Candidiatus Paracoxiella cheracis: ACJMKR_07645
Help
Entry
ACJMKR_07645 CDS
T10945
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
cchr Candidiatus Paracoxiella cheracis
Pathway
cchr01501
beta-Lactam resistance
cchr01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cchr00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
ACJMKR_07645
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
ACJMKR_07645
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cchr02000
]
ACJMKR_07645
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
cchr01504
]
ACJMKR_07645
Transporters [BR:
cchr02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
ACJMKR_07645
Antimicrobial resistance genes [BR:
cchr01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
ACJMKR_07645
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
HeH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XQW90292
LinkDB
All DBs
Position
complement(1469270..1472350)
Genome browser
AA seq
1026 aa
AA seq
DB search
MRLPEICIRQPVLAIVLSLVLVVLGIVGFHHLELRFFPKMQLPVVTVRTEYEGASSALME
SQVTTKIENALAGVDNVASISSSSWQGGSSVTVLFRLGGNFEEEASSVRDQVFAIRDKLP
TDAQPPTITVGTKGNPVLGIGFIDPEKKSPDIRDYVERSVQPLLRQLPGVGEVDILGASD
YAMRIWLDASKMASHGVTVTDIKKALTANNIYFPAGSIQGPKRNYSIISKTQLENANAFS
NIIIKHTNGGTVRFKDIGHVELGYRSLYNAPMRINGQNGIELMIKPLQDANPITVAQEVK
SELTLIHKNLPPVMSASVNYDASMFLKSSIDETFWAIGEAVILVILVVFLFLGSARAASI
PIVTIPVSLMSVFAVISLLGFSINIMSLLGIVLAIGLVVDDAIVMLENIHRHIEQGLTPF
QAAIKGSREIAFALIAMGLTLVAVYAPVGFVQGFTAGLFKEFAFTLAGAVVISTFVALTL
SPMMCSRVLLPRTSDTGFVVYIDRLFLKLSTVYHRFLKMALNRRKFVVLGLIVIAVIGYG
LFKSLSSELIPKEDIGLIQVSLTAPSGASLNYTDQYAEQVEAIIRKNPAVKSVMTQVWSD
GTNINVTLKPWGQRKLSTSQVVQQLNPQLAQIPGVDATAFVPDVVDYGLQGSDINLNFMT
SEGAYTDLLPSIDGMMKILKHYPGLIDVQTNLKFNTQQYAITIKRDLAAVLGVNIQDIAD
TVSAMMSGNHWTDVQAGNKSYEVIVQMEKKYLENFDALKKLYVRTSSDVNGDATGSTKMI
PVSSLINLTPMVGQGTLRHYDRFRSGTISARLAPGYSESQAINYIQSHIQGVLKPGVSYA
FSGKSQQFLESSGSIIGIIVMSLLFIYLVLSAQFGSFIDPFVILLAVPLCIVGALLSLKI
TGGTLSIYSQIGVVTLIGLITKHGILITQFINDLRKKGANIQEAIIKGATIRLRPILMTT
SAMVFGALPLALAHGPGSIGRHQIGWVIVGGLIFGTFFSLIVVPIAYSYLGQFKRIKLLD
SKSKYH
NT seq
3081 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagattacctgaaatctgcatacgccagcccgttttggcaattgtactcagtttagtg
ttggtcgtactgggcattgttggcttccatcatctagaattgcgtttttttcctaaaatg
caattgccagttgtgactgtgcgcaccgagtatgaaggtgctagttcagcattaatggaa
agtcaggtaacaacgaaaattgaaaatgccttggcaggtgttgataacgttgcgtcgatt
agttcgagtagttggcaaggaggcagctccgttactgttttatttcgactgggcggaaat
tttgaagaagaagcgagttctgttcgcgaccaagtttttgcgattcgcgataaattaccg
acggatgcacaacctcccacaattaccgtcggtacaaaaggcaatcccgttttaggtatt
ggttttatcgatccagaaaagaaatcgccggatattcgtgattatgttgaacggtcggtg
caaccgttattacgtcaattgccgggtgtcggtgaggttgatattttaggcgccagtgat
tatgcgatgcgtatttggttggatgcctctaaaatggcttcgcatggtgtcacggtgacc
gatattaaaaaagcactcaccgctaacaacatttattttccggcgggatccattcaagga
ccaaagcgaaattatagtattatttcaaaaacgcagttggaaaacgccaatgcattttcc
aatattattataaaacatactaatggtggtacggttcgctttaaagatatcggtcatgtg
gaactgggttatcgcagtctttataacgcgccgatgcgcattaatggccaaaatggtatt
gaattgatgataaaacctttgcaggatgcaaacccgattactgtggcgcaagaagttaag
agtgaattaacactcattcataaaaatttaccgccggtcatgagcgcctctgttaattac
gatgcctcaatgttcttaaaatcatccattgatgaaacgttttgggcaattggcgaagct
gttattttagtcatattggttgtgtttttatttctagggtcagcgcgcgcggcgagcatt
cctatcgtcacgattcctgtcagtttaatgagtgtcttcgcagttattagtttgcttgga
ttttcgatcaacatcatgtcgctgctgggtattgtgttagctattggtctggtggtggat
gatgcgattgtcatgctcgaaaatattcatcggcatattgagcagggtctgacaccgttt
caggccgcgattaaaggcagtcgcgaaattgcatttgccctcattgcgatgggtctcact
ttggtggcagtgtatgcgcccgtgggttttgtacaagggttcacagcgggattatttaaa
gaatttgccttcacactagcaggagcagtagtaatttctacttttgtggcgttaacactt
tcaccgatgatgtgttcacgtgttttattgccgcgcacttccgatactgggtttgttgtc
tatatcgatcgcttgtttttgaaattatcgacagtttaccaccgttttttaaaaatggca
ttaaaccgacgcaagtttgtggtgttaggtttaatcgttattgctgtcattgggtatggt
ttatttaagagtctgtcgtcggaattaattcctaaagaagatattggattgatacaagtt
agtttgacggcgccatcgggcgcaagcttgaattatacggatcaatatgcagagcaggtt
gaagcgatcattcgaaaaaatcccgcagtaaaaagtgttatgacgcaggtgtggagtgat
ggaactaatattaacgtcacattgaaaccatggggacaacgcaagctcagtacatcacaa
gtggttcaacaattaaatccgcaactggcgcaaattcctggtgtggatgctactgcgttt
gtgccggacgttgtcgattatggattgcagggtagtgatatcaaccttaattttatgact
tcagaaggtgcttacacggatttattgccatcaattgatgggatgatgaaaattttaaaa
cactatcccggcttgatcgatgtgcaaacaaatttaaaatttaatacacaacaatatgcc
atcacgattaagcgtgatttggccgctgttttgggtgttaatattcaagatattgccgat
acggtcagcgccatgatgagcggtaaccattggacagatgttcaagccgggaataaaagc
tacgaagtcatcgtgcaaatggaaaaaaaatatttggagaattttgatgcgctgaaaaaa
ctgtatgtgcgcaccagcagcgatgtcaatggcgatgccactggatccactaaaatgatt
cccgtatcgagtttaattaatctgacgccgatggttggacagggaacgttaaggcattat
gatcgttttcgttcggggacgatatcggcacgtttagcgccgggttattcggaaagccaa
gctattaattatatacaatcgcacatacaaggtgttttgaagcccggtgttagttatgca
ttttccggtaaatcacagcagtttctcgagtcctcgggcagcattattggcatcattgtg
atgtcattattgtttatttatctcgtgttatcggcgcaattcggtagttttatcgatccg
tttgttattttattggcggtgccattatgtattgtcggcgcgttattgtccttaaaaata
actggaggcactcttagcatctattcacaaatcggtgtggtaacgctgattggattaatt
accaaacacggtattttaatcacgcagtttattaacgacctgcgtaaaaagggcgcgaac
atacaggaagcgattataaaaggcgccaccattcgtttgcgccctatattaatgacgaca
tcggctatggtgtttggtgccttgccgttagccttggcgcatggtcctggttctatcggc
cgacatcaaatcggctgggtgatcgtgggtggtttgatctttggaacgtttttctcgtta
atcgttgtgccgattgcctattcctatttagggcaatttaagcggattaaactgcttgat
tctaaatcaaaataccactaa
DBGET
integrated database retrieval system