KEGG   Candida tropicalis: CTRG_01611
Entry
CTRG_01611        CDS       T01115                                 
Name
(RefSeq) conserved hypothetical protein
  KO
K12852  116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
Organism
ctp  Candida tropicalis
Pathway
ctp03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ctp00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    CTRG_01611
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome [BR:ctp03041]
    CTRG_01611
Spliceosome [BR:ctp03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U5 snRNP specific factors
    CTRG_01611
 Complex C
   U5 SnRNP specific factors
    CTRG_01611
SSDB
Motif
Pfam: GTP_EFTU EFG_C EFG_IV GTP_EFTU_D2 EFTUD2 MMR_HSR1 ATP_bind_1 Septin EF-G_D2 SRPRB FtsK_SpoIIIE TsaE AAA_29 EFG_III
Other DBs
NCBI-GeneID: 8301261
NCBI-ProteinID: XP_002547305
UniProt: C5M6Y0
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 963 aa
MDSDDDLYDEFGNYIGGSDAENSNDDLPSVIDEQSDHEEQQEERDENHQSSSTSLIKSTI
DSNTSETIYIGQDQEISNEPVIKPIEEKKMKIEYSTNNLNKLPELIYSRDYLISTMNSIP
ERIRNLAILGNLGCGKTTFIDSLILFTHSPSISIKNNLKNFKPLRFMDNHKLEIDREASI
KSSCVCLLLEDMKNRSHVVNLIDTPGHVDFNDEVLSTLNTVDGVVLMIDVVDGLTSRDKL
LVDEIIKRNLPIVLVLNKLDKLILDLRLPVKDSYLKLQYIIDDINDYIESHPLITTYSNH
KELSPELNNVIFASSTFEVSFTLQSFANLYNSDVEFSGKLWGDYYYDVENYKFTTDSQNN
KLPRSFISFVLEPIYKIVTYTITAEPSDKKLGKLLWDNFGVSLHKSDYKKDPQVLLKTVF
KAIFDNHCGLVDVITKSLPSPQKSKTRLLRGTPDKDIPVDVLAEVTKLIESTDGKSFNSL
VRIHKGSIKLGDKIKVYGENFNEDKEDYKIEKVRGIYLPCGRYKVPINEANTGCIVILEG
IDSIIKKGATITGSMENLDYIFDIPKYSINSVFKVAIEPENPSELPILLEGLRKINKNYL
SSIINVEESGEHIILAPGEFYMDCILHDLRFFFTNDLEIKVSDIMAKFSETCIESSFTKI
GISNPSKDIKISITAEPIEDFKLSNAIESERINLDQMSTREISKILRQEFNWDSLASRSI
WAFGPNDLITPDILLDDTLESEISKSELNNYKNSIIQGFKWSVNQGPLCDEPIRNTKFKI
LDVITNNNDLSLINGTNNLASQIIPISRRACYTGFLTAKPRLMEPIYKLISKCTHKSINV
IKKLLQQRRGFIDSVEPIPGTPYFEIIGYLPVNDSAGLTTDLKLHSQGQAIMSLVFSNWE
IVPGDPLDVNVELPNLKPVPEESLARDFMLKTRRRKGLTGEPTLQKYIDSELYIKLKEKG
FVL
NT seq 2892 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggactcagacgatgatttatatgatgaatttggtaactacattggaggatcagatgca
gagaattctaatgacgacctaccatctgttattgacgaacaaagtgaccatgaagaacaa
caagaagaaagagatgagaatcaccaatcatcaagtacatcattaattaaatctacaatt
gattcaaatacatcagaaaccatttatattggacaagatcaagaaatatcaaatgaacca
gttattaaaccaattgaagaaaaaaaaatgaaaatagaatattctacaaataatttaaat
aaattacctgaattgatttattcaagagattatcttatatctacaatgaattcaattcct
gaaagaataagaaatttagcaattctagggaatttaggatgtggtaaaactacatttatt
gattcattaatattatttactcattcaccttcaatttcaattaaaaataatttaaaaaat
ttcaagccgttaagatttatggataatcataaattagaaatcgatagagaagcatccatt
aaatcaagttgtgtttgtttattattagaagatatgaagaacaggtctcacgttgtcaat
ttgatagatactcctgggcatgtagattttaatgacgaggtattatcgacattaaataca
gttgatggagttgtattaatgattgatgtagtcgatggattaacaagtagagataagtta
ttggttgatgaaattataaaaagaaatttacctattgtattagtactcaataaattggat
aagctaatcttggatttaagattacctgttaaagacagttatttaaaactacaatatatt
attgatgatataaacgattatattgaatcacatcctttgatcactacgtattccaatcat
aaagaattatcacctgaattgaacaatgttatatttgcaagttccacatttgaagtttca
tttacattacaaagttttgccaatttatataattcagatgttgaatttagcgggaaatta
tggggagattattattatgatgtagagaattataaatttactactgattcacagaataat
aaacttccaagactgtttatttcatttgtcttggaacctatttataaaattgtcacatat
acgataactgctgaaccaagtgataagaaacttggcaaactattatgggataattttggt
gtttcattacataaatcagactacaaaaaggatcctcaagtattgttgaagactgtattt
aaagccatatttgataaccattgtgggcttgttgatgtaattaccaaatctttaccatca
cctcaaaaactgaaaacaagattattacgtggtaccccagataaagatattcccgtggat
gttcttgcggaggttacaaaattaatcgaatcaactgatgggaaatcatttaattcattg
gttagaattcacaaaggaagtattaaacttggtgataaaatcaaagtatatggtgaaaat
tttaatgaagataaagaagattataaaatagaaaaggtcagaggaatttatctaccatgt
ggaagatataaagttccaataaatgaagctaatactggttgtattgtgattcttgaagga
attgattcaataattaaaaaaggagcaacaattacaggatcaatggaaaatctagattat
atttttgatatacccaaatattctatcaattcggttttcaaagttgctattgaacccgag
aatccttctgaattacctatattattagaaggtttaagaaaaatcaacaagaattattta
tcaagtattattaatgttgaagaaagtggtgaacatataattctagccccaggtgaattc
tatatggattgtatattacatgatttaagatttttctttaccaatgatttagaaattaaa
gtaagtgatataatggctaaattttctgaaacttgtattgaatcatcatttactaaaatt
ggaatttcaaacccttcaaaagatattaaaatttcaataactgctgaaccaattgaagat
ttcaaattatccaatgcaatagaatctgaaagaattaatttagatcaaatgtcaactcgt
gaaatttcaaaaatattacgtcaagaatttaattgggattcattagcatctagatcaatt
tgggcatttggaccaaatgatttaattactcctgatattttacttgatgatactttagaa
tctgaaatatctaaatctgaacttaataattataaaaattcaattattcaaggttttaaa
tggagtgtgaatcagggacctttatgtgatgaaccaataagaaatacaaaatttaaaatt
cttgatgttattacaaataataatgatttatcattaataaatggtaccaataaccttgca
tctcaaattattccaattagtagaagagcatgttatactggatttttaacagcaaaacct
cgattaatggaacctatttataaattaatctcaaaatgtactcataaatcaattaatgta
attaaaaaattattacaacaaagaagaggttttatagattcagttgaacctatacctgga
actccttattttgaaatcattggttatttgcccgttaatgattctgctggtttaactaca
gatttgaaattacattctcaaggtcaagcaataatgtcgttagtgttttcgaattgggaa
attgttcctggtgatccattggatgtaaatgtcgaattgccaaatttaaaaccagtaccg
gaagaatctttggcaagagattttatgttgaaaacaagaagaagaaaaggattaacaggt
gaacctacattacaaaagtatattgattcagaattgtatataaaattaaaagagaaagga
tttgtattataa

DBGET integrated database retrieval system