Flavobacterium collinsii: TRV642_3916
Help
Entry
TRV642_3916 CDS
T08703
Name
(GenBank) conserved protein of unknown function
KO
K20483
class I lanthipeptide synthase [EC:
3.13.2.4
]
Organism
fcs
Flavobacterium collinsii
Pathway
fcs02020
Two-component system
fcs02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fcs00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
TRV642_3916
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
TRV642_3916
Enzymes [BR:
fcs01000
]
3. Hydrolases
3.13 Acting on carbon-sulfur bonds
3.13.2 Thioether and trialkylsulfonium hydrolases
3.13.2.4 lanthipeptide synthase
TRV642_3916
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lant_dehydr_C
Lant_dehydr_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI2768649
UniProt:
A0A9W4TKU6
LinkDB
All DBs
Position
TRV642:complement(4483070..4485919)
Genome browser
AA seq
949 aa
AA seq
DB search
MIFFDKIVKRVANFSVQSYEKNKKDKIQFFNDDALFKLSILISSRSLYEDANKNKNEKIK
KSLSKYFSRAHFNPTPFGIFSSVGVVKWGDSTLIKKNKDLKLNVRYDNSLLSSKVNAAMD
KDWLTKFYCINPSIYFRNETKISFFKSEIQDIGKIELKHVEIDFDENLEWLIERFEKKVH
LSEIVEELVLNGFERIDVEEYLQNVLESGLIVEYFLFFPYAEKLSNDNSMFFSALVDKKT
HLIKSNYDVESFSDQYISDQKVFFEENKEFKYSHLINSFDTDEGVLDQNFQDKIKRFIDF
TINFNTHSSHKNITLGKFISKISQSYNDGFIPLTKIFNPYSGLSYKSFEDVHNLKLDKEI
VSKILTSDKEDVYLDLFISGDNNETKKSKLPATFSILVEVLTCKDSSDPILYIKNLGANS
ALNLISRFSDITNDICQDIVTFEKQIHENKLVADINCIGTFRSLNISPVKQFYDYCIPIN
TTFTNNSNPILLSDIYVHLEDGRIALVSKKYKKEVIPKLTSAINPNLSDSEFYSFLCDYE
FYNQEIYGVNFDFNSYNYAMPYVPRIYLEKGVLLFPSQILLVNNNYSFVAFQVYLAEKIK
EYSFSKIINFSDIKGEITIDTDIVDDIFLIYEKIKERNYLYVSESLYESFNPQIIDKEHN
NFSHELVVSVKNGHYTRPQFNYDNVDEILSENIPVLSDWLYLEIFGNSYSNHDILKFINE
AILLQGKTDLFFFVNYANPDRHLRVRFKTNSRENKEYIILKIHELKSNHLISKYHILPYE
QEIHRYGGIQLMELAESIFSFDSMDFINNVINLDLDEDSVKITAMLKIKNYFNYFGLSLE
EMIENCERAIKLFSKEFELTAKLRKSLNKDFLEIRNKIDHVKYVNFLDDLMLGADIVKKL
NENKFSLYNYMSLIIHMSMNRHFSEEQRFNELKVYYLAKTYLNQLKFKK
NT seq
2850 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattttttttgataaaattgtaaaaagagttgccaatttttctgtacagtcatatgaa
aagaataaaaaagataaaattcagttttttaatgatgatgcattgtttaaactttcaatt
ttaatttcatctagaagtttatatgaagatgctaataaaaataagaatgaaaagataaaa
aaatctttatctaaatatttctcaagagcccattttaatccaacgccttttggtattttt
agtagtgttggagtcgttaaatggggagattctactttaataaaaaagaataaagatctt
aagctgaatgttagatatgacaactcattattgtcttcaaaggtaaatgccgcaatggat
aaggattggttaactaaattttattgtatcaatccttctatttatttccgtaacgaaaca
aaaattagtttttttaaatcagaaattcaggatattggtaaaatagaacttaaacatgtt
gagatagattttgatgaaaatctcgaatggttgatagagagattcgaaaaaaaagtccac
ttatctgaaatagttgaggaactggttttaaatggatttgaaaggattgatgttgaagaa
tatttgcaaaatgttctggagagtggtttaattgtggagtactttttattttttccttac
gctgaaaaactgagtaatgataattcaatgtttttttctgctcttgtagataaaaagaca
catttaattaaaagtaactatgatgtagaatctttttcggatcagtatattagtgatcaa
aaggttttttttgaagaaaataaagaatttaagtattctcatctgattaattcttttgat
acagatgaaggtgttttagatcaaaattttcaggataaaataaaaagatttatagatttt
acgattaattttaatacacattcttcacataaaaatattactttaggtaaattcattagt
aagatttcccaaagctataatgatggttttattccgttaacaaaaatatttaatccttac
tcaggtctaagttacaaaagttttgaggacgttcataatctaaagctagataaagagatt
gttagtaagatattgacttcagacaaagaagacgtttatttggatttatttatctcaggg
gacaataatgaaactaaaaaaagtaagctgcctgcaacattcagtattttagttgaagtt
ttaacatgtaaagattcgagtgaccctattttgtacataaaaaatctaggtgccaattcc
gcattaaacttgatttccagatttagtgatataactaatgatatatgtcaggatattgtg
acctttgaaaagcaaattcacgagaataaacttgtagcggatattaattgtattggcact
tttagaagtctgaatatttcacctgtaaaacagttttatgattactgtattcctataaac
acaacatttactaataactccaatccaattttattatctgatatttatgtacatttagag
gatggtagaatagcgcttgtatctaagaaatataaaaaagaagttattccaaaattaact
tcagctattaatccaaatctttcagattcagaattttatagttttttgtgtgattatgag
ttctataatcaagaaatttatggtgtgaattttgattttaatagttacaattacgctatg
ccctatgtacctagaatatatctcgaaaaaggggtattacttttcccttctcagatttta
ttagttaacaataattattcttttgtggcatttcaagtttacttagcagaaaaaattaaa
gaatattctttttctaagataattaacttttctgatataaagggggaaataacaattgat
actgacattgtagatgatatttttttaatttatgaaaaaattaaagaaagaaactattta
tatgtatcagaatcattatacgaatcgtttaacccacaaattattgataaagaacataat
aatttttcacatgaacttgttgttagtgtcaaaaatgggcattatacacgtccgcagttt
aattatgacaatgttgacgaaatcttaagtgagaatattccagttttatcagattggctg
tatttggaaatttttggtaactcttattcgaatcatgatattttaaaatttattaatgaa
gctattcttttacaaggaaaaacagatcttttcttttttgtaaactatgctaatcctgat
agacatttacgagtacgatttaagacaaattcgagagaaaataaagaatatattatttta
aagatacatgaattaaaaagtaaccatttaattagtaagtatcatatacttccttatgaa
caggaaattcatcgttatgggggtatacaattaatggaattggctgaaagtatttttagt
tttgacagtatggattttatcaacaatgttattaatttagatcttgatgaagactcagta
aaaattacagcgatgttaaaaatcaagaattattttaattatttcggtctctcattagag
gaaatgatagaaaattgtgaaagagcaattaaattgttttcaaaagaatttgagttaaca
gcaaaattaagaaagtcacttaataaagattttctggagattagaaataaaatagaccat
gttaaatatgttaattttttagatgatcttatgttaggtgctgatatagtgaaaaaatta
aatgagaataaatttagtctttataactatatgtctcttattattcacatgagtatgaat
agacatttttccgaagaacaaagatttaatgaacttaaagtttactatttggcaaaaaca
tatcttaatcaattaaaatttaaaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system