Crocodylus porosus (Australian saltwater crocodile): 109309040
Help
Entry
109309040 CDS
T07440
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1 isoform X1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
cpoo
Crocodylus porosus (Australian saltwater crocodile)
Pathway
cpoo04350
TGF-beta signaling pathway
cpoo04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpoo00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
109309040 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
109309040 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cpoo00536
]
109309040 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cpoo00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
109309040 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_Teneurin
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
EGF_PEAR1L
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109309040
NCBI-ProteinID:
XP_019389171
Ensembl:
ENSCPRG00005014181
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2788 aa
AA seq
DB search
MCTCPNGQIAPSCGSKSIQHCNIRCMNGGTCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVCESGCLNGG
RCVAPNRCACTYGFTGPQCERVTRFGTSDYRTGPCFTLITNQMCQGQLSGIVCTKTLCCA
TVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGICQGGNCINTVGSFEC
KCPAGHKFNEVTQKCEDIDECSTIPGICDGGECSNTVSSYFCKCPPGFYTAPDGLRCIDV
RPGYCFSSLTNGRCGNQLPQALTKMQCCCDSGRCWSPGATSAPEMCPIRSTEEFRKLCTV
TGLVPRRPDLPPSHPDGTIPIVIPPGPVPPAVYPPVLPGVLQPILPRPDIAFPSRAPPPH
VILPVNFTDYCQLYRHLCLNGRCIPTPGSYRCECNKGFQLDVRGECIDVDECEKNPCISG
DCVNTQGSYICQCRVGYQSTPTRTECRDIDECVQNGRICNNGRCINTDGSFHCVCNAGFQ
VAADGKNCEDMDECSIRNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFQLASDGRYCRDIDECETPGI
CMNGRCVNTDGSFRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHMRSTCYGEYKRGQCVRALTGAVTKSE
CCCASTDYAFGEPCQPCPAQNSAEYQALCSSGPGLTATGADINECLDLALCPNGECENLH
GTYKCRCNLGYEVDSSGKNCLDIDECASNLLLCDNGQCRNTPGSFTCTCPKGFIYKPDQK
TCEDIDECESNPCVNGVCKNTLSSFACECSPESTLDTTRTICIETVKGTCWQSIVDGRCE
ININGATLKSQCCSSLGAAWGSPCTPCERDPICPKGHSRIRGTLCEDVNECEVFPGVCTN
GQCVNTVGSFVCQCPYGMTLDASGRMCHDIRLESCYLKHEDEQCTLQVPGRHRMDACCCS
VGAAWGSECEECPLKGTPEYSALCPRGPGFSTRVEINGKPFSKDINECKMIPSLCTHGKC
RNTIGSFKCKCDSGFALDSEERNCTDIDECRISPDLCGQGNCVNTPGDFECECFEGYESG
FMMMKNCMDIDECQRNPLLCRGGTCENTEGSFRCNCPAGHQMAPNISACVDINECDLSTN
LCRNGHCVNLIGKYQCACNPGYQSTPDKLYCVDIDECSIMNGGCESFCTNSEGSYDCSCK
QGFALMPDHRTCTDIDECEDNPNICDGGQCTNIPGEYRCLCFDGFMASEDMKTCVDVNEC
GLYPDICLSGTCENTKGSFICHCDMGYSGKKGTTGCTDINECEIGAHNCDRHAICTNTAG
SFKCSCSLGWIGNGVKCTDLDECSNGTHNCSPHADCKNTMGSYRCLCKEGYTGDGFTCTD
LDECSENLNLCENGQCLNVPGGYRCECDMGFLPSPDRKACEDIDECALSKICVYGTCHNL
PGLFRCECETGYELDRSGGNCTDVNECADPTTCISGTCVNTPGSYTCECPPDFELNPTRV
GCVDTRSGNCYLEVKTRGDNGGTFCSNEIGVGVSKASCCCSLGKAWGIPCEHCPAVNSTE
YKVLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGRCINTFGSFQCQCPSGYYLNEDTR
VCDDVNECETPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDYMQVNGGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQ
TCDGELLFNMTKKMCCCSYNIGRAWNKPCEQCPIPSTDEFSTLCGSQRPGFFIDIYTGLP
VDIDECREIPGVCDNGICINMVGSFRCECPVGFFYNDKLLICEDIDECQNGPVCQRNAEC
VNTAGSYRCDCKPGYRFTSTGRCTDRNECQEIPNICSHGQCIDTVGSFYCICHSGFKTND
DQTMCIDIDECERDACGNGTCRNTIGSFNCRCNAGFTLSHNNDCIDLDECTSGNGMLCRN
GQCINTIGSFHCLCLEGYEVTPDGRTCADINECVQEPRKCSPGTCQNLDGTYRCICPPGY
ILEHDRCEDIDECVEEPEICALGTCSNTQGSFKCLCPEGFVLSSTGRRCQDLRVSYCFTK
FEDGKCSVPKLKNHSKQECCCALKGQGWGDPCELCPEEADDAFRQICPFGIGILIGPGDA
RLDVDECLDPDNCKFGRCINTDGSFRCECPYGYILHGAECIDTDECAVGNPCGNGTCRNV
IGGFECTCEEGFEPGPMMTCEDMNECAQNPLLCAFRCVNTYGSYECKCPAGYVLREDRRM
CRDQNECEEGIHDCAEKLMECKNLIGTYMCICGPGFQRRPDGEGCIDENECQTKPGICEN
GRCINTKGSYRCECNEGFTASDTQNECLDNREGYCFIEVLQSMCQIGSSNRNSVTKSECC
CDGGRGWGPNCEICPFPGTVAFKKLCPYGRGYMSNGADIDECKVIHEVCRNGECVNEGGT
YHCLCNTGYTPDITGTLCVDLNECSLSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPKGYILQEDGRSCK
DLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECATEVNLCGSKGVCQNT
PGSFVCECQRGFSLDQTGLSCEDIDECDGNHRCQHGCQNIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQ
CVDENECLSAHICGGASCHNTLGSYKCMCPAGFHYEQFSGGCQDINECGSAQAPCSYGCS
NTEGGYVCGCPPGYFRIGQGHCVSGMGLGKGQAQELPVSGEVDDNSLSPEACYECKINGY
HKRGRKRRSTNETIADEAEEQQEREPVISLASWDIEKTAIFSFNISKLNNKDRILELLPA
LTTLTNHNRYLIDSGNEDGFFKINKKEGISYLHFTKKKPVPGTYSLQISSIPLYKKKELN
QLEDKHDKDYLSGELGDNLKMKIQILLH
NT seq
8367 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcacatgtccaaatggtcagatagccccctcctgtggttcaaagtcaatacaacac
tgtaacatccggtgtatgaatggaggtacctgcagtgatgaccattgtctctgtcagaag
ggatacacaggaacacactgtggacagcctgtctgtgaaagtgggtgtcttaatggtggg
agatgcgtggctccaaatcgatgtgcttgtacatatggctttactggacctcagtgcgaa
agagtcaccaggtttggtacatcagactataggactgggccatgcttcactttgataacc
aatcagatgtgccagggacaactcagtggaatagtctgcaccaaaaccctttgctgtgcg
acagttgggagagcatggggtcatccttgtgaaatgtgtcctgctcagccacatccttgc
cgtcgaggtttcattccaaatattcgaacaggagcctgtcaagatgtggatgaatgccaa
gccatccctgggatctgtcaaggaggaaattgtattaacactgtcggatcttttgagtgc
aaatgcccagctggacacaagtttaatgaagtgacacaaaaatgcgaagatattgatgaa
tgcagcaccattcctggaatctgtgatggaggagaatgttcaaacacagttagcagttac
ttttgcaaatgtcctccaggattttatacagcccctgatggcttaaggtgtatagatgta
cgtcctggatactgcttctcttctctgacaaatggtcgctgtggcaatcaacttccacag
gcgttaactaaaatgcagtgttgctgtgacagtggacgatgctggtctcctggagcaacc
agtgcccctgaaatgtgtccaatccgatctaccgaggagtttcgcaagttatgcacagta
actggacttgtgcctaggagacctgaccttcctccctcccatcctgatggtaccattcct
attgtaatccctcctggtcctgttcctcctgctgtttatcctcctgtccttcctggtgta
ctacagcctattttaccacgcccagacattgcttttccctcccgggctccacctccacat
gtgatcttgccagttaatttcactgactactgccagctataccgacatctctgccttaat
gggcgttgcattccaactcctgggagctaccgctgtgaatgcaataagggattccaacta
gatgttagaggggaatgcattgatgttgatgaatgtgagaagaatccttgtattagtgga
gactgtgtaaatacccaaggatcgtatatatgccagtgtcgtgttggatatcagagtaca
ccaactaggacagagtgccgagatattgatgaatgtgtacagaacggtcggatctgtaat
aatggacggtgcataaacacagatggcagctttcactgtgtttgtaatgctggctttcaa
gtggcagctgatgggaaaaactgtgaagatatggatgaatgtagcataaggaacatgtgc
cttaatggaatgtgtatcaatgaggatggcagctttaaatgcatttgtaaacctggtttc
cagttagcatctgatggacgttattgtagagacattgatgagtgcgagacacctggaata
tgcatgaacgggcgctgtgtgaacactgatgggtctttcagatgtgaatgcttccctggg
cttgcagtgggactagatggacgtgtgtgtgttgatacacatatgcgaagcacatgttat
ggtgaatacaagagaggccaatgtgtaagagcactgaccggtgctgttactaaatcagaa
tgctgttgtgccagcactgactatgcctttggagaaccctgccagccttgtcctgcccaa
aattcagctgaataccaggctttgtgcagcagtggaccaggcctgactgcaacaggagct
gatattaatgaatgtttggatcttgcactctgccccaatggagaatgtgagaatctgcac
ggaacatacaaatgcagatgtaatcttggatatgaagtggattcaagtggaaaaaattgc
ctggacattgatgaatgtgcatcgaacctactgctttgtgacaatgggcaatgcagaaat
acccctggaagtttcacctgcacctgtcccaaaggatttatttacaagcctgatcaaaaa
acatgtgaagatattgatgaatgcgagtctaacccatgtgttaatggagtatgcaaaaat
acacttagctcttttgcttgtgaatgttcccctgaaagtactttggatacaacaagaacc
atctgcatagaaactgttaaaggcacctgctggcagagtatagtggatgggagatgtgaa
ataaatatcaatggagcaactctcaaatcccagtgctgttcttcactgggtgctgcttgg
ggtagcccatgtacaccctgtgaacgagacccaatctgcccaaaaggacattcaagaata
aggggaacattgtgtgaagatgtcaatgaatgtgaggtgtttcctggagtatgtaccaat
gggcagtgtgtcaataccgtgggatcctttgtttgtcagtgcccctatggaatgacttta
gatgcttctggacggatgtgtcatgacattcgtttggaaagctgctacctaaagcatgaa
gatgaacaatgtacattgcaagtaccaggccggcaccgaatggatgcttgctgctgttct
gtgggtgcggcatggggctctgaatgtgaggaatgccccttaaagggaacacctgaatat
tctgctctttgtccaagaggacctgggttttctactagagtagaaataaatggaaagcca
ttctccaaagatatcaatgagtgtaaaatgatccccagtctttgcacccatggaaaatgc
agaaacactattggcagctttaagtgtaaatgtgacagcgggtttgcacttgactctgaa
gaaaggaactgtacagatattgatgagtgccgcatatctcctgatctctgtggccagggg
aactgtgtcaatactcctggggattttgaatgtgaatgttttgaaggatatgaaagtgga
ttcatgatgatgaaaaactgcatggacattgatgagtgtcagcggaatcctcttttatgc
cgtggcggaacttgcgaaaacacagaaggaagctttcgctgtaactgtcctgcaggacat
cagatggctccaaatatttcagcgtgtgtagacattaatgagtgtgatttaagtaccaac
ctgtgcagaaatggacattgcgtcaaccttattggaaagtatcaatgtgcctgcaaccct
ggatatcagtctacacctgacaaattatattgcgttgatattgatgaatgcagcataatg
aacggtggttgtgagagtttctgtacgaactcagagggcagctatgattgtagctgtaaa
caaggctttgcactaatgccagaccacaggacttgcactgacattgatgagtgtgaagac
aatcctaacatttgcgatggaggccagtgtacaaacataccaggagaatacaggtgtctt
tgttttgatggattcatggcatctgaagatatgaagacatgtgtcgatgttaatgagtgt
ggtctgtatccagacatctgtctgagtggaacctgtgagaatacaaagggctcgtttatc
tgtcattgtgatatgggatattcaggcaaaaaaggaacaactgggtgcacagatatcaac
gaatgtgaaattggagctcataattgtgacagacatgccatatgcacaaacacagcagga
agtttcaaatgcagttgcagcttaggttggattggaaatggtgtcaaatgcacagatttg
gatgaatgctccaatggaacacacaactgcagcccacatgctgattgcaagaacaccatg
ggctcttaccgttgcctttgtaaagaaggttacacgggagatggcttcacttgtacagat
cttgatgaatgctcagaaaacctgaacctctgtgaaaatgggcagtgcctcaatgtccct
ggaggatatcgctgtgaatgcgatatgggatttttgccaagtccggataggaaagcatgt
gaagatattgatgagtgtgccctttctaagatctgcgtctatggaacttgtcataaccta
cctggtctattccgatgtgagtgtgagacgggctatgaattagacagaagcggtggtaac
tgcacagatgttaatgaatgtgcagaccccacaacctgtatcagtggcacatgtgtcaat
accccaggcagttatacctgtgagtgtccccctgattttgagctgaatccgacccgcgtt
ggctgtgttgatacccgttctggcaattgctacttggaagttaaaacacgaggagataat
ggaggtaccttctgcagcaatgagattggggttggtgtttccaaagcatcctgctgctgt
tccctgggaaaagcttggggaattccctgtgaacattgcccggctgtgaactcaactgag
tataaggttctgtgccctggaggggaaggattccgaccaaacccgattacagttatattg
gaggatattgatgagtgtcaagaactacccggactttgccaaggaggaagatgtatcaat
acatttggaagtttccaatgtcagtgtccatctggatactatttaaatgaagacactaga
gtatgtgacgatgtaaatgaatgtgaaacacctggaatttgtggtcctggcacttgttat
aacactgttggaaactacacctgtatctgtcctcctgactacatgcaagtcaatggtggc
aacaactgtatggatatgaggaggagtctctgctacagaaattattatgcagacaatcaa
acctgtgatggagagcttctctttaacatgaccaagaaaatgtgctgctgttcctacaac
attgggagagcatggaataagccttgtgagcagtgtcctattcctagtacagatgaattt
tcaacactgtgtggaagtcaaaggcctggtttcttcattgacatttatacagggttacca
gttgatattgacgaatgccgagagatccctggagtctgtgacaatggaatctgcataaat
atggttggcagcttcagatgtgagtgtcctgtgggattcttctacaatgataagttgctg
atctgtgaagatattgatgaatgccaaaatgggccagtatgtcaacgaaatgcagaatgt
gtcaacacagctgggagctatcgctgtgactgtaaacctggctacaggttcacctcaaca
ggccgttgcacagatcgtaatgaatgccaagaaattcccaatatttgtagccatggtcaa
tgtattgacacagttggaagtttctactgcatttgtcacagtggattcaaaaccaatgat
gaccaaacaatgtgcatagatattgatgaatgtgaaagagatgcatgtggaaatggaaca
tgtaggaataccattggctccttcaactgccgctgcaacgctggattcaccctctcgcat
aacaacgactgcatagatctggacgaatgtacaagtggaaacgggatgctctgcaggaat
ggccagtgcataaacaccattggatctttccactgtctgtgcctagaaggctatgaggtg
actccagatggcaggacctgtgctgatatcaatgagtgtgtacaagaacctagaaaatgt
tcaccgggcacatgccagaacttggatgggacatacagatgcatctgtcctcctggatac
attctggaacatgacagatgtgaagacattgatgaatgtgtagaagagccagaaatttgc
gctttgggcacatgtagcaatactcaaggcagtttcaaatgcctgtgccctgaaggattt
gtattgtcttccacaggaagaagatgccaagatctgagagtcagttactgctttaccaaa
tttgaagatggaaagtgttctgttccaaaattgaaaaaccattccaagcaggaatgttgt
tgtgccttgaaaggacaaggctggggcgacccatgtgaactctgtccagaggaagcagat
gatgcgtttcgacagatatgtccatttggaataggtattcttattggaccgggtgacgcg
cgccttgatgtggatgagtgtcttgatccagataactgtaaatttgggcggtgcatcaac
acagatggttcctttcgctgtgaatgtccatatggttatatacttcatggagctgaatgt
atagacactgatgaatgtgctgttggaaatccgtgtggaaatggaacttgtaggaatgtc
ataggagggtttgaatgtacctgtgaggaaggatttgaaccaggaccaatgatgacatgt
gaagatatgaatgagtgtgctcaaaatcctctactctgtgcattccgttgtgtgaacact
tatggatcatatgaatgcaagtgtccagctggctatgttcttagagaagacaggagaatg
tgcagagatcagaatgagtgtgaagaaggaattcatgactgtgctgaaaaactaatggaa
tgcaaaaatctgattggcacttacatgtgcatatgtggaccaggatttcaacgcaggcca
gatggtgaaggatgcatagatgagaatgaatgtcaaaccaaacctgggatctgtgagaat
ggtcgctgtataaacacaaaaggaagttacagatgtgaatgcaatgaaggatttactgcc
agtgacacccagaatgaatgcttggacaacagagagggctactgcttcattgaagtgtta
caaagtatgtgtcaaattggatcaagcaacaggaactctgtcaccaagtctgaatgctgc
tgtgatggtgggcgaggatgggggccaaactgcgagatctgccccttcccagggactgtg
gcttttaaaaagctttgcccttacggccgaggatatatgtccaatggagcagatattgat
gagtgcaaggttattcatgaagtttgccgtaatggagaatgcgtcaatgagggaggaaca
tatcactgcctttgcaatacaggctatacaccagatataactggcactctctgtgtagac
ctgaatgaatgcagcctgtcccccaagccttgtaatttcatctgtaaaaacacagagggg
agttaccagtgttcatgtccaaaggggtacatcttacaggaggatgggagaagttgcaaa
gatctcgatgaatgtgcaacaaaacagcacaactgccagttcctttgtgtcaacaccatt
gggggcttcacttgcaaatgtcctcctggtttcactcagcatcatacagcatgtattgac
aataatgaatgtgccactgaagtcaatctgtgcgggtctaaaggcgtttgccagaacaca
cctgggagctttgtctgtgaatgtcagcggggcttctcacttgatcaaactggactcagc
tgtgaagatattgatgaatgtgatggaaaccatcggtgtcaacatggttgccaaaatata
atcggaggatacaggtgcagctgtccacaaggatatctccagcattaccagtggaaccaa
tgcgttgatgaaaatgaatgcctctctgcacacatctgtggaggagcatcttgtcacaat
actttgggaagctataaatgtatgtgtcctgccggatttcactatgaacagtttagtgga
ggttgccaagatatcaatgaatgcggttctgctcaagccccatgcagttatgggtgttca
aatactgaaggtggctatgtctgtggatgtccacctggttacttcagaataggacaagga
cactgtgtttctggcatgggacttggtaaaggtcaggctcaggaattgccagtcagtggt
gaagtagatgacaactctctgtctccagaagcttgctatgaatgtaaaatcaacggctac
cacaagagagggaggaagcgcagaagcactaatgaaaccattgcagatgaagcagaggag
caacaggagagagaaccagtaatcagccttgccagctgggatattgaaaaaacagccatc
ttttctttcaacatctccaagcttaataacaaagatcgaatcctggaactgcttcctgct
cttacaacactgacaaatcataaccgatatttaattgactctggaaatgaagatggtttc
tttaaaatcaataaaaaggaagggataagctatcttcactttacaaagaagaagccagtg
cctggaacctattcattacaaatcagtagtattccactctataaaaagaaggaacttaat
cagcttgaagacaaacatgacaaagactacctcagtggtgagctgggagataacctaaaa
atgaaaattcagatattgcttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
