Helicobacter cetorum MIT 00-7128: HCW_05480
Help
Entry
HCW_05480 CDS
T02032
Name
(GenBank) efflux transporter
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
hce
Helicobacter cetorum MIT 00-7128
Pathway
hce01501
beta-Lactam resistance
hce01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hce00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
HCW_05480
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
HCW_05480
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hce02000
]
HCW_05480
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
hce01504
]
HCW_05480
Transporters [BR:
hce02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
HCW_05480
Antimicrobial resistance genes [BR:
hce01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
HCW_05480
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Med16_C
SecD_SecF_C
HMA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFI04358
UniProt:
I0EN39
LinkDB
All DBs
Position
1177306..1180374
Genome browser
AA seq
1022 aa
AA seq
DB search
MYKVAISRPITTLMFALAIIFFGTMGFKKLSVALFPNIDIPIVVVNTIYPGASAEIIESK
VTDKIEEAVMGVDGIKKVTSNSARNVSSVAIEFELEKPKEEALNDIINKVSSVHFDDPNI
QKPSIDKFDTNSQAIISLFVSSESIPIATINDHAKNVIKPMLQKIYGVGGVQLNGFRERQ
IRIYADPTLMNKYNITYSELYNVLKTENLEVDGGRIVNSQKELAILVNANSYKVSDVENI
QVANHVRLADIAKVEIGLQENTTFASFQHKPGVILEIQKIAGANEIEIVDHVYKELKHLQ
DASLGYEIIPFMDTTTYIRTSIEDVKFDLILGGILAVLVVFVFLRNGTITLVSAISIPIS
IMGTFALIQWMGFSLNMLTMVALTLAIGIIIDDAIVIIENIHKKLEMGMDKRTASYEGVK
EIGFAVVAISAMLLSVFVPIGNMKGIIGRFFESFGITVALAIALSYVVVVTIIPMVSSIV
VSPKQSRFYHWSEPFFKSLEVRYVSLLQWVLSHKLIIFSSVVVIFFGSLFVASKLGMDFM
LKEDRGKFNVWLKASPGVSIDYMVNKTQAFQKAIEKKPYVDFTTLQVGYGSIKSPFKAKI
FVQLKPIKERSLDQFKIMRELRQELDSMPEAKDMLSINFSDIPLLGGGDSSPFQVFVFAH
SQEIVDKSVANLKKFLLESPELKGKVENYHTSTSDSQPQLQLKVLRQNANKYGVSAQAIA
SVVSSAFSGENQASYFKEDGKEYDIVIRVPDNKRISIEDVKRLQVRNKYDKLMFLDALVE
VKETTSASNITRYNRERSITVFASPNKSMGISLGEVLKQVTKHSKEWLVEGANYSFTGEA
NNAKETGQEFIIALATAFVLIYMILAALYESLLEPLIIMITMPLSFSGAFFALALAHQPL
SMFSMMGLILLIGMVGKNATLLIDVANEQRKKGKNIQEAILYAGETRLRPILMTTIAMVF
GMLPLALAVGDGAAMKSPIGIAMSGGLMVSMLLSLLVVPIFYRLLAPIDDKIKRFYQNQK
AL
NT seq
3069 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataaagtagcgattagtcgtcctattacgacattaatgtttgcgcttgcgattatc
ttttttgggacaatggggtttaagaaattaagtgttgctctttttcctaatattgatatt
cctattgtggtagttaatacgatttatccgggagctagtgctgaaattatagaaagtaag
gtaactgataagattgaagaggcagttatgggggttgatgggattaaaaaggttacttct
aatagcgctaggaatgtaagctcggttgcgattgaatttgagctagaaaaacctaaagaa
gaggctttaaatgatattatcaataaggtttcttcagtccattttgatgaccccaatatt
caaaaaccttctatagataagtttgataccaattctcaagctatcatttcactatttgta
agcagtgagagtattcctattgcgaccattaatgaccatgctaagaatgtgattaaaccc
atgttgcaaaagatttatggggtagggggcgtgcaacttaatggttttagggaacgccaa
attagaatctatgctgaccctaccttaatgaataaatacaatatcacttatagcgaactt
tacaatgtgcttaaaacagaaaatttagaagtagatggggggcgcattgttaatagccaa
aaagaactagccatcttggtgaatgctaatagctataaagtctctgatgtagagaatatt
caagtggctaatcatgtgcgtttagcagatattgctaaagtagagataggtttgcaagag
aatactacttttgcaagttttcagcacaaaccgggtgttattttagaaattcaaaaaatt
gctggagccaatgaaattgaaatagtagaccatgtctataaagagcttaaacatctccaa
gatgcaagtttaggatatgaaatcataccctttatggatacaacaacttatatccgcacc
tccattgaagatgttaagtttgatttgattttaggggggattttagcggttttagtagta
tttgtattcttgcgtaatggcacgattactttggtttctgctatttctattcctatctcc
attatgggaacttttgcccttattcaatggatgggcttttctttaaatatgcttactatg
gtagctttaactttagccattggtattattattgatgatgcgattgttattattgaaaat
atccataaaaaattagaaatgggcatggataaacgcacagcaagctatgagggggttaaa
gagattggttttgcggttgttgcaatttctgcaatgttactatcagtgtttgtgcctata
gggaatatgaaagggattattggacgcttttttgaaagctttggaatcacggtagctctg
gcaattgcgctttcgtatgtagttgtagttacaattattcctatggtaagctctattgtg
gtaagccccaaacaatctcgcttttatcattggagtgagccatttttcaagtctttagaa
gttcgttatgtgtctttattgcaatgggttttgagccataaacttattattttttcatca
gtggtagtgattttttttggttcgctttttgtcgcctctaaattaggcatggattttatg
cttaaagaagataggggcaagtttaatgtgtggcttaaggcaagtccgggtgtgagcatt
gattatatggttaataaaactcaagctttccaaaaagctattgaaaaaaagccttatgtg
gatttcactactttacaggtgggttatggaagtattaaaagcccttttaaagctaagatt
tttgtgcaacttaagcctattaaagagcgctcattagaccaatttaaaatcatgagagaa
ttgcgccaagaattagacagcatgccagaggctaaagatatgcttagtattaatttttca
gatattcctttattaggcggtggggatagttcgcctttccaagtctttgtctttgcgcat
tcccaagagattgtagataagagtgtagctaatttgaaaaaattcttattagaaagccct
gaattaaaaggtaaggttgaaaattatcacactagcacgagcgattcacaaccccaatta
caattaaaggttttaaggcaaaacgctaataaatatggcgtaagcgctcaagcaattgca
tcagtggtgagttcagctttttcaggcgaaaatcaagcaagctattttaaagaagatggc
aaagagtatgacattgttattcgtgtgccagataataagcgtatttctatagaagatgtt
aagcgcttgcaagtgcgtaataaatatgataaattgatgtttttagatgctttagtagag
gtgaaagaaacgacaagtgcctccaatatcactcgctataatcgtgagcgtagcataacc
gtttttgctagtcctaataaaagcatgggaatttctttgggagaagtcttaaaacaagtt
actaaacattctaaagaatggttagttgaaggggctaattatagtttcacaggggaagcc
aataacgctaaagaaacaggtcaagaatttatcattgctttagcaacagcttttgtgcta
atttatatgattttagcagccttgtatgagtctttattagaacctttaattattatgatt
accatgcctttgagtttttcgggtgctttttttgctctagcattagcgcaccaacctcta
agcatgttttctatgatgggcttaatcttgcttataggaatggtaggaaagaatgcaacg
cttttaattgatgtggctaatgagcaacgcaaaaagggtaaaaatattcaagaggcaatt
ttgtatgcgggcgaaactcgcttaagacccattctaatgactactattgctatggttttt
ggaatgctccctttagctctagctgttggagatggagcagcgatgaaatcccctataggg
attgctatgagtggggggcttatggtatctatgcttttaagcttattggttgtgccaatt
ttttatcgtcttttagcgcctatagatgataagattaagcgtttttatcaaaatcaaaaa
gccctataa
DBGET
integrated database retrieval system