KEGG   Gloeomargaritales cyanobacterium VI4D9: LQF76_14175
Entry
LQF76_14175       CDS       T08937                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
gcy  Gloeomargaritales cyanobacterium VI4D9
Pathway
gcy01501  beta-Lactam resistance
gcy01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:gcy00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    LQF76_14175
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    LQF76_14175
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:gcy02000]
    LQF76_14175
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:gcy01504]
    LQF76_14175
Transporters [BR:gcy02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   LQF76_14175
Antimicrobial resistance genes [BR:gcy01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    LQF76_14175
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL SecD_SecF_C Abhydrolase_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: WAS05140
LinkDB
Position
complement(2968158..2971349)
AA seq 1063 aa
MIFSIANFFIRRPVFSTVLSVFILIVGAACIPTLPVAQYPNVTPPQIVVTSRYVGANAEV
VESTVTNLLERELNGIDGLRFIKSTSANDGTSNIALTFDLDRNQDIVATDVQNRVSSVQP
RLPDLVNRTGIQVTKANSSFLLAIGLYAEPDASGKDRYDDIYLSNYADLYITDALKRIKG
VENVQIFGERQYAMRIWLDPLKLAARNLTPQDVVQAIREQNLQVGAGQIGQPPVPPGQEF
QYSVTAQGRLASTDEFAKLVIRTEPNGSLLRLKDVARVELGAENYSSILRFTSDDGVSHR
GVGLGIRQQLGSNALAVAKQVKAQMRELQKSFPPGLKYEIAFDTTLFVEAGTQEVITSLI
LAIVLVVLIIFLFLQNWRSALITSIAIPVALVGTFIFVKIFGFSINTLTLFGLTLATGLV
VDDAIVIVEDITKRIQEEGMAPLPAAMASMDALFGAVIATSIVLITVFVPVAFLPGTTGQ
LYRQFALTIAFAITISTFNAITLTPTLAALLIRPGQVPDHWFFRWTNQLLEQLRQQYQDG
LQWVVQRKNLILALFGAALVLTYGAYNLMPKAFLPDEDQGYFITVVQAPQGVSLAYTERV
LQKAETILKQQPEIRNIFAVGGFSFSGATPNVGLIFATMRPWSERPRPEQSVSGVIGGFF
PPPARGLFPQLLGIKEAAVIPFAPPAITGVGNFGGFEFHLQDRVGLGLSVLGETLDQFLE
AAKKFPNPDRPILTRLRADFSGNTPQIEVQVNRERANALGINVSDIFDTLQTLLGSTYVN
DFNQFQRTYRVYVQADGSFRTNPANLNQFYVRSQNNQMVSLGNLITVRQITAPSVISHFN
LFRSVEINGVARRGKSSGEAIQALEAVARQTLPRGFGYEWAGLSLEEIESAGQAIGIFAL
GVVFVFLTLAAQYENYIDPLIIMLTVPLAVLGALMTVFLRGLTIDVYTQIGFVMLIGMAS
KNAILIVEFANQLVAEGLGITKAVLEACRERLRPILMTALSTLIGAFPLWIATGAGAAAR
RSLGTCIVGGMGIASLLSLFIVPVLYIVIKNLEARYLKRVPPV
NT seq 3192 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatcttttctattgctaattttttcatccgccgacccgttttttctacggttttgtcg
gtttttattctcattgtgggtgccgcctgtattcccaccttacccgttgcccaatacccg
aatgtcacccccccccaaattgtcgtcacttcccgctatgtgggtgcgaatgcggaagtg
gtcgaatccaccgttactaaccttttggaacgggaattaaacggcattgacggcttacga
tttatcaaatccaccagtgccaatgatggaaccagtaatatcgcccttacttttgatctg
gatcggaatcaggacattgtggcaacggatgtacaaaaccgggtgtcaagtgtgcaaccc
cgtttgccagatttggtgaatcgcaccggcattcaagtcaccaaagccaacagtagtttt
ctattagcgattgggctatatgcggagccagatgcgagtggcaaagaccgctacgatgat
atttatttaagtaactacgccgacctctatattaccgatgccctgaaacggattaagggc
gtagaaaatgtgcagatttttggggaacgccagtatgccatgcggatttggcttgaccca
ttgaaattggcggctcggaatctcaccccgcaagatgtggtgcaagccattcgggagcaa
aatttgcaggtgggggcggggcaaattggtcagccgccggtgccccccggacaggaattt
caatactcggtaacggcgcagggacggttagctagtacagacgaatttgccaagttggtg
attcgcaccgaaccgaatggttccctgctccggctcaaggatgtggcacgggtggaattg
ggggcggaaaattacagttcgattctccgatttacgtccgatgatggggtgtcccaccgg
ggggtgggtttggggattcggcaacagttgggcagtaatgcgttagcagttgccaaacag
gtgaaagcacagatgcgggaattacaaaaaagttttccgcctggattgaaatatgaaatt
gcgtttgataccaccctatttgtggaagccggtactcaggaagtcattacttctttaatt
ttggctatcgttttggtggttttgattattttcctatttttgcagaattggcggtcggcg
ttaattacttccattgccattcccgttgctttggtggggacatttatctttgtgaaaatt
tttggtttttcgattaataccctcaccctgtttggtttaaccctggcaacgggtttggtg
gtggatgatgcaattgtgattgtggaagatattaccaaaagaatccaggaagagggcatg
gctcccctaccggcggcaatggcttcgatggatgccctttttggggcggtgattgccacg
tcaattgtgttaattacggtgtttgtgccggtggcttttttaccaggaaccacagggcaa
ctctaccgccaatttgccctcaccattgcctttgcgattaccatttccacgtttaatgcc
attaccttaaccccgactttagccgctcttttaattcgtccggggcaggtgccagatcac
tggttttttcgctggacaaatcaacttttggagcaattgcgccagcagtatcaggatggt
ttgcaatgggtggtgcaacgaaagaacttgatcttagccttgtttggtgcggctttggta
ttaacttacggggcatacaatttgatgccaaaagcctttttacccgatgaagaccagggt
tattttattacagttgtacaagcccctcaaggggtatccttggcatacacagaacgggtt
ttgcaaaaggcggaaaccatcctcaaacaacagccggaaattcgcaatatttttgcggtg
gggggctttagttttagtggggcaacgccgaatgtggggttaatttttgcgaccatgcgt
ccctggtcagaacgtccccgtccagaacagtctgtatctggggtgattggtggctttttc
ccaccgcctgctcggggtttattcccgcaattgttagggatcaaagaagcggcggtgatt
ccttttgcacccccagcgattacaggtgtaggtaattttggtggttttgaatttcattta
caggatcgggtgggtctgggtttatcggtgttgggtgaaacgctcgatcaatttttggaa
gccgccaaaaaatttccgaatcccgaccgaccgatattgacccgactgcgggcggatttc
agtggtaacacgccccaaattgaggtgcaggtcaaccgggaacgagcgaatgccttgggg
atcaatgtatcggacattttcgacaccttacaaaccctgctcggttccacctatgtaaat
gactttaatcaattccaacgcacctatcgggtgtatgtgcaagcggacggttcattccgc
accaatccggcgaacttaaatcagttttatgtgcgttctcaaaacaatcaaatggtttct
ttagggaatctgatcacagtgcggcaaattacagcgccatcggtgattagtcattttaat
ttattccgttcagtagaaatcaatggggtagccaggcggggcaaatcttctggggaagcc
attcaagccctagaagcggtggcgaggcaaaccttaccccggggatttggttatgaatgg
gcgggtttatccctagaggaaattgaatcggcggggcaagccattggcatttttgcccta
ggggtcgtatttgtctttttgaccttggcggctcaatatgagaactacattgacccattg
attattatgctgaccgttcccctggcggtattgggggcattaatgactgtctttttgcgg
ggattgaccattgatgtttacacccaaatcggttttgtcatgttgattggtatggcgagt
aaaaatgccattttgattgtggaatttgccaatcaattggtggcggaaggtttggggatc
actaaggcggtattggaagcctgtcgggaacgtttgcgacccattttgatgacggcactt
tctacgctaattggggcatttcccctgtggattgcgacgggggccggggcggcggcacgg
cgttcccttggtacttgtattgttggggggatggggattgccagtttactgagtttattt
atcgttccggtgctgtacattgtcatcaaaaatctggaagcccgatacctcaagcgggtt
cccccagtttaa

DBGET integrated database retrieval system