Clostridium scatologenes: CSCA_1873
Help
Entry
CSCA_1873 CDS
T03803
Name
(GenBank) acriflavin resistance protein
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
csq
Clostridium scatologenes
Pathway
csq01501
beta-Lactam resistance
csq01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
csq00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
CSCA_1873
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
CSCA_1873
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
csq02000
]
CSCA_1873
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
csq01504
]
CSCA_1873
Transporters [BR:
csq02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
CSCA_1873
Antimicrobial resistance genes [BR:
csq01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
CSCA_1873
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKA68998
UniProt:
A0A0E3JNA8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2018705..2021782)
Genome browser
AA seq
1025 aa
AA seq
DB search
MKITEISVRRPAAMWMVVILLVALGAFGYLKMGANLLPSMNNPVITVSTIYSGAGADDIK
KDVIKPIEDSVSGISGVDTINSTAKEGYGTVTITFKSSANLNTAYSDVQKAVENASSKLP
EDANKPTILKMDTNAIPVLAISLNGNVSYDELYNESDILKQKLEKVPGVGNVSLMGADKK
QLMIKLDKTAMEYYGISTNTVMGKLKSVNLNVPAGEIKQDKQDQAVRVIGQFHNIDDAKN
MLVPTANGGSIRLGEIAQIKLEAPDATTQIRFNGNKTMAVVVGKQSDANVVEVANSVKKQ
LESIKKSIPGDIKIDIAFDTTTFITSSLKQVQHNLIEGIITTAVVLYLFFRSFRSSLVVL
VAIPTSLIATFFMMYKFNFTLNMLSLMGLSLVVGTLVDDSIVVIESIQRHLGLGKDPIRA
AIDGRDEVGMAAVAISLCDIVVFAPISLMSGMIGQLFREFGLTIVVATIFSLLVSFTVTP
MLSSRILKRENKEKEIKKDGFFSKVLEKYKSTLMWSLEHRKKVLSAVIICIILSVALIPM
GILKSEFIPTADQGSFTIDLSLTPGSTLKQTDEKITQVEKYLKNMKEVKSYFTMVGSNGQ
GSSDKATGEIMVNLVSKNERKKSQTKLAAQVRDFGKTMTGVDFTVTESQSGGGSSKPVSI
NIKGDDQGTLEDLSKQVEKIVKTVPGVIDVSNSSNIKSSELRVNIDSLAAAQYGISSADI
GSSVRTALAGTKAGVYRANNTENDITIKFMNGQIKNAEDIKSIKITNAAGQQIPISEVAS
IVKADSEPSISREDKQDVVTIGANLQGRVLGEVTNDIKAKLKSLSIPEGYSISYGGTQKN
MADSFSSLGLALGASLCLVYMILVVLYESFLTPAIRMVSLPCAIIGAFGLLALTGQTLNL
MSMIGLIMLEGLSSKNGTLLIDYTNTLMKKGMNLKDALIESGVTRLRPIIMTSSTMIVSM
LPVALSMGEGSEMKQSMAIVIIGGMVASTILSPIVIPVVYTLMDDLTKVVFKKKKSHKEA
VKYEV
NT seq
3078 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagataaccgagatatctgtaagaaggccagcagcaatgtggatggtagtaatttta
ttagttgcacttggtgcttttggctatttaaaaatgggagcaaatttactaccttctatg
aataaccctgttataacagttagtacaatttacagcggtgctggtgctgatgacattaaa
aaagatgttataaaaccaatagaagattcagtatcaggaataagtggtgttgatacaatt
aattccacagcaaaggaaggttatggtactgttacaataacttttaaatccagtgctaat
ttaaacactgcatactcagatgttcaaaaagcagttgaaaatgcttcctcaaagcttcct
gaagatgctaataaacctactatacttaagatggatactaatgctataccagttttagca
atttctctaaatggaaatgtaagctatgatgagctatataatgaatctgatatattaaaa
cagaaattagaaaaagtgcctggtgtaggaaacgtaagtttaatgggtgctgataaaaag
cagttaatgataaagcttgataaaactgctatggaatattacggaattagtactaatact
gtaatgggcaaattaaagtcagttaacctaaatgtacctgctggtgagattaagcaggac
aagcaagatcaagctgttagagtaattggtcaatttcacaatatagatgatgctaaaaat
atgctagtgcctacagcaaatggaggaagtatacgccttggtgaaattgctcaaataaag
ctggaagcgccagatgcaactacacaaataagatttaatggtaataaaactatggcagtt
gtagttggaaagcaaagtgatgccaatgtagtagaagtagcaaatagtgtaaaaaaacaa
ttagaatcaattaaaaagagtattccaggtgatattaaaattgatattgcctttgatacc
actactttcattacttcttcattaaagcaagtacagcacaatcttatagaaggaattata
actactgcagttgtactttacttattcttccgtagttttcgttcttctttagttgttttg
gttgctatacctacatcgcttatagctactttctttatgatgtataagtttaattttact
cttaatatgctgtcacttatgggattatccctggttgtaggtacactggtggatgattct
atagttgtaatagaaagcatacaaaggcatttagggttaggtaaagatcctataagagca
gctattgatggacgtgatgaagtgggaatggctgctgtagctataagtctttgtgacata
gttgtatttgcgcctatttctcttatgtctggtatgatagggcagttgtttagagaattt
ggacttaccatagttgtagctacaatattttctcttttagtatcctttacagttacacca
atgctttcatctcgcatactcaaaagagaaaataaagaaaaggaaatcaaaaaggatgga
ttttttagcaaagttttagaaaaatataaaagtactctcatgtggtccttagaacataga
aaaaaagtgttatctgctgttattatttgtattatactcagtgttgcccttataccaatg
ggaatattaaaatctgagtttatacctacagctgatcaaggtagttttaccatcgatctc
tcccttacaccaggttctaccttaaagcagacagatgaaaaaattactcaggttgaaaaa
tatttgaagaatatgaaagaggtaaaaagctactttacaatggttggatcaaatggacaa
ggaagttcagataaggctacaggcgaaattatggttaatttagtttctaaaaatgaacgt
aaaaaaagccaaaccaagctggcagcacaagttcgtgattttggtaaaactatgactgga
gtagattttactgtaacagaatcacaatctggtggtggaagcagtaagcctgtttctata
aatataaaaggagatgatcagggtactttagaggatttatcaaagcaggttgaaaaaata
gtaaaaacagtgcctggagttattgatgtaagtaattcttctaatataaaaagcagtgaa
ctaagagtaaatatagatagcttagctgctgcacagtatggaatttcatcagctgacata
ggaagttctgtaagaactgctttagcgggtactaaagcaggagtatatagagcaaataat
acagaaaatgatataacaattaaatttatgaatggtcagataaaaaatgctgaagatatt
aaatctataaaaattacaaatgcagctggacaacaaataccaataagtgaagttgcttca
attgtaaaagcagatagtgaaccatcaatatctagagaggataaacaagatgttgttact
ataggtgcaaatcttcaaggtagagttcttggagaagtaacaaatgatataaaagctaaa
ttaaaatctctatctatacctgaaggctatagtataagttatggaggaactcaaaagaat
atggcagattcctttagttctcttggattagccctgggtgcttcattatgtcttgtttat
atgatactagtggtactttacgagtctttcttaacaccagctataagaatggtatctctt
ccttgtgctataataggtgcctttggtttgttggcgttaacaggtcagacattaaatctt
atgtcaatgattgggcttataatgcttgaaggtttatcatctaaaaatggtaccttatta
atagattatacaaatacattaatgaaaaaaggaatgaacttaaaagatgcgcttattgaa
tctggtgttaccagattgaggcctataataatgacaagttctacaatgatagtttcaatg
cttcctgtagctttatccatgggtgaaggtagtgaaatgaagcaaagtatggctatagta
attataggtggtatggtagcatcaactatactttctccaatagtaataccagtagtttat
acattaatggatgatttaactaaagttgtatttaagaaaaagaaaagtcataaggaggct
gtgaagtatgaagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system