Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0285393
Help
Entry
DDB_G0285393 CDS
T00245
Symbol
ints1
Name
(RefSeq) integrator complex subunit 1
KO
K13138
integrator complex subunit 1
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
ddi03041
]
DDB_G0285393 (ints1)
Spliceosome [BR:
ddi03041
]
Other splicing related proteins
Proteins involved in snRNP biogenesis
Integrator complex
DDB_G0285393 (ints1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TFIIA
DUF3677
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8625060
NCBI-ProteinID:
XP_638252
dictyBase:
DDB_G0285393
UniProt:
Q54NC8
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(3120198..3127799)
Genome browser
AA seq
2497 aa
AA seq
DB search
MMLNKIKRSKAGSIEDSKLQALPLGTRRKIGQTTGESDNNNNNSNDQSLKKFKNDNTEEN
NSIGVNNNTSTNININTNTNINTNNSTNTNNINNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNS
NNNNNNNISNGGNNINNNNNNNNNGNNNNNINNSNGIRRVFDQNYYIDLVESEEDIEIKI
RIIKSMLMVLKSSVGNEPDKCAFISLLVICKRSPTLFSHFDLLEPLLSLLKKDPTHVQKK
NNLLSILACNLLMAGYDHIQDWPVYLFCAYLDDAIGDRYWVEDQYCKTFVNNIITAFPQQ
PQPPQQQQTKQPVNIKTQPQQQQQQQQQPQPQQIKKSDDDIVEEIDNLLSVSSSSQPQPQ
QQKNRFSHCLNDIIKYIIHMIRQYIQSPNQRVFIKLLSLTVGFKESRLEGSQIIEQLLGN
TNVFRFAKEYLTQLLAATTESTVEDIKTVQNLLKIQVSHHIDIISTLLVNNPIYPAIALH
QAIEIELDTNQKVATKSKLSIIFKFLPNNRGEEELAMILKDFCSRDDSIRSPVKIIVKKI
LKNLTFISLFYLCEQLSTITQKDEQFYLLLQSSQQQQQQQPPPSTITITRERWALNIIHM
LTQILFLIPSMNEHLKDQSNMRSMISTIQSSSVSWCFKLLNLGVLSYGDALSLIGKVLIF
EPLNSFFQAPNLAVDSDRNAYRMLTTEIPIQENILDILLTIGFEYPSEKKIVLELCEALL
KRAISIVHKFNVLVPLTKVTFAESILSLSRIENTSEPQLAYTSLFWQSTILACLLICLSP
SIIGSYYWNNCPTIRILIEMIITRSWKFPPYLPKAVANNPSYFQLIEQNQRIEEKKLLSR
IPQLTSIDFMILDSIKGTNGVIRQPPEEIIEKLQKLDNDFHLGFILCNCRSPDFLLDIMS
NQDSKQSMMWLNPIIHNDPKTLDILPPICLSEILLSTQFEQQQQQQQQQQQLQTPQQQQQ
QQQPTNPIAPRVLNRMSLFFNSPSPVPTLEILNFFFTLLCSDNPIIRILSKKSLSLLVLP
IKSTLSTTTTTTSSTTTTTTTTTSTTTSTSTSSSSSSLNPTQPSLRSSCDKIKTSGLSGS
SNGINQSSDSITAVAGSTSPTTTTTSSSSTCQTYITEEFQWLLKLNNLAWFEESQEIVIS
ALKKAINVETDVSSIRSYIQYLVVNQSTPFDASFQMDLSQLILNRGIIANYLLSSDISIL
IFNAYLNILEPLNQKDLSKKLLLLSSSTNSINNINNNDNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNND
NNINKNNDDNNHSNSMANNNLPNNNNKNNQKSKKWVKIIKNSNNKNNDDNSMEDDNNEDI
IYLPRIVLDSIIYCISSSLNVNDIDQIQSIVAILFPTTTTTAIDQDKTFEIKNKFLDFDN
QTDEEPILKSKQLVEVSLKSSIPQLISIALQRNTSVGLFNGLNDYIEQLILKGIEMSFLS
RSMILEIIDKNIDKIKSSFENNSSNNDNNESKEIKEILNQIIENNEKQTILKLFIKESSK
HGQLFLNFIESLISAKSGDSKQITKKKQKSSFNLFNEFLETDEINNQEIEEGSMELDINF
ENSIKHQILNINNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNITQLLEGNGQIDSFVKAI
NSFEVSKSISSDININIPFSISTIRILKNTTQQKQQKQQQKESVQKSIQSLSKLILSSKN
IKNYQKRFIDHILKKKSNLELIESAQNLTLENGINKEFDICKEWEIYSSGSGSSSNEIND
QFKGTEIIRKLVNKQHFSIIIVSDPLKLGEIFKSLVKQFILNDQLRLEEFIGGFFTKVYS
NSLSQSSTITIVLFNSLVSLLTDFGSNIQMKQSLGILLDWTGLLVQQFLLKNNNNNNNNN
NNGISLNIKQFYFLLFGKGSFKFSTLLHSHFIHNSTWRNLKIMMQWLFKVNNNYNDDDDD
NDDGDRPIIDATLVLNFINAYHQHPRSGAPYYSASNTATTASSKSITNMSTIMDSMVMHY
LNPSTIRTLSDYIIEEIDQVKGGPSNYPQSKLRNRMNLLISSSMISKENLISLVLHLSNQ
YTKSTSSSIVIKQIYFAFPSTLKSILTNFSPCLIVSSPNNLLSQQQQQQQQQQQQQQKQQ
SNNSNNINNNNNNNNSEKKQKSKEQNIILTTNDLIVNNQSIPSTQLDIILHRVILKISDM
STIENRNSGFIIVRKLAILHPELITLHLPSFYSLLSGRADTPLTLFLSRNYHHLFYQILD
LLDILRPIVFNSQSLLPILQEYFTLFSNNCNQRINDFIPIVSKLCDFLLPFTGNYQNLDI
LIQNKDTIKSLSIFYPNAEPLLLRIKPNQISSLSSSYYLSSLLSINNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNPLELIKFKLYDNGYNNNNNDKLVKQLEDVIKITQNLPSYLHCIKDELL
RLIQSDYQNIRAISYFLIQRYLQYCPQDAESMMDKYLSCFQHWNPDVVKDAIQHSSDFYC
LSNDRSEYLIEQILIYGGKDSINDIKKLINPFSRIFY
NT seq
7494 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgttaaataaaataaaaagatcaaaagctggatcgatcgaagattcaaaattacaa
gctttaccacttggaacaagaagaaaaataggtcaaacaacaggtgaatcagataataat
aataataatagtaacgatcaatcattaaagaaatttaaaaatgataacacagaggaaaat
aattccattggagtgaataataacacaagcacaaatataaatataaatacaaatacaaat
ataaatacaaataatagtacgaatacaaataatataaataatacgaacaataataataat
aataataataataataataataataataataacaataataataataataacaataatagt
aataataataataataataacatcagtaacggcggtaataatattaataataataacaat
aataacaataatggtaataataataataatattaataatagtaatggtattagaagagta
tttgatcaaaattattatatagatttagtagagagtgaagaagatattgaaatcaagata
aggataattaaatcgatgttaatggtattaaagagtagtgttggcaatgaacctgataaa
tgtgcattcatatcgttattggttatatgtaagaggtcaccaacactattctcacatttt
gatttactggaaccattattatcactcttaaaaaaggatccaacacatgtacagaaaaaa
aataatcttctctccattttagcttgtaatttattaatggctggttatgatcatattcag
gattggccagtctacctattctgtgcttatttagatgatgcaattggtgatcgatattgg
gtagaagatcaatactgtaaaacttttgtaaacaatataataactgcttttccacaacaa
ccacaaccaccacaacaacaacaaactaaacaacctgtaaatattaaaacacaacctcaa
caacaacaacaacaacaacaacaacctcaacctcaacaaattaaaaagagtgatgatgat
atagttgaagaaattgataatttattatcagtaagttcatcatcacaacctcaacctcaa
caacaaaagaatagattttcacattgtttaaatgatataattaaatatataattcatatg
ataagacaatatattcaatcaccaaatcaaagagtatttataaagttattatcattaaca
gttggatttaaagagtctagattagagggatcacaaattattgaacagttacttggtaat
accaatgtatttagatttgccaaagagtatttaacacaattgttggcagcaactacagag
agtacagtagaggatattaaaacggttcaaaatttattaaagattcaagtttcacatcat
atcgatatcatttcaacattattagttaataatccaatttatccagcaatagcattacat
caagccattgaaattgaattggacacaaatcaaaaggttgcaaccaaatcaaaactttca
atcattttcaaattcttaccaaataatcgtggtgaagaagagttggctatgattttaaag
gatttttgttcacgtgatgattcaataaggtcacctgttaaaatcattgttaaaaagatt
ttaaagaatttaacttttataagtttattttatctttgtgaacaattatcaacaataact
caaaaggatgaacaattttatttattattacaatcatctcaacaacagcaacagcaacaa
ccaccaccatcaactataacaattacaagagaaagatgggcattaaatataattcatatg
ttaacacaaattttatttttaataccgtcaatgaatgaacatttaaaagatcaaagtaat
atgagatcaatgataagtactattcaatcatcaagtgtttcatggtgttttaaattatta
aatttgggtgtattatcatatggtgatgcattatcattgattggaaaggtattaatattt
gaaccattgaattcattctttcaagcacccaatttagctgttgattccgatagaaatgct
tatcgtatgttaacgacagagataccgattcaagagaatatattggatatattattaacg
attggattcgaatatccatcagagaagaaaatagtattggaactttgtgaagctctattg
aaacgtgcaatctccattgtgcataaattcaatgttttagtaccattgactaaagttaca
tttgcagaatcgattctttctctatccagaattgagaatacctctgaaccacaattagcc
tacacttctttattctggcaatcaaccatattggcatgtctattgatttgtttatcaccc
tctatcattggctcctattattggaataattgtccgaccattagaattctcattgaaatg
atcatcactagatcttggaaattcccaccttatcttccaaaagcagtggcaaacaatcca
tcctattttcaattaattgaacaaaatcaaagaattgaagaaaagaaattactctctaga
ataccacaattaacttctatcgatttcatgatattggattcaattaaaggtaccaatggt
gtaattagacagcctcctgaggaaatcattgaaaaacttcaaaaacttgataacgatttt
catttagggtttattctttgcaattgtagatcaccagatttcctcttggatataatgtca
aatcaagattcaaaacaatcaatgatgtggttaaatccaattattcataatgatccaaaa
actcttgatattttaccaccaatttgtttaagtgaaatacttttatcaactcaatttgaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaattacaaacaccacaacaacaacaacaa
caacagcaaccaacaaatccaatagcaccaagagtattaaatagaatgtctttatttttt
aattcaccatctcctgtaccaactttagagattttaaatttcttttttactttactttgt
tctgataatccaataataagaattttatcaaagaaatcactttcattattagttttacca
attaaatcaactttatcaactacaacaacaaccacatcatcaacaacaacgacaaccaca
actacaaccagtacaaccacttcaacttcaacatcatcatcatcatcatcacttaatcca
actcaaccatcattaagaagttcttgtgataaaattaaaactagtggattaagtggatca
tcaaatggtattaatcaatcatcagattcaattacagcagtggcaggttcaacatcacca
acaacaacaacaacatcatcatcatcaacttgtcaaacatatataactgaagaatttcaa
tggttattaaaattaaataatttggcatggtttgaagaatcacaagaaatcgttatttct
gcattgaaaaaagcaatcaatgttgaaactgatgtttcatcaattagatcatacattcaa
tatttagttgttaatcaaagtacaccattcgatgcatcatttcaaatggatttatctcaa
ttgattttaaatagaggtataattgcaaattatttattatcaagtgatatttcaatatta
atatttaatgcttatttaaatatattagaaccattaaatcaaaaagatttatcaaagaaa
ttattattattatcatcatctaccaatagtattaataatattaataataatgataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataatgat
aataatattaataaaaataatgatgataataatcatagtaatagtatggccaataataat
ttgcctaataataataataaaaataatcaaaaatcaaagaaatgggttaaaataattaaa
aatagtaataataaaaataatgatgataatagtatggaagatgataataatgaagatata
atatatttaccaagaatagtacttgattcaattatttattgtatttcatcatctttaaat
gttaatgatattgatcaaattcaaagtatagttgcaatactctttccaacaacaacaaca
acagcaatagatcaagataaaacttttgaaattaagaataaatttttagattttgataat
caaactgatgaagaaccaatattaaagagtaagcaacttgttgaagtatccttaaaatca
tcaattccacaacttatttcaattgcattacaaagaaatacttctgtaggtttattcaat
ggtttaaatgattatatagaacaattgattttaaagggtattgaaatgtcatttttatca
cgttcaatgattttagaaataattgataaaaatattgataaaattaaatcatcttttgaa
aataatagtagtaataatgataataatgaaagtaaagaaattaaagaaattttaaatcaa
atcattgaaaataatgaaaaacaaacaatcttaaaattatttataaaggaatcttcaaaa
catggtcaattgtttttaaattttattgaatcattgatttctgctaaaagtggtgatagt
aaacaaataacaaagaaaaaacaaaaatcatcctttaatttatttaatgaatttttagaa
actgatgaaattaataatcaagaaatcgaagaaggttcaatggaattggatattaatttt
gaaaattcaattaaacatcaaattttgaatattaataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataatataactcaattgttagaaggaaatggtcaaatagattcatttgtaaaagcaatt
aattcttttgaagtatcaaaaagtattagtagtgacattaatatcaatatacctttctca
atatcgacaattagaattttaaagaacactactcaacaaaaacaacaaaaacaacaacaa
aaagaatcagtacaaaaatcaatacaatctttatcaaagttaattttaagctctaaaaat
attaaaaactatcaaaaaagatttattgatcatattttaaagaagaaatcaaatttagaa
ttaattgaatcagcacaaaatctaactttggaaaatggtattaataaggaatttgatatt
tgtaaagaatgggaaatatatagtagtggtagtggtagtagtagtaatgaaatcaatgat
caatttaaaggtacagaaattattagaaaattagtcaataaacaacacttttcaataatt
atagttagtgatccattgaaattaggtgaaatatttaaatcattagttaaacaattcata
ttaaatgatcaattaagattggaggagtttattggtggtttctttacaaaagtatattca
aattctctatctcaatcaagtacaataacaattgttttattcaattcattggtatcatta
ttaactgattttggttcaaatattcaaatgaaacaatcattaggtatacttttagattgg
accggtttattagttcaacaatttctattaaaaaataataataacaataataataataat
aataatggaattagtttaaatataaaacaattttatttcttattatttggtaaaggaagt
tttaaattttcaactctattacattcacattttattcataattcaacttggagaaattta
aagattatgatgcaatggttatttaaagttaataataattataatgatgatgatgatgat
aatgacgatggtgataggccaatcattgatgcaacacttgttcttaattttataaatgca
tatcaccaacatccaagatcaggagcaccatattatagtgcatcaaatacggcaactact
gcatcatcaaaaagtattactaatatgtcaacaattatggattcaatggtaatgcattat
ttgaatccatcaactattagaactttatcagattatataattgaagagattgatcaagtt
aaaggtggtccttcaaattatccacaatcaaaattaagaaatagaatgaatctattgatt
tcatcatcaatgatttcaaaagagaatttaatttcattggtacttcatttatcaaatcaa
tatacaaaatcaacttcctcttcaattgtaattaaacaaatttattttgcttttccttca
actttaaaatcaattttaactaatttttcaccatgtttaattgtatcatctccaaataat
ttattatcacaacaacaacagcaacaacaacaacaacaacaacagcaacaaaaacaacaa
tctaacaatagtaataatattaataataataataataataataatagtgaaaagaaacaa
aaatcaaaagaacaaaatataatattaacaacaaatgatttaatagttaataatcaaagt
ataccatcaactcaattggatattatattacatcgtgttatattaaagatatcagatatg
agtacaattgagaatagaaattctggatttattatagttagaaaattggcaattttacat
ccagagttgataacactccatttaccaagtttctattcattgttatcaggtagagctgat
actcctctaactcttttcctaagtagaaattatcatcatttattctatcaaattttagat
ctattggatatactaagaccaatcgtatttaacagtcaatcattgttaccaatacttcaa
gaatatttcacactgttttcaaataattgtaatcaaagaattaatgatttcataccaata
gtttcaaaactttgtgatttcttattaccattcactggaaattatcaaaatttggatata
ctcattcaaaacaaagatacaattaaatcactatcaatattttatccaaatgctgaacct
ttattattaagaattaaaccaaatcaaatttcatctttatcatcttcatattatttatct
tcattactttcaattaataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataacccattagaattaattaaatttaaa
ttatatgataatggttataataataataataatgataaattagttaaacaattagaagat
gttattaaaattactcaaaatttaccaagctatttacattgtattaaagatgaattatta
agactaattcaatcagattatcaaaatattagagcaatctcatattttctcattcaaaga
tatcttcaatattgtccacaagatgctgaatcaatgatggataaatatttaagttgtttc
caacattggaatcctgatgtggtcaaggatgcaattcaacattcttccgatttttattgt
ctctcaaatgatcgttccgaatatttaattgaacaaattttaatctatggtggtaaagat
tcaattaatgatattaaaaaattaattaatccatttagtcgtatattctattaa
DBGET
integrated database retrieval system
