Rippkaea orientalis PCC 8802: Cyan8802_0516
Help
Entry
Cyan8802_0516 CDS
T00968
Name
(GenBank) transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
cyh
Rippkaea orientalis PCC 8802
Pathway
cyh01501
beta-Lactam resistance
cyh01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cyh00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
Cyan8802_0516
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Cyan8802_0516
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cyh02000
]
Cyan8802_0516
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
cyh01504
]
Cyan8802_0516
Transporters [BR:
cyh02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
Cyan8802_0516
Antimicrobial resistance genes [BR:
cyh01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
Cyan8802_0516
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACU99464
LinkDB
All DBs
Position
complement(506363..509683)
Genome browser
AA seq
1106 aa
AA seq
DB search
MLLSFANAFIKRPVLSTVCTIVIILLGTIAMALLPLDKLPEIAPKKVAVSANYIGADAKT
TEDNVTTVLEREINGTEQVRWIDSFTDNTGNVTVNVTFPTEMDRNTAQVLVQNRVSQAQS
TLPSVVNQAGLRTNTQSPSLTLVYGFYVENGPDGQPLYDTTFIYNYVDRYIWNDMKGLPG
VGSVALFGGANYAMRIWLDPDKLAARGLTALDVVGTINEQNFEVGIGRIGQQPAPQDQQF
ELPLRVAGRFTNVAEAEDMVVKVGEDGTLIRIKDVGYAELGMENYDTKVNVDGNPGVAFL
IYQLPGSNALETADAAKAKMAELQQSFPPGLKVVIGLDNTLFVNASLEDLMITLLQAIAL
VVLVIFVFLQDWRTTVIPAIAIPVALVGAMIGLKAFGFTLNQLSLFACVLATGLVVDDGI
VIVEAVSNKLSQGMRPRQAAMDAMDELFGATIATSVVLMAVFVPVTFFPGTTGIVYRQFA
LTIIFAVAFSTFNALTFSPTMSAILLSPPQPKHGPLALFFNWFNRGFDLVREGYRRFINF
LTHVRILVMVVFIAGLVGTAWIYQTMPSGFIPAEDQGYFFGITEAPPGVSLNYTYAIDRQ
TTQIIQNMENADQVLDHVISLTGFSFEGRNANKSLTFVKLKPWGERPGPQKSAFGIIQKL
NRAFAQQISGARVFAANAPPVDGLSSFDGSEIFIQDRQLKGIDALIENVQRVMAAANQRP
EIGSTFTTFTFNSPLITMEIDRQKAKAQNIAIDDILRTLQTYIGSNFVNQFVFEGRLYRV
YAQATPQDRANPEDIGRLYVRSRDGAIVQLSNLVTPTQTTYPPILTRYKTYPAIKLIISP
APGYSSGQVIQAMEEVANETLQPGFGYAWTNTAAEEKSSGGAAPIVFGLAFVMVFLVLAA
QYESYIDPTIILLTVPLAILGALGAIWIRVSFVQTAPFNPGNGIWPILNNNMYAQVALVM
LIGLAAKNAILIVEFANQARDLGMTITRSAIYAAEERLRPILMTAVSSLVGFAPLLTASS
VGAVSRWSLGTAIFGGLALATVLSLVLVPILYIVVKNFEKYLLDGGKKPPSPPSSGNGHS
KPSPPPEPQPENEEIAPVFKTSPQNE
NT seq
3321 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttactctcctttgccaacgcttttattaaacgacccgttctcagtactgtctgcacc
attgtcattatcctcttggggacgatcgccatggcattattgcccctggataaattgcca
gaaattgccccaaaaaaagtagccgtatccgctaattacatcggtgctgatgccaaaacc
accgaagataacgtcaccaccgtcctagaacgagaaatcaacggaaccgaacaagtcagg
tggattgactccttcaccgataatacgggaaatgtcaccgttaacgtcacctttccgacg
gaaatggatcgtaatactgctcaagtgttagtccaaaaccgagtttctcaagcgcaatcc
accttaccctcggtagtgaaccaagccggactcagaaccaacacccaatcccccagttta
accctggtatatggattttacgtcgaaaacggtcccgatggtcagcccttgtacgacacg
acctttatctacaactacgtcgatcgctacatctggaacgacatgaaagggctgccgggg
gtgggttcagttgccctatttgggggagcaaactatgccatgcgaatttggctagatccc
gataaattagccgctagaggactgacagccttagatgtggtggggacgatcaacgaacaa
aattttgaggtagggattgggagaattggacaacaacctgccccacaagaccagcagttt
gaattgcccttgcgagtagctggaagatttaccaacgtcgccgaagccgaagatatggtg
gtcaaagtgggagaagatggcacgttaatccgtatcaaagatgtaggctatgccgaattg
gggatggaaaactatgataccaaagttaatgtagatggtaatccaggggttgccttttta
atctatcagttacctggaagtaatgccctcgaaacggcagacgcagctaaagcaaaaatg
gcagagttgcaacagagttttccccctgggttaaaggtagttatcgggttagacaatacc
ctgtttgtcaatgcgtccctcgaagatttaatgatcaccttactacaggcgatcgcctta
gttgtcctggtgatctttgttttcctccaagactggcgtaccactgttattcccgcgatc
gccattcccgtcgccttagtcggggcaatgattggcttaaaagcctttgggtttaccctc
aaccaattaagtctgtttgcttgcgttttagccacagggttagtggtagatgatgggatc
gtaattgttgaagcggtttcaaacaaattatcccaaggaatgcgccctaggcaagcagcc
atggacgcgatggatgaactattcggggcaaccattgctacctcggtagtcttgatggcg
gtgtttgttcccgtgacattcttccccggtacaacggggatcgtttaccgtcagtttgcc
ttaacgattatttttgcggtggcgttttccacctttaacgccttgaccttctcccctacc
atgtcggccattttgctgagccctccccaaccaaaacatggacctttagccctctttttt
aattggtttaaccgaggcttcgatctggttcgggaaggatatcggcgttttatcaatttt
ctaactcatgttcgtattctcgtgatggtggtctttattgcagggttagtcgggacagcc
tggatttatcagaccatgccctccgggttcattccggctgaagatcaaggctatttcttc
ggcattacggaagcccctccaggagtttctctgaactacacctatgccattgatcgccag
accacccaaattattcaaaatatggaaaacgccgatcaggtgttagatcatgtgatttct
ttaacggggttttcctttgaaggaagaaatgccaacaaatccctgaccttcgtcaaatta
aagccctggggagaacgccccggcccccaaaaatctgcctttgggattattcaaaagctc
aatcgagcctttgctcaacaaatctccggggcgcgggtatttgcagctaatgcccctcct
gtggatgggttaagtagttttgatgggtctgaaatttttatccaagaccgtcaattaaag
gggatagacgctctaattgagaatgtgcaacgggtgatggcagccgccaatcaacggcca
gaaattgggtcaacctttacgacctttaccttcaatagccctttgatcaccatggagatt
gatcgccaaaaggctaaagcccaaaatatcgccattgatgacattttaagaaccctacaa
acctatattggctccaattttgtcaatcaatttgtttttgaaggtcgtctctatcgggtt
tatgctcaagcaaccccacaagatcgggcgaaccctgaagatattggacggttgtatgtg
cgatcgcgtgatggagcgattgtccaattgagcaatttagtcaccccaacccaaaccacc
tatcctcccattctgacccgttataagacctatccagctattaaattgattatttctcct
gctccgggttatagttcaggacaggtgattcaagccatggaagaagtcgccaatgagacg
ttacagccgggttttggctacgcctggacgaatacggcagccgaggaaaaaagctctggt
ggggctgctcccatcgtctttggtttagcctttgtcatggtgttcttggtactggctgct
cagtatgaaagttatattgaccccactatcatcctactcacggttcctctagccattttg
ggggcattgggggcaatttggatacgggtcagctttgttcaaacggctccctttaacccc
ggtaatggcatctggccgatccttaataacaatatgtacgctcaagtagctttagttatg
ttgatcggattagcagccaaaaacgcgattttgatcgtagaatttgcgaaccaagcccgt
gatttgggcatgaccattacgagatcagcgatttatgctgccgaagaacgcttacgcccc
attttgatgacagccgtctcgtctctcgtcgggtttgcccctctattaaccgcttctagt
gtgggtgcagtcagtcgttggtcattagggacggctatttttggcgggttagccttagcc
acggtcttaagtttagttctcgttcccatcttgtatattgtggtcaagaactttgaaaaa
tacctcctcgacggaggcaaaaaacctccgagtccccctagttcgggtaatggtcacagt
aaaccgtctccccctcctgaacctcaacccgaaaacgaggaaattgcccctgtgtttaaa
accagtcctcagaatgagtag
DBGET
integrated database retrieval system
