Crocosphaera watsonii: CwatDRAFT_1792
Help
Entry
CwatDRAFT_1792 CDS
T05097
Name
(GenBank) Hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
cwa
Crocosphaera watsonii
Pathway
cwa01501
beta-Lactam resistance
cwa01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cwa00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
CwatDRAFT_1792
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
CwatDRAFT_1792
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cwa02000
]
CwatDRAFT_1792
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
cwa01504
]
CwatDRAFT_1792
Transporters [BR:
cwa02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
CwatDRAFT_1792
Antimicrobial resistance genes [BR:
cwa01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
CwatDRAFT_1792
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
YppG
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EAM49108
UniProt:
Q4BYX0
LinkDB
All DBs
Position
complement(8161..11286)
AA seq
1041 aa
AA seq
DB search
MNFVDFFIKRPVFSSVCSFLILLVGLVSLFNLPLDRFPEISPTRVQVQSTYDGASAEVVE
NAVTNVLERQINGIEGLRYISSSSSNSGTSSITVTFDSSRNPDLAAVDVQNQVSVVQSQL
PDVVQRTGVQVRRQGDNLLLGIGLFSDDDRYDPVFLSNYTDQYLLDAIKRLDGVGNVRIF
GERRYAMRLWLDPNKLASRGLTTQDVVNALSEQNLQVGAGKIGAEPAPEGQQFQFDLRAI
SQLKDPKDFENLLLKTDENGGLVYFKDVGRAELGAQDYNTFLRFRGQEAVGMGIYQRTGS
NALEVAQKVKAEMERLSVFFPPGLKYIVAFDTTEFVEESLSEVVKTLLVAVGLVIVVILI
FLQNWRTTLIPALTIPLALIGTFAFIKVFDFSINSLTLFGLTLATGMVVDDAIIVVEQIN
RYIEDNDMSPQAAASKAMGELSSAVVATSLVLMAVFVPVAFFPGTTGALYRQFALTIAFS
IVISTFLALTLTPSLCALLLKKGQKLPGILGTIFNQFNHLLDCLGRQYQRSLHTLANLRL
AVVGVFVALLLVTVWLYNLVPTAFTPEEDQGYFITIIQAPQGVSLQYTSKVMRQVENAIL
EEPDVRATFAVGGFAFGGSSASQGVIFSPLKPFKERRGPQHSAQAIIGKLWGKFSQIPEA
NIFPVNPPSIRGLGSFGGFVYQLQDQQGNEDINKLVEVMEPLVGAANQNPAIGRAFSRFS
ANTPQYIIEVNRNKAQALQVSIDDIFSTLQTALGSRYVNDFTLQQRTYRVYVQADKQFRS
NPQDINKLYVRSQTDQMVPLSNLVSLTATTGAQTINHYNLYRSVEVNGSPAPGVGSGTVI
ETMETLSKQLLPPGFGYEWSGTSLEELNSAGLAPIIFGLGLLFVFLVLAAQYENYIDPLI
IILAVPLAILGALSAQLLRGFANDVYCQIGLVMLIGLASKNAILIVEFANQLRDEGLPLV
KAAIEASQERLRPILMTAVSTLLGIFPLVVATGAGSGSRQSLGTAVFGGMLVASFLSLFV
VPILYIVIKMTTEKFLPKKSS
NT seq
3126 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttgttgacttttttattaaacgtccagttttttcttctgtttgctcttttcta
attttattagtaggattagttagtttatttaatctacctctggatagatttcctgaaatt
agtcccaccagggttcaagttcaatctacctatgatggggctagtgctgaagttgtagaa
aatgctgttaccaatgttttagaacgacaaattaatggaattgaaggactaagatatatt
agttctagcagtagtaatagtggaaccagcagcattaccgttactttcgactcttcgaga
aaccctgatttagctgccgttgacgtgcaaaatcaagtttctgtggtgcaatcacagttg
ccagatgtagtacaaagaactggggttcaagtaagaagacaaggggataatttactgttg
ggaattggtttatttagtgatgatgatcgttatgatcctgtctttttaagtaactataca
gatcaatatttattagatgctatcaaacgtcttgatggcgtgggaaatgtccgcattttt
ggagaacgtcgttatgcaatgcgtctctggttagaccccaataagttagcaagtagaggc
ttaactacccaagatgttgttaatgctttgtcagaacaaaatttacaggtaggagccgga
aaaataggcgcagaacccgcccccgaaggacaacaatttcagttcgatttacgggcaatt
agtcaattaaaagatcctaaagattttgagaatttattattaaaaaccgatgaaaatggc
ggtttagtttacttcaaagatgttggtagggcagagttaggggcgcaagactataacact
tttctacggtttcggggacaagaagcagtgggaatgggtatttatcaaagaacgggatca
aatgccttagaagttgcccaaaaagttaaggcagaaatggagagattgtcggtatttttt
ccccctggtttaaaatatattgttgcttttgatactactgaatttgtagaggaatcttta
tcggaagtagtgaaaactttgctcgtcgccgtgggcttagttattgtggttattttaatc
tttttacaaaattggagaactactttaattccggctttaactattcctttagccctgatt
ggaacctttgcttttattaaagtattcgatttttcaattaatagtttaactctatttggt
ttaaccctagctaccggaatggtggtggatgatgccatcattgtcgttgaacaaattaac
cgttatatcgaagataatgatatgtctccccaagctgctgctagtaaagctatgggggaa
ttatcatcagcagttgtggctacttcattggtgttaatggcggtgtttgttccagtggca
ttttttccgggaactaccggggctttataccgacagtttgccttaactattgctttttct
attgttatttctacctttttagccttaactttaactccttctttatgcgctttactttta
aagaagggacaaaagttacctggaattttaggaacaattttcaaccaatttaatcacctt
ttggactgtttaggaagacaatatcagcgatcgctccataccctagctaacctgcgctta
gcagttgtcggtgtcttcgtggccctattattagtcacagtctggttatataacttagtt
cccaccgcttttaccccagaagaagatcaaggctatttcatcactattattcaagctcct
caaggggtttccttacaatacactagcaaggtgatgagacaggtagaaaacgctatttta
gaagagccagacgtgagagcaacctttgctgtgggagggttcgcttttggggggagtagt
gccagtcaaggggtgatttttagccccctgaaaccctttaaagagcgtcggggcccccaa
cattccgcacaagcaatcatcggtaaactatggggtaagtttagtcaaataccagaagct
aatatttttcccgttaaccccccttctattcgaggtttagggagttttggtggttttgtt
tatcaactgcaagatcaacagggcaacgaggatattaacaagttagtagaggttatggag
ccgttagtgggtgcagctaaccaaaaccctgctattggtcgggcatttagtcgcttttcc
gctaatacccctcaatatatcatcgaggtgaaccgtaataaggcccaagcgttacaagtc
tccatcgacgatatttttagcaccctacaaaccgctttaggttctcgttatgtcaatgat
tttaccctacaacagcgtacctatcgggtttatgtacaagcggataaacagtttcgctct
aacccccaagatatcaataagttatatgtgcgatcgcaaaccgatcaaatggttccctta
tctaacctcgttagcttgactgctactactggcgcccaaaccattaaccactataattta
taccgttctgtggaagttaatggtagccctgcgccgggggtgggttccggtactgtcata
gaaacgatggaaactctctctaaacagttgcttcccccaggttttggttacgaatggtcc
ggcacttccttagaagaactaaattcagcaggtttagcaccgattatttttggtttgggg
ttactgtttgtcttcttagtattggctgcacaatacgaaaattacatcgaccccttaatt
attattttggcggttcctttggctattttaggagcattatctgcacaattattaagaggg
tttgctaacgatgtttattgtcagatagggttagtaatgttgatcggtttagccagcaaa
aatgctattttgattgtagagtttgctaaccagttacgggatgagggtttacctttagtt
aaagcagctatagaagcatcacaagaaaggttaagaccaattttaatgaccgcagtttct
acattactggggatatttcctttagtagtagcaaccggtgcaggttcggggagtcgtcag
tctttgggtacagcagtgtttgggggaatgttagtcgcttctttcttgagtttatttgtg
gtccctattctttatattgtgattaaaatgaccactgaaaaattcttacctaaaaaatca
tcataa
DBGET
integrated database retrieval system
