Gallus gallus (chicken): 373992
Help
Entry
373992 CDS
T01006
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1 isoform X1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
gga
Gallus gallus (chicken)
Pathway
gga04350
TGF-beta signaling pathway
gga04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gga00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
373992 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
373992 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
gga00536
]
373992 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
gga00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
373992 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
373992
NCBI-ProteinID:
XP_015147420
CGNC:
48993
Ensembl:
ENSGALG00000004960
UniProt:
A0A8V0ZDK1
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(10622651..10768893)
Genome browser
AA seq
2869 aa
AA seq
DB search
MWRGRLLGIALGVAVLWASQAGAAAAAGHSEGASAKELRASRAKRRGQGGGGHDALKGPN
VCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPNGQIAPSCGSKSIQ
HCNIRCMNGGSCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVCENGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQC
ERDYRTGPCFTLVTNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIP
NIRTGACQDVDECQAIPGICQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEVTQKCDDIDECSTIPG
ICDGGECSNTVSSYFCKCPPGFYTAPDGLKCIDVRPGYCFSTLTNGRCGNQLPQPLSKMQ
CCCDSGRCWSSTAASAPEMCPIRSTDEYRKLCSVAALLPARPDLPPGRPEVIPPPLLPGP
YPPLVPQQPEIVYPSRAPPPHVILPVNFTDYCQLFRHLCLNGHCIPTPGSYRCKCNKGFQ
LDVRGECIDVDECEKNPCISGDCVNTQGSYMCQCRIGYQSTPTRTECRDIDECLQNGRIC
NNGRCINTDGSFHCVCNAGFQVAADGKNCEDMDECNIRNMCLNGMCINEDGSFKCICKPG
FQLASDGRYCRDIDECETAGICMNGRCVNTDGSFRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHMRSTC
YGGYKRGQCVRPLTGAVTKSECCCASTDYAFGEPCQPCPAQNSAEYQALCSSGSGMTAGG
NDINECLLDPDLCPNGRCENLHGTYKCICNPGYEVDSTGKNCIDIDECVLNTLLCDNGQC
RNTPGSFTCTCPKGFVYTPDLKTCEDIDECESNPCVNGVCKNTPGSFACECSPESTLDTT
RTVCIETVKGTCWQNMVDGRCEININGATLKSECCSTLGAAWGSPCTQCERDRICQKGFS
RVRGTVCEDVNECEVFPGVCTNGQCVNTLGSFVCQCPSGMTLDASGRTCLDIRLESCYLQ
HEDEQCTAQIPGRHRMDACCCSVGAAWGFECEECPLKGSPEFEALCPRGAGFSTKIEITG
KPFSKDINECKMVPSLCTHGKCRNTIGSFKCRCDSGFALDSEERNCTDIDECRISPDLCG
QGICVNTPGDFECECFEGYESGFMMMKNCMDIDECQRNPLLCRGGTCINTEGSFRCDCPP
GHHISPNISACIDINECDLSTNLCRNGHCVNLIGKYQCACNPGYQSTADKLHCIDIDECS
IMNGGCENFCTNSEGSYECSCKQGFALMPDHRTCTDIDECEDNPNICDGGQCTNIPGEYR
CLCYDGFMASEDMKTCVDVNECDLHPNICLSGTCENTKGSFICHCDMGYSGKKGTTGCTD
INECEIGAHNCDRHAVCTNIPGSFKCSCSSGWIGNGIKCTDLDECSNGTHKCSPHADCKN
TMGSYRCLCKEGYTGDGFTCTDLDECSENLNLCENGQCLNAPGGYRCECDMGFLPSLDGK
ACEDIDECSLPNICVYGTCHNLPGLFRCECEVGYELDRSGGNCTDVNECADPTTCISGTC
VNTAGSYTCECPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIKTRGDNGGTFCSNEIGVGVSKASC
CCSLGRAWGVPCEQCPSVNTTEYKILCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGKC
INTFGSFQCQCPSGYYLNEETRVCDDVNECDTPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDYMQVN
GGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNIGRAWNKPCEQCPIPSTD
EFSTLCGSQRPGFFIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGICINMVGSFRCECPVGFFYNDK
LLICEDIDECQNGPVCQQNAECVNTAGSYRCDCKPGYRFTSTGRCTDRNECQEIPNICSH
GQCIDTVGSFYCICHNGFKTNDDRTMCIDINECERDACANGTCRNTIGSFNCRCNLGFIL
SHNNDCIDVDECASGNGMLCRNGQCVNTIGSFQCLCNDGYEVSLDGRTCADVNECAREPG
KCAPGTCQNLDGSFRCICPPGYVLQNEKCEDIDECVEQPEICALGTCSNTPGSFKCLCPE
GFVLSSTGRRCQDLRVSYCFTKFEDGKCSVPKSRNHSKQECCCALKGQGWGDPCELCPEE
ADEAFRQICPFGIGILVGPGDARLDVDECLDPDNCKFGQCINTDGSFRCECPYGYILQET
QCVDTDECAVGNPCGNGTCRNVVGGFECTCVDGFEPGPMMTCEDVNECIQNPLLCAFRCV
NTFGSYECKCPAGYVLREDRRMCRDQNECEEGIHDCDSKQMECKNLIGTYMCICGPGYQR
RPDGEGCIDENECQTKPGLCENGRCVNTVGSYRCECNEGFTVSDTQNECLDNREGYCFTE
VLQSMCQIGSSNRNSVTKSECCCDGGRGWGPNCEVCPFPGTVAFKKLCPHGRGYMSNGAD
IDECKVIHDVCRNGECINERGSYRCHCNLGYTTDITGTLCIDLNECNESPKPCNFICKNT
EGSFQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHHTAC
IDNNECATEINLCGAKGICQNTPGSFVCECQRGFSLDQTGLSCEDVDECDGNHRCQHGCQ
NIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCHNTLGSYKCMCPTGFQYEQF
SGGCQDINECGSAQAPCSYGCSNTEGGYVCGCPPGYFRIGQGHCVSGVGLGKGQGQELSL
SGEMDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRKRRSTNETANEAEDEQELEPPVSLASWDIEKAA
VFSINISDLSNKFRILKLLPALTTLTNHNRYLIDSGNEDGFFRINKKDGISYLHFTKKKP
VPGNYSLQISSIPLYKKKELNQLEEKHDKDYLSGELGDNLKMKIQILLH
NT seq
8610 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggcgggggcggctgctggggatcgccctgggagttgccgtgctgtgggcgtcccag
gcgggcgccgccgccgccgccgggcactccgagggggcgagcgccaaggagctgcgggcc
agccgggccaagaggagagggcagggcggcggcgggcacgacgcgctcaaaggaccaaat
gtgtgtggatcacgttacaatgcttactgttgccctggatggaaaactttacctggtgga
aaccagtgcatagtcccaatctgcagacattcctgtggggatggattttgctctagacca
aacatgtgcacatgcccaaatggtcagatagccccctcctgtggttcaaaatcaatacaa
cactgtaacatccggtgcatgaatggaggtagctgtagcgatgaccactgcctctgtcag
aagggatatacaggaacgcattgtggacagcctgtttgtgaaaatggatgtctaaatgga
ggaagatgtgttgccccaaaccgatgtgcatgcacatatggatttactggacctcagtgt
gaaagagattacaggactggcccttgcttcactttggtaacgaaccagatgtgccaggga
cagctcagtggaatagtctgcacaaaaaccctttgctgtgcaactgttgggagagcatgg
ggccacccctgtgaaatgtgtcctgcccagccgcatccctgtcgacgaggcttcattcca
aacattcgaactggggcctgtcaagatgtggatgaatgccaagctatccctgggatctgt
caagggggaaattgcattaatactgttggatcttttgagtgcaaatgcccagctggacac
aagtttaatgaagtgacacaaaaatgtgatgatattgatgaatgcagcaccattcctgga
atctgtgatggaggagagtgttcaaacacagtcagtagttacttctgcaagtgtcctcca
gggttttatacagctcctgatggcttaaaatgcatagatgtgcgtcctggatactgcttc
tctactctgaccaatgggcgctgtggcaatcagctcccccagcctttgtccaaaatgcag
tgttgctgtgacagcggccgatgctggtcttctactgcagccagcgcccctgagatgtgc
cctatcagatccactgatgagtatcgcaaattgtgctcagtagctgctctgctgccagca
agacctgaccttcctccaggccgtcctgaagtcatccctccaccccttcttcctggtcct
taccctcctctagtccctcaacagccagaaattgtctatccatctcgggctccaccacct
catgtgatcttgccggtgaacttcactgactattgccagctgttccggcatctctgcctt
aatggacattgtattcccactcctgggagctaccgctgcaagtgcaacaagggattccag
ctggacgttagaggggaatgtattgatgttgatgaatgtgagaagaatccatgtatcagt
ggagactgtgtgaacacccagggatcctacatgtgccagtgtcgaatagggtatcagagt
acaccaactagaacagagtgccgagacattgatgaatgtttacagaatggccgtatctgt
aataatggacgatgcataaatacagatggcagttttcactgtgtgtgcaacgctggcttt
caagtggcagctgatgggaaaaactgtgaagatatggacgaatgcaacataaggaatatg
tgcctgaacgggatgtgcatcaatgaagatggcagttttaaatgtatttgtaaaccgggg
ttccagctggcatctgatggacgctattgcagagacattgatgagtgtgagacagctgga
atatgcatgaacggacgctgcgtgaacactgatggctctttcagatgtgaatgcttccct
ggccttgcagtaggactcgatggacgtgtgtgtgttgatactcatatgcgaagcacgtgc
tatggtggctacaagagaggacaatgtgtgagaccattaaccggtgcagttacaaaatca
gagtgctgctgtgccagcactgactatgcctttggggagccttgtcagccctgtccagca
caaaattcagctgaatatcaggctctatgcagtagtggatctggtatgactgcaggagga
aatgacattaatgagtgcttactggatcctgacctctgtcccaatggaaggtgtgagaat
ctgcatggaacgtacaaatgtatttgtaaccctgggtatgaagtggattcaactggcaaa
aattgcattgatattgatgaatgtgtgctgaacacgctgctttgtgacaatgggcagtgc
agaaatactcctggaagtttcacttgtacctgtcccaaaggatttgtatacactcccgac
ctaaaaacatgtgaagatattgatgagtgtgaatctaatccctgcgttaatggggtatgc
aaaaacacaccaggctctttcgcttgtgaatgttctcctgaaagtactttggatacaaca
agaactgtctgcatagaaactgttaagggtacctgttggcagaacatggtagatggaaga
tgtgagataaatatcaatggagcaactctgaagtctgagtgctgttcaacactaggtgct
gcttggggtagcccatgtacgcagtgtgaacgagaccgaatatgccaaaagggattttca
agagtaagaggaacagtatgtgaagatgtaaatgaatgtgaggtgtttcctggagtctgt
accaatgggcagtgtgtcaataccctgggatcgtttgtttgccagtgccccagtggaatg
actttagatgcttctggacggacatgtcttgacattcgcttggagagttgctacctgcaa
catgaagatgagcaatgtactgcacaaataccaggccgacaccgaatggacgcttgctgc
tgttcagtgggggcagcatggggctttgagtgtgaggaatgccctctaaagggatcacct
gaatttgaagctctttgtccccgaggggctgggttttctacaaaaatagagataactggg
aaacctttctctaaagatatcaatgaatgtaaaatggtccccagtctctgtactcatgga
aaatgcagaaacaccattggcagttttaaatgcagatgtgacagtggatttgcccttgat
tctgaagagaggaactgtacagatattgatgaatgccgcatctctcctgatctttgtggc
caaggcatctgtgtcaatactcctggggacttcgaatgtgaatgttttgaaggctatgaa
agtggatttatgatgatgaagaactgcatggacattgatgagtgtcagcgcaatcccctt
ctctgccgaggtggcacctgcatcaacacagagggaagttttcggtgtgattgtcctcca
ggccatcacatttcaccaaatatttctgcatgtatagacattaatgaatgtgacctaagc
accaacctgtgtcgaaacggacattgtgtcaacctgattgggaagtaccaatgtgcttgc
aaccctggttatcagtccacagctgacaagttacactgcattgatattgatgaatgcagc
ataatgaatggtggctgtgagaacttctgtacaaactcagagggcagctatgaatgtagc
tgtaaacaaggatttgcactcatgccagaccacaggacatgcacagatattgacgagtgt
gaagacaatcctaatatctgtgatggaggccaatgcacaaacatcccaggagaatacagg
tgcctttgctatgatggattcatggcatctgaagacatgaagacttgtgtagatgttaat
gaatgtgatctacatccaaacatttgtctgagtggaacctgtgagaacacaaaaggctca
tttatctgccattgtgatatgggatattcaggcaagaaaggcacgactggttgcacagat
atcaatgagtgtgaaattggagcccataactgtgatagacatgccgtttgtacaaacata
ccaggaagtttcaaatgtagctgcagctctggctggattggaaacggtatcaaatgcaca
gatctggatgagtgctccaatggaacccacaagtgtagcccacatgctgactgcaagaat
acaatgggctcttaccgctgcctgtgtaaagaaggttatactggagatggcttcacttgt
acagacctggatgaatgctcagaaaacttgaatctctgtgaaaatgggcagtgcctcaat
gccccaggaggatatcgctgtgaatgtgatatgggatttttgccaagtctggatgggaaa
gcatgtgaagatattgatgagtgctcacttcctaacatctgtgtctatggaacttgtcat
aaccttcctggacttttccgttgcgagtgtgaagtgggctatgagttggacagaagtggt
ggtaattgcacagatgttaatgaatgtgcagatcccacaacctgcattagtggcacatgt
gtcaatactgctggtagttacacatgcgagtgccctcctgattttgagctgaatcccacc
cgcgttggctgtgttgatacacgatctggcaactgttacctggacattaaaactcgggga
gataatggtggcaccttttgcagcaatgagattggagtgggtgtctctaaggcttcctgt
tgctgctccctgggcagagcttggggagttccctgtgaacagtgcccatctgtgaacaca
acggagtataagattctttgccctggaggagaaggattccgaccaaaccctattacagtt
atattggaggatattgatgaatgtcaagaattgcctgggctctgccaaggaggaaaatgt
attaatacatttggtagcttccagtgtcaatgtccatcaggttactatttgaatgaggag
actcgagtatgtgatgatgtgaatgagtgtgatacacctggcatttgtggacctggcaca
tgttacaatactgttgggaactacacctgcatctgtcctcctgattacatgcaagtcaac
ggagggaacaactgtatggatatgagaagaagtctatgctacagaaattactatgctgac
aatcaaacctgtgatggcgaactactctttaatatgaccaagaaaatgtgctgctgttcg
tacaacattggacgtgcatggaataagccttgtgaacagtgtcccatccctagcactgat
gagttctccacactctgtggaagtcaaaggcctggcttcttcattgacatttacacagga
ttaccagttgatattgatgagtgcagagagattcctggagtgtgtgaaaatgggatctgt
ataaacatggttggcagcttccgatgcgagtgtccggtgggcttcttctacaacgacaag
ctactcatctgtgaagatattgatgaatgccaaaatggaccagtgtgtcagcaaaatgca
gaatgtgtcaacacagctggaagctaccgttgtgactgtaaacctggctataggttcaca
tcaactggccgctgcactgatcggaatgaatgtcaagaaattcccaatatctgcagccat
gggcagtgtattgacactgtcggaagtttttactgtatttgtcacaatggattcaagacc
aacgatgacagaacaatgtgtatagatattaatgaatgtgagagagatgcctgtgccaat
ggaacctgtagaaacaccattggctctttcaactgccgctgcaatttgggattcatcctc
tcgcacaacaatgactgcatagatgtggacgagtgtgccagtgggaatgggatgctctgc
aggaatggtcagtgtgtgaacacgattggatccttccagtgtctgtgcaatgacggttat
gaggtgtctctggatggaaggacttgtgctgacgtcaacgagtgtgcaagggagcctgga
aaatgtgcgccaggcacatgccagaacttggatgggtcgttcagatgcatttgtcctcct
ggatatgtcctgcaaaatgaaaaatgtgaagacattgatgagtgtgtggaacagccagaa
atttgtgccctgggcacatgcagcaacactccaggcagtttcaaatgcttgtgtccagaa
ggttttgtgttgtcttccacaggaaggcgatgccaagatctgagagtgagttactgcttt
accaaatttgaagatgggaaatgttccgtgccaaagtctcgaaaccactccaaacaagag
tgttgttgtgccctgaaaggacagggatggggagatccctgtgaactctgcccagaggaa
gcggatgaggcattcagacagatttgtccatttggaattggcatccttgttggacctggt
gatgcaagactggatgtggatgagtgccttgatccagataactgtaaatttggccagtgt
atcaacacagatggatctttccgctgtgaatgtccatatggttacatcctacaagaaact
caatgtgtggatacggatgaatgtgctgttggaaatccgtgtggaaatggaacttgcagg
aatgtagtgggaggttttgaatgtacctgtgttgatgggtttgagcctggaccaatgatg
acctgtgaagatgtcaacgagtgcattcagaaccccctgctatgtgctttccgctgtgtg
aacacttttggatcctatgagtgcaagtgccctgcagggtatgttctgcgagaggaccgg
agaatgtgcagagatcagaatgagtgtgaagaaggcattcatgattgtgactcaaaacaa
atggagtgcaaaaacctaataggcacctatatgtgcatctgtggaccaggttaccagcgc
agaccagatggagaaggctgtatagatgagaatgaatgtcagaccaagcctgggctctgt
gagaatggtcggtgtgtaaacacagtgggaagttacagatgtgaatgcaatgagggattc
acagtcagtgacactcagaacgaatgccttgacaacagggaaggctactgcttcactgaa
gtcttacaaagtatgtgtcaaattggatcaagcaacaggaactctgtcaccaagtctgaa
tgctgctgtgatggtggccgaggctgggggccgaactgcgaggtctgccccttcccaggc
actgtggcctttaagaagctttgtcctcatggtcgggggtacatgtccaatggagcagat
attgatgagtgcaaggttatccacgatgtctgccgtaatggggaatgcatcaatgaaagg
ggatcttaccgttgtcactgcaatcttggctatactacagatataactggcactctttgc
atagatctgaatgaatgtaatgagtcccccaaaccttgcaatttcatctgcaaaaacaca
gaagggagcttccagtgctcatgtccgaaagggtacatccttcaagaagatgggagaagc
tgcaaagatctcgatgaatgtgcaacaaagcagcacaactgtcagttcctttgtgtcaac
actattgggggttttacttgtaaatgtcctcctggattcactcagcaccatacagcctgc
attgataataatgaatgtgctacagaaattaatttatgcggggcaaaaggtatttgccag
aatactccgggaagttttgtgtgtgaatgtcagcgtggcttctcactcgaccagactggg
cttagttgtgaagatgttgatgaatgtgatggaaaccatcgatgtcagcatggctgccaa
aacataatcggaggatacaggtgtagctgcccacaaggatatctccagcattaccagtgg
aaccaatgcgttgatgaaaatgaatgtttaagtgcacacatttgtggaggagcatcttgc
cacaatactttgggaagctataaatgtatgtgccctaccggatttcagtatgaacagttt
agtggaggttgccaagatatcaatgaatgcggttccgcacaagccccatgcagttatggt
tgttcaaatactgaaggtggctatgtctgtggatgtccacctggttacttcagaatagga
caaggacactgtgtttctggagttgggctaggcaaaggtcaaggacaagagctttcactc
agcggagaaatggatgacaactccctgtctccagaagcttgctatgaatgtaaaatcaat
ggctatcccaagagaggaaggaagcgcagaagtactaatgaaactgcaaatgaagcagag
gatgagcaagagctggagcctccagtcagtcttgccagctgggatattgagaaagcagca
gtcttttctatcaacatctccgatctcagtaacaaatttcgcatcctgaaactgcttcct
gccctcacaacactgacaaaccataaccgatatttaattgactccggaaacgaagatggt
ttctttagaatcaataagaaggacggaataagttaccttcatttcacaaagaagaagcca
gtgcctggaaactattcattacaaatcagtagtattccactctataaaaagaaggaactt
aaccagcttgaagagaaacatgacaaagactacctcagtggtgagctgggagataacctg
aaaatgaaaattcagatattgcttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
