Dermochelys coriacea (leatherback sea turtle): 119862351
Help
Entry
119862351 CDS
T09064
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1 isoform X1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
dcc
Dermochelys coriacea (leatherback sea turtle)
Pathway
dcc04350
TGF-beta signaling pathway
dcc04518
Integrin signaling
dcc04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dcc00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
119862351 (FBN1)
09133 Signaling molecules and interaction
04518 Integrin signaling
119862351 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
119862351 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
dcc00536
]
119862351 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
dcc00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
119862351 (FBN1)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_PEAR1L
EGF_TEN
EGF_Teneurin
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119862351
NCBI-ProteinID:
XP_038274879
LinkDB
All DBs
Position
10
Genome browser
AA seq
2868 aa
AA seq
DB search
MRLGRLLKFALGFTVLLSSRTSEGAEGNLEADSVKETRASRAKRRGQGGGGGGHDALKGP
NVCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPNGQIAPSCGSKSI
QHCNIRCMNGGSCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVCENGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQ
CERDYRTGPCFSLVTNQMCQGQLTGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFI
PNIRTGACQDVDECQAIPGICQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEVTQKCEDIDECSTIP
GICDGGECSNTVSSYFCKCPPGFYTAPDGTRCIDVRPGYCFSSLTNGRCGNQLPQVLTKM
QCCCDTGRCWSPGATSAPEMCPIRATEEYRKLCVVAGLTPGRPDLPPGLPDVYPPLIPVI
PQRPDIVFPPPSRGPPPHVVLPVNFTDYCQLFRHLCLNGRCIPTPGSYRCECNKGFQLDV
RGECIDVDECEKNPCISGDCINTQGSYICQCRAGYQSTLTRTECRDIDECLQNGRICNNG
RCINTDGSFHCVCNAGFHVAVDGKNCEDMDECSIRNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFQL
ASDGRYCNDIDECETAGICMNGRCVNTDGSFRCDCFPGLVVGLDGRVCVDTHMRSTCYGG
YKRGQCVKPLFGAVTKSECCCASTDYAFGEPCQPCPAQNSAEYQALCSSGPGLDLEGRDI
NECALNPDICPNGICENLRGTYKCICNSGYEVDASGKNCIDIDECALNTLLCDNGQCRNT
PGSFTCTCPKGFIYKPDLKTCEDINECESNPCVNGICKNTLGSFACECSPESTLDTTRTI
CIETIKGTCWQTIVNGRCEININGATLKSQCCSSLGAAWGSPCTPCERDPICSKGYSRIR
GTLCEDVNECEVFPGVCPNGQCVNTLGSFVCQCPSGMILDASGRTCLDIRLETCYLKHED
EECTLPIAGRHRMDSCCCSVGAAWGPECEECPVKATPEFEALCPRGLGFASRGEIINGKP
FFKDINECKMIPSLCTHGKCRNTIGSFKCKCDSGFALDSEERNCTDIDECRISPDLCGQG
ICVNTPGDFECKCFEGYESGFMMMKNCMDIDECQRNPLLCRGGICINTEGSFQCNCPPGH
QLAPNISACIDINECDLSHNLCRNGHCVNLIGRYQCACNPGYQSTPDKLFCIDIDECNIM
NGGCDTFCTNSEGSYECSCKSGFALMPDHRSCTDIDECEDNPNICDGGQCTNIPGEYRCL
CYDGFMASEDMKTCIDVNECDLNPNICLSGSCENTKGSFICHCDMGYSGKKGTTGCTDIN
ECEIGAHNCDRHAICTNTAGSFKCECSSGWIGDGIKCTDLDECSNGTHMCSPHANCKNTM
GSYRCLCKDGYTGDGFTCTDLDECSENLNLCENGQCLNAPGGYRCECEMGFLPSPDEKAC
EDIDECSLPNICVYGTCHNLPGLFRCECETGYELDRTGGNCTDVNECADPTTCISGTCVN
TPGSYTCECPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIKPRGDNGDIVCSNEIGVGVSKASCCC
SLGRAWGIPCEHCPPVNSTEYKVLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGKCIN
TFGSFHCQCPNGYYLNEESRVCDDINECETPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDYMQVNGG
NNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNIGRAWNKPCEQCPIPSTDEF
ATLCGSQRPGFFIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVCINMVGSFRCECPVGFFYNDKLL
ICEDIDECQNGPVCQRNAECVNTAGSYRCECKAGYRFTSTGQCADRNECLEIPNICSHGQ
CIDTVGGFYCICHSGFKTNADQTMCIDINECEKDPCGNGTCRNTVGSFNCRCDNGFILSH
NNDCIDVDECASGNGMLCRNGRCINTVGSFQCLCNDGYEVSSEGRTCVDINECAVEPGRC
SPGTCQNLDGTYRCICPPGYVLQNDRCEDIDECVEEPEICALGTCSNTPGSFTCLCPEGF
VLSSTGRRCQDLRVSYCFTKFEDGKCSVPKSRNHSKQECCCALQGEGWGDPCELCPEEGD
EAFRQICPFGIGILIGPGDARLDVDECLDPDNCRFGQCINTDGSFRCECPFGYILHGAQC
VDTDECSVGNPCGNGTCRNVVGGFECTCDEGFEPGPMMTCEDVNECAQNSLLCAFRCVNT
YGSYECKCPAGYILREDRRMCRDQDECEEGIHDCDSKQMECKNLIGTYMCICGPGYQRRQ
DGEGCVDENECQTKPGICENGRCINTIGSYRCECNEGFTASDTQNECLDNREGYCFTEVL
QSLCQIGSSNRNSVTKSECCCDGGRGWGPNCEICPFPGTVAFKKLCPHGRGYMTNGADID
ECKVIHDVCRNGECINERGSYRCICKPGYTPDITGTLCIDLNECNQSPKPCNFICKNTEG
SYQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHHTACID
NNECASEINLCGARGICQNTPGSFTCECQRGFSLDQTGLSCEDVDECDGNHRCQHGCQNI
IGGYRCSCPHGYLQHYQWNQCVDENECLSAHVCGGASCHNTLGSYKCMCPTGFQYEQFSG
GCQDVNECSSAQAPCSYGCSNTDGGYVCGCPPGYFRIGQGHCVSGVGLGKGHGQELPISD
EVDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRKRRSTNETIAYEAEDQPEMEPEVSLASWDSEKIAI
FSFNTSGLNNKDRILELLPALSTLTNHNRYLIDSGNEDGFFRINQKEGISYLHFTKKKPI
PGTYSLQISSIPLYKKKELNQLEDKHDKDYLSGELGDNLKMKIQILLH
NT seq
8607 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggctgggtaggctgctgaagttcgccctgggatttacagtgcttttatcttcccgt
acgagcgaaggtgctgaagggaatttggaggctgatagcgtgaaggaaaccagagccagc
agagccaagaggagaggacaaggaggaggcggaggagggcacgatgcgctcaaaggaccc
aatgtgtgtggatcacgttacaatgcctactgttgccctggatggaaaacgctacctggt
ggaaatcaatgcatagtcccaatttgcagacattcctgtggggatggattttgttcaaga
ccaaacatgtgcacatgtccaaatggccagatagcaccttcctgtggttcaaagtcaata
caacactgcaacatcaggtgtatgaatggaggtagctgcagtgatgaccattgtctctgc
cagaaaggatacacaggaacacattgcggacagcctgtctgtgaaaatgggtgccttaat
ggagggagatgtgtggctccaaaccgatgtgcttgtacatatggcttcactggacctcag
tgtgaaagagattataggactggcccatgcttctcactggtaaccaatcagatgtgccag
ggacagctcactggaatagtctgtacaaaaaccctttgctgtgcaacagttgggagagca
tggggccacccctgtgaaatgtgtccagctcagcctcatccctgccgccggggtttcatt
ccaaatattcgcacaggtgcctgtcaagatgtggatgaatgccaagccatccctgggatc
tgtcaagggggaaattgtattaatactgttggatcttttgagtgcaaatgcccagctgga
cacaagtttaatgaagtgacacaaaaatgcgaagatattgatgaatgcagcaccattcct
ggaatctgtgatgggggagagtgttctaacactgttagcagctatttttgcaaatgtcca
cctggtttttatacagctcctgatggcacaagatgtatagatgtgcgtcctggatactgt
ttctcttctctgaccaatggccgttgtggcaatcagctaccccaagttttaactaaaatg
caatgctgctgtgacactggacgatgctggtctcctggggcaacaagtgcccctgaaatg
tgcccaatccgagctactgaggagtatcgcaagttatgcgtggtagctgggctaacgcct
gggagacctgatcttcctccaggccttcctgatgtttatcctcctctgattcctgtgata
ccacaacggccagacattgtttttccacctccatcacgcggtccacctccacatgtggtt
ttgccagttaatttcactgactattgccagctattcagacatctctgtcttaatgggcgc
tgtattccaactcctgggagctaccgctgtgagtgcaacaaaggattccaactggatgtc
agaggggaatgcattgatgttgatgaatgtgagaagaatccttgtattagtggagactgt
ataaatacccaaggatcctacatatgccagtgtcgtgctggatatcagagcacactaact
aggacagagtgtcgagatattgatgaatgtttacagaatggccggatctgtaataatgga
cggtgcataaacacagatggcagttttcactgtgtttgcaatgctggctttcatgtggca
gtcgatggaaaaaactgtgaagatatggatgaatgtagcataaggaacatgtgcctcaat
gggatgtgtatcaatgaagacggcagctttaagtgcatttgtaaacctggtttccagtta
gcatctgatggacgttattgcaatgacatcgatgagtgtgagacagctggaatatgcatg
aacgggcgctgtgtgaacactgatggttctttcagatgtgactgcttcccaggtcttgta
gttggactagatggacgtgtgtgcgttgatacacatatgcgaagcacatgctatggtgga
tacaagagaggtcaatgtgttaaaccattatttggcgctgttactaaatcggaatgttgt
tgtgccagcactgactatgcctttggagaaccttgtcagccatgtcctgctcaaaattca
gctgagtaccaggctctgtgcagcagtggaccaggcctggatttagaaggaagagatatt
aacgaatgtgcactgaatcctgatatctgcccaaatggaatctgtgagaatctgcgtgga
acatataaatgcatatgtaattctgggtatgaagtggatgcaagtgggaaaaactgcatt
gacattgatgaatgtgcattgaacacgctgctgtgtgacaatggacaatgcagaaatacc
cctggaagcttcacctgcacctgtcccaaaggatttatatacaagcctgatctaaaaaca
tgtgaagatattaatgagtgtgagtctaacccctgtgttaatggaatatgcaaaaataca
cttggctcttttgcttgtgaatgtagccctgaaagtactttggatacaacaagaaccatc
tgcatagaaactattaaaggcacttgttggcagactattgtgaatggaagatgtgaaata
aatattaatggggcaactctaaagtcccagtgctgttcctcactaggtgctgcgtggggt
agcccatgtacaccctgtgaacgagacccaatctgttcaaaaggatattcaagaataagg
ggaacattatgtgaagatgtaaatgaatgcgaagtgtttcctggggtgtgtccaaacggt
cagtgcgtcaataccttgggttcctttgtttgccagtgtcctagtggaatgattttagat
gcctctggacggacatgccttgacattcgcttggagacttgctacttgaagcatgaagat
gaagaatgtacattaccgatagcaggccggcaccgaatggatagttgctgctgttctgtt
ggtgcagcatggggccctgaatgcgaggaatgtcctgtgaaggcaactcctgaatttgaa
gctctttgtccaagaggacttggatttgctagtaggggagagattataaatggaaagcca
ttctttaaagatatcaatgaatgcaaaatgatcccaagtctttgtacccatggaaaatgc
agaaacaccattggcagtttcaagtgtaaatgtgacagcggatttgcacttgattctgaa
gaaagaaattgtacagatattgatgaatgccgcatatctcctgatctctgtggtcaaggc
atctgtgtcaataccccaggggacttcgaatgtaaatgttttgaaggctatgaaagtgga
tttatgatgatgaaaaactgcatggacattgatgagtgtcagagaaatcctcttttgtgc
cgaggtggcatttgcataaacacagaaggaagctttcagtgcaactgtcctccaggtcat
caactggctccaaatatctccgcatgtatagacatcaatgagtgtgacctaagccacaac
ctgtgcagaaatgggcattgtgtcaacctgattggaaggtatcagtgtgcctgcaaccct
ggatatcagtccactcccgacaaattattttgtattgatattgatgaatgcaacataatg
aatggaggttgtgacaccttctgtacaaactcagagggaagctatgaatgtagctgtaaa
tcaggctttgcactaatgccagaccacagatcttgcactgatattgatgagtgtgaagac
aatcctaacatctgtgatggaggccagtgcactaacataccaggagaatacaggtgtctt
tgttatgatggattcatggcatctgaggatatgaagacttgtatagatgtcaacgagtgt
gacctgaatccaaacatctgtctaagtggaagctgtgagaatacaaaaggctcatttatc
tgtcattgtgatatgggatattcaggcaaaaaaggaaccactggttgtacagatatcaat
gagtgtgaaattggagcccataactgtgacagacatgccatatgtacaaatacggcaggg
agtttcaaatgtgagtgcagctcaggttggattggagatggcatcaaatgcacagatctg
gatgaatgctccaatggaacacacatgtgcagcccacatgccaattgcaagaacacaatg
ggctcttaccgttgcctttgcaaggacggctacactggggatggcttcacttgtacagac
cttgatgaatgctcagaaaacctgaatctctgtgagaacgggcaatgtctcaatgctcca
ggagggtatcgctgtgaatgtgaaatgggatttttaccaagtccagatgagaaagcatgt
gaagatattgatgagtgctcccttcctaacatctgtgtctatgggacttgtcataacctc
cctggtctattccgatgcgagtgcgagacaggctatgaactggacagaaccggtggtaac
tgcacagatgttaacgaatgcgcagaccccacaacctgtatcagtggcacatgtgtcaat
acccctggcagttacacctgtgagtgccctcctgatttcgagctgaaccccacccgtgtt
ggctgtgttgacacacgttctggcaactgttacttggatattaaaccgcgaggagacaat
ggagatatagtctgcagcaatgagattggggttggtgtttccaaggcctcttgctgttgc
tccctggggagagcttgggggattccctgtgaacattgcccacctgtgaactcaactgaa
tataaggtgctgtgccctggaggggaaggattccgaccaaaccctattacagttatattg
gaggatattgatgagtgtcaagaactacctggactttgccaaggaggaaaatgtattaat
acgtttggtagtttccactgtcagtgtccaaatggctactatttgaatgaagagtctcga
gtatgtgatgatattaatgaatgtgaaacacctggcatttgtggacctggcacttgttat
aacactgttgggaactacacctgtatctgtcctcccgactacatgcaagtcaatggtggc
aacaactgtatggatatgaggaggagtctgtgctacagaaattattatgctgacaatcaa
acctgtgatggagaactgctctttaacatgaccaagaaaatgtgctgctgttcctacaat
attgggcgtgcatggaataagccttgtgaacaatgccccatccctagcacagatgaattt
gcaacactctgtggaagtcaaaggcctggtttcttcattgacatttatacaggtttacca
gttgatattgatgaatgccgagagatccctggagtctgtgagaatggagtctgtataaac
atggttggcagcttcagatgcgagtgtccagtgggattcttttacaatgacaaattgctg
atctgtgaagatattgatgaatgccagaatggaccagtgtgtcaacgaaatgcagaatgt
gtcaacacggctggcagctatcgctgtgagtgtaaagccggctataggttcacatcaaca
ggccagtgtgctgatcgcaacgaatgcctagaaattcccaatatctgtagccatggccag
tgtattgacactgttggaggattctactgcatatgtcactcgggattcaaaaccaatgct
gaccaaacgatgtgcatagatattaatgagtgtgaaaaagatccatgtggtaatggaaca
tgtagaaataccgttggctctttcaactgccgctgtgacaatggattcattctctcacac
aataatgactgcatagatgtggacgaatgtgcaagtggaaatgggatgctctgcaggaat
ggccgctgcataaacacagttgggtctttccagtgtctgtgcaacgatggctatgaggtg
tcctccgagggcaggacctgtgtggatatcaatgagtgtgcagtggagcctggtagatgc
tcacctggcacatgccagaacctggatgggacgtatagatgcatctgtcctcctggatac
gttctgcaaaatgacagatgtgaagatattgacgagtgtgtagaagaaccagaaatctgt
gccttgggtacatgcagcaatactccaggcagtttcacatgcctatgtcctgaagggttt
gtactgtcttccaccggcagaagatgccaagatctgagagtgagttattgctttaccaaa
tttgaagatggcaaatgctcagttcccaaatccagaaaccattccaagcaagaatgttgc
tgcgctttgcaaggagaaggatggggtgacccatgtgagctttgcccagaggaaggagat
gaggcgtttcgtcaaatttgtccatttggaattggcatccttattggaccaggggatgca
cggcttgatgtggatgagtgccttgacccagataactgcagatttgggcagtgtatcaac
acggatgggtccttccgctgtgaatgtccttttggttatatccttcacggagctcaatgt
gtagatactgatgaatgctctgttggaaatccatgtggaaatggaacttgtaggaatgtt
gtaggtggttttgaatgtacctgtgatgagggatttgagccaggaccaatgatgacatgt
gaagatgtaaatgagtgtgctcagaattctctactgtgtgccttccgatgtgtgaacacc
tacggatcatatgaatgcaagtgtccagctggctacattcttagagaagacaggagaatg
tgcagagatcaggatgaatgtgaagaaggaattcatgattgtgactcaaaacaaatggag
tgtaaaaatttgattggcacttacatgtgcatatgtggaccaggatatcagcgcagacag
gatggtgagggctgtgtagatgaaaatgaatgtcaaaccaaacctgggatctgtgagaat
ggacgttgtatcaacacaataggaagctacagatgtgaatgcaatgaaggattcactgcc
agtgacacccagaatgaatgccttgacaacagagagggctactgcttcactgaagtgtta
caaagtctgtgtcagattggatcaagcaataggaactctgtcacaaagtctgaatgctgc
tgcgatggcgggcgtggctgggggccaaactgtgagatctgccccttcccaggcactgtg
gcgtttaaaaagctatgtccccatggccgaggatacatgaccaatggagcagatattgat
gagtgcaaggttattcacgatgtctgccggaatggagagtgcatcaatgagagaggatca
tatcgctgcatatgtaaacctggctatactccagatataacgggcaccctttgcatagat
ctgaatgaatgtaaccagtcccctaagccttgcaatttcatctgcaagaacacagaaggg
agttaccagtgttcatgtccaaaagggtacatcttacaagaggatggaagaagctgtaaa
gatctcgatgaatgtgcaacgaaacagcataactgccagttcctgtgtgtcaacaccata
gggggcttcacttgtaaatgtcctcctggtttcactcagcatcatacagcgtgtattgat
aataatgaatgtgcctctgaaatcaatctgtgtggggccaggggtatttgccagaacaca
ccaggaagtttcacgtgtgaatgccagcgtggcttctcccttgaccagactggactcagc
tgtgaagatgttgatgaatgtgatggaaaccaccggtgccagcatggttgccagaatata
attggaggatacaggtgtagctgcccacatggatatctccagcattaccagtggaaccaa
tgtgttgatgaaaacgaatgcctcagtgcacacgtttgtggaggagcatcttgtcacaat
actttgggaagctataaatgtatgtgccctaccggatttcagtatgaacaatttagtgga
ggctgccaagatgtcaatgaatgcagttctgcacaagccccatgcagttatggttgttca
aatactgatggtggctatgtctgtggatgcccacctggttacttcaggataggacaagga
cactgtgtttctggagtgggactgggtaaaggtcatggtcaagaattgcccatcagcgat
gaagtagatgacaactctctctcccctgaggcgtgctatgaatgtaaaatcaacggttat
cccaagagaggaaggaagcgcagaagcactaatgaaaccattgcatatgaagcagaggat
caacctgagatggaaccagaagtcagtcttgccagttgggatagtgaaaaaatagccatc
ttttccttcaacacctcggggcttaataacaaagatcgcatcctggaacttcttcccgct
ctctcaacactgacaaatcacaaccgatatttaattgactctggaaacgaagacggtttc
tttagaatcaatcagaaggaagggataagctaccttcatttcacaaagaagaagccaata
cctggaacctactcattacaaatcagtagtattcctctctataaaaagaaggaacttaac
cagcttgaagacaaacatgacaaagactacctcagtggtgagctgggagataacctgaaa
atgaaaattcagattttgcttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
