KEGG   Flavobacterium pectinovorum: Q1W71_18530
Entry
Q1W71_18530       CDS       T09245                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
fpec  Flavobacterium pectinovorum
Pathway
fpec01501  beta-Lactam resistance
fpec01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:fpec00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    Q1W71_18530
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    Q1W71_18530
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:fpec02000]
    Q1W71_18530
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:fpec01504]
    Q1W71_18530
Transporters [BR:fpec02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   Q1W71_18530
Antimicrobial resistance genes [BR:fpec01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    Q1W71_18530
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL SecD_SecF_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: WKL46948
LinkDB
Position
4449433..4452609
AA seq 1058 aa
MKLAEISIKRPSLVIVLFTILTLGGLFSYSQLGYELIPKFEQNVITISTIYPGASPSEVE
NTVTKKIEDAIASLENVKKIDSKSYESLSIVSITLTSNAKVDFSLNDAQRKINAIISDLP
DDAETPSLTKFSLSDLPIMTLGANGKMDEAEFYDLIDKKIAPILSRVQGVAQVNIIGGSE
REIQVNLDAVKMQGYGLSVPQVQQNILTSNLDFPTGNIQTRNQKILIRLAGKYKSVQELR
NLVVSSQNGIQVRLGDIADVQDTQKVAEKISRVDQKSAIVLQIVKQSDANAVAVSEQLLK
TIAILENDYKANQLKLEVAKDSTIFTLEAADSVVHDLLIAVVLVAFVMLFFLHSIRNSLI
VMVSIPASLIATFIGIYLMGYTLNLMSLLGLSLVVGILVDDAIVVLENIYRHMEMGKGRI
RASYDGTAEIGGTVTSITLVIVVVFLPIAMSSGLVSNIITQFCVTVIISTLLSLLASFTI
IPWLSSRYGKLEHIEGKNLFGRIILGFESYLTRFTNWVSDLLTWCLDHYVKTILVVLVLF
FGSTIGLMGGGFIGGEFFASSDSGEFLVQIEMPKDASLEQTNFMTQKAEAYLKSQEYVHS
QITTVGQTSEGFGASQATAYKAEIDVKMIEQKDRTDDANVYAAKIKRKLEKVLVGAKVKT
VPVGILGTAEDATLGLIVTGPSTESAMAFAKLAEAELRTIPGTTEIKLTVEDGNPEVNVK
VDRDKMAALGLTLQTVGLTMQTAFSGNTDGKYRAGEYEYDINIRYNAFDRKSITDVSNLI
FINSAGQQIKLSQFADITEGSGPSQLERRDKSASVTVKGQNVGVPSGTIVTQWQAKLDKL
KKPTGVNYIWGGDQENQSEGFGTLGIALLAAIILVYLVMVSLYDSFAHPFVVLFAIPLSF
IGAMLALALTNNSLNIFTILGIIMLIGLVCKNAIMLVDYTNQRRAAGESIRTALIQANHA
RLRPILMTTIAMVFGMFPIALASGAGAEWKNGLAWVIIGGLISSLFLTLIVVPVIYNIME
KIIARVSKGEKVDYEAEMVADYVHTELSEDGFNPKHTH
NT seq 3177 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaattagccgaaatatccataaaacgtccgtcgttggtaattgtattgtttacaatt
ctaacacttggtggattgttcagttacagccaattaggttatgagctgatcccaaaattt
gaacaaaacgttattacaatttctacaatttatccgggagcttctccaagtgaggtagaa
aacacagtaaccaagaaaattgaagatgcgatcgcatcattagagaatgtcaaaaaaatc
gactcaaagtcatacgaaagtttatctattgtatcgattacattaacatcaaatgccaag
gtcgatttttctttgaatgatgcacagcgtaaaatcaatgctattattagtgatttaccg
gatgatgcagaaacaccttcgctgacgaaattctcgctgagtgatttaccaattatgaca
cttggtgctaatggaaaaatggacgaagcagaattttatgacttaattgacaaaaaaatt
gctcctattttatctcgtgtacaaggtgttgcccaggtaaatattattggtggttcagag
cgtgaaattcaagtaaatcttgatgctgttaaaatgcagggttacggattatctgttcca
caggttcagcaaaatattttgacttcgaatttagatttcccaacaggaaatatccaaaca
cgtaatcaaaaaatattaattcgtttagcgggtaaatataaaagtgttcaggagttaaga
aacctggttgtttcttctcaaaatggaattcaggttcgtttaggtgatattgccgatgtt
caggatactcaaaaagtagcagaaaaaatatcacgtgtagatcaaaaaagtgctattgtt
ttacaaatcgtaaaacaatctgatgcaaatgcagtagcagtaagtgagcaattattaaaa
acaattgctattcttgaaaatgattataaagcaaatcaattaaaattagaagtagcaaaa
gatagtacaatttttactcttgaagctgcagattctgtagttcacgatttattaattgca
gtagttctggtagcttttgtaatgttgttctttttgcacagtattagaaactcattgatt
gtaatggtttcgattccggcatcgttgatcgctacttttattggtatttatttaatggga
tatacattaaacttaatgagtttattaggattatctcttgttgtaggtattctggtcgat
gacgcgattgtggtcctcgagaatatttatcgacacatggaaatgggtaaaggcagaatt
cgtgcatcttacgacggaactgcagaaattggtggaactgtaacttcgattacattagta
attgtcgtggtattcttgccaatcgcaatgagttctggtttagtatctaatattattaca
caattttgtgttaccgtaattatttcaactttactgtcacttttagcttcatttacaatt
atcccttggttatcatctcgttatggtaaattagagcatattgaaggaaagaatttattt
ggaagaattattcttggtttcgaaagttatttaactcgttttacaaactgggtttctgat
ttattgacttggtgtttagatcattatgttaaaaccattttagttgttcttgtattgttc
ttcggatcaacaattggattaatgggtggaggtttcattggaggagaattctttgcatct
tctgatagtggtgagtttttagttcaaatcgaaatgccgaaagatgcttcgttagaacaa
accaacttcatgacgcaaaaagcagaagcttatttgaaatctcaggaatatgttcacagt
cagattacaactgtaggacaaaccagtgaaggttttggtgcatcgcaagctactgcttac
aaagcagagatcgacgtaaaaatgatcgagcaaaaagatcgtactgatgatgctaacgtt
tacgcagcaaaaatcaaacgtaagcttgaaaaagtattagttggggcaaaagtaaaaacg
gttcctgtaggtatcttaggaactgctgaggatgctactttaggattgatcgtaacaggt
ccttctacagaaagtgctatggcatttgctaaattagctgaagctgaattacgtacaatt
cctggaacaacagagattaaattaactgttgaagacggaaatccagaggtaaatgttaaa
gttgatcgtgataaaatggcagctttaggattaacacttcaaactgttggtttaacgatg
caaactgcttttagtggaaatacagacggtaaatacagagctggagaatatgaatatgat
atcaacattagatataatgcatttgatagaaaaagtattactgacgttagtaatttgatt
ttcatcaattctgcaggacaacaaattaagttatctcaatttgctgatattacagaagga
tcaggacctagccagttagagcgtagagacaaatctgcttcggtaacagtaaaaggacaa
aacgttggggttccttcaggaacaattgtaacgcaatggcaggcaaaattagataagctt
aaaaaaccaactggtgtaaactatatctggggtggtgaccaagagaaccaatcggaaggt
tttggtactttaggaatcgctttattggccgctattatcttggtttaccttgtaatggtg
agtttgtatgacagttttgctcacccgtttgtagtattgtttgcaattccgctttcgttt
attggtgcgatgttggcattggctttgaccaataactcattaaatatctttacgattttg
ggtatcatcatgttgattggtctggtgtgtaagaacgcgattatgcttgtcgattatacc
aaccaaagaagagcagcaggtgaatcaatcagaacggcgttaattcaggcgaatcacgct
cgtttacgtccgatcttgatgacaacaattgcgatggtatttggtatgttcccaattgca
ttggcatctggagcaggagctgagtggaaaaacggattggcctgggtaattatcggagga
ttaatttcttctttattcctaaccttgattgtagttccggttatttataacatcatggag
aaaatcattgccagagttagcaaaggagaaaaagtagattacgaagctgaaatggttgct
gattatgtgcacactgaattaagcgaagacggttttaatcctaagcacacgcattaa

DBGET integrated database retrieval system