Clostridioides difficile CD196: CD196_2250
Help
Entry
CD196_2250 CDS
T00997
Name
(GenBank) putative multidrug efflux pump, membrane protein
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
cdc
Clostridioides difficile CD196
Pathway
cdc01501
beta-Lactam resistance
cdc01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cdc00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
CD196_2250
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
CD196_2250
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cdc02000
]
CD196_2250
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
cdc01504
]
CD196_2250
Transporters [BR:
cdc02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
CD196_2250
Antimicrobial resistance genes [BR:
cdc01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
CD196_2250
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBA64314
UniProt:
A0A0H3N8Z0
LinkDB
All DBs
Position
2610156..2613290
Genome browser
AA seq
1044 aa
AA seq
DB search
MNLTQTSVKRPLTIIMVFLVLIVFGGIGYKKMSINLMPDIEIPVVMVMTTWTGAGPQDVD
EQVSQKVDESLSAVSNVKSTISSSQESVSMVVAQFEFGTNLDEIMNDVRSKVDALQTSLP
DDAAKPTVLKLDMNAQAIGQLVISGGNENSSQALRKYAEDVIQPKIESIDGVTSADLKGG
EKAQVNVIADPAVLSNYGVSLSTIKGVLSSSNKTFPYGSITQGEDKIVLRAIDKLESLDD
IKQIQIPVKGGNTVRLDNLCSVDYGYADKDSIYRYNGKDSLVIDISKQQDANTVKVMQSA
YKYVDELNKENPQFKIKIANDTSSYISESINSVMSNLLISAVIAFIVIFAFLKSVRASLV
VAVAIPISIIGAIAILYFTGESLNLITASSLVISVGMVVDNATVVIENIFKYRKSGRLSL
DDCAIEGTRTVTNAILASTLTTIAIFLPIMFTEGIAKITFGALGKTLIASLAFSFIGAIT
LVPSVFAKLSRGKNSQKMQEKDSPIFDKVSEAYKKLLSVCLRHQRLVVISSLLIFVASLF
GMGFIGMDFMPAADKGELSISIELPKGLSLESNDYYVSMTEKKVSDIPEIKTLITTLTSD
SNNSKASIAIELESQKNRKRTTDEIEKEIIDRVATVPDCKINVSQNSSVMGGAGGADFTL
EMKGPDLDVLKILGKEAEKEFSSIKGFRNVETSLTDTTQEAQFTIDKHKAQEYGVNTAEI
AGMLRTAINGDSVTTATIDDYKVDVNLKFKADTIDSLEDIKQLKVNSATGKEVPLGAFSD
IKMADGLQSISRTDGDFSVNITATLDNLDAGTATKLALEKTNKMVIPKDYSIGVGGETEM
MNESMASLGFSMVIAIALVYMVMVAQFESFSKPFIIMFCVPFAFVGVVLSLLVSGQSLST
VGMLGIILLIGIVVNNGIVLIDYIEQLRKTNRNNDLIGLVSIGCAARLRPVLMTTATTIL
GMLPTALSLGEGGETMQPLAIVIMGGLTVSTLITLVLIPTIYLIFDKWENKFSDKMPKIF
GKITDKIGSIKRKIIKKPKLKAKV
NT seq
3135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttaacacagacttccgttaaacgtcctctcacaatcataatggtctttttagta
ttaatagtttttggtggtattggatataaaaaaatgtcaataaatctaatgcctgatata
gaaataccagttgtaatggtcatgactacttggacaggtgctggtcctcaagacgttgat
gaacaagttagtcaaaaagttgatgaaagtttatctgccgtttcaaatgtaaaatctact
atatcaagttcacaagaaagtgtttctatggtagttgctcagtttgaatttggaactaat
ttggatgaaataatgaatgatgttaggtctaaagttgatgcattacagaccagcctccca
gatgatgcagcaaaaccaacagttttaaagctggatatgaatgcacaggctataggtcaa
cttgtcatatctggaggaaatgaaaatagttcacaagccttaagaaaatacgctgaagat
gtaattcagcctaaaatagaatccatagatggtgttacttcagcagaccttaaaggtgga
gaaaaagcacaggttaatgtaatagctgacccagctgttctttcaaattatggagttagt
ttatccactataaaaggtgtcttatcctctagtaataaaacattcccttatggttcaatt
actcaaggtgaggataaaatagttttaagagcaattgataaattagaatccctagatgat
ataaaacagattcaaattcctgtaaaaggaggaaatacagttagattagataatctttgt
agtgtagattatggatatgcagacaaagatagtatttatagatacaatggaaaagacagt
ttggtaatagatatttctaaacaacaagatgccaacactgtaaaagttatgcagagtgca
tacaaatacgtagatgaattgaataaggaaaatcctcaatttaaaattaaaattgctaat
gatacaagttcatacataagtgaatcaataaacagtgtaatgagcaacttgcttataagt
gctgttatcgcatttattgtaatatttgctttcctaaaaagtgtaagagcttcactagtt
gttgcagttgcaataccaatttctataataggtgctatagcaattctctactttactggt
gaaagtttaaatcttattactgcaagttcattggtaatttcagttggtatggttgttgat
aatgctacagttgtaattgaaaatatatttaaatataggaaaagtggcagattgagtctt
gatgattgtgctattgagggaacaagaactgtaacaaatgcaatacttgcatcaacattg
accacgatagcaatattcttacctatcatgtttacagaaggtatagctaaaataactttt
ggggcattaggtaaaacactaatagcttcactagcattctcctttataggtgcaattaca
ctcgttcctagtgtatttgcaaaattaagcagaggaaaaaatagtcaaaagatgcaagaa
aaagatagtcctatatttgataaggtaagtgaagcatataaaaaattattaagtgtatgt
ttaagacatcaacgcttagttgtaatatcaagtttacttatttttgtagcttccttattt
ggaatgggatttataggtatggactttatgcctgcagcagacaagggtgaattatctatt
tctatagaacttccaaaaggtcttagcctagaatccaatgattactatgtatctatgact
gagaaaaaagtctcagatattccagaaattaaaactttaataacaactttgacatcagat
tcaaataatagtaaagcaagtatagcaattgaattagaatctcaaaaaaatagaaaaaga
actactgatgaaatagaaaaagagataattgatagagtggctactgtaccagattgtaaa
ataaatgtaagtcaaaacagtagtgttatgggtggagctggaggagcagacttcacatta
gaaatgaaaggtcctgatttagatgtattaaaaatactgggaaaagaagctgaaaaagaa
tttagctctataaaaggatttagaaatgttgaaacttctcttacagatacaacacaagaa
gctcaatttactatagataaacataaggctcaagaatatggtgtaaatactgctgaaatt
gcaggcatgttacgtacagcaataaatggtgactccgtaaccactgctactattgatgat
tacaaagtggatgtaaacctaaaatttaaagcagatactattgatagcttagaagatata
aagcaactaaaagtaaactctgcaactggaaaagaagttcctcttggtgctttttcagat
ataaaaatggcagatggtctacaatctatatctaggactgatggagatttttctgtaaat
ataactgctacacttgacaatttagatgctggtactgctacaaaactagcactagaaaaa
acgaataaaatggtaattcctaaagattactctataggtgttggtggtgaaacagaaatg
atgaatgaatctatggcaagtcttggattttcaatggtcatagctatagcattagtttat
atggtaatggtagctcagtttgaatcatttagtaaaccatttataatcatgttctgtgtt
ccatttgcattcgttggagttgtgctttcgcttctagttagtggtcaaagtttaagtact
gtcggtatgctaggtataatcttacttatcggtattgttgttaataatggtatagttctt
attgactacatagagcaacttagaaaaacaaatcgtaacaatgatttaattggtttggtt
tcaattggttgtgcagcaagattaagaccagtcttaatgactacagcaacaacaatttta
ggtatgttgccaacagcactatctcttggtgaaggtggagaaactatgcaaccactagcc
atagttataatgggtggtctaactgtatctacacttataactttggtgcttatacctact
atatacttaatatttgataaatgggaaaataagttttcagacaaaatgcctaaaatattt
ggtaagataacagataaaataggaagtataaaacgtaaaataataaagaaaccaaaattg
aaagctaaagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
