KEGG   Flavobacterium flavipigmentatum: LNP22_13460
Entry
LNP22_13460       CDS       T10330                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
ffv  Flavobacterium flavipigmentatum
Pathway
ffv01501  beta-Lactam resistance
ffv01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
Transporters [BR:ffv02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   LNP22_13460
Antimicrobial resistance genes [BR:ffv01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    LNP22_13460
SSDB
Other DBs
NCBI-ProteinID: UFH37739
LinkDB
Position
complement(3132170..3135268)
AA seq 1032 aa
MSLSTTSIKRPVLTIVLNLLIILFGFIGYTFLGVREFPSIDPAQVSIRTNYTGANADIIE
SQITEPLEKAVNAIDGIRNITSSSNQGSSNITIEFNLDKDLEEAANDVRDKVSQAIRSLP
QDIDAPPVVSKADADSDAIISMTVQSDSRSSLELSDYAENVISQRLETIPGVSGVQIWGQ
KRYAMRLWIDPVKLAAYGCTVAEVRDALNAQNVELPSGKLTGNNTELTVKTIGNLSKPEE
FNNIIIRTDGDKIVRFSDVGGAELGPENIETKLSQSGLPMIGLAIVPMPGANYLDISSEF
YKKYEALKKDLPKDIKLNIALDNTIFVKKSVLEVAETLGISIILVIIIIYLFFRDWAIAF
RPLIDIPVSLIATFFIMWLFGFSINVLTLLAIVLATGLVVDDGIVVTENIFKKVEEGMSP
IEAAIKGSNEIFYAVISISVTLAAVFLPVIFLEGFVGRLFREFGVVIGAAVLISAFVSLT
LTPMLNAYLMKGGEQKKSKFYIKTEPFFERLNSGYAESLQKFMTKKWISFPILIACFGLI
YLFFTILPKETAPYDDRSSVTMRMTTPEGSSYEYTDRFMQEISKLVDDSVPEKKVSLVIT
APGFGASATNTGFIRLSLKESDERKASQKEIADKLTKWTKKYPDAKTSVIQQPTIAVNRR
GGLPIQYIIQAPNFEKLREKIPVFMDAVGKSDVFSISDVNLKFNKPEINVSIDREKAESL
GISIIDIAQTLQLSLSGQRFGYFIRNGKQYQVIGQFDQKDRSKPLDLTSMFVKNNKGQLI
QMDNVVNVEEQSNPPQLYHNNRYMSATVSAGLAPGKSISDGIQAMDQIKAKVLDESFTTD
LSGESRDFVESSSNTSFAFGLALLLIFLILAAQFESFIDPLIIILTVPMAVAGALFSLWL
FNQTWNIFSQIGTVMLIGLVTKNGILIVEFANQLREQGKPKLEAILEASEARLRPILMTS
LAIALGALPIAMSLGAASTSRIGMGVVIVGGTIFSLALTLFVIPAIYLMWSKARKHYPEF
DHIEEYEKESKS
NT seq 3099 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagtttatccaccacaagtataaaaagacctgttttaaccatcgtactgaatcttctg
attattttattcggttttattggttatacgtttttgggtgttcgggaatttccctcgatt
gatcctgcgcaggtttccattagaaccaattacaccggagccaacgcagatattatcgaa
tctcaaattacagaacctcttgaaaaagctgtaaacgctattgacggaattagaaatata
acgtcgtcgagcaatcagggaagcagtaatataacgatagaatttaaccttgataaagac
ttagaagaagctgcaaatgatgtacgtgacaaagtttcgcaagcgattagaagcttaccg
caggatattgatgctcccccagttgtttctaaggctgatgccgatagtgacgcgattata
tcgatgacggttcagagtgatagtcgtagttcattagaattgagtgattatgcagagaat
gttatttcgcaacgattagagaccattcccggtgtgagtggagttcagatttggggacaa
aaacgttacgccatgcgtttgtggatcgatcctgtaaaactggcagcctatggttgtacc
gttgcagaagttcgtgatgctttgaatgctcaaaacgtagaattaccatctggaaaactt
acgggtaataataccgaacttactgtaaaaacaatcggaaacttatccaaaccagaagaa
tttaataatatcattatccgtaccgatggtgataaaattgtgcgttttagcgatgttggt
ggtgccgaattaggtccggaaaatatcgaaacaaaattgagtcagtccggtcttcctatg
attggtttggcaattgttccgatgccgggtgccaattatcttgatatttcatcagaattt
tataaaaaatatgaagccttaaagaaagatttacctaaagatattaagttaaatattgct
cttgataatactattttcgtaaaaaaatcagtgcttgaagtagccgaaacactgggaatt
tctattattttggtaatcatcattatttacttgttttttagagactgggcaattgctttc
agacctttaatcgatattccagtatctttaattgctaccttttttattatgtggcttttt
gggttttcgataaacgtactgactttattggcaattgtacttgctacgggactggtcgta
gatgacggaatcgtagtaaccgagaatattttcaaaaaagtagaagaaggaatgtcgccg
atcgaggctgctatcaaaggatcaaacgaaatattttatgccgtaatttcgatttcggta
acattggccgccgtatttttgcccgtgattttcttagaaggttttgtgggccgactcttt
cgggaatttggagttgtgattggtgccgccgtattaatttcggcttttgtgtcccttact
ctaacaccgatgctgaacgcatatttgatgaaaggcggcgaacagaaaaaatctaaattt
tacattaaaacagagccctttttcgaaagattaaatagtggttacgccgaatcgttgcaa
aaattcatgactaaaaaatggattagctttcctattctaattgcgtgtttcggattgatt
tatttattttttacgatacttccaaaagaaactgcaccctacgatgaccgtagctcggta
acgatgcgtatgacaaccccagaaggttcttcttacgaatatacagatcgctttatgcag
gaaatttcaaaattggttgatgattctgttcctgagaaaaaagtaagtttggtgatcact
gccccaggttttggagcttcggctactaatactggttttatcaggctgtcactaaaagaa
tctgacgaaagaaaagcatctcaaaaagaaattgcggataaattaaccaaatggacaaaa
aaatatccggatgctaaaacatcagttattcagcaaccaaccatcgctgttaacagacgt
ggaggtttgcctattcaatatatcattcaggctcctaattttgaaaaattaagagaaaaa
atacctgtttttatggatgcggtgggtaaaagtgatgttttttcgatttcggatgtcaat
ttgaaatttaataaacccgaaattaatgtgagtatcgaccgagaaaaagccgaaagttta
ggcatctcgattatcgatattgcacaaactttacaactttcgttaagtggccagcgtttt
ggttattttatcagaaacggaaaacaatatcaggttattggtcagtttgatcaaaaagat
cgttcgaaaccacttgatttaacgtcgatgtttgtcaaaaataataaagggcaattgatt
cagatggataatgtggtcaatgtagaagagcaaagtaatcctccgcaattgtatcacaac
aaccgatacatgtctgctacagtttctgctggtttggcgccaggaaaaagcatcagcgat
ggtattcaggcaatggatcagataaaagcaaaagtgctggatgagagttttacaaccgat
ttaagtggagaatctcgtgattttgttgaaagtagttccaatacttcttttgcatttgga
ttagcgcttttattgatcttcctgattttggcagctcagtttgaaagttttatagacccg
ttgattatcatcctaacagtaccaatggcggtagccggagcgttattttcactttggtta
ttcaatcagacttggaatatctttagtcaaatcggaaccgtaatgttgattggtttggta
accaaaaatggtattttgattgttgaatttgccaatcagttgcgagaacagggaaaacca
aaactggaagcgattttagaagcttcagaggcacgtttacgtccaattttgatgaccagt
ttggctattgctttaggagcattacctattgcaatgtcgcttggagcggcttctacgagt
agaatcgggatgggagttgtaatcgttggaggaactattttctctctggcactaacactt
tttgttattccagctatttatttgatgtggtcaaaagccagaaaacattacccggaattt
gatcatatcgaagaatacgagaaagaaagcaaatcgtag

DBGET integrated database retrieval system