Dermatophagoides farinae (American house dust mite): 124497511
Help
Entry
124497511 CDS
T08043
Symbol
IntS1
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: integrator complex subunit 1
KO
K13138
integrator complex subunit 1
Organism
dfr
Dermatophagoides farinae (American house dust mite)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dfr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
dfr03041
]
124497511 (IntS1)
Spliceosome [BR:
dfr03041
]
Other splicing related proteins
Proteins involved in snRNP biogenesis
Integrator complex
124497511 (IntS1)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
INTS1_RP2B-bd
INT1_R3
INTS1_INTS2-bd
INTS1_R4
DALR_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124497511
NCBI-ProteinID:
XP_046917128
LinkDB
All DBs
Position
2:7106584..7113361
Genome browser
AA seq
2030 aa
AA seq
DB search
MSNKRGNKKHMAPLSQDLFALGATTSAPTSQVKLPAKRNEPFQAPISSMSPKRPKLNSPI
SQSMIGSSSSLVQPSQQVQPASQQSKLRSWEEKAIIVPTTELKDKILQYDSESDSEEMIE
RLLCGAVKQLREQKTKPDSCLVFTLLYLAKIRPLFFCSNIIVEAFASLLSREHLFYFKTK
NNMVPVLLINLFYHAFHDENSWPELFIRLYVEDSLGDRIWVDNEECKDFVEIIVASFRTK
LPPKSLLQTSDVLNITTKHQMESSPNLTLSGSSSIGGEDSVGEESCSSTTSLFCEQNRDI
GQQPITSRYLDNEPEIIQYVVEVINENLLRRQTISDVSRNMLKLLIATAGLRNVRLLVAQ
KLELWFQNPKLTRPAQDLLLTIFLNCDEKDIDTLNHLLKIRLKQKPYISHFCVCFKELLQ
QKNGTFDIVMRILLTNELNGIRNLNNIQMLSIMFQHNSLDAAKILAKFFISTIFTKEDHL
RLLRSLLREIVRSLKSEPINYYCFVSTLIYEFRRVMLDNNIKFDYSREKVINEVVDIITM
TIFLSVNQNIRESFARPERKEIMRAFQMNITLVQSETIAWIKEITYNKLGLEDKESLLRI
LRKLLILEPMDFYCKLDNWPQETERLNIYRITSEGIPLAEESVKNILSMGFHPEVSLSLQ
DGFELIWTLIHHATMNFDGDMNHPVLLFTDPKIIDLLFSCCEYVCPDNAPLPENYQPPKL
ARVDLYWKVWFMLVIIAAHLPSTFGKSAWNAFPTFQTLIEMAITNCFQFPPKSMDNDEMQ
NKILQYNQFEKMKILEFESYLARDQEINESNSYLISSLITLDPCSIPRRPPNPILNDYKL
LCTNNTNYRLCHLLCQSREPDFLLIIIDKQQNHISSNSSQFYHSSLNWLIDLVESYESNY
GLLPVQCLCEFLLKQVAEEAHVQSANSGADISKLEKVKKKEKRRKLIRLIAYFQDDIVQA
ANSGKLSNAFEYLIHHLSHPRSTTRMLAYKALYVIASINVGKYLQMLDDNLIPSLFANES
VAWFRTNLIKFLKSDLQIQAMCTALNAALSEESNTSLICDYLEFIAEYVKNPDEMLVQKC
SSLLIQRKKIAMHIVKYSDHKFKQRFLHSLFKIYWLYLESLMATNKIVRPMEGKKYVYLK
FPNIGQRIMIDSGLIHSIILSLSFVDDDFEFSDYYDNLAQHFLDEPYPQIFTDVEMKQPE
SLIPDWLISRLLSTESTKIVALLFENVKIENIIPYMNSYGISTIVLQTALQAFDKLTAAE
SKIIKNLNFDRSKLLASFHVFWSKNITAGFKFAKIHLNYKAGSDDTEDVEMNELPKKRDD
QKSSQESSFRSETFRKDDVIKMFVDKDFKRLTFLTRQIAAELNDSSVKTKKLTKQFLSEF
FNSIEDVTDNIISGTFNSIFNVIIISAVKDSKHFGLNSELTNIKKELSSLDVENIESTML
WKCFDRFLHKDGTKTKKSKLQKKKVSSSSSSSKTWTKALEEFLNKKDQIKAQTSEKWIDI
YMDLAYDKFYRKDIDSENFGPHLQTTIFSRNRPYFLSQLLHKSNFSTLNDCIRFILNPDL
CLNPTAVLDFLGICIELPKLWIGRENDSQKVQKHEDVLDLNGKQIHCLIDYVLQENAISN
RIDLIMRTCCITTYKTEMVIHFLKNFQQNQKESIRNELFTRIYLQIPSIGLELKLSDDHV
CMLQKLPSFMDKITHNLITSFMYVETNGSTLSISSPQQFIYWGDALLKIASEHPLLFLRQ
LPMIPAMLRGKVNVVHYDIFKSLNILKIFTKLLNILNLLRPWLWNHNVNGVEQLLNLYMD
MFLSYYQLPRQQDSNHELQPLILQFLHLLDDWNKNDSESCSHWIQLHKNDLNELCTAYPN
EKNFFESIMSGVPLPNETELIIASQDYRSLEMKLKQSNRLSNEIIATTLSDVNRFVDRYP
LLGENFLNSIQSYYSNPYFCELSFTITLKTLQTNPSTVRTIISSFVKCLHNESATVVKNA
MVIIPEFVLLAQDYRYTLLRKVFDLAISGDSNATLALIESFRALNSQIGC
NT seq
6093 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaacaaacgtggcaataaaaaacatatggctccattgagtcaggatctttttgct
cttggtgccactacatctgcaccaacaagtcaggtaaaattaccggctaaacgaaatgaa
ccatttcaagctccaatatcatcaatgtcaccaaaacgaccgaaattaaattcaccgata
tcacaatcaatgattggatcgtcatcatcgttggttcaaccatcgcaacaggttcaacct
gcatcacagcaatcaaaacttcgatcatgggaagagaaagccattatcgtaccgacaacc
gaattgaaagataaaatcttacaatatgatagtgaatccgattccgaagaaatgatcgaa
cgtttattatgtggtgcagtgaaacaattacgtgaacagaaaacaaaaccagattcttgt
ttggtttttacattgctttatctggccaaaatacggccattatttttctgttcaaacatt
attgtcgaagcattcgcatcattattaagtcgtgaacatttgttttatttcaaaacaaaa
aacaatatggttccagtattacttataaatctattttatcatgcatttcatgatgaaaat
tcatggcccgaattattcatccgattatatgttgaagattcacttggtgatcgaatctgg
gtagataatgaagaatgtaaagattttgttgaaataattgttgcatcatttcgtacgaaa
ctgccgcctaaatcattgctacaaacatcagatgttttgaatataacaaccaaacatcag
atggaatcatcaccaaatcttacacttagtggttcatcatccattggtggtgaagatagt
gttggagaagaatcatgttcatcaacaacgtcattattttgtgaacaaaatcgtgatatt
ggtcaacaaccaataacatccagatatttggataatgaaccagaaattattcaatatgtt
gtcgaagttatcaatgaaaatcttttacgacgacaaaccattagtgatgttagccgtaat
atgcttaaattattgatagcaacagctggtttacgaaatgttcgtttattggttgcacaa
aaattagagttatggtttcagaatccaaaacttacaagaccagcacaagatcttctatta
acgatattcttgaattgtgatgagaaagatattgatacattgaatcatttgttgaaaatt
cgtttgaaacaaaaaccatatattagtcatttttgtgtttgtttcaaagaattactacaa
caaaagaatggtacattcgatattgttatgcgaatattgctcaccaacgaattgaatggt
attcgtaatttaaacaacatacaaatgttatccattatgtttcaacataattcattggat
gctgcgaaaattttggccaaatttttcatatcaacaattttcaccaaagaagatcatctc
cgattattacgttcattacttcgtgaaattgttcgatcactgaaatctgagccgataaat
tattattgttttgtttctacattgatctatgaatttcgtcgtgttatgttggacaacaac
ataaaatttgattattcacgtgaaaaagtgatcaatgaagttgtcgatattataacgatg
acgatatttttatcggtcaatcaaaatattcgtgaatcatttgcacggcctgaacgaaaa
gaaattatgcgtgcatttcagatgaacattacacttgtacaaagtgaaacgattgcatgg
atcaaagagattacatataataaacttggtcttgaagataaagaatcgttgctacgaatt
ttgcgtaaattattaatactcgaacctatggatttctattgtaaacttgataattggccg
caagaaactgaacgtcttaacatttatcgtataaccagtgaagggatcccattggccgaa
gaatcggtaaaaaatatcctgtcaatgggttttcatcctgaagtttccctttcactacaa
gatggtttcgaactaatatggacattaatacatcatgcaaccatgaattttgatggcgat
atgaatcatccggtattattgtttaccgatccgaaaattatcgacctgttattcagttgt
tgtgaatacgtatgtccggataatgctccattgccggaaaattatcagccacctaaattg
gctcgtgtcgatctttattggaaagtttggttcatgcttgttattattgctgctcatcta
ccatcgacatttggcaaatcagcatggaatgcatttccaacatttcaaactttaatcgaa
atggccattacaaattgttttcaatttccacccaaaagtatggacaatgatgaaatgcaa
aacaagatcctacaatataatcaatttgaaaagatgaaaattcttgaattcgaatcatat
ttggcacgtgatcaagagataaatgaatcaaatagttatctgatttcatcgttaataaca
ttggatccatgttcaataccacgacggccaccaaatccaatattgaatgattataaatta
ttatgtacaaacaatacaaattatcgtctatgtcatttgctatgtcaaagtcgtgaacca
gattttctgttgataatcatcgataaacaacagaatcatatttcatcaaattcatcacaa
ttttatcattcatcactgaattggttaattgatctagtagaatcatatgaaagtaattat
ggtctactacctgttcaatgtttatgcgaatttctattgaaacaggttgccgaagaagca
catgtacaatcggcaaacagtggcgccgatataagtaaattggaaaaagtcaaaaaaaaa
gaaaaacgacgaaaattgattcgtttgattgcctattttcaggatgatattgttcaagca
gcaaattcaggaaaattaagtaatgcattcgaatatctaattcatcatttaagccatcca
cgttctacgacacgaatgttggcctataaagcattatatgtaattgcatcgattaatgtg
ggaaaatatctacaaatgttggatgataatttaataccttcattgtttgccaatgaatcc
gttgcttggtttcgtacgaatttgataaaatttctaaaatctgatctacaaattcaagcc
atgtgtactgcattgaatgctgcattatcggaagaatcgaatacatcgcttatctgtgat
tatttggaatttattgctgaatatgttaagaatccagatgaaatgcttgttcaaaaatgt
tcatcattattgatacaacgaaaaaaaattgccatgcatatcgttaaatattctgatcat
aaattcaaacaaagatttcttcattctttatttaaaatctattggctttatttggaatca
ttaatggccacgaataaaatcgttcgtcctatggaaggaaagaaatatgtttatctaaaa
ttccccaatattggtcaacgaattatgatcgattctggattgatacattcaataatttta
tcattatcatttgttgatgatgattttgaattttccgattattatgataatcttgcacaa
cattttttggatgaaccatatccacaaatattcaccgatgtcgaaatgaaacaaccggaa
tcgcttataccagattggcttatatcacgtcttttatcaactgaatcgacgaaaattgtt
gcacttttgtttgaaaatgtaaaaattgaaaacatcattccttatatgaattcatatggt
atatcgaccattgttttgcaaacagcattgcaagcatttgataaactgactgcagctgaa
tcaaaaataatcaaaaatttaaattttgatcgatccaaactgttggcttcatttcatgtt
ttttggagtaaaaatattactgctggatttaaatttgccaaaattcatttgaattataaa
gctggcagtgatgatactgaagatgttgaaatgaatgaattgcccaaaaaacgtgatgat
caaaaatcttcacaagaatcatcatttcgctcagaaacatttcgtaaagatgatgtgatt
aaaatgtttgtggataaagatttcaaacggctaacatttcttacacgacaaattgctgcc
gaacttaatgattcgtccgtgaaaacgaaaaaattgactaaacaatttttatccgaattt
ttcaattcaatcgaagatgtaaccgacaatataatcagtggtacattcaattccattttc
aatgtgattatcatttctgcggttaaagatagtaaacattttggattgaattctgaattg
acgaatattaaaaaagaattatcatcacttgatgtggaaaatattgaatcaacaatgttg
tggaaatgttttgatcgtttcctacataaagatggtacaaaaacgaaaaaatcaaaatta
caaaagaaaaaagtttcatcatcatcgtcatcgtcaaaaacatggaccaaagcattggaa
gaatttctaaataaaaaagatcaaataaaagcacaaacatcggaaaaatggattgacatc
tatatggatttagcttatgataaattttatcgaaaagatattgattctgaaaattttggt
ccccatttacaaacgaccattttctcacgtaatcgtccatattttctttcacaattgtta
cataaatcaaatttttccacccttaatgattgtatacgattcatattgaatccagattta
tgtttaaatccaacagctgtattggatttccttggtatttgtattgaattaccaaaatta
tggattggtcgtgaaaatgattcacaaaaagtgcagaaacatgaagatgtactcgatttg
aatggcaaacaaattcactgtcttattgattatgttctacaagagaatgccatatcgaat
cgtatcgatttaattatgcgtacttgttgtattaccacatacaaaacagaaatggtcatt
cattttctcaaaaattttcaacaaaatcagaaggaatctatacgaaatgaattgttcact
agaatttatctacagatacctagcataggattagagttgaaattatctgatgatcatgtt
tgcatgttgcaaaaattgccaagttttatggataaaatcactcataatctaatcacatca
ttcatgtatgtcgaaaccaatggatcaacattatcgatatcatcaccacaacaatttatt
tattggggtgatgcattgttaaaaattgcctcggaacatccattattatttttgcgtcaa
ttaccaatgataccagcaatgcttcgtggtaaagttaatgttgttcattatgatatattc
aaaagtttgaatatattgaaaatattcaccaaattattgaacattctaaatcttttacgt
ccatggttatggaatcacaatgttaatggtgtagaacaattattaaatctttatatggat
atgtttctatcatattatcagctaccacgacaacaagattcaaatcatgaactacagcca
ttaatactgcaatttctgcatctactagatgattggaataaaaatgattccgaatcatgt
agtcattggattcaattgcataaaaatgatcttaacgaattatgcacagcatatccaaat
gaaaaaaattttttcgaatcaatcatgtccggtgtaccgttaccaaatgaaacagaatta
atcattgctagccaagattatcgttcattagaaatgaaattaaaacaatctaatcgatta
tcaaatgaaattatagcaacaacattgagtgatgtaaatcgatttgttgatagatatcca
ttattgggtgaaaattttctgaattccatacaatcatattattcgaatccatatttttgt
gaattatcattcacaattacattgaaaacattacaaacaaatccatctacagtgcgaaca
atcatatcatcatttgttaaatgtttacacaatgaatcggctaccgttgttaaaaatgca
atggtaataataccagaatttgttttattggctcaagattatcgttatacattgttacgg
aaagttttcgatttagcaattagtggtgattccaatgcaactttagcacttattgaaagt
tttcgtgccttaaattcacagattggctgttga
DBGET
integrated database retrieval system