Gilliamella apis: RAM11_04840
Help
Entry
RAM11_04840 CDS
T09380
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
gaq
Gilliamella apis
Pathway
gaq01501
beta-Lactam resistance
gaq01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gaq00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
RAM11_04840
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
RAM11_04840
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
gaq02000
]
RAM11_04840
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
gaq01504
]
RAM11_04840
Transporters [BR:
gaq02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
RAM11_04840
Antimicrobial resistance genes [BR:
gaq01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
RAM11_04840
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
DUF6353
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WLT07454
LinkDB
All DBs
Position
1033146..1036355
Genome browser
AA seq
1069 aa
AA seq
DB search
MAKFFIDRPVFAWVIAIMMMLGGALCIKLLAVEQYPDIAPPAVTVSAVYPGADAQTIENT
VTQLIEQNLTGLDNLIYMKSTSSAQGVVQTTLTFAPGTSPDFAQVQVLNKVESIKSRLPE
SVQKNGVSVAKNNTNFLKVIGFYSTNPQKTQADIADFIYSTVQDQIRRVQGVGDTQLFGS
EYAMRIWLDPNKLNYFNLSIEEIIAAIQAQNAQVTAGQLGALPATEGQELNATITAQSRL
KTPEQFQNILVRVNTDGSNILLKDVANVEIGAADYNFLSRYDGKPSAGLGIYLATGANQL
DTSAKVDQKIQELSQIFPEDIKFAYPYDTTPFVKLSINNVVHTLIEAIILVVIVMYVFLQ
NLRSTLIPTITVPVVLLGTFAVLYIFGFTINTLSMFAMVLAIGLLVDDAIVVIENVERIM
HDEGLSPYDATVKSMEQITSALVGIAVVLSAVFVPMAFYGGAAGGIYRQFSITIVTSMAL
SVLMAIVLTPALCAQILKAPSKNKVKITTLGEKLQTVPPFTWFSIGTKWFFNKFNNLYNK
SLHAYEKGVIKFIRYPLISFVCYVLIVVGLVFGFNRLPTGFLPNEDQGVLIVMVELPPGA
TLEQTMGVLNKTSQFYMNEKADSVREIFTVAGFSMVGRGQNMGLGFIRLKDWDERKRPDQ
KVDALVGSGWGFASTITEGRVIITNVPAVPSLGMANGFSYMLKDTAGLGHEALMGAFFQL
LGQAAQNPNLQQVRPGSMLDVPQYKINVDFETAQALGVAVSSVNTVLSTALGSAYIDDFV
YNNRVKKVYLQSDSAYRMLPDDFSFWHVKNQKGEMVPYDAFATTTKSYGSPSLVRYDGVA
AMGVSGAAAPGMSSGQAMAIMEELSKNLPKGFSYDWTDISYQERQTGSQTTTLYIISLIV
VFLSLAALYESWTVPISILFVIPLGIIGTVYATMFRGLDNDIYFIVGLLTTMGLSAKNAI
LIVEFAKDALEKEGKSLIDATLEACRLRLRPILMTSFAFILGVYPLATSSGAGSVSQNAV
GTGVIGGMLTATFLAIFYVPLFFLFITKLFTKHKNKVVLPANYTGKTEK
NT seq
3210 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaagttttttattgatagacctgtttttgcatgggtaattgctatcatgatgatg
ctgggcggtgctttatgtattaagctactcgctgttgaacagtatcctgatatcgcacca
ccagctgttacggtttctgctgtttatccaggggctgatgctcaaactattgaaaataca
gttacccaattgattgagcaaaacttgactggtttggataatttgatttatatgaaatca
accagtagtgctcaaggggttgtacaaaccactctgacttttgctcccggcactagccct
gattttgcgcaagtacaggtcttaaataaagtagaaagtattaaatctcgtttgccagaa
agcgtgcaaaaaaatggggtatcggttgctaaaaataataccaacttcttaaaagttatt
ggtttctattctaccaatcctcaaaaaacacaagcagatatcgctgactttatttattca
acagtacaagatcagatacgtcgtgtacaaggtgtcggtgatactcagttatttggttct
gaatatgcaatgcgtatttggttagatccgaacaaactaaattattttaatctatctatt
gaagaaattattgctgctattcaagcgcaaaatgcgcaggttactgcagggcaactaggt
gctttaccagcaactgaaggtcaagagcttaatgcaactattacagctcaatcacggtta
aaaacacctgagcaatttcaaaatattttagttcgcgttaacacagatggctcaaacatc
ttattaaaagatgttgctaatgttgaaattggtgccgctgattataactttctttcacgt
tatgacggtaaaccatcagctggtttaggtatttatttggcgacaggtgcaaaccaactc
gatacatcagcaaaagttgaccaaaaaattcaagaattatcacagatttttcctgaagat
atcaaatttgcctatccttatgatacaactccgtttgttaaattatcgattaataacgta
gtgcatacattaattgaagcaatcatattggttgttatcgttatgtatgtctttttacaa
aatctgcgttcgacacttattccaactattaccgtaccagtagtattgttaggtaccttt
gcagttttatatatatttggatttaccattaatacgttatctatgtttgctatggtgctg
gccatcggtcttctggtcgatgatgccatcgtagtaattgaaaacgttgaacgtattatg
catgacgaaggcctttcgccttatgatgcaacggttaaatcgatggaacaaattacttcg
gcattagtggggattgctgtggtattatccgccgtattcgtaccaatggcattttatggt
ggtgctgcaggggggatctatcgtcaattttcaatcacaattgtaacgtcaatggcttta
tcagtattgatggcaattgtattaacgccagcactttgtgcgcaaattttaaaagctcca
tcgaaaaataaagttaagataacaacgttaggcgaaaaattacaaaccgtacctccattt
acttggttttcaatcggaactaaatggtttttcaataagttcaataatttatataacaaa
agcttacatgcttatgaaaaaggcgttattaagtttattcgttatccgctgatttcattt
gtttgttatgtcttgatcgttgtaggcttagtttttggctttaaccgtttaccaactggt
ttcttaccaaatgaagatcagggggtattgattgtaatggttgagttacctcctggtgcg
acattagaacaaaccatgggtgtattgaacaaaacctctcaattttatatgaatgaaaaa
gctgattcagtgagagagatcttcactgttgcaggttttagtatggttggtcgaggacaa
aacatgggacttggctttattcgcttaaaagattgggatgaacgtaaacgccctgatcaa
aaagtggatgcattagttggtagtggttggggatttgcttctactattactgaaggtcgt
gtcattattacgaatgtaccggctgtaccatcgcttggtatggcaaatggtttttcttac
atgttaaaagataccgctggacttggccatgaggcactaatgggggcatttttccaatta
ttgggtcaagctgcacagaatcctaatctacaacaagttcgtccaggtagtatgctagat
gttccacaatataagattaatgttgattttgaaactgctcaagcacttggtgttgcagta
agtagcgtaaatactgtactttcaacagcattgggttcagcttatattgatgactttgtt
tataacaatcgggttaaaaaagtctatttacaatcagattcggcttatcgaatgttacct
gatgatttcagcttttggcatgttaaaaatcaaaaaggtgaaatggttccttatgatgca
tttgccactacaactaagagttatggttcgccatctctagttcgttatgatggcgttgca
gccatgggtgtcagtggagctgctgcaccgggtatgagttcaggacaagctatggcaata
atggaagaactatctaaaaacttaccgaaaggtttctcgtatgattggacagatatttct
taccaagaacgtcaaactggttcacaaacgacaacactttatattatctcacttatcgta
gtgttcttatcgttagctgcattatatgaaagttggactgtacctatttctatcttattc
gttatcccattaggtattattggtactgtatatgcaactatgtttagaggccttgataac
gatatctactttatcgttggtctattaacaacgatggggctatcggctaagaatgctatt
ttgatcgtagaatttgctaaagatgcacttgaaaaagaaggtaagtcattaattgatgca
acattagaagcgtgtcgcttacgtttacgcccaattttaatgacttcatttgcctttatc
ctcggtgtttatccactggctacaagtagcggtgccggttctgtaagtcagaatgcggta
ggtactggggttattggaggtatgttaacggcgacgttcttagcgatattctatgttccg
ttattcttcttgtttataacgaaattattcactaaacataagaataaagtggtgttgcct
gctaactatactggtaaaactgagaaatag
DBGET
integrated database retrieval system