Dellaglioa kimchii: ACE83Q_02150
Help
Entry
ACE83Q_02150 CDS
T11222
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
dki Dellaglioa kimchii
Pathway
dki03030
DNA replication
dki03430
Mismatch repair
dki03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dki00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
ACE83Q_02150 (dnaE)
03430 Mismatch repair
ACE83Q_02150 (dnaE)
03440 Homologous recombination
ACE83Q_02150 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
dki03032
]
ACE83Q_02150 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
dki03400
]
ACE83Q_02150 (dnaE)
Enzymes [BR:
dki01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
ACE83Q_02150 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
dki03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
ACE83Q_02150 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
dki03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
ACE83Q_02150 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XLP63908
LinkDB
All DBs
Position
446652..449972
Genome browser
AA seq
1106 aa
AA seq
DB search
MFVPLKVKSSFSLLQSTTKINDLVQSAKSKGYKAIALTDNNTLYGAIDFYNACQKAEIKP
IIGLTLDISGLIETNHEYELTFIAKDKQGYQNLMQLSTLKMTLNDDKLNFSSLTNYLDGL
FILSPSEKSEFSYLIEQSQISDAKELLAKYQSLIGSENIRVGLSHLMDKITAQSIKSLAQ
NFDIRVIALDEVAYLDAENQFDIDVLKAISTGETILINKVDEQIQGEYALRNPKEITEQY
QELLMADAIQETQNLADETSLELTFSQPKLPEYPLPNNETAHSYLRSMCNTGLNERFPNG
VPKEYKQRLELELNVIQQMGFEDYFLIVWDIMNYAHSQNIITGPGRGSSAGSLTAYVLTI
TDVDPIKYNLLFERFLNSKRVQMPDIDLDIPDDKRGLILNYLHQKYGHYHMAQIITFGTM
AAKQALRDVGRVFGVSPFEMKGWSDAIPNVLKITLTEALAQSQKLRNLVNDSSKNKNIFT
IAQHIEGIPRHYSTHAAGVVLSQIDLREVVPLQNGSEDILLTQYSKDIVENVGLLKIDIL
GLRNLNILDQAVTQVKKNYQADFNPAFINLEDEKTLALFRLGDTSGVFQFESNGIKNVLK
KLQPTSFEDIAAVNALYRPGPMENIDTFIARKHHLEKITFPDNSLKQILESTYGVLVYQE
QVMQVASKMGNFTLGEADLLRRAMSKKKKKTIDEMRTQFINGAYDNGIQEDVAKTVYSYI
EQFANYGFNRSHAVAYSKIAFQLAYIKANFPAAFFEAILNSVGNNPQKIKEYLVEAKQYH
VIIKLPDINMSDVGFCLIQNVVLFGLNSIKGLRKDFIEHIITLRQKESFTDFQSFLHRID
KKYLNVENISALIYSGCFDQFEYNRAELISALPELISSIDLSGNNTNLFELLTPKIARQS
NFPLMVRLEKESQYLGAYLSGHPVEKYRKQLNQSDFKKISEISDKTHVTILVNLTRVKVI
RTKKGQQMAFVNGSDETSEIDLTIFPDLFRQKESLLEKNKVVVVSGDVETNRGLQIIVKK
IELADDYFKRITQKKWFLKITKETTNEKIEKLMQTMKIRLGQTPVILFYEKDNRKISLDR
TYWLRNDKETHTALTKILGSENVVIK
NT seq
3321 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgttccgttaaaagttaaaagttcattcagcttattacaaagcaccactaaaatt
aatgatcttgttcaaagtgctaaaagtaaaggctataaagcaattgccttaacagataat
aatacattgtatggtgcaattgatttttataatgcctgtcaaaaagctgaaattaagcca
attatcggactaacgttagatatctccggtttaatcgaaacaaaccatgaatatgaattg
acctttattgcaaaagataaacaaggttatcaaaatttaatgcaattatcgaccttaaaa
atgaccttaaatgatgataagttaaactttagtagtttaactaactatttagacggttta
tttatattatcacctagtgaaaaaagtgaatttagttatttaattgaacaaagtcaaata
tccgatgcaaaagaattattagccaaatatcaaagcttaataggttcagaaaatattcga
gttggcctatctcacttaatggataaaattacggcacaatcaattaaatctttagctcaa
aattttgatattcgtgtaattgcgctagatgaagtagcttatttggatgctgaaaatcag
tttgatattgatgtgttaaaggcaattagtactggtgaaacgattttaattaataaagtt
gatgaacaaattcagggagaatatgcattaagaaatccaaaagagataacggagcaatat
caagaattgctaatggcagatgcaattcaagaaacccaaaatttagcagatgaaacgtct
ctggaattaacattctcacaacccaaactacctgagtatccattacctaataatgaaaca
gcacatagttatttgagaagtatgtgtaatactggattaaatgagcggtttccaaatggt
gtacctaaggaatataaacaaagattagaacttgagttaaacgttattcaacaaatggga
tttgaagattactttttaatcgtttgggatattatgaactatgctcattcgcaaaatatt
ataactggcccaggacgagggtcatctgctggatcactcacagcctacgttttaacgatt
acggatgttgatccaattaaatataatttattgtttgaacgttttttgaattcaaaacgt
gttcagatgccggatattgatttagatattccagatgataaacgtggactaatccttaat
tatttacatcaaaaatatggacattatcacatggctcaaattattacatttggcacaatg
gcagcaaaacaggctttgagggatgttggtcgagtatttggtgtatcaccttttgaaatg
aaagggtggagtgatgcaattccaaatgttttgaaaattacgttgacagaggcgctagca
caatcacaaaaattacgtaatttagttaatgatagttccaaaaataaaaatatttttaca
attgcgcagcatatcgaagggattccaagacactactctacgcatgcagcaggggtcgta
ttgagccaaattgatttacgagaagttgttcctttacaaaatggaagtgaggatattctt
ttaacacagtattctaaagatatagttgaaaatgttggtttattaaaaatcgatatttta
ggtctacgtaatttaaatattttagatcaagctgtaacacaggttaaaaagaattatcaa
gcagacttcaatccagcattcattaatttagaagatgaaaaaacattagccctttttaga
ttaggtgatacatccggtgttttccaatttgaatctaatggtatcaaaaacgttttaaaa
aaattacaaccaacatcttttgaagatatcgcagctgtaaatgcgttatatcggccgggt
ccgatggaaaatatagatacatttattgcacgaaaacatcatcttgaaaaaataacattt
ccggacaatagtttaaaacaaattcttgagtcaacctatggtgtattagtttatcaggag
caggttatgcaggtcgcatcaaagatgggtaattttacacttggtgaagctgatttacta
cgccgagcaatgagtaaaaagaaaaaaaagactattgatgaaatgcgtactcagtttatc
aatggggcatatgataatggaattcaagaagatgtggctaaaacagtttatagttatatt
gagcagtttgctaattatggatttaatcgttcacatgccgttgcctatagtaaaattgct
tttcaattagcctatattaaagctaattttccagctgcattttttgaagctattttaaat
tccgttggtaataatccgcaaaaaataaaagaatacttagtggaagcaaagcaatatcat
gtaataattaaattacctgatattaatatgagcgatgtcgggttttgtttaatacaaaat
gttgttttatttggattaaatagtataaaaggacttagaaaagactttattgaacatatc
attacgttacgacaaaaagaatcgttcacagatttccaatccttcttgcatcggatagac
aaaaaatatttaaatgtggaaaatatttcagcattaatatattctgggtgttttgatcaa
tttgaatataatcgtgctgaattgatcagtgccctaccagaattaatcagcagcattgac
ttaagtgggaataatactaatttatttgaattattaacgcctaagatagcaagacaatca
aactttccattaatggttcgattagaaaaagaatcacaatatttaggtgcgtatctttcg
ggacatccggttgagaagtatcggaaacagctaaatcaaagcgattttaaaaaaatatcg
gaaatatctgataagacacatgtaaccattttagttaatcttacgagagtaaaagttatt
cgaacaaagaagggtcaacaaatggcctttgtaaatggttcggatgaaacaagtgagatt
gatttgacaatatttcctgatttatttcgacagaaagaatctttacttgaaaaaaataag
gtcgttgtcgtttcgggggatgttgaaacaaatagaggattacaaattattgttaaaaaa
atagaattagcagatgactattttaaacgaataactcaaaaaaaatggtttttgaagatt
actaaagaaacaacaaatgaaaaaatagaaaaattgatgcaaaccatgaaaataaggtta
ggtcaaacgccggttattttattctatgaaaaagacaatcgtaaaattagtttagataga
acttattggttaaggaacgacaaagaaacacatacagcgcttacaaaaatattaggttct
gaaaatgtcgtcattaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system