Chrysoperla carnea: 123299655
Help
Entry
123299655 CDS
T09255
Name
(RefSeq) nuclear pore membrane glycoprotein 210
KO
K14314
nuclear pore complex protein Nup210
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Pathway
ccrn03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
123299655
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ccrn03019
]
123299655
Messenger RNA biogenesis [BR:
ccrn03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
123299655
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_NUP210_2nd
Ig_NUP210_1st
Ig_NUP210_15th
Ig_NUP210_9th
Big_2
Ig_NUP210_7th
Ig_NUP210_3rd
Ig_NUP210_4th
Ig_NUP210_6th
NUP210_Ig
HL_N-beta
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123299655
NCBI-ProteinID:
XP_044737872
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(45090171..45102206)
Genome browser
AA seq
1962 aa
AA seq
DB search
MARRKYLLLFMILINLFIKQIESSKLNVPRILLPLFNDLSVNFTLEVTDGGCYKWSTSRL
DLVQLIPLNLDEERRCSAAVIVSTISRDAVRNTAMILAEEVQTEQILRCDVILDVIDSLK
IVTTTRELYMEEAPEAFEVRAYDDQGNEFSSLEGIPFQWSLFSHCSGKEKCHDSPVLRFL
TFKESPYETPHSIQAFEELGIQGHIVLLEGVKTGVAKVSVGLPQTEYRHIKPSEVVLMIV
ANIIILPPEVYILPNSEIKFRVYRMYQNKLEEIIMPNNQYYFGVQDQSVALLGTNGLIQG
LTVGKTRVTVNDKNMDPSESNVKLPSALVSVVYPAYLVINILPHRNWAVLLRDSHEIMVE
AFCSQDHKIHLGDEVEVNIQIDPAYYQVTQRSNNGTWLTGYGIEHGFTTVHASLESVNLR
RLDTKVSVRSDLYIYPRIVLTPTEIILPWDPIVKPKYEVKLKATGGDGHFLWSTTNAGVA
VVTQGGVVRTQSQGTAQISAAMARNHNNRKTSKVYIIPPTRLEIIEYILEAEINKPINLQ
IALYGIRGSQTKDEVPFTQCGEIPFKVTSTDENFFYNETKVLQPVGTACTTIQIVGLIVG
TSKITVSYEYQGILLEDSVTVSAFQPLTILHPVKAETILAVGTSRNIILQGGPKPWIGRL
AEYNRSVIVNTDNVEACDITDSITEKKADVFVVNVRCLSIGESIVDISIVNTPMVSTSCS
SIASIASIRVICSKPRIIRIKPEVEIVDTHSCPMDLNSQKIAVHNYQNIELTVLVKDEQG
RIFDNISSLALHWQLVPSTGGSIFFKDGYKEETIKEYNVDLPKRYYQIIQPSKQIGNLDI
TSIIEGYKKNILSQQKINTDIKELSKDFGCTGVCPPNVIPTIFTALTFFLVGDVELSATK
ISIYNHPSNVQYLNIKQGSGYYELALSSKDIAHVKFNEGNREMEITPKATGELKISVTDI
CLPSRSVQILVQVVSVKSIKVDMPDRVEIGKCIKATLKFYDDSDILLPLPPLELLELRHT
IDSSIISVKQAIGTSGSGCTGTCSMSTKTDESSVGEIPYIITGLELGEAKLSFTTGHGPR
IVKSNPISIQVFRPIKILPRNITLIVSSMLQLNYEGGPSPDANIDFITENSKIATVQSNG
LVEAQEFGKTKILGQATGVNSCSGQKVLFSKDSIQVNVVKLTGIKIGAPLARFKVGNTVP
VWALGIPEQITPLILGTTSLPITYEWQVIPEEIASINTVFNGDGIKYNKEEQVTMQLTGL
APGRAKVILTANVHCKILGLDCVLKNCYRKLETSLDIEIFERLLVSPPPKMVHQELLLAP
YSTFQITSNKDRTCQVAYSVQQDVSPGAMVANEKSIGFANVVVSVTPTGMVKSYGIYGRA
VIVVTAVEEFGLKQSITIVVEVKPVHYMLPHIHSSINILKGQYINDIPRGVDIHLEITYH
DNTGDKFVAVQNNLKIRTSRSDLATVRRGTDNTTLIANLQRTGDTVLKIWDDAYTLRVMD
YLKFHVGNVIRPASPKLTVGDVVCFFSPLTSPDGAYGKWSAQSPFLEDGKKDGVMVAVKS
RERPISIGYTIGGMQTTNDVHVSPINRIRFLSENTCACLSNSFRLSVEEIPLVLYGPLDT
IDKVKNLITAEKCNSKFDYEITRFPYTCEIEFTNKNTETSIEDLFNVEPSFNFNTGQYSC
KIITLRDSELNTSLLSNNITVRAISNGIKDEAKLSFIPGVFIDNSYLYISPDHRTGYILI
HGVASVLKNLKVIPVDSELLDVYHSSSPAYTTKRFDIALKDVGANQITDDKMGVIVISEM
TKQKIKVNVISDGTTFEGSASSLEWGSPLMERIWNLRQVFAITASLIGIFLASLYGYSNY
IQPIINVNVQAARPPIVDGSPKNTSMYNYPGRGTGAPGPFSKFSPSSSPVNRSGTSPNCY
GAPINLTPRKTLYTSYDSPNLSNISPPRQTNYEELRNRAFNK
NT seq
5889 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgcgtagaaaatatttactacttttcatgatattaataaatttatttattaaacaa
atagaaagttcaaaactaaatgtaccacgtattttgttaccattatttaatgatttatca
gtaaattttacgttagaagttactgacggcggatgttataaatggagtacatcaagacta
gatttagtacaactaatacctttaaatttagacgaggaacgaagatgttccgcagcagtt
attgtttcgactatttcaagggacgctgttcgcaatacagctatgattttggctgaagaa
gtacaaactgaacaaattttaagatgcgatgttattttggatgttattgatagtttaaaa
attgttacaactacacgagaattatacatggaagaggctcctgaagcttttgaagttcga
gcatatgacgatcaaggcaacgaattcagttccttggaaggcataccgtttcaatggtca
ctcttttcgcactgctctggtaaagaaaaatgccatgatagtcccgttttacgttttcta
acatttaaagaatctccatatgagacaccacattcaattcaagctttcgaggaattagga
attcaaggacatattgtgcttttggaaggagttaaaactggtgttgccaaagtttctgtt
ggccttccacaaacagagtacagacatataaaaccctcagaggttgtattaatgattgtt
gctaacattattatattacctcctgaagtgtatattttaccaaattccgaaattaaattt
cgagtatatagaatgtaccagaacaagttagaagaaattataatgccaaataatcaatat
tattttggtgttcaagatcaaagtgttgcccttcttggaacaaatggattaattcaaggc
cttactgttggcaaaacaagagttaccgtgaacgataagaacatggatccatccgaatct
aatgtaaaattaccttcagcattagtatctgtagtttatcccgcatatctagtcattaat
attctaccacatcgaaattgggctgtacttttacgagattcacatgaaattatggtggaa
gcattctgcagtcaagatcataaaattcatttaggcgatgaagttgaagttaatattcaa
attgatccagcatattaccaagtaacacaaaggtccaataatggtacatggcttacagga
tacggtattgaacatggatttacaacagttcatgcttctttagagtccgtaaatttacga
cgcttagatacaaaagtatcagttcgtagtgatctatatatttatcctcgtattgtgcta
acacccactgaaatcattttaccatgggatccaattgttaaaccaaagtatgaagtaaaa
ttaaaagcaacaggtggggatggacactttttgtggagtacaacaaatgctggtgttgct
gtggttactcaaggcggagtcgttcgaacacagtcacaaggaacagctcaaatttccgcg
gcgatggcaagaaatcataataatcgcaagacttctaaagtgtatataataccccccaca
cgattagaaatcattgaatatattttagaagctgaaataaataaacccattaatttacaa
atcgctttatatggaatacggggttctcaaacaaaagatgaagttccattcacccaatgc
ggtgaaataccatttaaagtgacgtcgactgacgaaaatttcttttacaatgaaacaaaa
gttttacaacccgtcggcactgcgtgcacgacaattcaaatagtgggtttaatcgtagga
acgagcaaaattactgtcagctacgaataccaaggaattttattagaagatagtgttaca
gtatctgcatttcaaccgcttactatattgcatccagtaaaagccgaaactattttagct
gtcggtacaagtcggaatattatattacaaggtggtccaaaaccatggatcggtcgttta
gctgaatacaaccgttctgtaattgtaaatactgataatgttgaagcatgtgacattaca
gattcgataaccgaaaagaaagccgatgtttttgtagtaaatgttcggtgtttatctatt
ggagaatccatagtcgatatttcaatcgtaaacacaccaatggtttcaacatcctgttca
agtattgctagtattgcctcaattcgtgttatttgtagtaaacctcgaataattcgtatc
aaacccgaagtagaaattgttgatactcattcttgtccaatggatttaaattcacaaaaa
atcgctgtgcataattatcaaaatattgagctaactgttttagttaaagatgaacaagga
cgaatatttgataacatttctagtttagctttacattggcaattagttccatccactggt
gggagcatattttttaaagatgggtataaagaagaaactataaaagaatataatgtggac
ctaccaaaacggtattaccaaattattcaaccttcgaaacaaattggaaatcttgatata
acaagtatcattgaaggatataagaagaatatattatcccagcaaaagattaatacagat
ataaaagagttatctaaagattttggatgtacgggtgtatgtccacctaatgtgattcca
acaatttttacagctttgacatttttcttggttggagatgttgaattgagcgcgacaaaa
atttcaatttataaccatccaagtaacgttcaatatttgaatataaaacaaggatccggg
tattatgaactagctctaagctccaaagacattgcccatgttaaatttaacgaaggtaat
cgtgaaatggaaatcacaccaaaagcaactggggagttgaaaatcagcgtaactgacata
tgtttaccatctcgatcagttcaaattttggtacaagttgtatctgttaaatctattaaa
gttgatatgcctgacagagttgaaattggtaaatgtataaaagctacccttaaattttac
gatgattccgatatattgttaccgctacctcctttagaattacttgaattacgtcatacg
attgattcaagtattataagtgtaaaacaggctattggtacttcggggagcggttgcaca
ggaacttgttcaatgtcaaccaaaaccgatgaatcatctgttggtgaaattccatatatt
ataacaggacttgaattaggtgaagcgaagttatcattcacaacaggtcatggtccgcgt
attgttaaaagcaatccgataagtattcaagtttttcgcccaattaaaattttaccaaga
aatataactcttatagttagttcaatgctgcaattaaattatgaaggtgggccatcacca
gatgctaatattgattttatcactgaaaatagtaaaattgccactgttcaatcgaatggg
ttagttgaagcgcaagaattcggtaaaacaaaaattttaggacaagctactggtgtaaat
tcttgttcgggccaaaaagttttattttcaaaagattccattcaagtaaatgttgttaaa
ttaactggaattaagattggtgcaccattggctcgttttaaggttggtaatacagttcca
gtttgggcgcttggtatacctgaacaaataactccattaattttgggtacaactagtttg
ccaataacatacgaatggcaagtgatacctgaagagatagcatcaataaatacagttttc
aatggtgacggaattaagtataataaagaggaacaagttaccatgcaattgacaggccta
gcaccaggtcgagctaaagtaattttaacagcaaatgttcattgcaaaattcttggtttg
gattgtgtgcttaaaaattgttaccgaaagctagaaactagtttagatattgaaattttt
gaacggttattggtatccccgccgccaaaaatggtacatcaagaattacttttagcccca
tattcaacattccaaattacttcgaataaagatcgtacttgtcaagtggcatactcagta
caacaagatgtatcacctggagctatggtggctaatgaaaaatcaataggatttgcaaat
gttgtagtgtctgttacacctactggaatggttaaatcatatgggatttatggtcgagct
gttattgtagtaacagctgttgaagaatttggattaaaacaatccatcacaattgtggtc
gaagtgaaacctgtacattacatgttaccccatatccattcatcgataaatattctcaaa
ggacaatatattaatgatattccacgaggtgttgatatccatttggaaatcacgtatcat
gataatacaggtgataaatttgttgccgtacaaaataatttaaaaattcgaacaagtcga
tcggatttagccacagtacgtcgtggtacagataacacgacactgattgcaaatttacaa
cgtacgggggatacagttcttaaaatttgggatgatgcttatacattacgtgtaatggat
tacttaaaattccatgttggaaatgttattcgaccagcatcaccaaagttaactgttggc
gatgttgtttgtttcttttcacctttaacatcaccagatggtgcttatggtaaatggtca
gctcaaagtccattcttagaagatggtaaaaaagatggtgttatggttgctgttaaatca
cgggaacgaccaataagcattggatatacaattggtggaatgcaaactaccaacgatgtt
cacgtatcaccaattaataggattcgtttcttgagtgaaaatacatgtgcgtgtctatca
aattcgttccgattatcggttgaagaaattcctttggtcctgtacggtccattggataca
attgataaagtgaagaatttaatcacagctgaaaaatgtaactcaaaatttgattatgaa
attacacgattcccatatacttgtgaaattgagtttaccaataaaaatacggaaaccagc
attgaagatttatttaatgtagagccgagtttcaattttaacacaggccaatattcatgt
aaaattataacacttcgtgattcagaattgaatactagtttattatcaaataatataact
gtgagagccatcagtaatggaattaaagatgaagcaaaattatcattcatacctggtgta
tttattgataacagttatttatacatatcaccagatcatcgaaccggatatatattaata
catggtgtagcatctgttcttaaaaatttaaaagtaattccagttgatagtgaattatta
gatgtataccattcatcaagtcctgcatacactacaaaacgtttcgatattgcattaaaa
gatgtgggcgcaaatcaaataacagatgataaaatgggcgttatagtgatatcagaaatg
accaaacaaaaaattaaggtgaatgttatatctgatggaaccacgtttgaaggctcagca
agttctctagaatggggttccccccttatggaaagaatatggaatttacgtcaagtattt
gctattactgcctctttaattggcatattcttagcatcactttatggatattccaactat
atccaaccaattataaatgtcaatgttcaagcagcgaggccaccgatagttgatggatca
ccaaaaaatacatctatgtacaattatccaggtcgaggaactggagcacctggtccattc
tctaaattttcaccatcatcatcaccggtaaatcgaagtggaacatcaccgaattgttat
ggagctcctataaatttaactcctagaaaaactttatacaccagctacgattcaccaaat
ttatccaatatatcgccaccaagacaaacgaattatgaagaattaagaaatcgtgcattt
aataaatag
DBGET
integrated database retrieval system
