Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly): 135957467
Help
Entry
135957467 CDS
T10781
Name
(RefSeq) otoferlin-like
KO
K19949
otoferlin
Organism
cvj Calliphora vicina (urban bluebottle blowfly)
Brite
Membrane trafficking [BR:
cvj04131
]
Exocytosis
Small GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
135957467
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
135957467
NCBI-ProteinID:
XP_065364288
LinkDB
All DBs
Position
4:65688836..65860740
Genome browser
AA seq
2165 aa
AA seq
DB search
MSLTIKLIRFEVPKAKTNLIGRVEFRGVAHITSELCSSSSEIDVNQSFIWPLARPACDEE
PLIVELRTQTTKTLIKTGLSHASGGLMGGTATGTITSSSKCIGQYMMLMQGLIHTGFIHV
QDQLVDISTSRSIPVVVTFEAKYVSPDDAAGNFEPTNLVRSIQQQSISCSSQSLEDDQQM
LLDIEQNIANLERSLNKESSGNLACGSGAASSGSESYVSAKKRHLLRRVMSAANPNATTS
SAAATAANTLALHRQRAEMKFEKYGKTPTRKGSTSMTVGLVSAGASSDAATPGGSPVAPV
KEKRMTIRAVRNIIRLGRSRQSSQTRDSSTEDEGRSPLIFEQENGAAVNNTSMPNADTMD
PQHFIRGNNGLITATTTPGAESGQSNQSSDLEELQHFDQGKMIKQMTRTADHLKSQDFQV
CITIIEARQLPGLNMDPVVCIQVGDQKKYTSVKESTNCPYYNEYFVFDFHMPPVMLFDKI
ITLSVLQSRSVFSRNKLIGNFKLDVATVWHQKDHQFYHKWALLTDPDDFYSGPKGYLKCD
IGIIGKGDTVKVPQKSEKDPDDIEANLLLPDGVPIERQRAKFIVKIYRADGLPRMNSSLM
ANVKKALTGESKDLVSPYVQVSFAGLTGKTTVKKNAYAPVWNEQLVFTEMFPPLCQRIKI
QLRDADPMKPSIIGTHYIDLKQTSNDGEKGFLPTFGPSFIHLYGSTRDYTLLDQHSNLNT
GLGEGVSYRARLLIAIRTEITDNIEITTEKNVELEPTQLISESSYSRNEEFFLFGSIVEA
SMIDKKISDKTVFFELSLGNAGNSLDGHNESFATALDDGEDGCVLETVDTTSFSSTTNAC
KPISHDKNHYYLPYWDYKPCMDVRCTLPDLRRRMYNSNMLSKMAEKFEDGLNETKRLIED
EDAKAEVRLRSILEDLASACLRYQTITKTNSMSAGSGKTKLDKERIKLCLREIESLGNLA
RNLRALVTRSSLSERFKQAQGYMQKLKFLIDDPQHSLPDIFLWMIANGKRYAYHRMSARD
LIYSLTDEESGMHCGKVQTIFLRLPGKQSTGPASWFIQAKLSIYLWLGVVNHKGHFFDGL
PIGYDLSHELRNAERPGAMAPNNIHYLEKSTFQLRAHIYQARSLIGSDASGLSDPYATVY
ITEFAKTTQVIEETLSPTWDELLVFDEILVYGTKDEIKKSPPTIIIEIYDQDKVGKSEFI
GRAIAQPRVKLRENPYVTPTLEWFDIVRGPDNAGELLAAFEMLEIGSTDMPRLTEPKNVL
AEIKKERNNVPQQNTIFPVPKEVRPNLAKFRLEVLFWGLRDLKRVHLMSVDKPRIDVECS
GKILSSNIIQNAKKNPNFPNMLKSIELELPLEETYAPPITIRCVDCRSFGRYTLVGTHQI
TSIHRYLFKPPPKEDITKYKTIGGQIILSAPLNEESLQNLVDGYGMQPMLDSLQQASMKD
FYGNRRSSCDQFTLYGAACVTKMVKKQNSKKKTSRRGSNKENQLVQEQDSDDELSRDWWT
KYFWSYERLIDNAKAEKALNHTEKYLTPPPTQLTQNSNKLGAKGAKFVQKLSPKAMTGLG
RNKPDFNNATNIIKSKPLNSTTALCQIYPNELESQAEFNNFREWLQSFALYRGKKTGDST
EDENRTVGFFKGTIKVYRLPPPKGVDYPIPNLPANEPIHVLVRVYIVKATDLHPMDLNGK
ADPYVVLHLGSKRISDKDNYVSKQLNPVFGKCFEIEVTFPQDSMLTVQIFDWDLVGSDDL
IGETRIDLENRFYSKHRATCGLALRYEDCGYNQWRDPMKPSQILSKLCKENKLDTPHYFQ
DRVAIGKYCMTFSDEEVIAWNGPSTCRNRDEHLALACLHRWSEIPNVGCKIVPEHIESRP
LYNPDKPGIEQGKIEMWVDMFPMDMPLPGPAVDISPRKPKAYELRIIIWNTDDVVLEDDA
FFTGEKMSDIYVKGWLKGPQDCQSTDIHYRSLTGEGNFNWRFIYPFEYLAAEERIVLSRR
ESLFSWDETEVKIPARLELQVWDADHFSADDFLGAISFDLNRFPRGAKSSKLCTLDMLKT
DNVPTVNIFKQKRVRGWWPFYIKKQNEEMELTGKVEAEFHLLTKEEAEQNPAGHGRNEPD
PLEKPNRPDASFMWFVNPLKSIRYIVWHNYKWAILKALLLCAIALFFVLFVYSVPGYSVK
KMLGA
NT seq
6498 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgttgaccatcaaactaatacgttttgaagtgcccaaggccaaaacaaatctaata
ggacgtgtggaatttcggggtgttgctcatataacttcagaattgtgttcgtcttcttca
gaaattgatgtcaaccagtcatttatatggcccttggcacgacccgcctgcgatgaggag
cctctaattgtcgaattgcgaacacaaacaacaaaaactctaattaagaccggcttaagt
catgcctcgggtggtttaatgggcggcacagccactggcactataacgagcagcagcaaa
tgtatcggacaatacatgatgttaatgcaaggtctcatacataccggttttatacatgtg
caagaccaattagttgatatatcaaccagtcgttcaataccggttgtagtcacatttgaa
gctaaatatgtatctcccgatgatgctgctggtaattttgagccaacaaatttggtacgc
tccatacaacagcaaagcataagttgtagcagtcaaagtttggaagatgatcaacagatg
ctacttgacatcgaacagaacatagcgaacctggagcgaagtctgaataaagaatccagt
ggcaatttagcctgtggcagtggagcggcctctagtggcagtgaatcgtatgtatcagca
aagaaacgacatctattgagacgcgtgatgtcggccgccaatccaaatgccacaacctca
tcagcagctgccacagcagctaatacattggcgctgcatcgccaacgtgctgaaatgaaa
ttcgagaaatatggcaaaacaccaactagaaaaggcagcacctccatgaccgttggtctg
gtatcggcgggagcatcaagtgatgctgccacaccaggcggaagtccagtggcacctgtc
aaagagaaacgtatgaccatcagagctgtacgcaacataatacgtttggggcgtagtcga
cagagttcacagacacgtgacagcagcactgaggatgagggcagatcacccttgatattt
gaacaagaaaatggtgcggctgtcaacaacacatcaatgccaaatgctgatacaatggac
cctcaacattttattagaggcaataatggccttataacagccactaccacaccgggagct
gaaagtggacaatcaaatcaatccagtgatctggaggaattgcaacactttgatcagggc
aaaatgattaaacaaatgacccgtactgctgatcatctaaaatctcaagactttcaagtt
tgtataaccattatagaggccagacaattgcccggtttaaatatggatccagtggtttgt
atacaagtgggagatcaaaagaaatataccagtgttaaggagagtacaaattgtccttac
tacaacgaatattttgtttttgattttcatatgcctccggtgatgttgtttgataaaatt
attactctgtcggttttacaaagtcgtagtgtttttagtcgtaataaattgattggcaac
tttaaattggatgtagcgacagtgtggcatcaaaaagatcatcaattttatcataaatgg
gccttattaacggatcccgatgatttctatagtggacccaagggttatttaaaatgtgat
attggtatcattggcaaaggtgataccgttaaagtgccacagaaatctgaaaaagatcca
gatgacatcgaagcaaatctcttattgccggatggtgtacccattgaaagacaacgagct
aaatttatagtgaaaatctatagagcagatggtttgccccgcatgaattcctcactaatg
gccaatgttaagaaagctttaaccggagaatctaaggacttggttagtccttatgtccaa
gtctcttttgccgggctaacgggcaaaacaactgtaaagaaaaatgcctatgctccggta
tggaatgaacaattggtgtttaccgaaatgtttcctccattgtgtcaaagaattaagatc
caactaagagatgccgatcccatgaaaccctccattataggcactcactatatagatttg
aaacaaacctccaatgatggcgaaaagggttttctgcccacttttggtccctcatttata
catctctatggttctacccgtgattatactctattagatcaacattccaatttaaatact
ggcctgggagagggtgttagctatagagcccgcttactcatagccatacgtactgaaatc
accgataacatcgaaataaccaccgaaaaaaatgtcgaacttgaacccacccaactgata
tccgaatcatcttattcgcgcaatgaagaattctttttgttcggttccattgtggaggcc
tctatgatcgataagaaaatcagcgataaaaccgtattctttgagttaagtttgggtaat
gctggcaattctttggatggtcataatgaaagttttgccactgccttggatgatggtgaa
gatggttgtgtattggagacagtggatacgacttcgtttagcagtactacaaatgcttgc
aaacccatatcacacgataagaatcattactatctgccgtattgggattataagccgtgt
atggatgttagatgtactttgccggatctgaggagacgaatgtataacagtaatatgttg
tcgaagatggcggagaaatttgaggatggcctaaatgaaaccaaacgcctaattgaggat
gaagatgccaaagctgaggtgcgtctacgatcaattctagaagatttagcatctgcctgt
ctgcgttatcaaacgataacaaaaacgaattccatgagtgctggcagcggtaaaaccaaa
ctagacaaagagcgcattaaattgtgtctaagagaaattgaaagtttaggtaatttggca
cgaaatctaagagccttggtaacacgcagctcccttagtgaacgttttaagcaggctcaa
ggttatatgcaaaaattaaaattcctaatagatgatccccaacattctctaccggatata
ttcttgtggatgatagcgaatggcaaacgttatgcttatcatcgtatgtcggccagagat
ttaatttattcacttacggatgaagaatccggcatgcattgtggcaaggtgcaaacaata
ttcctacgtttaccgggtaaacaatcaacgggaccagcaagttggtttatacaagccaaa
ctctccatttatctgtggctgggagtggttaatcataaaggccatttctttgatggtcta
cccataggctatgacttatcacatgagttgagaaatgccgaaagacccggagccatggct
cccaataatatacactatttagagaaatcgacctttcaactacgagcccatatttatcag
gcacgttctttgattggctctgatgcctctggcttaagtgatccctatgccacagtttat
ataaccgaattcgccaaaaccacccaagtcatagaggaaactctaagtcccacctgggat
gaactattggtgtttgatgaaattttggtttatggcactaaagacgaaattaagaaaagt
cctcccaccataatcatagagatttacgatcaagataaagtaggcaagtcagagtttata
ggacgagccatagcccaacccagagtcaagctaagagaaaatccctatgtaacacccacc
ttggaatggtttgatattgttagaggacccgataatgctggagaactattggccgccttt
gaaatgctggaaattggttccaccgatatgccccgcctgaccgaacctaaaaatgttttg
gccgaaataaaaaaggaacgaaataatgtaccacaacagaacaccatatttccagtaccc
aaagaagttcgtccaaatctggctaaatttcgtttagaggtactattctggggcctcaga
gatttgaaacgagtacacctaatgtcagtagacaaaccacgtattgatgttgagtgttcg
ggcaaaattttaagttcgaatatcatacagaatgccaaaaagaatcctaattttccaaat
atgttaaagtccatagagttggaattgcctttggaggagacctatgctcctcccataacc
ataagatgtgtagattgtcgctcgtttggtcgttacactttggtgggcactcatcagatc
acttccatacatcgttatctgtttaagccaccaccgaaagaggatataaccaagtataag
acaattggtggtcagatcattttgtcggcacccttaaatgaggagagtcttcagaatctt
gtggatggttatggcatgcaaccgatgttggattcgctgcaacaggccagcatgaaggat
ttctatggcaatcgcaggtcatcatgtgatcaatttactttgtatggggcggcatgtgtt
acgaaaatggtaaaaaaacaaaattccaaaaagaaaacctctcgacgtggcagcaacaaa
gaaaatcagctggtgcaagagcaagattccgatgatgaattgagccgtgattggtggact
aaatacttctggtcctatgaacgtctcattgacaatgccaaagctgagaaggctctcaat
cacacagaaaaatatcttacaccgccacccacacaacttacacaaaactccaataaattg
ggagcaaaaggtgcgaaattcgtacaaaagttaagtcccaaagctatgactggcttgggc
cgcaataagcccgatttcaacaatgcaacaaatataatcaaatcaaagcccctcaatagc
actacagcattatgtcagatctatcccaacgaactggagtcgcaagcggaattcaacaat
ttccgtgaatggctgcagtcatttgctttgtacagaggcaagaaaacaggagactctaca
gaggatgaaaatcgcacagtgggttttttcaaggggaccattaaagtttaccgcctacca
ccacccaagggtgtagattatcctatacccaatttgccagcaaatgaacccatacatgtg
ctcgtcagagtttatatagttaaggccaccgatttacatcccatggatttaaatggcaaa
gctgatccctatgtggttctgcatttgggtagtaaacgtatttccgataaagacaactac
gttagcaaacagctgaatcctgtatttggtaaatgtttcgaaatagaggtaacttttccc
caggattccatgttaacagtgcagattttcgattgggatttggtgggctctgatgatttg
attggtgagactcgcatagatttggagaatcgtttttacagcaaacatcgagccacttgt
ggtttggccttaagatatgaagattgcggctacaaccaatggcgtgatcccatgaaaccc
tcgcagattttatcgaaactatgcaaagaaaataaattggatactccacattattttcaa
gatcgcgtggctattggcaagtactgtatgaccttctccgatgaggaggttatagcctgg
aatggtcccagtacttgccgtaaccgcgatgaacatttagcattagcttgcttacatcgt
tggagtgaaataccgaatgtgggttgtaagattgttccggagcatattgaaagtcgtccc
ctatacaatcccgataaaccgggtatagaacagggtaaaattgagatgtgggtggatatg
tttcccatggatatgccgctgccaggaccagcagtggatatatcacctcggaaacccaaa
gcttatgaattgcgcattataatatggaatacagatgatgtggtgttggaagatgatgcc
ttctttacgggagaaaaaatgtccgatatttatgttaagggatggcttaaaggtccccaa
gattgccagtcaaccgatatccattatcgctctttaaccggtgagggtaatttcaattgg
cgttttatctatccctttgaatacttggcagccgaggagagaatagtgttgtcccgaaga
gaatctttattcagctgggatgagacagaggtgaaaatccctgctcgtttagagctgcaa
gtatgggatgctgatcatttttcggcagatgattttttgggtgccatttcctttgatttg
aatcgttttcctagaggtgctaaatcttccaaattgtgtactttggatatgctcaaaacc
gataatgtacccactgtaaatatttttaaacaaaaacgtgttagaggttggtggccattt
tatattaagaaacagaatgaagagatggagctgacgggtaaggtggaagctgaattccat
ttgttgactaaagaggaagccgaacaaaatcctgccggtcatggacgcaatgaacccgat
ccattagagaaaccaaatcgtccagatgcctcctttatgtggttcgtaaatcctttgaag
tccatacgctacattgtctggcacaattacaaatgggcaatactgaaggcgctactcctg
tgtgccattgcactattctttgtgctctttgtctactcagtacctggttattcggttaag
aaaatgctgggtgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
