KEGG   Chondrinema litorale: OQ292_03160
Entry
OQ292_03160       CDS       T09098                                 
Name
(GenBank) ABC transporter permease
  KO
K02004  putative ABC transport system permease protein
Organism
clit  Chondrinema litorale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:clit00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:clit02000]
    OQ292_03160
Transporters [BR:clit02000]
 ABC transporters, prokaryotic type
  ABC-2 type and other transporters
   Putative ABC transporter
    OQ292_03160
SSDB
Motif
Pfam: FtsX MacB_PCD PAS
Other DBs
NCBI-ProteinID: UZR94812
LinkDB
Position
769683..772079
AA seq 798 aa
MFWNNFKITLRSFLKQKKFTLIILTGLTLGLSACLFITVYVIHEKSYDHFWPKANQLVRV
PMTWHFGETSMPSGSATSEAGVMLKEELPEVLNFTRIRPGYGIVLKKDDKLFEEKEFVYA
DTAIISMFDLHLVKGNPETALKEPNSLVLTVSLAEKYFGANWNETNVIGTSLLVNNQTNY
LITGIVEDLPDNTHIQFSCIGSFASLNDYENPNWDNSEFATYALLTPEAAVNPTATIDKF
TDLITKKFGAESVSMVQLHMEPITDVYLYSEFHNALGKKSDIRYLYIFSAIGLLILIMAC
INYVNMTTALSLSRAKEVGIKKVAGAQRDQLFWQFMIESGTLIFSAFFLAILLLFLLKDW
FKDIASVNISTNLLIQPEILLPFVGLSLFMTFLSGIYPAIVLSGFRPIIVLKGRFSYSNQ
GKFLRKTLVIVQFSISMFLLAFTFVIFRQMQLIQDQNLGYEKEHTIILPTDKAIQDKKDV
IRNDLLKISGVKNVTFASRPPINITSTTTVKAVGDENERQLISYLISDENYIETFDLQVL
TGKDFQEITYPDSALVFMVNEAAMKFFGWSPENVIGQELQIWGRFKGEIIGVVKDFNFQS
LKQNIEPLVMVSSKKQINFGYNLMVKLNKEANTPTNLTQIQQTWNKHAAHYPFDYHFMDE
AFDRLYKSEQYLSELFVAFSIIAVIIAFLGLTGLAAFNTRQRYKEISIRKVLGANISGIL
VLLSKDYLWLLLTSFAFALPVSHYFVTEWLDNFAYKIDATWWVYALPAFTVIITAILAII
FQSLKAVNANPAQVLKNE
NT seq 2397 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttctggaacaacttcaaaatcactttaagaagctttttaaagcaaaagaaatttact
cttattattctaactggcctaactttaggtttatctgcttgcctttttattactgtttat
gtaatccacgaaaaaagctacgaccacttttggccaaaagcaaaccagcttgttagagtt
ccaatgacatggcattttggagaaactagtatgccctctggcagtgctacttcagaagct
ggagtaatgctaaaggaggaacttcccgaagtgctaaattttaccagaataagacccggc
tatggtatagttttaaagaaagatgataaactatttgaagagaaagagtttgtatatgca
gatacagctattatctcgatgtttgacttgcatctagttaaaggaaaccctgaaacagca
ttaaaagagccaaattcgttagtgttaacagtaagcttagctgaaaaatactttggcgct
aattggaacgaaacgaatgtaatcggaacatctctgttagttaataaccaaacaaattat
ttaattactggaattgtagaagacctaccagataatacccatattcaatttagctgcata
ggctcatttgcttcattaaacgattatgagaatccaaactgggataattccgaatttgcc
acctatgcactgctaactcctgaggctgctgtaaatcctacagccactattgataaattc
acggatctaatcactaaaaaatttggggcagaatctgtgagtatggtgcaattacatatg
gaaccgattacagatgtttatttatattctgagtttcacaatgcattgggcaaaaaaagt
gacataagatacctctacattttttcggctattggtttactcattttaataatggcgtgt
atcaattatgtaaacatgactacagccctatctctaagcagagccaaagaagtaggtatt
aaaaaagttgctggtgcacaaagagaccaacttttctggcaatttatgatagaatcaggc
actttaatattcagcgccttttttctagccattctattgttatttctactaaaagactgg
tttaaagatattgcttcggtcaatatctctactaatttgctcatacaaccagaaatctta
ctgccttttgtaggtttatccttatttatgacctttttatcgggaatataccctgcaatt
gtactttctggttttagaccgattatagtcttaaaaggtaggtttagttattcaaatcaa
ggtaagttccttagaaaaaccttagtaattgttcaattctcaatttctatgtttttacta
gcatttacttttgtgatttttcgccagatgcaactaattcaagatcaaaatctgggctat
gaaaaagaacatacaatcatactccccactgataaagcgattcaagataaaaaagatgta
atccgtaacgatttattaaaaatatcgggagtaaaaaatgtcacattcgcttctagacct
ccaattaatattacatcgacaacgactgtaaaagctgttggtgatgaaaatgaaaggcaa
ttgatttcttatctgataagcgatgaaaactatatcgaaacatttgacttacaagtgcta
acaggaaaggattttcaagaaattacctatccagactccgctttagtttttatggtgaat
gaagctgccatgaaattttttggctggtcaccagaaaacgttattggacaagagttacaa
atatggggaagatttaaaggagaaataattggtgtggtaaaagattttaactttcaatct
ttaaagcaaaatattgaaccattggtaatggtgagctcaaagaaacaaatcaactttggc
tataacttaatggtgaaactaaataaagaagccaacaccccaactaatttaacccaaatc
caacaaacctggaataaacatgctgctcactatccttttgactatcattttatggatgaa
gcattcgacagattgtataaatcggagcagtacttaagtgaattgtttgttgcatttagc
attatcgctgtaattatcgcctttttaggattaacaggtttggctgcttttaacacgcgc
caacgatataaagaaattagtattagaaaagttttaggtgcgaatatttcaggtattttg
gtattgctttcgaaagattacttatggctattactaacatcttttgcctttgcgctacct
gttagccactatttcgtaaccgaatggctcgataattttgcttataaaattgatgcgact
tggtgggtttacgcattgccagcctttactgtaattattacagcaatactggcaatcatt
ttccaatcattaaaagcagtgaatgcaaacccagctcaggtattaaaaaatgagtga

DBGET integrated database retrieval system