KEGG   Candidiatus Paracoxiella cheracis: ACJMKR_07645
Entry
ACJMKR_07645      CDS       T10945                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
cchr  Candidiatus Paracoxiella cheracis
Pathway
cchr01501  beta-Lactam resistance
cchr01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cchr00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    ACJMKR_07645
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    ACJMKR_07645
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:cchr02000]
    ACJMKR_07645
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:cchr01504]
    ACJMKR_07645
Transporters [BR:cchr02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   ACJMKR_07645
Antimicrobial resistance genes [BR:cchr01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    ACJMKR_07645
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL SecD_SecF_C HeH
Other DBs
NCBI-ProteinID: XQW90292
LinkDB
Position
complement(1469270..1472350)
AA seq 1026 aa
MRLPEICIRQPVLAIVLSLVLVVLGIVGFHHLELRFFPKMQLPVVTVRTEYEGASSALME
SQVTTKIENALAGVDNVASISSSSWQGGSSVTVLFRLGGNFEEEASSVRDQVFAIRDKLP
TDAQPPTITVGTKGNPVLGIGFIDPEKKSPDIRDYVERSVQPLLRQLPGVGEVDILGASD
YAMRIWLDASKMASHGVTVTDIKKALTANNIYFPAGSIQGPKRNYSIISKTQLENANAFS
NIIIKHTNGGTVRFKDIGHVELGYRSLYNAPMRINGQNGIELMIKPLQDANPITVAQEVK
SELTLIHKNLPPVMSASVNYDASMFLKSSIDETFWAIGEAVILVILVVFLFLGSARAASI
PIVTIPVSLMSVFAVISLLGFSINIMSLLGIVLAIGLVVDDAIVMLENIHRHIEQGLTPF
QAAIKGSREIAFALIAMGLTLVAVYAPVGFVQGFTAGLFKEFAFTLAGAVVISTFVALTL
SPMMCSRVLLPRTSDTGFVVYIDRLFLKLSTVYHRFLKMALNRRKFVVLGLIVIAVIGYG
LFKSLSSELIPKEDIGLIQVSLTAPSGASLNYTDQYAEQVEAIIRKNPAVKSVMTQVWSD
GTNINVTLKPWGQRKLSTSQVVQQLNPQLAQIPGVDATAFVPDVVDYGLQGSDINLNFMT
SEGAYTDLLPSIDGMMKILKHYPGLIDVQTNLKFNTQQYAITIKRDLAAVLGVNIQDIAD
TVSAMMSGNHWTDVQAGNKSYEVIVQMEKKYLENFDALKKLYVRTSSDVNGDATGSTKMI
PVSSLINLTPMVGQGTLRHYDRFRSGTISARLAPGYSESQAINYIQSHIQGVLKPGVSYA
FSGKSQQFLESSGSIIGIIVMSLLFIYLVLSAQFGSFIDPFVILLAVPLCIVGALLSLKI
TGGTLSIYSQIGVVTLIGLITKHGILITQFINDLRKKGANIQEAIIKGATIRLRPILMTT
SAMVFGALPLALAHGPGSIGRHQIGWVIVGGLIFGTFFSLIVVPIAYSYLGQFKRIKLLD
SKSKYH
NT seq 3081 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagattacctgaaatctgcatacgccagcccgttttggcaattgtactcagtttagtg
ttggtcgtactgggcattgttggcttccatcatctagaattgcgtttttttcctaaaatg
caattgccagttgtgactgtgcgcaccgagtatgaaggtgctagttcagcattaatggaa
agtcaggtaacaacgaaaattgaaaatgccttggcaggtgttgataacgttgcgtcgatt
agttcgagtagttggcaaggaggcagctccgttactgttttatttcgactgggcggaaat
tttgaagaagaagcgagttctgttcgcgaccaagtttttgcgattcgcgataaattaccg
acggatgcacaacctcccacaattaccgtcggtacaaaaggcaatcccgttttaggtatt
ggttttatcgatccagaaaagaaatcgccggatattcgtgattatgttgaacggtcggtg
caaccgttattacgtcaattgccgggtgtcggtgaggttgatattttaggcgccagtgat
tatgcgatgcgtatttggttggatgcctctaaaatggcttcgcatggtgtcacggtgacc
gatattaaaaaagcactcaccgctaacaacatttattttccggcgggatccattcaagga
ccaaagcgaaattatagtattatttcaaaaacgcagttggaaaacgccaatgcattttcc
aatattattataaaacatactaatggtggtacggttcgctttaaagatatcggtcatgtg
gaactgggttatcgcagtctttataacgcgccgatgcgcattaatggccaaaatggtatt
gaattgatgataaaacctttgcaggatgcaaacccgattactgtggcgcaagaagttaag
agtgaattaacactcattcataaaaatttaccgccggtcatgagcgcctctgttaattac
gatgcctcaatgttcttaaaatcatccattgatgaaacgttttgggcaattggcgaagct
gttattttagtcatattggttgtgtttttatttctagggtcagcgcgcgcggcgagcatt
cctatcgtcacgattcctgtcagtttaatgagtgtcttcgcagttattagtttgcttgga
ttttcgatcaacatcatgtcgctgctgggtattgtgttagctattggtctggtggtggat
gatgcgattgtcatgctcgaaaatattcatcggcatattgagcagggtctgacaccgttt
caggccgcgattaaaggcagtcgcgaaattgcatttgccctcattgcgatgggtctcact
ttggtggcagtgtatgcgcccgtgggttttgtacaagggttcacagcgggattatttaaa
gaatttgccttcacactagcaggagcagtagtaatttctacttttgtggcgttaacactt
tcaccgatgatgtgttcacgtgttttattgccgcgcacttccgatactgggtttgttgtc
tatatcgatcgcttgtttttgaaattatcgacagtttaccaccgttttttaaaaatggca
ttaaaccgacgcaagtttgtggtgttaggtttaatcgttattgctgtcattgggtatggt
ttatttaagagtctgtcgtcggaattaattcctaaagaagatattggattgatacaagtt
agtttgacggcgccatcgggcgcaagcttgaattatacggatcaatatgcagagcaggtt
gaagcgatcattcgaaaaaatcccgcagtaaaaagtgttatgacgcaggtgtggagtgat
ggaactaatattaacgtcacattgaaaccatggggacaacgcaagctcagtacatcacaa
gtggttcaacaattaaatccgcaactggcgcaaattcctggtgtggatgctactgcgttt
gtgccggacgttgtcgattatggattgcagggtagtgatatcaaccttaattttatgact
tcagaaggtgcttacacggatttattgccatcaattgatgggatgatgaaaattttaaaa
cactatcccggcttgatcgatgtgcaaacaaatttaaaatttaatacacaacaatatgcc
atcacgattaagcgtgatttggccgctgttttgggtgttaatattcaagatattgccgat
acggtcagcgccatgatgagcggtaaccattggacagatgttcaagccgggaataaaagc
tacgaagtcatcgtgcaaatggaaaaaaaatatttggagaattttgatgcgctgaaaaaa
ctgtatgtgcgcaccagcagcgatgtcaatggcgatgccactggatccactaaaatgatt
cccgtatcgagtttaattaatctgacgccgatggttggacagggaacgttaaggcattat
gatcgttttcgttcggggacgatatcggcacgtttagcgccgggttattcggaaagccaa
gctattaattatatacaatcgcacatacaaggtgttttgaagcccggtgttagttatgca
ttttccggtaaatcacagcagtttctcgagtcctcgggcagcattattggcatcattgtg
atgtcattattgtttatttatctcgtgttatcggcgcaattcggtagttttatcgatccg
tttgttattttattggcggtgccattatgtattgtcggcgcgttattgtccttaaaaata
actggaggcactcttagcatctattcacaaatcggtgtggtaacgctgattggattaatt
accaaacacggtattttaatcacgcagtttattaacgacctgcgtaaaaagggcgcgaac
atacaggaagcgattataaaaggcgccaccattcgtttgcgccctatattaatgacgaca
tcggctatggtgtttggtgccttgccgttagccttggcgcatggtcctggttctatcggc
cgacatcaaatcggctgggtgatcgtgggtggtttgatctttggaacgtttttctcgtta
atcgttgtgccgattgcctattcctatttagggcaatttaagcggattaaactgcttgat
tctaaatcaaaataccactaa

DBGET integrated database retrieval system