
tgtgccagcactgactatgcctttggagagccttgccagccctgcccagcacaaaattca
gctgaatatcaggctctgtgcagcagtggaactggcatgactgcaggaggaaatgatatt
aatgagtgcttattggatcccgatctctgtccaaatggaaggtgtgagaatctgcatgga
acatacaaatgttattgtgaccctggatatgaagtagactcaactgggaaaaactgcatt
gatattgatgaatgtgcactgaacatgctgctttgtgacaatgggcaatgcagaaatacc
cctggaagtttcacctgcacctgtccaaaaggatttgtatacactcctgatctaaagaca
tgtgaagatattgatgaatgtgaatctaacccctgtgttaatggagtgtgcaaaaacaca
ccaggctctttcgtttgtgaatgttctcccgaaagtactttggatccaaccagaaccatc
tgcatagaaactgtcaagggtacctgttggcagaacatagtgaatggaaggtgtgaaata
aatatcaatggagcaactctgaagtcccagtgctgttcctcactaggtgctgcttgggga
agcccgtgtacaccatgtgaacgagacccaatatgtcaaaagggatattcaagaataaga
ggaacattgtgtgaagatgttaatgaatgtgaggtgtttcctggggtctgtacaaatggg
cagtgtgtcaataccttgggatcatttgtttgccagtgccccagtggaatgactttagat
gcttctggacgaacttgtcttgatattcgcttggagagttgctacctgcagcacgaggac
gagcagtgcaccgcccagatcccgggccggcaccgcatggacgcctgctgctgctctgtg
ggggcagcctggggctacgagtgtgaggagtgtcctctcaggggaactcctgagtttgaa
gctctttgcccaaggggacctgggttctctacgaagatagagataagtgggaagcccttc
tctaaagacatcaatgaatgcaaaatgttccccagcctttgtacccatggaaaatgcaga
aataccattggcagttttaagtgtagatgtgacagtggatttgcccttgattctgaagag
aggaactgcacagatatcgatgaatgccgcatctctcctgacctttgtggccaaggcatc
tgtgtcaacactcctggagactttgagtgtgaatgttttgaaggctatgaaagtggattt
atgatgatgaaaaactgcatggacatcgacgagtgtcagcgcaacccccttctctgccga
ggtggcacctgcatcaacacagagggaagttttcggtgtgattgtcctccaggccaccag
atatcaccaaatatctctgcatgtgtagacattaatgaatgtgagctgagcaccaacctg
tgccgaaatggccgttgtgtcaacctgattggaaagtatcagtgtgcttgcaaccctggc
tatcagtccacacaagacaagctatactgtgtcgatatcgatgagtgcagtataatgaat
ggtggctgtgagaacttctgcacaaactcagagggcagctatgaatgtagctgtaaacaa
ggctttgcactcatgccagaccacaggacatgcactgatattgatgaatgtgaagacaat
cctaacatctgtgatggaggccagtgtacaaacatcccaggagaatacaggtgtctttgc
tatgatggattcatggcatctgaagacatgaagacttgcatagatgttaatgagtgtgat
ctgcatccaaacatctgtctgagtggaacctgtgagaatacaaaaggctcctttatctgt
cactgtgatatgggatattcaggcaagaaaggcacaactggttgcacagatatcaatgag
tgtgaaattggagcccataactgcgacagacacgccatatgtacaaacacagcaggaagc
ttcaaatgtagctgcagccctggctggattggaaatggcatcaagtgcacagatctggat
gagtgctccaatggaacccacatgtgcagcccacatgctgactgcaagaacacgatgggc
tcttaccgctgcctgtgtaaagaaggttacactggggatggtttcacttgtacagacctt
gatgaatgctcagaaaacttgaacctctgtgaaaatgggcagtgcctcaacgcccctgga
gggtatcgctgtgaatgcgatatgggatttttgccaagtgtagatgggaaagcatgtgaa
gatattgatgagtgctcacttcctaacatctgtgtctatggtacttgtcataacctccct
ggactcttccgatgcgagtgtgaagtgggctacgagttggacagaagtggtggtaactgc
acagatgttaatgaatgtgcagaccctacaacctgcattagtggcacgtgtatcaacact
gctggtagctacacctgtgagtgccctcctgatttcgagctgaatcccacccgagttgga
tgcgttgatacacgatctggcaactgttacctggacatcaaaacgcggggagataacggt
ggcaccttctgcagcaatgagattggagtgggtgtttccaaggcctcctgttgctgctcc
ctgggcaaagcctggggagttccctgtgagcactgcccactggtgaacacaactgagtat
aaggttctttgccctggaggggaaggattccgaccaaaccctattacagttatattggaa
gatattgatgaatgtcaagaactgcctggactttgccaaggaggaaaatgcattaataca
tttggtagcttccagtgtcagtgtccatcagggtactacttgaatgaagagactcgagtg
tgtgatgatgtgaatgagtgtgagacacctggcatttgtgggccaggcacatgttacaat
actgttgggaactacacctgcatctgtcctcctgattacatgcaagtcaatggaggaaac
aactgcatggatatgagaagaagtctgtgttacagaaattactatgctgacaatcaaacc
tgtgatggtgagctgctcttcaatatgaccaagaaaatgtgctgctgttcctacaacatt
gggcgtgcatggaataagccttgtgaacagtgtcctatcccgagcacagatgaattctcc
acactgtgcggaagtcaaaggcctggcttcttcattgacatttatacaggattaccagtt
gatattgatgaatgcagagagattcctggagtgtgtgaaaatgggatctgtataaacatg
gttggcagcttccgatgcgagtgtcctgtgggtttcttctacaatgacaagctcctgatc
tgtgaagatattgatgagtgccagaacggaccagtttgccagcaaaacgcagagtgtgtg
aacacagctgggagctaccgctgtgactgcaaacctggctacaggttcacgtccacgggg
cgctgcactgatcggaatgaatgtcaagaaattcccaatatctgcagccatgggcagtgt
atcgacactgttggaagtttctactgcatttgtcacaacggattcaaaaccaacgatgac
aggacaatgtgtatagatattaatgagtgtgagagagacgcctgtggcaacggaacctgc
aggaacaccattggctccttcaactgccgctgcaacctgggcttcatcctctcgcacaac
aacgactgcatagacgtggatgagtgtgcaagtggaaatggaatgctctgcagaaatggt
cagtgtgtgaacaccattgggtccttccagtgtctctgcaatgatggctatgaggtggct
ctggatggaaggacttgtgttgatatcaatgagtgtgcactggagcctggaaaatgctca
ccaggcacatgtcagaacttggatggctcgttcagatgcatctgtcctcctggatacatc
ctgcagaatgacaaatgtgaagacattgatgagtgtgtggaacagccagaaatttgtgcc
ctggggacatgcagcaacactccaggcagtttcaagtgtctgtgtccagaaggctttgta
ttgtcttccacaggaaggcgatgccaagacctgagagtgagctactgctttaccaagttt
gaagatggaaaatgttctgtgccgaagtcccgaaaccactccaaacaagagtgttgctgt
gccttaaaggggcagggatggggagatccctgtgagctctgcccagaagaagcagatgag
gcattcagacagatttgtccatttggaattggcatccttgttggacctggtgacgcaaga
ctggatgtggatgagtgccttgatcctgataactgtaaatttgggcagtgtatcaacaca
gatgggtctttccgctgtgaatgtccatatggttacatcctacaaggagcagaatgtgtg
gatactgatgaatgtgctgttggaaacccatgtggaaatggaacttgcaggaatgtgata
ggaggcttcgaatgcacctgtgtagaaggatttgagcctgggccaatgatgacctgtgaa
gatgtcaatgagtgcattcagaaccccctgctctgcgctttccgctgcgtgaacacgttt
ggatcctacgagtgcaagtgccccggggggtacgttctgcgggaggaccggagaatgtgc
agagatcagaatgagtgtgaagaaggaattcacgactgtgactcaaaacagatggaatgc
aaaaacctaattggcacctatatgtgtatctgtgggcctggttatcagcgcagaccagat
ggggaaggctgtatagatgagaatgaatgtcagaccaaacctgggctctgcgagaacggc
cgttgtgtgaacacagtggggagctacaggtgtgagtgcaacgagggattcaccgtcagt
gacacccaggacgagtgccttgatgtcactctctcgttcttactgctggtagtctttcac
tctcagttccacagtctcaggacaacagggagggctactgcttcaccgaagtcttacaaa
gtatgtgccaaatcggatcgagcaacaggaacgctgtcaccaagtctgaatgctgctgtg
acagtggccgaggctgggggcagaactgtgaggtctgtcccttcccaggcaccgtggcct
tcaagaaactttgccctcatggccgaggatacacatccagtggagcagatattgatgagt
gcaaggttattcacgacgtctgccgcaacggggagtgcatcaacgagaggggaacttacc
gctgtctttgcaatctgggctacaccacagatatcactggcactctttgtgttgatctga
DBGET
integrated database retrieval system