Clostridium novyi: NT01CX_1550
Help
Entry
NT01CX_1550 CDS
T00431
Name
(GenBank) RND efflux transporter, putative
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
cno
Clostridium novyi
Pathway
cno01501
beta-Lactam resistance
cno01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cno00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
NT01CX_1550
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
NT01CX_1550
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cno02000
]
NT01CX_1550
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
cno01504
]
NT01CX_1550
Transporters [BR:
cno02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
NT01CX_1550
Antimicrobial resistance genes [BR:
cno01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
NT01CX_1550
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
GidB
DUF7778
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABK62132
UniProt:
A0PZ29
LinkDB
All DBs
Position
737114..739669
Genome browser
AA seq
851 aa
AA seq
DB search
MDKLKNYPISLEDVTKALKVQNVKIPPGAIESKTSKIDVITSNGFDSIKDIENVVVYVSE
DTGAIVRLKDIAKIYMDYDQDDVKYKQDGKKSILLTGHFEDNKNVVLIGKDVRREIESIK
KTLPNDLNFYEVLYQPTDVDNAVSDFMTNLIEGIILVIVVIFAGVGVRNSIVVSTALPIS
ILLSFIMMHFAGIKVHQISTMALIIALGILVDNAIVISDVVQVKINQGVDNVRAALEGAK
ESSIPIFTSTLTTVASFAPLLTIPGVPGKYVESIPKVVIISLIASYICAMLITPALAAVC
YKKTSDAKQGKIMKKVEKFFENALSFGLKKRKLTILISLGMLAVAAFITTTLGLQFFPYA
NKNMMYINTTIEKKGDIKATENLSKVVEKVLKAQPEVKSYSTGIGDGLPKFWVAMPPSVP
SNDFAQTKIDFDLKKGGRFKDNAEFANFLQEKLDSEIVGAKCTVYPLQYALPKEAPIGIR
VIGDDMEKLYAASEKLQGLIRQIDGATKVRDDAADRTYQYKVDIDSDMASQLGIIKYDIE
RQINIALRGTEGSVYRKNGKEFSIIVKSNIDSKEKLENLAVKSTLAGHKVLLKEIATINL
QTQIDTIKRYNKEDCINVYADIKPGGNAVDLQDKIEEKIKTTDLPGVRLEFFGEKADIVK
YFGTLGQSAGVAIFFIYIILLIQFNSFMQPFIIFLTIPLSLIGSALGLFIFRQPLSLMAL
MGIVSLVGVVVKNAILLIEYINKARKEGYSLNDSCMDAMKKRFSPIILSAFTTVMGLAPI
IPSGNPMFVPMAVALMCGLIVSTLLTLIIIPVLYNLIESSVDKFNNKHKGGFKFNFKFGG
RKIKKENTLEG
NT seq
2556 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaattaaaaaattatccaatatcattagaggatgttacaaaagcacttaaggtg
caaaatgttaaaataccaccaggagctattgaaagtaaaacttcaaaaattgatgtaatt
acaagcaatggtttcgattctataaaagatatagaaaatgtagttgtatatgtgtcagag
gacactggtgcaatagtaagacttaaagatattgcaaaaatatatatggattatgaccaa
gatgatgttaagtacaaacaggatggtaaaaaatctatattattaacaggtcactttgaa
gataacaaaaacgtagttttaattggtaaagatgtaagacgtgaaattgaatcaattaaa
aagacgcttccaaatgacttgaatttttatgaagtattatatcaacctacagatgttgat
aatgctgtttctgattttatgactaacttaatagaaggtattatattggttattgtagtt
atatttgcaggtgttggtgttagaaactcaatagttgtatcaacagcacttccaatatca
atacttctaagttttataatgatgcactttgctggaataaaggtacaccaaatatcaact
atggcacttattattgccctgggaatactggttgataatgcaatagtaataagtgacgtt
gttcaagttaagataaatcaaggagttgacaatgtgcgagccgcccttgaaggtgctaaa
gaatcatcaattcctatatttacttcaacacttacaacagttgcatcctttgctccatta
cttacaataccgggagttccaggaaagtacgttgagagtataccaaaggttgttataata
tcccttattgcgtcttatatatgtgctatgcttataacccctgcattagctgcagtttgt
tacaagaaaacatcagatgcaaaacaaggtaagataatgaaaaaagttgaaaaattcttt
gaaaatgcattgagttttggacttaaaaagagaaagcttactattttaatttctcttggt
atgctagcagtggcagcatttattacaacaactttaggacttcagtttttcccatatgcc
aataaaaatatgatgtatataaatactacaattgagaaaaaaggtgacataaaagcaact
gaaaatttatcaaaggttgtagagaaggtattaaaagcacaacctgaagttaagagttat
tcaacaggaattggagatggacttccaaaattctgggttgcaatgcctccttcagtacca
tctaatgactttgctcaaacaaagattgattttgatcttaaaaagggtggaagatttaag
gataatgcagagtttgcaaatttccttcaagaaaaattagattctgaaatagttggtgct
aaatgtacagtttatccacttcaatatgcattacctaaagaagctcctataggtataaga
gttataggtgatgatatggaaaaattatatgcagcatcagaaaaacttcaaggattaatt
aggcaaattgatggtgcaactaaagttcgtgatgatgcagcggatagaacatatcaatat
aaagtagatattgattctgatatggcgtcacaacttggtattattaaatacgatatagaa
agacaaataaacatagctttaagaggaacagaaggttctgtttatagaaagaatggtaaa
gaatttagtattattgtaaagagtaatatagatagcaaagaaaaacttgaaaatctagct
gtaaaatctactcttgcaggacacaaagttttattaaaagaaattgctacaattaaccta
cagacacaaattgatactataaaaagatataataaagaagattgtataaatgtttatgcg
gatattaaaccaggtggaaacgccgttgatcttcaagataaaatagaagaaaaaataaaa
actacagatttacctggagttagattagaattctttggagaaaaggctgacatagtaaaa
tacttcggaacattaggtcaatcagcaggtgttgctattttcttcatatatataatatta
cttatacaatttaactcatttatgcaaccatttattatattccttacaataccattatca
ttaattggttccgcacttggattatttatatttagacaaccactatcacttatggctctt
atgggaattgtaagtttggttggtgtagttgttaaaaacgcaatacttcttattgaatat
ataaataaggcaagaaaagaaggatattcattaaatgattcttgtatggatgctatgaaa
aagagatttagtcctattatactaagtgcatttacaacggttatgggacttgcacctata
ataccatctggaaatcctatgtttgttcctatggcagttgccttaatgtgtggacttata
gtatctacactattgacacttattataatacctgttttatacaacttaattgaaagttct
gttgataagttcaataacaaacataaaggtggatttaaattcaattttaaatttggtggt
agaaaaataaagaaagaaaatactttagaaggatga
DBGET
integrated database retrieval system