Clostridium sp. AWRP: DMR38_10110
Help
Entry
DMR38_10110 CDS
T07742
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
clos
Clostridium sp. AWRP
Pathway
clos01501
beta-Lactam resistance
clos01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clos00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
DMR38_10110
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
DMR38_10110
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
clos02000
]
DMR38_10110
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
clos01504
]
DMR38_10110
Transporters [BR:
clos02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
DMR38_10110
Antimicrobial resistance genes [BR:
clos01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
DMR38_10110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZV56919
UniProt:
A0A3T0LWH6
LinkDB
All DBs
Position
2169467..2172556
Genome browser
AA seq
1029 aa
AA seq
DB search
MKITEISVKRPAAMWMVVILLVALGVFGYSKMGANLLPSMNNPVITVSTIYSGAGADDIK
KDVIKPIEDSVSGISGVDTINSTAKEGYGTVTITFKSTTNLNTAYSDVQKAVENASSKLP
EDANKPTILKLDTNAIPVLAISLNGNVSYDELYNESDILKQKLEKISGVGSVTLMGADKK
QLMIKLDKTAMEYYGVSTNTVMGRLKSVNLNVPAGEIKQDKQDQAVRVIGQFHSIDDAKN
MLVPTANGGSVRLGEIAEIKLEAPDATTQIRFNGKKTMAIVVGKQSDANVVEVANGVKKQ
LESIKKGIPSDIKIDIKIDIAFDTTTFITSSLKQVQHNLIEGIITTAVVLYLFFRSFRSS
LVVLVAIPTSLIATFFMMYKFNFTLNMLSLMGLSLVVGTLVDDSIVVIESIQRHLGLGKD
PIRAAIDGRDEVGMAAVAISLCDIVVFAPISLMSGMIGQLFREFGLTIVVATIFSLLVSF
TVTPMLSSRILKKENREKEIKKDGFFSKVLEKYKSTLIWSLEHRKKVLSAVIICIVFSIA
LIPMGILKSEFIPTADQGSFTIDLALTPGSTLKQTDEKITQVEKYLKNMKEVKSYFTMVG
SNGQGSSDKATGEIMVNLVPKNERKKSQTKLAAQVRDFGKTMTGVDFTVTESQSGGGSSK
PVSISIKGDDQSTLEDLSKQVEKIVKAVPGVIDVSNSSNIKSSELRVNIDSLAAAQYGVS
SADIGSTVRTALAGTKAGVYRVNNTENDITIKFMNGQVKNAEDIKSIKITNVSGQQIPLG
EVASIVKADSEPSISREDKQDVVTIGANLQGRVLGEVTKDIKAKLKSLSIPEGYSISYGG
TQKNMADSFSSLGLALGASLCLVYMILVILYESFLTPAIRMVSLPCAIIGAFGLLALTGQ
TLNLMSMIGLIMLEGLSSKNGTLLIDYTNTLMKKGMNLKDALIESGVTRLRPIIMTSSTM
IVSMLPVALSMGEGSEMKQSMAIVIIGGMIASTILSPIVIPVVYTLMNDLTKVVFKKKKS
HKEAVKYEV
NT seq
3090 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagataactgaaatatctgtaaaaaggccagcagcaatgtggatggtagtaatttta
ttagttgcacttggtgtttttggctattcaaaaatgggagcaaatttactaccatctatg
aataatcccgttataacggttagtacaatttacagtggtgctggtgctgatgatattaaa
aaagatgttataaaaccaatagaagattcagtatcaggaataagtggtgttgatacaatt
aattcaacagcaaaagaaggttatggtactgttacaataacttttaaatccactactaat
ttaaacactgcatattcagatgtccaaaaggcagttgaaaatgcttcatcaaagcttcct
gaagatgctaataagcctactatacttaaattagatactaatgctataccagttttagca
atttctctaaatggaaatgtaagctacgatgaactatataatgaatctgatatattaaaa
caaaagctagaaaaaatatccggtgtgggaagcgtgaccttaatgggtgctgataaaaag
cagttaatgataaaacttgataaaactgctatggaatattacggcgtcagcactaatact
gtaatgggcagattaaagtcagttaacctaaatgtacctgctggtgaaattaagcaggac
aagcaagaccaagctgttagggtaattggtcaatttcatagtatagatgatgctaaaaat
atgctagtgcccacagcaaatggaggaagtgtacgtcttggtgaaattgctgaaataaag
ctagaggcgccagatgcaactacacagataagatttaatggtaaaaaaactatggcaatt
gtagttgggaagcaaagtgatgccaatgtagtagaagtagcaaatggtgtaaaaaaacag
ttagaatcaattaaaaagggtattccaagtgatattaaaattgatattaaaattgatatt
gcctttgataccactacttttattacttcttcattaaagcaagtacagcacaaccttata
gaaggaattataactactgcagttgtactttacttattctttcgtagttttcgttcttct
ttagttgttttagttgctatacctacatcacttatagctaccttctttatgatgtataaa
tttaattttactctcaatatgctgtctcttatgggattatctttggttgtaggtacattg
gtggatgattctatagttgtaatagaaagtatacaaaggcatttaggtttaggtaaagat
cctataagagcagctattgatggacgtgatgaagtaggaatggctgctgtagctataagt
ctttgtgacatagtcgtatttgcacctatttcccttatgtctggtatgatagggcagttg
tttagagaatttggtctcacaatagtagtagccacaatattttcccttttagtatccttt
acagttacaccaatgctttcatctcgcatacttaaaaaagaaaatagagaaaaagaaatc
aagaaagatggcttttttagcaaggttctagaaaaatataaaagtactctaatatggtcc
ttagaacatagaaaaaaggtattatctgctgttattatctgtatagtattcagtattgct
cttataccaatgggaatattaaaatctgagtttatacctacagctgatcaaggtagtttt
actattgaccttgcccttacgccaggttctaccttaaagcaaacggatgaaaaaattact
caggttgaaaaatatttaaagaatatgaaagaagtaaaaagctactttacgatggttggc
tcaaatggacaaggaagttcagataaggctacaggtgaaattatggttaacttagttcct
aaaaatgaacgtaaaaaaagccaaaccaagttagcagcacaagttcgtgactttggtaaa
accatgactggagtagatttcactgtaacagaatcacaatctggtggtggaagcagtaag
cctgtttctatcagcataaaaggagatgatcagagtaccttagaggatttatcaaagcaa
gttgaaaaaatagtaaaagcagtgcctggagttattgatgtaagtaattcttctaatata
aaaagcagtgaactaagagtaaatatagatagtttagctgctgcacaatatggagtttca
tcagctgatataggaagtactgtaagaactgctttggcaggtactaaagcaggagtatat
agagtgaataatacagaaaatgatataacaattaaatttatgaatggtcaggtaaaaaat
gctgaagatattaaatctataaaaattacaaatgtatctgggcaacaaataccattaggt
gaagttgcttcaattgtaaaagcagatagtgaaccatcaatatctagagaagataaacag
gatgttgttactataggtgcaaatcttcaaggtagagttcttggagaagtaacaaaggat
ataaaagctaaattaaaatcgctatctatacctgaaggttacagtataagctatggagga
actcaaaagaatatggcagattcctttagttctcttggattagccttaggtgcttcattg
tgtcttgtttatatgatactagtcatactttatgagtctttcttaacaccagctataaga
atggtatctcttccttgtgctataataggtgcttttggtttgctggcgttgacaggacag
actttaaacctgatgtcaatgattggtcttataatgcttgaaggtttatcatctaaaaat
ggtaccttattaatagattacacaaatacattaatgaaaaaaggaatgaacttaaaggat
gcacttattgaatctggtgttaccaggttaaggcctataataatgacaagttcaacaatg
atagtttcaatgcttcctgtagctttatccatgggtgaaggaagtgaaatgaaacaaagt
atggctatagtaattataggcggtatgatagcatcaactatactttctccaatagtaata
ccagtagtttatacattaatgaatgacttaactaaagttgtatttaagaaaaagaaaagt
cataaggaggctgtgaagtatgaagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
