Candidatus Johnevansia muelleri: CEM_150
Help
Entry
CEM_150 CDS
T03696
Symbol
metH
Name
(GenBank) cobalamin-dependent methionine synthase
KO
K00548
5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase [EC:
2.1.1.13
]
Organism
eme
Candidatus Johnevansia muelleri
Pathway
eme00270
Cysteine and methionine metabolism
eme00450
Selenocompound metabolism
eme00670
One carbon pool by folate
eme01100
Metabolic pathways
eme01110
Biosynthesis of secondary metabolites
eme01230
Biosynthesis of amino acids
eme04981
Folate transport and metabolism
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
eme00001
]
09100 Metabolism
09105 Amino acid metabolism
00270 Cysteine and methionine metabolism
CEM_150 (metH)
09106 Metabolism of other amino acids
00450 Selenocompound metabolism
CEM_150 (metH)
09108 Metabolism of cofactors and vitamins
00670 One carbon pool by folate
CEM_150 (metH)
09150 Organismal Systems
09154 Digestive system
04981 Folate transport and metabolism
CEM_150 (metH)
04980 Cobalamin transport and metabolism
CEM_150 (metH)
Enzymes [BR:
eme01000
]
2. Transferases
2.1 Transferring one-carbon groups
2.1.1 Methyltransferases
2.1.1.13 methionine synthase
CEM_150 (metH)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Met_synt_B12
S-methyl_trans
Pterin_bind
B12-binding
B12-binding_2
Peptidase_M16_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDZ16418
UniProt:
A0A078KE00
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(143498..147187)
Genome browser
AA seq
1229 aa
AA seq
DB search
MIIFDHYIDTLINTLSSRIVILDGGMGTMIQKYCLEEKDFKGYRFINSNKEIKGNNDILN
LTQANVIKSIHIAYIEAGADIIETNTFNSNRISQLDYSMEYIVPELNMESVIIARNVCDK
FYYETGIPRYIAGILGPTSRTASLSPDVNDPSNRNISFDKLCENYSEAAIALIDGGVDLI
LIETIFDTLNAKAAIYALYDLFENIGKNIPIMISGTITDASGRTLSGQTPEALWNSVRHA
NPISIGLNCALGAENIRPYIEELSKKADTFISVHPNAGLPNEFGEYDQTAKDMSKIIYDF
AKNKILNIIGGCCGSTPQHISAIKLAVTCLQPRQIPVIDKICRISGLEALNITSKSLFVN
VGERTNVTGSSKFKRFIEEKDYNSALEIALQQIQNGAQIIDINMDEGMLDSKTELVKFLN
IIGSEPEICRVPIMIDSSKWDIIESGLKCIQGKSIVNSISLKEGEDKFRYQAILCRMFGA
AIIVMAFDEYGQADTFDRKIEICSRAYHILVNELFFPAEDIIFDPNIFSIATGINEHNNY
AVDFINATLWIRKNLPYSMISGGVSNVSFSFRGNNFVREAIHSVFLYYAIKSGMSMGILN
AGQLSVYDDLTNELRNIVENVVLNRGKSGTEKLLEIADQYKKEDIIQIKKDLEWRLFDVE
KRIEYSMVRGITTYIEEDAELARKLYKNPINVIEGPLMTGMNLVGDLFGAGKMFLPQVVK
SARVMKQAVAYLIPYIKYKKNNDKNKGKIIIATVKGDVHDIGKNIVSVVLQCNNYEVIDL
GVMVPAETIIKTAIDKKADIIGLSGLITPSLDEMIYVAKEMERQGFKLPILIGGATTSKS
HTAVKIAPYYSAPVVYVTDASRAVGVTSNLLSKKKNTYVESIRKEYTNVRLRNAKRKPKL
SDLTYAESKKRKFLIDWKNYTPQAPNFTGIKILNKYDLHEITKYIDWTPFFISWQLIGKY
PHIFNDKVIGESARNLFKDAKNMLYKLINNNNIYASGVVGFWLSAVVDDDIIEIYADESR
NKVINCIYNIRQQSSKFNKIICYSLADFIAPKHSGLIDWIGAFSVTTGHGVDEIAQQYEK
FNDDYNAIMVKSLADRLAEAFAERLHERVRKEFWGYSPYEQFDNDALISEKYFGIRPAPG
YPACPDHTEKSTLFDLLESKKNAGLTLTDNFAMWPASTVSGWYYSNPQSRYFSTGNIGKD
QIIFLSERKCISINETERWLAPILSYNKA
NT seq
3690 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcatatttgatcattatattgatactcttattaatactctttcatctagaattgta
atactagatggaggtatgggcacaatgattcaaaaatactgtttagaagaaaaagatttt
aagggttaccgatttataaattctaacaaggaaattaaaggaaataatgatattcttaat
ttgacacaggctaatgtcattaaatcaattcatattgcttatatagaagcaggtgcagat
ataatagaaacaaatacatttaatagtaatagaatttctcaattagattattccatggaa
tatatagttccagagctaaatatggaatcagtaataattgcgcgcaatgtatgtgataaa
ttttattatgaaacaggaataccacgttatatagctggtatacttggaccaactagccgt
actgcatcattatcaccagatgttaatgatccttcaaatagaaatattagctttgataaa
ttatgtgaaaattatagtgaagcagctattgctctaattgatggaggtgttgatttaatt
ttaattgaaactattttcgatactttaaatgctaaagctgcaatttatgcattatatgat
ttatttgaaaatattggtaaaaatattccaataatgatttctgggactattaccgatgct
tctggtagaactctttcaggtcaaactcctgaagcattatggaactcagttagacatgct
aacccaatttctattggattaaattgtgctttgggagcagaaaacataagaccttatatc
gaagaactatctaaaaaagctgatacttttatttctgtacatcctaatgctggactacct
aacgaatttggtgaatatgatcaaactgcaaaagatatgagtaaaattatatatgatttt
gccaaaaataaaatattgaatattataggggggtgctgtggatcaaccccccaacatata
tcagcgattaaattagcagtaacttgtttacaaccacgtcaaattcctgttatagataaa
atttgtcgtatttctggactagaagctctgaacattacatcaaaatctctatttgttaat
gtaggtgaacgtactaatgttactgggtcatcgaaatttaaacgttttatagaagaaaaa
gattataatagtgcattagaaatagctttgcaacaaatacaaaatggcgctcagattatt
gatattaatatggatgaaggaatgttagattctaaaacagaactagtaaaatttttaaat
attattggatcagaaccagaaatttgtcgtgttcctattatgattgattcatcaaaatgg
gatattattgaatcaggactaaaatgtattcaggggaaatctattgttaattctatttct
ctgaaagaaggagaagataaatttagatatcaagcaattttatgtagaatgtttggtgct
gcaattattgtaatggcttttgatgagtatggacaagctgatacttttgatcgtaaaata
gaaatttgtagtagagcttatcatatattagttaatgaacttttttttcctgcagaagat
attatatttgatcctaatatattttctattgctactggtattaacgaacataacaattat
gctgttgatttcataaatgcgactctgtggatacgcaaaaatttaccatattctatgatt
tctggtggggtatctaatgtttctttttcatttcgcgggaataattttgtacgtgaagca
atacactcagtatttctttattatgctattaaatctggaatgtcaatggggattttaaac
gctgggcagctatctgtatatgatgatttaacgaatgaattacgtaatattgttgaaaat
gtagtgttaaacaggggtaaatctggaacagaaaaattgttagaaatagctgatcaatat
aaaaaagaagatataattcaaattaaaaaagatttggaatggcgattatttgatgtggaa
aaacgtattgaatactctatggttagaggtattactacttatatcgaagaagatgctgaa
ttagcaagaaaactttataaaaatccaattaatgttatagaaggtccattaatgaccggg
atgaacctagttggtgatttatttggtgctggtaaaatgtttttacctcaagttgtaaaa
tctgcaagagttatgaagcaagcagttgcatatttaatcccttatattaaatataaaaaa
aataatgataaaaataaaggtaaaattattatagccacagttaaaggtgacgttcatgat
ataggaaaaaatattgtaagtgtagtgcttcaatgtaacaattatgaggttattgattta
ggggttatggtacctgctgaaactattattaaaactgcaattgataaaaaagctgatata
attggcctatctggattaattacaccatctcttgatgaaatgatttatgtagctaaggaa
atggagcgacaaggttttaaattacctattttaattggtggagctactacttctaaatcg
catacagcagttaaaattgctccatattattctgcaccagtggtttatgttactgatgct
tctcgtgctgtaggagtaactagtaatttgctatctaaaaaaaaaaatacatatgttgag
tctatacgtaaagaatatacaaatgtgcgattacgtaatgcgaaacgtaaacctaaatta
tccgatttaacttatgcagaatccaaaaaaagaaaatttttaattgattggaaaaactat
actccacaggccccaaattttactgggataaaaattttaaataaatatgatttacatgaa
ataacaaaatatattgattggacaccttttttcataagctggcaattaattggtaaatat
ccacatatattcaatgacaaagttattggggaatcagccagaaatctatttaaagatgca
aaaaatatgttatataaattaataaataataataatatttatgctagtggggtagtggga
ttttggttatcagcggttgtagatgatgatataatagaaatatatgctgacgaatcacgt
aataaagtaataaattgtatttataatatacgtcaacaaagtagcaaatttaataaaata
atttgttatagtctagctgattttattgctcctaaacacagtggattaatagattggatc
ggtgctttttcagttactactggtcatggtgttgacgaaatagcacaacaatatgaaaaa
tttaacgacgattataatgctataatggtaaaatcactggctgataggttagctgaagct
tttgcagaaagattacatgaaagagtacgaaaagaattttggggttattcaccatatgag
caatttgacaatgatgcattaataagtgaaaaatatttcggtattcgtccagcaccaggc
tatcctgcatgtcctgatcataccgaaaaatctacattgttcgatttacttgaatctaaa
aaaaatgctggattaactcttactgataattttgcaatgtggcctgcatctacagtatct
gggtggtattactctaatccacaatctcgttacttttcaactggtaatattggaaaagat
caaataatatttttatcagaaagaaaatgtatttccataaatgaaacagaacgttggtta
gcacctatattatcttataataaagcataa
DBGET
integrated database retrieval system