Halarcobacter bivalviorum: ABIV_0020
Help
Entry
ABIV_0020 CDS
T06437
Name
(GenBank) RND family efflux system, inner membrane transporter, AcrB family
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
hbv
Halarcobacter bivalviorum
Pathway
hbv01501
beta-Lactam resistance
hbv01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hbv00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
ABIV_0020
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
ABIV_0020
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hbv02000
]
ABIV_0020
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
hbv01504
]
ABIV_0020
Transporters [BR:
hbv02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
ABIV_0020
Antimicrobial resistance genes [BR:
hbv01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
ABIV_0020
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
DUF5693
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXH11062
UniProt:
A0AAX2A8R1
LinkDB
All DBs
Position
complement(15454..18561)
Genome browser
AA seq
1035 aa
AA seq
DB search
MISSFFIKKPVFAGVLSIVIFLTGLISMFNLPIEQYPRVLPPQIIVSTTYPGASADTIAK
TVAAPLEEKINGAKNMLYMNSVAEDSGRLNINVFFEVGTDPDSAKIDVNNRVQAALAKMP
EQVQRQGVVVGERSPSILMFIMLQSPNNSYDSVYLSNYALLNMVESLKRVNGVGDAIIFG
AKDYSIRIWMDPSKLSKYSLATTDVITAIKEQNNQYAAGKIAAEPIANKQMYTYTIQTPK
RFENPSQFGDIVIRANEDGSTLKLKDVASIELGAADYSVETRLNNAPSIPIGIFLQSGAN
ALETANAIKKSLEEAQKNFPEDMTYSIPYDSTDFISASIEEVVKTFIEALILVILIMYLF
LQNWRATVIPFIAVPISIVGAFAGMYVLGFSINLLTLFGLVLAIGIVVDDAIIVIENIER
HMEEGKSPREAAFIAMQEVTGALIAIILVLGAIFIPVAFMGGLSGEMYRQFAITIVISVM
ISGFVALTLTPTLCVKILKNRKHEPKGFFKWFNNMFDKATEGYSFLVKKTIRFSLISILL
YGGLIFVSYDMFKSMKTGLVPQEDQGTIFVFGFNPPGYSLSKSLELSEETNEIVSADPNV
ANIITLAGYDFTTSAQRTHTVATIIKLKDWSERPNEEQGAEALLGKFSKQLMGTSEGFSF
AVVPPPIMGMSITGGFDMYVQDRTGGSVEDLGKVVNQILEKAKTRPELIGVRTSLSATIP
QYKVDVDVEKAKAKGVNLNDIYNTITSTYGSFYVNDFSLYGRTYRVNLQADSEYRNNIED
FKEIFVRADSGELLPINSFISYKKVVGADIVERFNLFQAAKVSGQPAAGYSSGDALKAIE
EVANEVLPDGYTISWTGSAYQEKQVGGSSAMAFIFGIVFLFLILCALYERWLLPISVVLA
VPFAVFGAILATNLRSLDNNIYFQIGLLVLAGLAAKNAILIVEFALQKQKEGFNLIDAAL
EAAKVRLRPIIMTSLAFTVGVLPLAISNGAGAASKHSIGTGVIGGMLAATFIAIVFIPLF
YVLISKLSKKTSDES
NT seq
3108 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttcttcattttttataaaaaaacctgtatttgcaggtgttttatctattgtaata
tttttgacaggattaatctctatgttcaatttaccaattgaacaatacccaagagtttta
cctcctcaaattattgtaagtactacttatccaggagctagtgctgatactattgcaaaa
actgttgcggcacccttagaagagaaaatcaatggtgcaaaaaatatgctttatatgaac
tcagttgcagaagatagtggaagattaaatattaatgtattttttgaggttggaacagac
ccagattctgcaaagattgatgtaaataatagagttcaagcagctttagcaaaaatgcct
gaacaagttcaaagacaaggtgttgtagtaggagaaagaagtccaagtattctaatgttt
attatgcttcaatctccaaataatagttatgattcagtatatttatcaaactatgcactt
ttaaatatggttgaatcattaaaaagggtaaatggagtaggggatgctatcatttttgga
gcaaaagattattctattagaatttggatggacccatctaaattatctaaatactctctt
gctacaactgatgtaattacagcaataaaagagcaaaacaatcaatatgcagcaggtaaa
attgcagctgaaccaattgcaaataaacagatgtatacatatactattcaaactccaaaa
agatttgaaaatccaagtcaatttggagatatagttattagagcaaatgaagatggaagt
actttaaaactaaaagatgtggcttctattgaacttggggcagctgattatagtgttgaa
acaagattaaataatgcaccttctattcctattggtatcttcttacaaagtggagcaaat
gctttagagactgcaaatgctattaaaaaatctttagaagaggctcaaaaaaactttcct
gaagatatgacttatagtattccatatgatagtacagactttatttctgcttctattgaa
gaggttgtaaagacttttattgaagctttaattctagttattttaattatgtatctattc
ttacaaaactggagagcaacagtaattccatttattgctgttcctatctctattgtaggt
gcttttgcaggtatgtatgttttaggctttagtattaacttattaacactatttggtctt
gtacttgctattggtattgttgttgatgatgctattattgttattgaaaatattgaacga
catatggaagagggtaaatcgccaagagaagctgcttttattgctatgcaagaagtaaca
ggagctttaattgctattatcttagttcttggtgctatttttattcctgttgcctttatg
ggtggtttatcaggagaaatgtatagacaatttgcaattactattgttatttctgtaatg
atttctggttttgttgctttaactttaacaccaacattatgtgtaaagatattaaaaaac
agaaaacatgaaccaaaaggcttcttcaaatggtttaataacatgtttgataaagcaact
gaggggtattcatttttagttaaaaagactattagattttctctgatttctattttactt
tatgggggtctaatttttgtttcatatgatatgtttaaatctatgaaaacaggacttgtt
ccacaagaggaccaaggtacaatctttgtatttggatttaaccctcctggttactcttta
tcaaaatctttagagttatcagaagagacaaatgagattgtttcagcagatccaaatgtt
gcaaatattattactctagcaggttatgactttactacatctgctcaaagaacacataca
gttgcaactattatcaaactaaaagattggagtgagagaccaaatgaagagcagggtgct
gaagctttattaggaaaattctctaaacaacttatggggacaagtgaaggattctcattt
gccgttgttccacctccaattatgggaatgagtattactggtggatttgatatgtatgtt
caagatagaacaggtggaagtgttgaggatttaggaaaggttgttaatcaaatacttgaa
aaagcaaaaactagacctgaattaattggggttagaacctctttatcagcaacaattcct
caatataaagttgatgttgatgtagaaaaagcaaaagcaaaaggtgtaaatttaaatgat
atttacaacactattacttcaacatatggaagtttttatgtaaatgacttctcactttat
ggaagaacatatagagtaaatttacaagcagattcagaatatagaaataatattgaagat
tttaaagagatttttgtaagagcagatagtggagagttacttcctattaactcatttatc
tcttataaaaaagtagttggagctgatattgttgaaagatttaaccttttccaagcagca
aaagtttcaggacaaccagcagcaggatatagttcaggggatgcattaaaagcaattgaa
gaagtagcaaatgaagtattacctgatggatatactattagttggacaggttcagcttat
caagagaaacaagtaggtggaagctcagctatggcctttatatttggaattgttttctta
ttcttaattctttgtgcattatatgagagatggttacttcctatttcagttgtacttgca
gtaccatttgctgtatttggagctatcttagcaacaaatttaagaagtttagataataat
atctacttccaaattggtcttttagtacttgcaggtcttgcagctaaaaatgctatctta
attgtagaatttgctctacaaaaacagaaagaaggattcaatttaattgatgctgcttta
gaagctgcaaaagttagattgagaccaattattatgacttctttagccttcacagtaggt
gttttaccattagctattagtaatggagcaggggctgctagtaaacactctattggtaca
ggagttattggtggaatgcttgcagcaacatttattgcaattgtgtttattcccttattt
tatgtacttatttctaaactttctaaaaaaacaagtgatgagtcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
