Flavobacterium agricola: K5I29_01915
Help
Entry
K5I29_01915 CDS
T09474
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
fag
Flavobacterium agricola
Pathway
fag01501
beta-Lactam resistance
fag01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fag00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
K5I29_01915
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
K5I29_01915
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fag02000
]
K5I29_01915
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
fag01504
]
K5I29_01915
Transporters [BR:
fag02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
K5I29_01915
Antimicrobial resistance genes [BR:
fag01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
K5I29_01915
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
EMC4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UYW01707
LinkDB
All DBs
Position
389984..393055
Genome browser
AA seq
1023 aa
AA seq
DB search
MSLSTLSIKRPVFTIVVNLALILFGILGFTFLGVREYPSIDPAQISVRTNYAGANADIIE
SQITEPLEKVINSIDGIKNLSSTSNQGVSNINIEFHLDKNLEEAANDVRDKVSQALRSLP
QDLDTPPVVSKADADSEPIIIMTLQSDGKNILELSDYADNVIAQRLQSISGVSSVSIWGQ
KRFAMRLWIDAPKLAAYGLTILDVQAALQAQNVELPSGKLTGAKTEMAIKTLGNLATEDQ
FNDIIIKSTDQKVIRLKDVGTARLEAENFETSMTESGVPMVSLAIIPQPGTNYLDIANQF
YKEFDRLQDDLPDGFKMEISMDNTLFVKRAITEVVETLFISVALVVLIIYAFFRNWSVAF
RPLVDIPVSLIATFFIMYLCGFSINVLTLLAIVLATGLVVDDGIVVTENIYKKVEEGMSP
IEAAIKGSNEIFYAVISISVTLAAVFLPVIFLEGFVGRLFREFGVVIGAAVLISAFVSLT
LTPMLNAYLVKGGQQKQTKFYQRTEKYFVRMNKSYAGSLQFFLNRKWLSAAVIVVCLGMI
ALFFTILPKETAPYDDRSNISVRATGPEGVSYDYMQKFMNELTDMINDSVPEKNVSLVIT
SPSYGSGSANSGVIRLGLVQPQDREKTQGQIANDLSVWTRNFTDAKVSISQQPTISVGRR
GGMPIQYIIQATNFEKLEEKVPEFMDAVSQSPVFSNFDINLKFNKPEAYITIARDKAENL
GVSILDIARTLQMSLSGQRFAYYMMNGKQYQVIGQFNRTDRSAPMDLAAMYVKNNKGQLI
QMDNLVTIEEKSSPPQLYHNNRYMSATVSASLAQGQSLEDGIKEMDRIKEQVLDDSFTTD
LGGEARDFMESSSNTLFAFGLAIVLIFLILAAQFESFIDPIIILITVPMAVAGALFSLWL
FGQTWNIFSQIGTIMLIGLVTKNGILIVEFANHLRDQGLSKYDAVLQASESRLRPILMTS
LTIALGALPIALSIGAASISRMGMGVVIVGGTLFSLVLTLFVIPTIYLMFSRKRKHNPEL
DKY
NT seq
3072 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtctgtctaccttaagtataaaacgaccggtatttactattgtcgttaacctggcc
ttaattttattcggaattttaggatttacctttttaggtgttcgagaatatccgtctatt
gacccggctcaaattagcgttcgtacaaattatgcaggggctaatgccgatattattgag
tcgcaaattacagagcctttagaaaaagttattaactcgattgacgggattaaaaacctc
tcttccacgtcaaaccaaggggttagtaatattaatattgaattccatttagataaaaat
ttagaagaagctgctaacgatgtacgtgacaaagtttcgcaagcgctacgtagtttacct
caagatttagatacgccaccggtagtttctaaagccgatgccgattcagaacctattatt
atcatgactttacaaagtgatggtaaaaatattttagaattatccgattatgctgataac
gttattgcacaacgcctacaatctatatcgggcgtaagttcagtaagcatttgggggcag
aaacgttttgctatgcgtttatggattgatgcaccaaagttagccgcttacggcttaact
attttagatgttcaggccgcgttacaagcccaaaatgttgagttaccttctggtaaatta
acaggtgccaaaaccgaaatggcaattaaaaccttaggaaacttagctactgaagatcag
tttaacgatatcattatcaaatctactgatcaaaaagttattcgattaaaagatgttggt
actgcacgtttagaagctgaaaactttgaaaccagtatgaccgaatccggcgtaccaatg
gtttccttagctattattccgcaacccggaaccaattatttagatattgctaaccaattc
tataaagaatttgatcgtttgcaagatgatttacctgacgggtttaaaatggaaatttcc
atggataatacgttgttcgtaaaacgcgccattaccgaggtggtcgaaaccttatttatt
tcggttgcattggttgtgttaattatttacgcgtttttcagaaactggtcggttgctttc
cgcccgttggtagatattccggtatcgttaattgctactttttttattatgtatttgtgt
ggtttttcaatcaacgtacttaccttattggctatcgttttggcaaccggtttggtggta
gatgatggaattgtagtaaccgaaaatatttataaaaaggttgaagaaggcatgtcgcca
attgaagctgcaataaaaggatctaacgaaattttctatgccgtaatttccatttcagta
accttagcagccgtatttttacccgtaatctttttagaaggatttgtgggccgattgttc
cgggaatttggtgtggtaattggagccgccgttttaatttcggcctttgtatcgcttacg
ttaacaccaatgttaaatgcatatttggtaaaaggtggccagcaaaaacaaaccaagttt
taccaacgtaccgaaaaatattttgtgcgtatgaacaaatcgtacgcaggcagcttgcag
ttctttttaaatcgcaaatggttaagcgcagcagttattgtggtttgtttaggtatgatt
gctttattttttaccattttaccaaaagaaactgcaccttacgacgatcgtagtaatatt
tctgttcgtgcaaccggtccagaaggtgtttcgtatgattatatgcaaaaattcatgaat
gaattaacggatatgattaacgattctgttccagaaaaaaatgtaagcttagtaattaca
tcaccaagttacggatctggatcagcaaacagcggggtaattcgtttaggattggtacag
ccgcaagatcgtgaaaaaacacaaggccaaattgctaacgatttaagcgtttggactcgt
aattttaccgatgctaaagtttctatttcccaacaaccaaccatttcggttgggcgccgt
ggtgggatgccaattcaatacattattcaggcaactaattttgaaaaactagaagaaaaa
gttccggaatttatggatgcggtttcacaaagtcctgttttttcaaacttcgatatcaat
ttaaaatttaacaagcccgaagcgtacattaccattgctcgtgataaggccgaaaattta
ggtgtttctattttagatattgcacgtaccttacaaatgtcattatctgggcagcgtttt
gcttattatatgatgaacggaaaacaataccaagtaattgggcagtttaaccgtaccgac
cgttcggcacctatggatttagctgctatgtatgtaaaaaataacaaagggcaactaatt
cagatggataacttggttacgattgaagaaaaaagtagcccaccgcagttgtatcacaac
aaccgttatatgtcggcaaccgtttcagcatctttagcacaaggtcaaagtttagaagat
ggaattaaagaaatggatcgcattaaagaacaagttttagacgattcttttacaactgat
ttaggtggtgaagcgcgtgattttatggaaagtagttcaaataccttatttgcatttggt
ttagctattgttttaatattcttaatcttagccgcgcagtttgaaagttttattgatcca
attattattttaattacggtgccaatggctgtagctggagctttattttcgctgtggttg
tttggacaaacctggaacatttttagccaaatcggaaccattatgttaattggtttggta
actaaaaacggaattttaattgttgaatttgcgaatcatttacgcgatcaaggtctatct
aaatacgatgccgttttacaagcgtcagaatcacgtttacgcccaattttaatgacctcg
ctaaccattgctttaggagctttaccaattgctttatcaatcggtgctgcatctattagc
cgtatgggaatgggtgttgtaattgttggtggaaccttgttttcattggttcttacctta
ttcgtaattcctactatttatttaatgttttcacgcaagcgcaagcacaatccagaatta
gacaaatattag
DBGET
integrated database retrieval system
