Gilliamella apicola: GAPWK_1910
Help
Entry
GAPWK_1910 CDS
T03066
Name
(GenBank) RND efflux system, inner membrane transporter CmeB
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
gap
Gilliamella apicola
Pathway
gap01501
beta-Lactam resistance
gap01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gap00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
GAPWK_1910
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
GAPWK_1910
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
gap02000
]
GAPWK_1910
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
gap01504
]
GAPWK_1910
Transporters [BR:
gap02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
GAPWK_1910
Antimicrobial resistance genes [BR:
gap01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
GAPWK_1910
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN26483
UniProt:
X2H5T0
LinkDB
All DBs
Position
complement(2111814..2115026)
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MAKFFIDRPVFAWVIAIMMMLGGALCIKLLAVEQYPDIAPPSVTVSAVYPGADAQTIENT
VTQLIEQNLTGLDNLIYMKSTSSAQGVVQTTLTFAPGTSPDFAQVQVLNKVESIKSRLPE
SVQKNGVSVAKNNTNFLKVIGFYSTNPQKTQADIADFIYSTVQDPIRRVQGVGDTQLFGS
EYAMRVWLDPNKLNYFNLSIEEIIAAIQAQNAQVTAGQLGALPVTEGQELNATITAQSRL
KTPEQFQNILVRVNTDGSNVLLKDVANVEIGAADYNFLSRYDGKPSAGLGIYLATGANQL
DTSAQVDQKIQELSQIFPEDIKFAYPYDTTPFVKLSINNVIHTLIEAIILVVIVMYVFLQ
NLRSTLIPTITVPVVLLGTFAVLYICGFTINTLSMFAMVLAIGLLVDDAIVVIENVERIM
HDEGLSPYDATVKSMEQITSALVGIAVVLSAVFVPMAFYGGAAGGIYRQFSITIVTSMSL
SVLMAIVLTPALCAQILKAPSKSKVKKTTLGEKLVTIAPFCWCSAGTKWFFDKFNNLYNK
SLHLYEKGVIKFIRYPVISFICYVLIVVGLVFGFNRLPTGFLPNEDQGVLIVMVELPPGS
TLDQTMGVLNKTSNFYMTQKADSVKEIFTVAGFSMVGRGQNMGLGFIRLKDWDERKRPDQ
KVDALVGSGWGFASTITEGRVIITNVPAVPSLGMANGFSYMLKDSAGLGHNALMGAFFQL
LGQAAREPQLQQVRPGSMLDVPQYKINVDFETAQALGVAVSSVNTVLSTALGSAYIDDFV
YNNRVKKVYLQSDAAYRMLPDDFSFWHVKNQKGEMVPYDAFATTTKSYGSPSLVRYDGVA
AMGISGSAAPGMSSGQAMAIMEELSKQLPKGFSFDWTDISYQERQTGSQTTTLYIISLIV
VFLSLAALYESWTVPISILFVIPLGIIGTVYATMFRGLDNDIYFIVGLLTTMGLSAKNAI
LIVEFAKDALEKEGKSLIDATLEACRLRLRPILMTSFAFILGVLPLALNSGAGSASQNAV
GTGVIGGMITATFLAIFYVPLFFLFVTKLFTKHKNKVVLPSNYNGKIENN
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaagttttttattgatagacctgtttttgcatgggtaatcgctatcatgatgatg
ctaggtggtgctttatgtattaagctactagctgttgaacagtatcctgatatagctcct
ccttctgttactgtttctgctgtttatccaggggctgatgcgcaaactattgaaaacact
gttacacaattaattgaacaaaacttaactggtttagataatcttatttatatgaaatca
accagtagtgctcaaggtgtagttcaaactactttaacttttgcgcctggaacaagtcct
gattttgcacaggtacaggttttaaataaagtagaaagtattaaatcacgtttaccagaa
agcgttcaaaaaaatggagtttcggttgctaaaaataatactaactttttaaaagttatt
ggtttctattctaccaatcctcaaaaaacgcaagcagatattgctgactttatctattct
acagtgcaagatcctattcgccgtgtgcaaggggtaggggatactcagttatttggttct
gaatatgcaatgcgtgtttggttagatccaaacaaattgaattattttaacttatctatt
gaagaaataattgctgctatccaagcgcaaaatgcacaggttacagccgggcaacttggt
gctttaccagtaacggaagggcaagaactcaatgcgacaattactgctcaatcacgttta
aaaacacctgagcaattccaaaatattttagtacgtgttaatactgatggctcaaatgtt
ttattaaaagatgtggcgaacgttgagattggtgcagctgactacaacttcctttctcgt
tatgacggtaaaccttccgctggtttaggtatttatttggcaactggtgctaaccaatta
gatacatcagcacaagttgatcaaaagattcaggaattatctcaaatttttcctgaagac
attaaatttgcgtatccttatgatacaaccccttttgttaaattatccattaataacgta
attcatacattgatcgaagcaatcatattggttgttattgtaatgtatgtattcttacaa
aatcttcgttctacacttataccaactattacagtaccagtcgtattacttggtactttt
gcagttttatatatctgcggatttactatcaatacgttatctatgtttgctatggttctt
gccatcggtcttctggtcgatgatgccatcgttgttattgaaaacgttgagcgtattatg
catgatgaaggtctatccccttatgatgcaaccgttaaatcaatggaacaaattacttct
gcattagttgggatagcggtggtattatcagctgtatttgtaccaatggcattttatggt
ggtgctgcagggggaatttatcgtcaattctcaattacaattgtaacttcaatgtcctta
tcagtgttgatggcaattgtattaactcctgcactttgtgcacaaattttaaaagcgcca
tcaaaaagtaaagttaagaaaacaactttgggtgaaaaactagtaaccatagctccattt
tgttggtgctctgctggaactaaatggttttttgataaatttaataatttgtataacaaa
agtttgcatctctatgaaaaaggtgtaattaagtttattcgttacccagttatttcattt
atttgctatgtcttgattgttgtgggcttagtatttggatttaatcgtttaccaacaggc
tttttaccaaatgaagatcagggtgtattgattgttatggttgaattaccgccaggatcg
acattagatcaaacgatgggcgtgcttaataaaacttctaacttctatatgacgcaaaaa
gccgattcagtgaaagaaatattcaccgttgcaggttttagtatggttggtcgaggacag
aacatggggcttggctttatccgactaaaagattgggatgagcgtaaacgccctgatcaa
aaagtggatgccttagttggtagtggttggggatttgcttcaacgattacagaaggtcgt
gtaattatcaccaatgtcccagctgtgccatcacttggtatggcaaatggtttttcttat
atgttaaaagattcggctggtcttgggcataatgctttaatgggggcttttttccaacta
ttgggccaagctgcgcgcgaacctcaattacagcaagttcgtccgggaagtatgttagat
gttccacaatataaaattaatgtggattttgagactgctcaagctcttggtgtagctgtt
agtagcgttaataccgttctttcaactgcattaggttctgcttatattgatgattttgtc
tataataaccgtgttaaaaaagtttatttacaatctgatgcggcttatcgaatgctacct
gatgatttcagtttttggcatgtaaaaaaccaaaaaggtgaaatggtaccttatgatgct
tttgcaactacaacaaaaagttatggttctccatcgcttgttcgttatgatggtgtagct
gcaatggggatcagtggttcagcagcgccaggcatgagttctggtcaagctatggcaata
atggaagaattatctaaacagttacctaaaggtttctcgtttgattggacagatatttca
tatcaagaacgtcaaacaggttctcaaactacaacactttatattatttcacttattgtt
gtattcttgtcattagcagctttatatgaaagttggacagtaccaatttcaatactattc
gttattccattaggtattattggtaccgtatatgccactatgtttagaggtcttgataat
gatatttactttattgttggtctattaactacgatgggattatctgccaagaatgctatt
ttgattgtagaatttgcaaaagatgcactcgaaaaagaaggtaaatcattaattgatgca
acattagaagcttgtcgtttacgtttacgtccaattttaatgacatcatttgcatttatt
ttaggtgttttaccattagcattaaatagtggtgctggatctgctagccaaaatgcggta
ggtacaggagttatcggtggtatgataacggcaacatttttagcaatattctatgttcca
ttattcttcttgtttgtaactaaactgtttactaaacataagaataaagttgttttacca
tctaactataatggtaaaatcgagaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
