Egretta garzetta (little egret): 104130917
Help
Entry
104130917 CDS
T05152
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: fibrillin-1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
egz
Egretta garzetta (little egret)
Pathway
egz04350
TGF-beta signaling pathway
egz04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
egz00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
104130917 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
104130917 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
egz00536
]
104130917 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
egz00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
104130917 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104130917
NCBI-ProteinID:
XP_009642311
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2828 aa
AA seq
DB search
MEILDSVGTLSKAPVESAELDHSVLPNVCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCG
DGFCSRPNMCTCPNGQIAPSCGSKSIQHCNIRCMNGGSCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVC
ENGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQCERDYRTGPCFTLITNQMCQGQLSGIVCTKTLCC
ATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGICQGGNCINTVGSFE
CKCPAGHKFNEVTQKCDDIDECSTIPGICDGGECSNTVSSYFCKCPPGFYTAPDGLKCID
VRPGYCFSSLTTGRCGNQLPQPLSKMQCCCDSGRCWSSGAATAPEMCPIRSTDEYRKLCT
VAALLPARPDLPPGRPDVIPPPLLPGVYPPQQPEIVYPSRAPPPHVILPVNFTDYCQLFR
HLCLNGRCIPTPGSYRCECNKGFQLDVRGECIDVDECEKNPCISGDCVNTQGSYICXQST
PTRTECRDIDECLQNGRICNNGRCINTDGSFHCVCNAGFQVAADGKNCEDMDECSIRNMC
LNGMCINEDGSFKCICKPGFQLASDGRYCRDIDECETAGICMNGRCVNTDGSFRCECFPG
LAVGLDGRVCVDTHMRSTCYGGYKRGQCVRPLTGAVTKSECCCASTDYAFGEPCQPCPAQ
NSAEYQALCSSGTGMTAGGNDINECLLDTDLCPNGRCENLHGTYKCICNPGYEVDSTGKN
CIDIDECALNMLLCDNGQCRNTPGSFTCTCPKGFVYTPELKTCEDIDECESNPCVNGVCK
NTPGSFACECSPESTLDTTRTICIETVKGTCWQNIVDGRCEININGATLKSQCCSSLGAA
WGSPCTPCERDPICQKGYSRIRGTLCEDVNECEVFPGVCTNGQCVNTLGSFVCQCPNGMT
LDASGRTCLDIRLESCYLQHEDEQCTSQIPGRHRMDACCCSVGAAWGFECEECPLKGSPE
FEALCPRGSGFSTKIEITGKPFSKDINECKMVPSLCTHGKCRNTIGSFKCRCDSGFALDS
EERNCTDIDECRISPDLCGQGICVNTPGDFECACFEGYESGFMMMKNCMDIDECQRNPLL
CRGGTCINTEGSFRCDCPPGHQISPNISACIDINECDLSTSLCRNGRCVNLIGKYQCACN
PGYQSTPDKLYCVDIDECSIMNGGCENFCTNSEGSYECSCKQGFALMPDHRTCTDIDECE
DNPNICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASEDMKTCIDVNECDLHPNICLSGTCENTKGSF
ICHCDMGYSGKKGTTGCTDINECEIGAHNCDRHAICTNTAGSFKCNCSPGWIGNGIKCTD
LDECSNGTHMCSPHADCKNTMGSYRCLCKEGYTGDGFTCTDLDECSENLNLCENGQCLNV
PGGYRCECDMGFLPSPDGKACEDIDECSLPNICVYGTCHNLPGLFRCECEVGYELDRSGG
NCTDVNECADPTTCISGTCVNTAGSYTCECPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIKTRGD
NGGTFCSNEIGVGVSKASCCCSLGKAWGVPCEHCPLVNTTEYKVLCPGGEGFRPNPITVI
LEDIDECQELPGLCQGGKCINTFGSFQCQCPSGYYLNEETRVCDDVNECDTPGICGPGTC
YNTVGNYTCICPPDYMQVNGGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSY
NIGRAWNKPCEQCPIPSTDEFSTLCGSQRPGFFIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGICI
NMVGSFRCECPVGFFYNDKLLICEDIDECQNGPVCQQNAECVNTAGSYRCDCKPGYRFTS
TGRCTDRNECQEIPNICSHGQCIDTVGSFYCICHNGFKTNDDRTMCIDINECERDACGNG
TCRNTIGSFNCRCNLGFILSHNNDCIDVDECASGNGMLCRNGQCVNTIGSFQCLCNDGYE
VALDGRTCVDVNECALEPGKCSPGTCQNLDGSFRCICPPGYVLQNDKCEDIDECVEQPEI
CALGTCSNTPGSFKCLCPEGFVLSSTGRRCQDLRVSYCFTKFEDGKCSVPKSRNHSKQEC
CCALKGQGWGDPCELCPEEADEAFRQICPFGIGILVGPGDARLDVDECLDPDNCKFGQCI
NTDGSFRCECPYGYILQGAQCVDTDECAVGNPCGNGTCRNVVGGFECTCVEGFEPGPMMT
CEDVNECIQNPLLCAFRCVNTFGSYECKCPTGYVLREDRRMCRDQNECEEGIHDCDSKQM
ECKNLIGTYMCICGPGYQRRPDGEGCIDENECQTKPGICENGRCVNTVGSYRCECNEGFT
VSDAQNECLDNREGYCFTEVLQSMCQIGSSNRNSVTKSECCCDGGRGWGQNCEVCPFPGT
VAFKKLCPHGRGYMSNGADIDECKVIHDVCRNGECINERGSYRCHCNLGYTTDITGTLCI
DLNECNESPKPCNFICKNTEGSFQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNT
IGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECATEINLCGAKGICQNTPGSFVCECQRGFSLDQTGL
SCEDVDECDGNHRCQHGCQNIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCH
NTLGSYKCMCPTGFQYEQFSGGCQDINECGSAQAPCSYGCSNTEGGYVCGCPPGYFRIGQ
GHCVSGVGLGKGQGQELSLSGEVDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRKRRSTNETANEAED
QQELEPPISLASWDIEKAAVFSINISDLSNKDRILELLPALTTLTNHNRYLIDSGNEDGF
FRINKKDGISYLHFTKKKPVPGNYSLQISSIPLYKKKELYQLEEKHDKDYLSGELGDNLK
MKIQILLH
NT seq
8487 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaatccttgattcagtgggaacgctgagtaaagctccagtggagtcagcagagctg
gaccactctgtgctaccaaatgtgtgtggatcacgttacaatgcttactgttgccctgga
tggaaaactttacctggtggaaaccaatgcatagtcccaatctgcagacattcctgtggg
gatggattttgctctagaccaaacatgtgcacatgcccaaatggtcagatagccccctcc
tgtggttcaaaatcaatacaacactgtaacatccggtgcatgaatggaggtagctgcagt
gatgaccattgcctctgtcagaagggatatacaggaacacactgtggacagcctgtctgt
gaaaatggatgcctaaatggagggagatgcgtggctccgaaccgatgtgcttgcacatat
ggctttactggacctcagtgtgaaagagattacaggaccggcccttgcttcactttgata
accaaccagatgtgccagggacagctcagtggaatagtctgcacaaaaaccctttgctgt
gcaacagttggaagagcatggggccacccctgtgaaatgtgtcctgcccagccgcatccc
tgccgccgaggcttcattccaaacattcgaactggggcctgtcaagatgtggatgaatgc
caagccatccctgggatctgtcaagggggaaattgcattaatactgttggatcttttgag
tgcaaatgcccagctggacacaagtttaatgaagtgacacaaaaatgcgacgatattgat
gaatgcagcaccattcctggaatttgtgatggaggagagtgttcaaacacagtcagcagt
tacttctgcaagtgtcctccagggttttatacagctcctgatggcttaaagtgcatagat
gtgcgtcctggatactgcttctcttctctgaccaccgggcgttgcggcaatcagctcccc
cagcctttgtccaaaatgcagtgttgctgtgacagcggccgatgctggtcttctggtgca
gccactgctcctgaaatgtgcccgatcagatccaccgatgagtaccgcaagttgtgcaca
gtagctgctctgctgccagcaagacctgaccttcctccaggccgtcctgatgtcatccct
ccaccactccttcccggtgtttacccccctcaacagccagaaattgtctatccatctcgg
gctccaccacctcatgtgatcttgccggtgaacttcactgactattgccaactgttccga
catctctgtcttaatgggcgctgtattcccactcctgggagctaccgctgcgagtgcaac
aaaggattccaactggatgttagaggggaatgcattgatgttgatgaatgtgagaagaat
ccatgcatcagtggagactgtgtgaacacccagggatcctacatatgtnatcagagcacg
ccaactagaacagagtgccgagacattgacgaatgtttacagaatggtcgtatctgtaat
aatggacgatgcataaatacagatggcagttttcactgtgtgtgtaatgctggctttcaa
gtggcagctgatgggaaaaactgtgaagatatggatgaatgcagcataaggaacatgtgc
ctcaatgggatgtgcatcaatgaagatggcagttttaaatgcatttgtaaaccagggttc
cagttagcatctgatggacgctattgcagagacatcgatgagtgtgagacagctggaata
tgcatgaacgggcgctgtgtgaacactgatggctctttcagatgtgaatgcttccctggc
cttgcagtaggactggacggacgtgtgtgtgtcgatacacatatgcgaagcacgtgctat
ggtggctacaagagaggacaatgcgtgagaccattaactggtgcagttacaaaatcagag
tgctgttgtgccagcactgactatgcctttggggagccttgtcagccctgcccagcgcaa
aattcagctgaatatcaggctctgtgcagcagtggaactggcatgactgcaggaggaaat
gatattaatgaatgcttactggatactgatctctgtccaaatggaaggtgtgagaatttg
cacggaacatacaaatgtatttgtaaccctggatatgaagtggattcaactgggaaaaac
tgcattgacattgatgaatgtgcgctgaacatgctgctttgtgacaatgggcaatgcaga
aatacccctggaagtttcacctgcacctgtccaaaaggctttgtatacactcctgaacta
aagacatgtgaagatattgatgagtgcgaatctaacccctgcgttaatggggtgtgcaaa
aacacaccaggctctttcgcttgtgaatgttctcctgaaagtactttggatacaaccaga
accatctgcatagaaactgttaagggtacctgttggcagaacatagtggatggaagatgt
gaaataaatattaatggagcaactctgaagtcccagtgctgttcctcactaggtgctgcc
tggggaagcccgtgtacaccatgtgaacgagacccaatatgtcaaaaaggatattcaaga
ataagaggaacattgtgtgaagatgtaaatgaatgtgaggtgtttcctggagtctgtaca
aatgggcagtgtgtcaatacgttgggatcgtttgtttgccagtgccccaatggaatgact
ttagatgcttctggacggacgtgtcttgacattcgcttggagagttgctacctgcagcat
gaagatgagcaatgcacctcacaaataccaggccgacaccgaatggatgcttgctgctgt
tcagtgggggcagcatggggctttgagtgtgaggagtgtcctctgaagggatcacctgaa
tttgaagctctttgtccaagaggatcaggattctctacaaagatagagataactgggaaa
cctttctctaaagatatcaatgaatgtaaaatggtccccagtctttgtacccatggaaaa
tgcagaaataccattggcagttttaagtgtagatgtgacagtggatttgcccttgattct
gaggagaggaattgcacagatattgatgaatgccgcatctctcctgatctttgtggccaa
ggcatctgtgtcaatactcctggagactttgaatgcgcatgttttgaaggctatgaaagt
ggatttatgatgatgaaaaactgcatggacatcgacgagtgtcagcgcaatccccttctc
tgccgaggtggcacctgcatcaacacagagggaagttttcggtgcgattgtcctccaggc
catcagatatcaccaaatatctctgcgtgtatagacattaatgaatgtgatctaagtacc
agcctgtgccgaaacggacgttgtgtcaacctgattggaaagtaccagtgtgcttgcaac
cctggatatcagtccactcctgacaagttatattgtgttgatattgatgagtgcagtata
atgaatggtggctgtgagaacttctgcacaaactcagagggcagctatgaatgtagctgt
aaacaaggctttgctctcatgccagaccacaggacatgcactgatattgatgagtgtgaa
gacaatcctaacatctgtgatggaggccagtgtacaaacatcccaggagaatacaggtgt
ctttgctatgatggattcatggcatctgaagacatgaaaacttgcatagatgtgaatgag
tgtgatctgcatccaaacatctgtctgagtggaacctgtgagaatacaaaaggctcattt
atctgtcactgtgatatgggatattcaggcaagaaaggcacaactggctgcacagatatc
aatgagtgtgaaattggagcccataactgcgataggcatgccatatgtacaaacacagcg
ggaagtttcaaatgtaactgcagccctggctggattggaaatggtatcaagtgcacagat
ctggatgagtgctccaatggaacccacatgtgcagcccacatgctgactgcaagaataca
atgggctcgtaccgctgcctgtgtaaagaaggttatactggggatggcttcacttgtaca
gacctcgatgaatgctcagaaaacttgaatctctgtgaaaatgggcagtgcctcaatgtt
cctggaggatatcgctgtgaatgtgatatgggatttttgccaagtccagatgggaaagct
tgtgaagatattgatgagtgttcacttcctaacatctgtgtctacggtacttgtcataac
ctccctggacttttccgatgtgagtgtgaagtgggctacgagttggacagaagtggtggt
aactgcacagatgttaatgaatgtgcagatcccacaacctgcattagtggcacatgtgtc
aatactgctggtagttacacctgtgagtgccctcctgactttgagctgaatcccacccga
gttggatgcgttgatacacgatctggcaactgttacctggacattaaaactcgtggagat
aatggtggcaccttctgcagcaatgagattggagtgggagtttccaaggcctcctgctgc
tgctccctggggaaagcttggggagttccctgtgaacactgcccacttgtgaacacaact
gaatataaggttctttgccctggaggggaaggattccgaccaaaccctattacagttata
ttagaggatattgatgagtgtcaagaactgcccggactttgccaaggaggaaaatgtatt
aatacatttggtagctttcagtgtcagtgtccatcagggtactatttgaatgaagagact
cgagtgtgcgatgatgtgaatgagtgtgatacacctggcatttgtggacctggcacatgt
tacaatactgttgggaactacacctgcatctgccctcctgattacatgcaagtcaatgga
ggaaacaactgcatggatatgagaagaagtctgtgttacagaaattactatgctgacaat
caaacctgtgatggtgagctgctctttaatatgaccaagaagatgtgctgctgttcctac
aacattggacgtgcatggaataagccttgtgaacagtgtcctatcccaagcactgatgaa
ttctccacactctgtggaagtcaaaggcctggcttcttcattgacatttatacaggatta
ccagttgatattgatgaatgcagagagattcctggagtgtgtgaaaatgggatctgtata
aacatggttggcagcttccgatgcgagtgtcctgtgggtttcttctacaatgacaagcta
ctgatctgcgaagatattgatgaatgccaaaatggaccagtgtgtcagcaaaatgcagaa
tgtgtcaacacagctggtagctaccgttgtgactgtaaacctggctacaggttcacatca
actggccgctgcactgatcggaatgaatgtcaagaaattcccaatatctgcagccacggg
cagtgtattgatactgttggaagtttctactgcatttgtcacaatggattcaagaccaat
gatgacagaacaatgtgtatagatatcaatgagtgtgagagagacgcctgtggcaatgga
acctgcagaaataccattggctctttcaactgccgctgcaatctggggttcatcctctca
cacaacaatgactgcatagatgtggacgagtgtgcaagtggaaatggaatgctctgcagg
aatgggcagtgtgtgaacacgatcgggtccttccagtgtctttgcaatgacggctatgag
gtggctctggatggaaggacttgtgttgatgtcaatgagtgtgcactggagcctggaaaa
tgctcaccaggcacatgtcagaacttggatgggtcattcaggtgtatctgtcctcctgga
tatgtcctgcagaatgacaaatgtgaagacattgatgagtgtgtggaacaaccagaaatt
tgtgccctgggcacatgcagcaacactccaggcagtttcaaatgtttatgtccagaaggt
tttgtgttgtcttccacaggaaggcgatgccaagatctgagagtaagttactgctttacc
aaatttgaagatggaaaatgttctgtgccgaagtcccgaaaccactccaaacaagaatgt
tgctgtgcattgaagggacagggatggggagatccctgtgaactgtgcccagaggaagca
gatgaggcattcagacagatttgtccatttggaattggcatccttgttggacctggtgat
gcaagactggatgtggatgagtgccttgatccagataactgtaaatttgggcagtgtatc
aacacagatgggtctttccgctgtgaatgtccgtatggttacatcctacaaggagctcaa
tgtgtggatactgatgaatgtgctgttggaaacccgtgtggaaatgggacttgcaggaat
gtggtgggaggttttgaatgcacctgcgttgaaggatttgagcctggaccaatgatgacc
tgtgaagatgtcaacgagtgtattcagaatcctctgctctgcgctttccgctgtgtgaac
acttttggatcctacgaatgcaagtgccccacagggtatgttctgcgagaggaccggaga
atgtgcagagatcagaatgagtgtgaagaaggaattcacgactgtgactcaaaacagatg
gagtgcaaaaacctaattggcacctatatgtgtatctgtggaccaggttatcagcgcaga
ccagatggggaaggctgtatagatgagaatgaatgtcagaccaaacctgggatctgcgag
aacggccgttgtgtaaacacagtaggaagttacagatgtgaatgcaatgagggattcact
gtcagtgatgcccagaacgaatgccttgacaacagggagggctactgcttcactgaagtc
ttacaaagtatgtgtcaaatcggatcaagcaacaggaactctgtcaccaagtctgaatgc
tgctgtgatggtggccgaggctgggggcaaaactgcgaggtctgccccttcccaggcact
gtggccttcaagaagctttgtcctcatggccgaggatacatgtctaatggagcagatatt
gatgagtgcaaggttattcatgatgtctgccgtaatggggaatgcatcaatgagagggga
tcttatcgttgtcattgcaacctcggttatactacagatataactggcactctttgcata
gatctgaatgaatgtaatgagtcccccaaaccttgtaatttcatctgcaaaaacacagag
gggagcttccagtgttcatgtccaaaagggtacatcctgcaagaagatgggagaagctgt
aaagatctcgatgaatgtgcaaccaagcagcacaactgccagttcctttgcgtcaacact
attgggggtttcacttgtaaatgtcctcctggattcactcagcaccatacagcctgcatt
gataataacgagtgtgctactgaaatcaatttatgtggtgcgaagggcatttgccagaat
acaccgggaagttttgtgtgtgagtgtcaacgtggcttctcactcgatcaaactgggctt
agctgtgaagatgttgatgaatgtgatggaaaccaccgatgtcagcatggctgccaaaat
ataattggaggatacaggtgtagctgcccacaaggatatctccagcattaccagtggaac
caatgtgttgatgaaaatgaatgtctcagtgcacacatttgtggaggagcatcttgccac
aatactttgggaagctataaatgtatgtgccctaccggatttcagtatgaacagtttagt
ggaggttgccaagatatcaatgaatgcggttctgcacaagccccatgcagttatggttgt
tcaaatactgaaggtggctatgtctgtggatgtccacctggttacttcagaataggacaa
ggacactgtgtttctggagtggggctaggcaaaggtcaaggacaagagctttcactcagt
ggagaagtagatgacaactccctctctcccgaagcttgttatgaatgtaaaatcaatggc
tatcccaagagaggaaggaagcgcagaagcactaatgaaactgcaaacgaagcagaggat
cagcaagagctggagccgccgatcagtctcgccagctgggatattgagaaagcagcagtc
ttctccatcaacatctcggatctcagtaacaaagatcgcatcctggaactgcttcctgcc
ctcacaacactgacaaaccataaccgatatttaattgactccggaaatgaagatggtttc
tttagaatcaataagaaggacgggataagttaccttcatttcacaaagaagaagccggtg
cctggaaactattcattacaaatcagtagtattccactctataaaaagaaggaactgtac
cagcttgaagagaaacatgacaaagactacctcagtggtgagctgggagataacctgaaa
atgaaaattcagatattgcttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system