Candida tropicalis: CTRG_01611
Help
Entry
CTRG_01611 CDS
T01115
Name
(RefSeq) conserved hypothetical protein
KO
K12852
116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
Organism
ctp
Candida tropicalis
Pathway
ctp03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ctp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
CTRG_01611
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
ctp03041
]
CTRG_01611
Spliceosome [BR:
ctp03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U5 snRNP specific factors
CTRG_01611
Complex C
U5 SnRNP specific factors
CTRG_01611
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
GTP_EFTU
EFG_C
EFG_IV
GTP_EFTU_D2
EFTUD2
MMR_HSR1
ATP_bind_1
Septin
EF-G_D2
SRPRB
FtsK_SpoIIIE
TsaE
AAA_29
EFG_III
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8301261
NCBI-ProteinID:
XP_002547305
UniProt:
C5M6Y0
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
963 aa
AA seq
DB search
MDSDDDLYDEFGNYIGGSDAENSNDDLPSVIDEQSDHEEQQEERDENHQSSSTSLIKSTI
DSNTSETIYIGQDQEISNEPVIKPIEEKKMKIEYSTNNLNKLPELIYSRDYLISTMNSIP
ERIRNLAILGNLGCGKTTFIDSLILFTHSPSISIKNNLKNFKPLRFMDNHKLEIDREASI
KSSCVCLLLEDMKNRSHVVNLIDTPGHVDFNDEVLSTLNTVDGVVLMIDVVDGLTSRDKL
LVDEIIKRNLPIVLVLNKLDKLILDLRLPVKDSYLKLQYIIDDINDYIESHPLITTYSNH
KELSPELNNVIFASSTFEVSFTLQSFANLYNSDVEFSGKLWGDYYYDVENYKFTTDSQNN
KLPRSFISFVLEPIYKIVTYTITAEPSDKKLGKLLWDNFGVSLHKSDYKKDPQVLLKTVF
KAIFDNHCGLVDVITKSLPSPQKSKTRLLRGTPDKDIPVDVLAEVTKLIESTDGKSFNSL
VRIHKGSIKLGDKIKVYGENFNEDKEDYKIEKVRGIYLPCGRYKVPINEANTGCIVILEG
IDSIIKKGATITGSMENLDYIFDIPKYSINSVFKVAIEPENPSELPILLEGLRKINKNYL
SSIINVEESGEHIILAPGEFYMDCILHDLRFFFTNDLEIKVSDIMAKFSETCIESSFTKI
GISNPSKDIKISITAEPIEDFKLSNAIESERINLDQMSTREISKILRQEFNWDSLASRSI
WAFGPNDLITPDILLDDTLESEISKSELNNYKNSIIQGFKWSVNQGPLCDEPIRNTKFKI
LDVITNNNDLSLINGTNNLASQIIPISRRACYTGFLTAKPRLMEPIYKLISKCTHKSINV
IKKLLQQRRGFIDSVEPIPGTPYFEIIGYLPVNDSAGLTTDLKLHSQGQAIMSLVFSNWE
IVPGDPLDVNVELPNLKPVPEESLARDFMLKTRRRKGLTGEPTLQKYIDSELYIKLKEKG
FVL
NT seq
2892 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactcagacgatgatttatatgatgaatttggtaactacattggaggatcagatgca
gagaattctaatgacgacctaccatctgttattgacgaacaaagtgaccatgaagaacaa
caagaagaaagagatgagaatcaccaatcatcaagtacatcattaattaaatctacaatt
gattcaaatacatcagaaaccatttatattggacaagatcaagaaatatcaaatgaacca
gttattaaaccaattgaagaaaaaaaaatgaaaatagaatattctacaaataatttaaat
aaattacctgaattgatttattcaagagattatcttatatctacaatgaattcaattcct
gaaagaataagaaatttagcaattctagggaatttaggatgtggtaaaactacatttatt
gattcattaatattatttactcattcaccttcaatttcaattaaaaataatttaaaaaat
ttcaagccgttaagatttatggataatcataaattagaaatcgatagagaagcatccatt
aaatcaagttgtgtttgtttattattagaagatatgaagaacaggtctcacgttgtcaat
ttgatagatactcctgggcatgtagattttaatgacgaggtattatcgacattaaataca
gttgatggagttgtattaatgattgatgtagtcgatggattaacaagtagagataagtta
ttggttgatgaaattataaaaagaaatttacctattgtattagtactcaataaattggat
aagctaatcttggatttaagattacctgttaaagacagttatttaaaactacaatatatt
attgatgatataaacgattatattgaatcacatcctttgatcactacgtattccaatcat
aaagaattatcacctgaattgaacaatgttatatttgcaagttccacatttgaagtttca
tttacattacaaagttttgccaatttatataattcagatgttgaatttagcgggaaatta
tggggagattattattatgatgtagagaattataaatttactactgattcacagaataat
aaacttccaagactgtttatttcatttgtcttggaacctatttataaaattgtcacatat
acgataactgctgaaccaagtgataagaaacttggcaaactattatgggataattttggt
gtttcattacataaatcagactacaaaaaggatcctcaagtattgttgaagactgtattt
aaagccatatttgataaccattgtgggcttgttgatgtaattaccaaatctttaccatca
cctcaaaaactgaaaacaagattattacgtggtaccccagataaagatattcccgtggat
gttcttgcggaggttacaaaattaatcgaatcaactgatgggaaatcatttaattcattg
gttagaattcacaaaggaagtattaaacttggtgataaaatcaaagtatatggtgaaaat
tttaatgaagataaagaagattataaaatagaaaaggtcagaggaatttatctaccatgt
ggaagatataaagttccaataaatgaagctaatactggttgtattgtgattcttgaagga
attgattcaataattaaaaaaggagcaacaattacaggatcaatggaaaatctagattat
atttttgatatacccaaatattctatcaattcggttttcaaagttgctattgaacccgag
aatccttctgaattacctatattattagaaggtttaagaaaaatcaacaagaattattta
tcaagtattattaatgttgaagaaagtggtgaacatataattctagccccaggtgaattc
tatatggattgtatattacatgatttaagatttttctttaccaatgatttagaaattaaa
gtaagtgatataatggctaaattttctgaaacttgtattgaatcatcatttactaaaatt
ggaatttcaaacccttcaaaagatattaaaatttcaataactgctgaaccaattgaagat
ttcaaattatccaatgcaatagaatctgaaagaattaatttagatcaaatgtcaactcgt
gaaatttcaaaaatattacgtcaagaatttaattgggattcattagcatctagatcaatt
tgggcatttggaccaaatgatttaattactcctgatattttacttgatgatactttagaa
tctgaaatatctaaatctgaacttaataattataaaaattcaattattcaaggttttaaa
tggagtgtgaatcagggacctttatgtgatgaaccaataagaaatacaaaatttaaaatt
cttgatgttattacaaataataatgatttatcattaataaatggtaccaataaccttgca
tctcaaattattccaattagtagaagagcatgttatactggatttttaacagcaaaacct
cgattaatggaacctatttataaattaatctcaaaatgtactcataaatcaattaatgta
attaaaaaattattacaacaaagaagaggttttatagattcagttgaacctatacctgga
actccttattttgaaatcattggttatttgcccgttaatgattctgctggtttaactaca
gatttgaaattacattctcaaggtcaagcaataatgtcgttagtgttttcgaattgggaa
attgttcctggtgatccattggatgtaaatgtcgaattgccaaatttaaaaccagtaccg
gaagaatctttggcaagagattttatgttgaaaacaagaagaagaaaaggattaacaggt
gaacctacattacaaaagtatattgattcagaattgtatataaaattaaaagagaaagga
tttgtattataa
DBGET
integrated database retrieval system