Haliovirga abyssi: HLVA_04990
Help
Entry
HLVA_04990 CDS
T09313
Name
(GenBank) acriflavin resistance protein
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
haby
Haliovirga abyssi
Pathway
haby01501
beta-Lactam resistance
haby01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
haby00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
HLVA_04990
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
HLVA_04990
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
haby02000
]
HLVA_04990
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
haby01504
]
HLVA_04990
Transporters [BR:
haby02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
HLVA_04990
Antimicrobial resistance genes [BR:
haby01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
HLVA_04990
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
BRX_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDU49930
UniProt:
A0AAU9D9G3
LinkDB
All DBs
Position
593420..596440
Genome browser
AA seq
1006 aa
AA seq
DB search
MKLVEFSIKRPVAMTMIIITMLVAGVIAMLNMSAELMPDFDMPIVSVKTTWVGASPEDMD
KLVTEKIEDALSGIDGVDKVTSYSGQNYSYVIVEFDYGVDTDKKVDLIQNEVSKIRGKLP
SDITDPYVTKMDVTGGTGVATVEMSGADLMELKGIADNTIKPRLQQIKGVGSVEVSGGLE
KRILIEIDPNRLANYNMDVSSVVNILKASNINIPGGMVYEGDKEMLIRVMGEIKTLEQVK
NIVISNKNNEILRLKDICNVNLTTKKRETYSRLNGKTVLSLNIKKTKDGNAVEIVKKLKE
ELKDMKNYISSDIDLKISYDSSKEIGDSINTVVNNGLTGLVLAAIILLLFLKNMRTSGIV
AMAIPTSIIFAVFLLKVKGVSLNRISLLGLALGVGMVVDNSIVVIDNIYRKITEEGEKVF
EAVRDGASEMAVPIIASTATSVAVFAPILFTNGMAKEIFQDLAYSIIFSLLASIIIALTF
VPMVASKILKSGEKKDFDGKLFTKVKFGYHKLLDSALKHKAITLFITGIVFFGAIFFGVK
NIEMEFMPKVDNAQYNVTAELPKGLDIEKANRIAYQMEKIVKNDKNTIQYATVVKKDEVN
INVDVIKKNKRRESIDEITKRMREKLKVIPDAKMKFSLGFGPSGGDIQLQLLGRNQKILV
DVSNEIKNKMRSIDGFTDVKSSFEGGNPEGKIVIDRTKAQYYGLRVAQINQIISYQILGT
EPFTIKTDDEEVDVSVQLMKKYKNSSEKLMEMRIKTPTGKTIQLKDIAELKVEEGPSEIV
KENKIKKITLSANSSTMALKTAEKQIKEVINNMELPKGVTYKFGGESEQFSKVMKDLTIA
LALAIFLIYFILATQFESFILPLIVMGTLPLSVIGIIIGLVITGTNFSMMVMIGIIMLAG
IVVNNAIVLIDYIHSLREKGVELVEAIKKGGETRLRPILMTTFTTIFGMIPLALGIGEGS
EFFKGMAISVIFGLGFATLLTLVVIPVMYSIVEGIKEKRKIRKEIK
NT seq
3021 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattagtagaattttcaataaaaagacctgttgctatgacaatgattataataaca
atgttagtagcaggagttatagcaatgttaaatatgtctgctgaattaatgccagatttt
gatatgccaattgtttcagtaaaaacaacttgggtaggagcttctcctgaagatatggat
aaattagtaacagaaaaaattgaagatgctctttctggaatagatggagtagataaagtt
acttcatattcaggtcaaaattattcatatgtaattgtagaatttgattatggagtagat
actgataaaaaagttgatttaattcaaaatgaagttagcaaaataagaggcaagttacca
agtgatataactgatccatatgtaacaaagatggatgtaactggtggaactggagtagca
acagttgaaatgagtggagcagatttgatggaattaaaaggaattgcggacaatacaata
aagcctagattacagcaaattaaaggagtcggaagtgtagaagtaagtggcggattggaa
aaacggatattaatagagattgatccaaatagattagcaaattacaatatggatgttagc
agtgttgtaaatatattaaaagcttcaaatataaatatccctggtggaatggtttatgaa
ggggataaagagatgttaattagagtaatgggagaaattaaaactttagaacaagtaaaa
aatatagtgattagcaacaaaaataatgagatattgagattaaaagatatatgtaatgta
aatttaactactaaaaaaagagaaacttatagtagattaaatggaaaaacagtattatct
ttaaatattaaaaagacaaaagatggaaatgcagttgaaattgttaaaaagttaaaagaa
gaattaaaagatatgaaaaattatatatcgtcggatatagatttaaaaataagttatgat
tcttcaaaagagataggagattctattaatactgtggtaaataatggattaactggatta
gttttggctgcgattatattattactattcttaaaaaatatgagaacaagtggaattgta
gcaatggctataccaacttcgataatctttgcagtttttttattaaaggtaaaaggggta
tcattaaatagaatatcactacttggattagctttgggcgttggaatggttgtggataat
tctatagttgttattgataatatatataggaaaataacagaagagggagaaaaagtattt
gaagctgtaagagatggagcttctgaaatggctgtgcctataattgcttctacagcaact
tcagtggcagtatttgctccaatattatttacaaatggaatggcaaaagagatatttcaa
gatttagcttattcaataatattttcattattagcttctataataatagcattaactttt
gtacctatggtagcttctaaaatattaaaaagtggagagaaaaaagattttgatggtaaa
ttatttacaaaagtgaaatttggatatcataagttactggatagtgcattaaaacataaa
gctataacattatttataacaggaatagttttctttggagctatatttttcggagttaaa
aatatagagatggagtttatgccaaaagttgataatgctcaatataatgttacagctgaa
ttaccaaaagggttagatatagaaaaagcaaatagaatagcttatcaaatggaaaaaata
gtaaaaaatgataaaaatacaatacaatatgcaacagtagtaaaaaaagatgaagttaat
ataaatgttgatgtaattaagaaaaataaaagaagagaatcaatagatgaaataactaaa
agaatgagagaaaagttaaaagtgattccagatgcaaaaatgaaatttagtttaggtttt
ggaccaagtggtggagatattcaattacaattattaggaagaaatcaaaaaatattagtt
gatgtttcaaatgaaataaaaaataagatgagatcaattgatggatttacagatgtaaaa
tcttcttttgaaggtggaaatccagaaggtaaaatagtaatagatagaacaaaagcacaa
tattatggattaagagttgctcaaattaaccagataataagttatcaaattttgggaaca
gaaccatttacaataaaaacagatgatgaagaggtagatgttagcgtacaattaatgaag
aagtataaaaattcaagtgaaaaattaatggagatgagaataaaaactccaactggaaaa
acaatacaattaaaagatatagcagagctaaaagtagaagaaggtccatctgaaatagta
aaagaaaataaaataaaaaaaattactctatctgcaaatagctctacaatggcattaaaa
acagctgaaaaacagataaaagaagtgataaataatatggaacttcctaaaggagttact
tataaatttggtggagaaagtgaacaattttcaaaagtgatgaaagacttaaccatagca
ttagcattagctatattcttaatatatttcattttggctacacaatttgaatcatttata
ttaccgcttatagtaatgggaactttgccactatctgtaattgggataataataggactt
gtaataactggaactaattttagtatgatggtaatgattggaataataatgttagcggga
atagttgtaaataatgcaatagtattaatagactatatacattcgttaagggaaaaaggg
gtagaattagtagaagctattaaaaaaggtggagaaactagactaagacctatactaatg
acaacatttacaacaatatttgggatgattccattagctttaggaataggagaaggttca
gaattttttaaaggaatggcaatttcagtaatatttggattagggtttgcaacgttattg
acattagtagtgattcctgtaatgtattcaatagttgaagggattaaggaaaaaaggaaa
ataagaaaagaaataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
