Danio rerio (zebrafish): 558217
Help
Entry
558217 CDS
T01004
Symbol
fbn2a
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
dre
Danio rerio (zebrafish)
Pathway
dre04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
dre00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
558217 (fbn2a)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
dre00536
]
558217 (fbn2a)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
dre00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
558217 (fbn2a)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
TB
hEGF
FXa_inhibition
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_PEAR1L
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
558217
NCBI-ProteinID:
XP_073770642
ZFIN:
ZDB-GENE-090112-4
Ensembl:
ENSDARG00000051896
UniProt:
A0AC58GLM0
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(18597468..18765627)
Genome browser
AA seq
2856 aa
AA seq
DB search
MSSQGDLRCLFGFVALLGILTGKISGIHGKATVHIDGSQRRQKQESLRGPNVCGSRLQSF
CCPGWKTLPGGNQCVVPICRSDCGDGFCSRPNMCTCPGGQTATTCFTKSSKQCNIRCMNG
GVCEDDYCQCPKGYTGSFCGQPVCEKNCQNGGHCIGPNRCACGYGFTGPQCERDYRTGPC
FIQVHSRKCAGQSSEFVCSKALCCATVGQAWGHSCEQCPPISSPCTRGFIPNTRTGACQD
VDECKVVPDLCKGGRCINTLGSYQCTCPVGYQQHVSILKCEDVDECSTIERACEAGHCIN
SAGSFSCVCPSGYVLSADRTRCLDQHTGICFASVVNGRCAHEISGRFNKIQCCCDRGRCW
SQRTTHEMCPVPGSDEYLRICLVGSALSGYNEEDPEMSPHHHSSFSVSPNDQILHPHNGN
GQIKPQIRQTPQILQFPQIPQIPRHDNGFKPQRPVVSVNETVNRCRLLPNLCLNGRCIPM
ESDYRCDCNTGFKEDNRGECSDVDECEFDPCANGNCINTPGSYYCRCHTGFLRVPGKQTC
IDIDECLQNGVLCKNGRCLNTEGSFQCICNSGFKLSPDGRNCVDHDECAATNMCLNGMCI
NEDGSFKCVCKPGFTLNSSGRYCTDIDECRTPGVCMNGRCVNTQGSFRCECFAGLTVGID
GRTCVDTHMRSTCYGAVKRGLCLRPFQRAVTKSQCCCANPDYAFGEPCHPCPAKHSAEFQ
VLCASGVGFSADGKDINECALDPDICSNGVCENLRGNFRCVCNIGYESDQSGRNCLDIDE
CVVNSLLCDNGLCRNVPGSYSCTCPAGFIFRHDTETCEDVNECVSSPCVNGVCKNSAGSF
YCECSQGSKLDSTGLLCVDSVKGSCWLTLQDGRCEVNINGATLRSQCCATLGLAWGSPCE
PCQTDLVCERGFAQSRGASCEDVNECEVFPGVCHNGHCVNTRGSFKCQCPESLTLDVTGR
LCVDVRSEPCFLTYEEDVCTQPVPGRFRMDMCCCTVGLAWGKDCDLCPEPGTRQFDTLCP
RGPGFANKGDVLTGRAVYKDINECKVFQSICVHGKCRNTIGSFRCRCDSGFALDTNEKNC
TDIDECMISPDVCGHGTCVNTLGSFQCDCFPGYESGIMMMKNCMDIDECERNLSLCNGGT
CENTDGSYKCVCPPGHHLSVDGSACEDVNECDLSSTLCPNGWCVNLVGTYQCSCNSGYQT
TPDWKGCTDIDECTIENGGCELYCSNSEGSYSCSCGQGYSLTPDQRTCSDVNECEEVLDI
CEGGQCTNVPGAYHCLCYEGFMASVDMKTCIDVNECELNDNICAFGECENTKGSFICHCD
MGYAVKKGTSGCTDVNECEINSHNCDTHATCVNTPGHYHCSCGDGWFGDGVKCADVDECA
NRTSVCSADAECVNTAGSYHCECSDGFIGDGVICSDLDECAEDVDLCENGQCLNVPGSYR
CECEMGFTHTSNRKTCRDIDECSFQNICVFGTCQNIPGMFRCICDEGYELDRTGGNCTDV
DECLDSLNCVNGHCENTAGSYQCNCPIDFELNPTGIGCVDTRVGNCFLEVAYNSKLACSA
EIGFGVSRSSCCCSLGRVWGYPCDHCPTLNTSEYNTLCPGGEGFKPNPVTIILEDIDECQ
ELPGVCQGGNCVNTFGSFQCECPAGFYLNTQSRICEDIDECVLSLGVCGPGTCYNTLGNY
TCVCPQDYIQVNGGHRCMDMRKSLCYRSYNGSACEHQLNFNITHRLCCCSYNVGKAWNKP
CHACPIPGTDDYSSLCGSVTGFWIDIATGKPKDIDECHEILGVCAHGVCINHMGSFHCEC
PTGFLYNDLLLICEDIDECSSREPVCQRNADCINRPGGYQCECSDGYILTPNGDCNDRNE
CLETPSVCRHGDCVDIPGGYECMCHTGFTVTPNRRMCVDINECSHQPCGNGTCKNSVGSF
NCICHHGFELATNNYCTDIDECAVFHSQLCRNGRCVNNVGSFQCLCREGYELTFDGKTCM
DVNECTIIPGICAPGTCLNLDGSFRCVCPDGYIVQSDHCVDVNECSEEPGICTYGTCFNS
LGSFECVCKPGFVLSEDKRRCYDTRESFCFTRFENSKCSVPQAFNTTKAKCCCSIMAKEG
WGDPCELCPKEHDAAFQDLCPFGHGIIPGVGDTRVDLNECVENPEICVNGRCINMDGSFR
CECPAGYTLDYTGTHCDDIDECSVRNPCGNGTCSNVIGAFECLCEEGFEPGPMMSCEDVN
ECGQNPLLCAFRCINTFGSYECSCPSGYTLREDGRMCQDVDECAEDLHNCDSRGMECSNL
IGTFMCVCPAGMIRRMSDEACQDENECLTQPGVCENGRCVNTVGSYTCECGVGFKTDSSA
TQCLDYRKGFCFTEVLHTMCQMSSSSRVPVSRSQCCCNGGHGWGDQCELCPLPATANYKK
LCPYGHGYAIDGTDIDECKLIPDVCANGACINMMGSYRCHCKPGYIASTAGTACVDVDEC
GMSPKPCNFICKNTEGSYACSCPRGYTLQNDNRSCKDVDECQSRRHNCQFSCMNTIGGFT
CKCPAGFSQHHRACRDIDECLSDLTPCGLQGACQNSVGSFSCECPQGFSLDSLGHNCDDV
DECARDHRCQFGCQNVAGGFRCSCPQGYTQHQQWNQCVDDNECLNADNCGSASCFNTLGS
FKCGCPSGFTFDPASTSCEDVDECGSFMNPCRYGCSNTQGGFACGCPAGYYRAGQGHCIS
AAGFGGDAAGPENENDIPPENCYGCKTNGHQKKSIRRRHTSNITPETVSLASVGVDQPLE
LFLNRSRLRPSEAILKLLPAIGPPGQHILYTITAGNHAGFFQIRQRAGVTYLHTIHRTSL
KRQYLLQIRGSALSHDISRDDQPPSNFLMTLHITLQ
NT seq
8571 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcatctcagggggacctcaggtgtttatttggatttgttgctctgttgggaatttta
acggggaaaatctctggaattcatggaaaagcaactgttcatattgatggatcacagaga
cgccaaaaacaagagtccctgagaggccctaatgtgtgtggatctcgtctgcagtccttc
tgttgtccaggctggaagactctgcctgggggcaaccagtgtgttgtgcctatttgccgg
agtgactgtggggatggtttctgctccagacctaacatgtgcacatgtcctggtggacaa
acagctacaacctgttttactaaatcatccaaacaatgcaatataaggtgtatgaatgga
ggagtgtgtgaagatgactattgccagtgtccaaagggatatacaggaagcttttgtgga
caacctgtctgtgaaaaaaactgtcagaatggtggacactgcattggaccgaacagatgc
gcgtgtggatacggcttcactggaccacagtgtgagagagactaccggacaggcccatgc
ttcatccaagtgcacagcaggaagtgtgcaggtcagagcagtgaatttgtttgcagtaag
gccttgtgctgtgccacagtgggtcaagcgtggggtcactcgtgcgagcagtgcccacct
atcagctcgccctgcaccagagggttcatcccaaacacccgcacaggagcctgccaagat
gttgatgaatgcaaggttgtccccgatctgtgtaaaggaggaagatgcatcaacacattg
ggttcatatcagtgcacgtgtcctgtcggttaccaacagcatgtgagcattttgaagtgc
gaggatgtggatgaatgctccaccattgaacgtgcgtgtgaagcgggacactgcattaat
tcggcgggcagtttctcctgtgtgtgtccttctggatatgtgctgtctgcagaccggact
cgctgtcttgaccagcacacagggatctgctttgcgtcagttgtgaatggacgctgtgct
catgaaatcagcggacgtttcaataaaatccagtgctgctgtgatcgtggccggtgctgg
agtcaaagaacaactcatgaaatgtgtcctgtaccaggatcagatgaatacttgaggatt
tgtctggtaggctctgctctgagtggctacaatgaggaggatcctgaaatgagccctcac
caccacagcagcttcagtgtttcccctaatgaccagatacttcacccacataatggcaat
ggacaaataaaaccccagattcgccaaacacctcaaattctgcagtttccacagattcca
cagatcccaaggcatgacaatggatttaaaccacaacgacctgttgttagtgtgaatgag
actgtgaacaggtgccgtttgcttcctaatttgtgtctgaatggacgctgtattcccatg
gagtctgactaccgatgtgactgtaacaccggattcaaagaagacaacagaggagagtgc
tcagatgtagatgagtgtgagtttgacccctgtgctaatggaaactgcatcaacactcct
ggttcctactactgcagatgccacacaggctttcttagggttccaggcaaacaaacctgc
atagatattgatgaatgtcttcagaatggagtgctctgtaagaacggccgctgtctgaac
actgagggaagctttcagtgcatctgcaactctggatttaagctttcacctgatgggaga
aactgtgtagatcatgatgaatgtgctgccacaaacatgtgtcttaacggcatgtgtatc
aacgaagacggcagctttaaatgtgtgtgtaaacctggattcaccctcaactctagtgga
cgatactgtacagatatcgatgagtgccggactccaggtgtgtgcatgaatggacgatgt
gtaaacacacagggctctttcaggtgtgagtgttttgcaggtcttactgttggaatagac
ggccgaacatgtgtagacacacacatgcgtagcacctgttatggggctgtaaaaagaggt
ttgtgtttacgacccttccagcgtgctgtcaccaagtcacagtgctgctgtgccaaccct
gactatgcttttggtgaaccctgccatccctgccctgccaaacactcagctgagtttcag
gtcttatgtgcgagcggtgttggattttctgctgatggcaaagacattaatgagtgtgct
ctggatccggatatctgctcaaatggagtgtgtgagaatctccgaggaaatttccgctgc
gtctgtaacattggctatgaaagtgaccagagcggcagaaactgtttagatattgatgaa
tgtgtggtgaacagtctcctctgtgataatggcctgtgccggaatgttccaggaagctac
agttgcacctgcccggcggggttcatcttcagacatgacacagagacatgtgaggatgtg
aatgagtgtgtgagcagcccatgcgtcaatggagtgtgtaaaaacagtgcaggctctttc
tactgtgaatgttcacaaggaagtaaactggacagcactggacttttatgtgttgacagt
gtgaagggttcatgctggttaactcttcaggatggtcgttgtgaagttaacatcaacgga
gctacactgaggtcacagtgctgtgccacactaggactggcgtggggcagcccatgtgaa
ccatgtcaaactgatctagtgtgcgaacgaggatttgctcagtcaagaggggcttcatgt
gaagatgtgaatgaatgtgaggtgtttcctggtgtgtgtcacaatggacactgtgtgaac
actagaggctcatttaaatgtcagtgcccagaaagcctcacactggatgtcactggacgc
ctctgtgttgatgttcgttcggagccgtgctttcttacttacgaagaagatgtgtgtaca
cagccggtaccaggacgcttccgcatggacatgtgttgctgtacggtgggtttggcttgg
ggcaaagattgtgacttatgtcctgagcctggtactcggcagtttgacaccctgtgccca
agaggaccaggcttcgccaacaaaggagacgttctcactggcagagctgtctataaagat
atcaatgagtgcaaagttttccaaagcatttgtgtccatgggaaatgtcggaacaccatt
gggagcttcagatgtcgctgtgatagtggatttgcactggataccaatgagaaaaactgc
acagatattgacgagtgcatgatctctcctgatgtctgtggtcatggcacatgtgtgaac
actttgggcagtttccaatgtgactgttttcctggctacgaaagtggaatcatgatgatg
aagaactgcatggatattgatgaatgtgagcgtaacctttcactgtgcaatggaggcacc
tgtgaaaacactgacggcagctacaagtgtgtgtgtccgcctggtcatcatctgtctgtg
gatggcagtgcctgtgaagacgtgaacgagtgtgatctgagtagcacactttgtcctaat
ggctggtgtgtgaatttggtgggaacctaccagtgctcttgtaactctggctaccagacg
acacctgattggaagggttgcacagatatagatgagtgcacaatagagaacggaggatgt
gagctgtactgtagtaactcagagggcagttactcctgcagctgtggtcagggttacagt
ctcacgccggaccagcggacatgttcagatgtgaatgaatgtgaagaggttttagacatc
tgtgaaggtggtcagtgcactaacgttcctggagcatatcattgtttgtgttacgaagga
tttatggcttccgtggacatgaagacatgtattgatgtgaatgagtgtgaactgaacgac
aacatctgtgcatttggggagtgtgagaacaccaagggttctttcatctgtcattgtgac
atgggttacgccgtaaaaaaaggaacctctggctgcactgatgttaatgagtgtgagatt
aacagtcataactgtgacacacatgccacctgtgtcaacacaccaggacattaccactgc
tcctgcggggacggatggtttggagatggagtcaaatgtgctgatgtggatgagtgtgct
aacaggactagcgtctgcagcgccgatgccgagtgtgtgaacacagctggctcgtaccac
tgtgaatgttcagacgggtttattggagatggggttatctgctcagatttggatgaatgc
gctgaagatgtggatctgtgtgaaaatggccagtgtctaaatgttcctggcagctatcgc
tgtgaatgtgagatgggcttcacacacacttcaaacagaaaaacctgtcgagatatagac
gagtgctccttccagaacatctgtgtgtttggcacatgtcagaatattccaggaatgttt
cgctgtatttgtgatgaggggtatgagctggacaggacaggtggaaactgcacagatgtg
gacgagtgtctcgattccttaaactgtgttaatggtcactgtgagaacacagccggctcg
taccagtgtaactgtcctattgacttcgagctcaatcctactggaattggatgcgttgac
acccgggttggaaactgttttctggaggtggcgtacaatagtaagctggcatgtagtgct
gaaattggatttggagtcagtcgttcctcatgttgctgttctctgggacgggtgtggggt
tacccatgtgaccactgccctacactcaacacctcggagtataacacactctgtcctgga
ggagaggggttcaaacccaaccctgtcaccatcatcttggaagatatcgatgagtgtcag
gagctgcccggcgtctgtcagggtggaaactgtgttaacacattcggaagtttccagtgt
gaatgtccagccggattctaccttaacacacagagccgcatctgtgaagatatcgatgag
tgtgtgctcagtttgggggtttgtggtccaggcacctgctacaacacactgggaaactac
acttgtgtctgtccacaagattacattcaggtgaatggaggacacagatgcatggatatg
aggaaaagtttgtgctatcgcagctacaatggcagtgcctgtgaacatcagctcaacttt
aacatcacacacagattgtgctgctgttcctacaatgtgggaaaagcctggaacaagcca
tgccatgcctgcccgatacctggaactgatgactacagcagtctttgtggcagtgtgact
ggattctggatcgacattgcaactggaaagccaaaagatattgacgaatgtcatgaaatc
ctgggagtttgtgctcatggtgtgtgtataaaccacatgggcagtttccactgcgagtgt
cccactggctttctttataatgacctgctgctcatctgtgaagacattgatgaatgcagc
agcagagagcctgtgtgtcagagaaatgcagactgcatcaaccgtccaggcggttatcag
tgtgaatgttctgatgggtatatactcacacctaatggagactgtaatgaccgtaatgag
tgcttggagacacccagtgtgtgtcgtcatggtgactgtgtggatattccaggagggtat
gagtgcatgtgccacacaggatttacagtaacaccaaaccgcaggatgtgtgtagatatc
aatgaatgttcacatcagccatgtgggaatggcacgtgtaaaaactctgttggatcattt
aactgtatctgccatcacggatttgagctcgccactaataactactgtacagatatcgat
gagtgtgcagtttttcactctcagctctgcaggaatggtcggtgtgtcaataatgtgggc
tccttccagtgtctctgtagagaaggttatgaactcacttttgatggcaagacttgtatg
gatgttaatgagtgtacaatcattcctgggatatgtgctcctggaacttgtctgaatttg
gatggttctttcagatgtgtctgtcctgatgggtacattgtccagagtgatcactgcgta
gatgtaaacgagtgttcggaggagcctgggatctgcacatatgggacctgcttcaacagt
ctgggcagctttgagtgtgtgtgtaaaccaggatttgtgctgtcagaagataagcgcaga
tgttatgacaccagagagagcttctgtttcacacgctttgagaacagcaagtgctctgtc
ccgcaggcgtttaacaccaccaaagccaagtgctgctgtagtatcatggcaaaggagggc
tggggcgacccgtgtgagctgtgccctaaagaacatgatgcagcatttcaggatctgtgc
ccatttggtcatgggatcattcctggtgttggggacacacgtgtagatttaaacgagtgt
gtggagaatccagagatctgtgtaaacggacgctgcatcaacatggatggttcctttcgc
tgtgagtgtccagcagggtacactcttgactacacaggaacacattgtgatgatatcgat
gaatgttcagtgagaaacccatgtggaaacggcacgtgctccaatgtaatcggggcattt
gagtgtttgtgtgaagaaggatttgagcctggaccgatgatgagctgtgaagatgtgaac
gaatgtggtcagaatcctctgctctgtgcatttcgctgcatcaacactttcgggagttat
gaatgcagctgtccatctggttacacactgagagaggatggacgcatgtgtcaagatgtg
gacgagtgtgcagaagatcttcataactgtgactccagaggaatggaatgtagcaaccta
attggcacatttatgtgtgtttgtccggccggtatgatccgcaggatgagtgatgaggcc
tgtcaagatgaaaatgaatgcttgactcagcctggtgtttgtgaaaatggccgttgtgtg
aacactgttggcagctacacttgtgaatgtggtgttgggttcaaaacggactcgtcagcc
acacaatgtcttgattacaggaaaggcttctgtttcactgaagttctgcacaccatgtgt
cagatgtcgtccagcagtcgtgttcctgtcagcaggtctcagtgctgctgtaatggaggt
catgggtggggggatcagtgtgagctctgccctctgcctgccactgccaactacaaaaaa
ctctgtccatatggtcatggatacgccatagacggaacagatatagatgagtgtaaacta
attccagatgtctgtgccaatggcgcttgtatcaacatgatgggctcttacagatgccac
tgcaaaccaggatacatagcatctactgcaggaaccgcatgtgttgatgtcgatgaatgt
ggtatgtctccaaaaccctgtaacttcatatgtaagaacaccgagggcagctatgcatgt
tcctgtccccgtggttacactctgcagaatgacaacaggtcatgcaaagatgtggatgaa
tgtcagagcagacgacacaactgccagttctcgtgcatgaacaccatcggtggattcaca
tgcaagtgtccagcaggtttcagccagcatcacagagcttgcagagatattgatgaatgt
ttgtcagacctaacaccgtgtggcctgcaaggagcatgtcagaattcagtgggaagcttc
agctgtgagtgtccccagggcttcagtctggactctctcggccacaactgtgatgatgta
gatgagtgtgcacgggatcacaggtgtcagttcggttgtcagaatgttgctggaggtttt
cgctgcagctgtccacagggttacacacaacaccagcagtggaaccagtgtgtggatgac
aatgagtgcttgaacgcagacaactgtggttcagcttcctgtttcaacactttgggcagt
ttcaagtgtggctgcccatctggcttcacctttgatcctgcatctactagctgtgaggat
gtagacgagtgcgggtccttcatgaacccctgcagatacggctgctctaacacacagggt
ggatttgcgtgcgggtgcccagctggttattacagagcaggacaggggcactgtatatca
gctgctggttttggaggtgacgctgctggacctgaaaatgaaaacgatattcctcctgaa
aactgctacggctgcaaaaccaatggacatcaaaagaaaagtatcaggagaagacacact
tcaaacatcacaccggaaacagtcagtctggccagcgtgggtgtggatcagccgctggaa
ttatttctcaatcgctcaagactcagaccctcagaagccatcctgaaactgctgccagcc
atcgggccaccgggccagcacatactctacaccatcacagctggaaaccatgctggattc
ttccagataagacagagggcaggtgtcacttacctgcacactatacacaggacatcctta
aagagacagtacctgctgcagatcagaggttctgctctctctcacgacatcagcagagat
gatcaacctccttcaaacttcctcatgacactgcacattacactgcagtag
DBGET
integrated database retrieval system
