Faecalibacter bovis: J9309_09900
Help
Entry
J9309_09900 CDS
T07705
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
fbo
Faecalibacter bovis
Pathway
fbo01501
beta-Lactam resistance
fbo01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fbo00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
J9309_09900
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
J9309_09900
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fbo02000
]
J9309_09900
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
fbo01504
]
J9309_09900
Transporters [BR:
fbo02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
J9309_09900
Antimicrobial resistance genes [BR:
fbo01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
J9309_09900
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTV05101
LinkDB
All DBs
Position
2051818..2054982
Genome browser
AA seq
1054 aa
AA seq
DB search
MKLAEISIKRPTLIIVLFTILTLGGLLSYSSLGYELIPKFDVNVVTVSTIYPGASPGEVE
NSVTKKIEDAVSSLENVKKVESKSYESLSIVMITLNSDADADYSLNDAQRKINQIISDLP
EDVETPSLSKFSMSDLPIITAGVSSDKLNDKDLYDLLDKKIEPVLARVKGVAQVNLIGGQ
EREIQVRLDAKKLEGYGLSVPQVQQAILTSNLDFPTGNIKTRENSTIIRLSGKYKSVEEL
NGLVLTTNQGIQVRLSDVALVYDSQREVEKVARLNQEPSIIFQVVKQSDANAVEVSSLVQ
KATKDIEKQFKAEGVKIRIMNDTSIFTLNAANSVVFDLVLAIVLVAVVMLLFLHSIRNAF
IVMVAIPASLIATFIGMELLGYTLNLMTLLGLSLVVGILVDDAIVVLENIYRHMEMGKSR
IRASYDGAAEIGFTVTAITLVIVVVFLPIALSTGLVAGIIGQFCVTVVIATMLSLLSSFT
IVPWLSSRFGKLEHLTGKNLFERFILWFEGVLNSFTNWVSDLLKWCLKNTFTKIASIVGA
VALLIASFMLVPLGYVGTGFFPKIDKGEFLVQIELPKDASIEQTNQKTIQIERYLRDKPE
IVDMITTVGQQSGGMGASQSTAYQAEIDVILTDKSEREDNSSIYAAKMKRELQDKFVGVK
IKTVPVGLVGAERAPLLLTVTGTDYEAAAKFATQALDILKTIPGSSEPELTSEDGNPEIT
VSVDRDKMSALGLNLQTVGLTMQTAFSGNTDGKYRDGAYEYDINIQFDDFNRRSIEDVKN
IIFVNNAGQQIKLSQFANVLQGSGPSLLERRDKTAAVSIESQVVGRAIGDVANEWMAEIE
KLDKPAGVDYVWGGDMENQTEGFGTLGIALLAAIILVYLVMVALYDSFVYPFVVLFSIPL
SLIGVFVILALTANSLNVFTILGMIMLIGLVCKNAILLVDFTNQRKEAGESTYNALLQAN
HARLRPILMTTIAMVFGMIPIALAKGAGAEMNNGLAWVIIGGLISSLFLTLIIVPVVYSI
FDSLIKKFTKGEPIDYEAEMKADYDEVQIKEEWE
NT seq
3165 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattagctgaaatatcgatcaaacgacctacgctgattatcgtattatttacgata
ttaactttaggtggtttactaagttattcgagtttagggtatgaattaatcccaaaattc
gatgttaacgtggtaacggtttctacaatctaccctggagcttctccgggtgaggtagaa
aactcggttactaaaaaaatagaggacgcagtttcgtccttagaaaatgtaaaaaaagta
gaatctaaatcgtatgagagtttatcaatcgttatgattacgttaaactctgacgcggat
gctgattattctttgaatgacgcacaacgtaaaattaatcagatcatttccgatttacct
gaagatgtagaaacaccttcgttaagtaaattctctatgtctgatttacctattattacg
gcgggtgtttcgtctgataaattgaatgataaggatctttatgatttattagataagaaa
atagaaccagttttggcgcgtgtaaaaggtgttgcacaagttaacttaattggtggacaa
gaacgtgaaattcaagttcgtttagatgctaaaaaattagaaggttatggtttatctgtg
cctcaggttcagcaagcaatcttaacatcaaacttagatttccctacaggaaatatcaaa
acaagagaaaattcaacgataattcgtttatctggaaaatacaaatcagtagaggaatta
aatggattagttttaacaacaaatcaaggaattcaggttcgtttatcagatgttgcttta
gtttatgattctcagcgagaagtagaaaaagttgctcgtctgaatcaagaaccatcaatt
attttccaggttgtaaaacagtctgatgcaaatgcggttgaggtttcttcattagtacaa
aaagcaacgaaggacatcgaaaaacagttcaaagcagaaggtgttaagattcgtatcatg
aatgatacttctatctttacattaaacgcagcaaactctgttgtattcgatttagtttta
gctattgtattagttgctgttgtaatgttattattcttacacagtattcgtaatgccttt
attgtaatggttgctattccggcttcgttaattgcgacatttatcggaatggaattatta
ggatatacgctaaatttaatgactttattaggattatctttagttgtaggtattctggtg
gatgatgccattgttgtattagaaaatatttaccgacacatggaaatgggaaaatctcgt
attcgtgcgtcttatgatggtgctgccgaaattggatttactgtaactgccattacttta
gttattgttgttgtattcttaccaattgcattatcaacaggattagtagctggtatcatt
ggtcaattttgtgttacagttgttattgctacgatgttatctttattatcatcgtttact
attgtaccatggttgtcatctcgttttggtaaattagaacatctaacaggaaaaaattta
tttgagcgatttattctttggtttgaaggcgtattaaattcatttacaaattgggtttct
gatttattaaaatggtgtttaaaaaatacgttcacaaaaattgcctcaatcgttggtgca
gttgcgttattgattgcctcttttatgttagttcctcttggttatgtcggaactggattt
ttccctaaaattgataaaggagaatttttagttcagattgaattacccaaagatgcttct
atcgagcaaacaaatcaaaaaactattcagattgaacgttatttacgtgataaaccggaa
attgttgatatgattacaacggttggtcaacaatctggtggaatgggagcttctcaatca
actgcataccaagctgagattgatgttattttgacggataaatcggaacgtgaagataat
tcatctatctatgcagctaaaatgaaaagggagttacaggataaatttgtaggagttaaa
attaaaactgttccagttggtttagtaggtgctgaaagagctccgttattactaacggtt
actggtacagattacgaagctgctgcgaaatttgcaactcaagctttagatattttgaaa
acgatcccaggttcttctgaaccagaattaacttctgaagatggaaatcctgaaattaca
gtttctgtagatcgtgataaaatgtctgctttaggattaaacttacaaacggttggtctt
acgatgcaaacagctttctcaggtaatactgatggtaaatatcgtgatggagcgtatgaa
tatgatatcaatatccaatttgatgattttaatcgtcgttcaattgaggatgttaagaat
attatttttgtaaataatgcaggtcagcaaattaaattaagtcaatttgcgaatgtactt
caaggttcaggtccatcgttattagaacgtcgtgataaaactgctgcagtttctatcgaa
tcgcaagtagttggacgtgcaattggtgatgttgcaaatgagtggatggcagaaattgaa
aaactggataaacctgctggtgtcgattacgtttggggtggagatatggaaaatcaaacg
gaaggatttggtacgttaggaatcgcgttattagctgcaattatcttagtttatttggta
atggttgcattgtatgactcattcgtgtatccattcgtcgtattattttctattccatta
tcgttaattggtgtatttgtaatcttagccttaacagcgaattccttaaacgtatttacg
attctgggtatgattatgttaatcggattagtgtgtaaaaatgccatcttacttgtcgat
tttacaaatcaacgtaaagaagctggagaatctacttacaatgcacttttacaagcaaat
catgcgcgtttacgtccaatcttaatgactactatcgccatggtttttggtatgattcct
attgcattagctaaaggagctggagcggaaatgaacaatggtttagcatgggtaattatt
ggtggtttaatttcatctttattcttaactttaattattgtaccagttgtttattctata
tttgatagtttaattaaaaagttcacaaaaggagaaccaatcgattatgaagctgaaatg
aaagctgattacgatgaagttcagatcaaagaagaatgggagtaa
DBGET
integrated database retrieval system