Hemicordylus capensis (graceful crag lizard): 128334769
Help
Entry
128334769 CDS
T08891
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1 isoform X1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
hcg
Hemicordylus capensis (graceful crag lizard)
Pathway
hcg04350
TGF-beta signaling pathway
hcg04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hcg00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
128334769 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
128334769 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hcg00536
]
128334769 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hcg00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
128334769 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
hEGF
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128334769
NCBI-ProteinID:
XP_053127912
LinkDB
All DBs
Position
10:12387380..12604141
Genome browser
AA seq
2878 aa
AA seq
DB search
MWLGRLLLRFALGFTVLLLCASSPGQGAAQSHLEADVAAAAVAKETNSRASRAKRRGQSG
VAAGHDALKGPNVCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPSG
QIAPSCGSKSVQHCNIRCMNGGTCSDDHCLCQKGYTGAQCVQPVCESGCLNGGRCVAPNR
CACTYGFTGPQCERDYRTGPCFTLVTNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCP
AQPHPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGICQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEVTQK
CDDIDECSTIPGICDGGECSNTVSSYFCKCPSGFYTAPDGSRCIDVRPGYCFSSLTNGRC
GNQLQQVFTKMQCCCDSGRCWSPGATSAPEMCPIRATEEFRKLCVFDGLPPLRPEIPGRP
PIIYPLPDTYPPLPGPGPQVVVPSRRPDIQPVNVTHPNYCQVYQNLCINGRCIPTPGSYR
CECKKGFELDLRGECIDVDECERSPCIGGDCVNTQGSYICQCRPGYQSTLMRTECRDIDE
CLQNGRICNHGRCINTDGSFHCVCNAGFHVSADGRNCEDMDECSIRNMCLNGMCINEDGS
FKCICKPGFQLAPDGRYCRDIDECETPGICMNGRCVNMEGSFRCDCLPGLAVGLDGRVCV
DTHMRSTCYGEYRRGQCVKPLSGAVTKSECCCASTDYAFGEPCRPCPAQSSDEYHALCSS
GPGITAAGTDINECALDPDICPNGICENLRGTYKCICNAGYEVDSTGKNCIDIDECALNR
LLCDNGQCRNTPGSFTCTCPKGFAYKPEQQTCEDINECESNPCINGVCKNTPGSFVCECS
SESTLDATRTICIETVKGTCWQSIVNGRCEININGATLKSQCCSSLGAAWGSPCIPCDRD
PVCSRGYSRIRGTQCEDINECEVFPGVCTNGHCVNTLGSFICQCPTGMTLDATGRRCIDI
RLESCYLDHDDEDCTKPIGGRHRLDACCCSVGAAWGPDCDECPTKGTPEYEALCPRPGFS
TRGEIINGKPFYKDINECKMIPSLCTYGKCRNTIGSFRCKCDSGFALDSEERNCTDIDEC
RISPDLCGQGLCVNTPGDFHCDCFEGYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGVCINTEG
SFRCECPPGHQLSPNISACIDINECDLSINLCRNGRCVNLIGKYQCACNPGYQSTPDKLY
CIDIDECDIMNGGCDTFCTNSEGSYECSCRPGFALMPDHRTCTDIDECEDNPNICDGGQC
TNIPGEYRCLCYDGFMATDDMKSCLDVDECELNKDICLSGTCENTKGSFICHCDLGYSGK
KGSTGCTDINECEIGAHNCDRNAICTNTAGSFKCSCGPGWIGDGIKCTDLDECSNGTHTC
SPHADCKNTMGSYRCLCKEGYTGDGFTCTDLDECSENLNLCENGQCLNAPGGYRCECDMG
FLPSEDGKACEDIDECTLPSICVFGTCHNLPGLFRCQCETGYELDRSGGNCTDINECADP
TTCMSGTCLNIPGSYTCECPPDFELNPTRVGCVDTRSGHCYLEIKPRGDNGDSACSNEIG
IGVSKSSCCCSLGKAWGIPCEACPAVNSSDYKVLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECIELP
GLCQGGQCINSFGSFQCQCPSGYYLNEDTRVCDDVDECITPGICGPGTCYNTIGNYTCIC
PPDYMQVNGGNNCMDMRRSLCYRNFYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNIGRAWNRPCE
QCPVPSTDEFSTLCGSQRPGFFIDIYTGLPVDIDECREIPGMCENGVCINLVGSFRCECP
GGFIYNEKLLICEDIDECQNGQVCQQHAECINTPGSYRCDCKPGYRFTSLGWCVDRDECK
EMPNLCSHGTCHDQDGGYYCTCDTGFKTNDDRTMCVDINECDRDPCGNGTCRNTVGSFNC
RCHTGFILSHNNDCIDVDECASGNGMLCRNGRCINTVGSFQCLCSDGYEISPDGRVCVDI
NECALDPGKCSPGTCQNLDGSYRCICPVGYSLDKDNCIDIDECTEEANICVLGTCSNTPG
SFTCLCPEGFIVTSDGRRCNDLRMSYCFTKFEEGKCVVPKARNHSKHECCCNMRGEGWGE
PCELCPQEGQEAYKDICPFGYGIMIGPGGEPIDADECLDPDNCKNGQCINTDGSFRCECP
FGYVIHGSECVDTDECSVGSPCGNGTCKNIIGSFECTCEEGFEPGPMVTCEDINECAQNP
LLCAFRCVNTYGSYECKCPAGYILREDRRMCKDQNECEEGIHDCDSKNMECKNLIGTYMC
ICGPGYQRRPDGEACIDENECQTKPGICENGRCVNTVGKYRCECHDGFNASADETECIDN
REGYCFTEVLQSMCQIGSSNRNPVTKSECCCDGGRGWGPNCEICPFLGTIAFKKLCPYGR
GYTTTGADIDECKVIHDVCQNGNCINERGSYRCDCKDGYTTDITGTLCIDLNECNQSPKP
CNFICKNTEGSFQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPG
FTQHHSACIDNNECASDVNICGSKGICQNTPGSFNCECQRGFALDQTGASCEDVDECDGN
HRCQHGCQNIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCHNTLGSYKCMCP
TGYHFEQFSGACQDVNECGSSQAPCSYGCSNTEGGYVCGCPPGYFRVGQGHCVSGMGLGK
GHGQDLPMSGEVDDNSLSPEACYDCKINGYPKRGRKRRSTNETDALEAEDLPEMESAVNL
ASWDIEKPTTFSFNISDLDNKDRILKLIPALTTLTNHNRYLIDHGNEGGFFRINQKEGIS
FLHLTKKKPVPGTYSLHISSIPLYKKKELNQLEDKHDKDYLSGELGDNLKMKIEILLH
NT seq
8637 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggctgggcaggctgctgctgaggttcgccctgggatttactgtgctgctgctctgc
gcttcgtccccgggccaaggggctgctcagagccacctggaagcggacgtcgccgccgcc
gccgtcgcgaaggaaaccaacagccgggccagccgggccaagaggcgagggcagtcggga
gtcgccgccgggcacgatgcgctcaaaggacccaacgtatgtggatcacgttacaatgcc
tactgttgtcctggatggaaaacattacctggcggaaaccagtgcatagtcccaatttgt
agacattcctgtggagatggattttgctcaagaccaaacatgtgcacatgtccaagcggc
cagattgccccctcctgtggctcaaaatcagtgcaacactgcaacatcagatgtatgaat
ggaggcacgtgtagtgatgaccattgtctctgtcagaaagggtacacaggagcacagtgt
gtacagcctgtctgtgaaagtgggtgtctgaatggaggcagatgtgttgcgcccaacagg
tgcgcctgcacgtatggttttaccggaccccagtgtgaacgagactacaggactggcccg
tgcttcacattggtcaccaaccagatgtgccaagggcagctcagtgggatagtctgcaca
aaaaccctctgctgtgcgaccgtcgggagagcgtggggccacccgtgcgaaatgtgtccg
gctcagcctcatccttgtcgccggggcttcattccaaacatccggacgggagcctgtcaa
gatgtggatgagtgccaagctatcccggggatttgtcaagggggaaattgcattaatact
gttggatcttttgagtgcaagtgcccagctggacacaagtttaatgaagtgacacaaaaa
tgtgacgatattgatgagtgcagtaccattcctggaatctgtgatggcggagaatgttcc
aacacagttagcagttacttctgtaaatgcccttctggattttacacagcccctgatggc
tccaggtgcatagatgtacgccctggatactgcttttcttcactcactaatggccgctgc
ggcaaccaactgcaacaggtgtttaccaaaatgcagtgctgttgtgactctggacggtgc
tggtctcctggagcaactagtgccccggaaatgtgtcccatcagagctactgaggagttc
cgcaaattatgcgtatttgatggcttaccaccactgagaccagaaatccctggcaggcct
cctatcatctatcctctacctgacacatatcctcccctaccaggaccaggaccacaagtt
gttgttccgtcccgtagaccagatattcagccagttaatgtcactcaccccaactattgc
caggtatatcaaaatctttgcatcaatggacgctgtatcccaactcctggaagttatcgc
tgtgaatgtaagaaaggatttgaactggatctcagaggggaatgcattgatgttgatgag
tgtgagaggagcccttgtattggcggagactgtgtaaatacgcaaggatcctacatatgc
cagtgccggcctggatatcaaagtacccttatgaggacagaatgccgagatattgatgaa
tgcttgcagaatggccggatatgtaatcatgggcggtgcataaacactgatggcagtttc
cactgcgtttgcaatgctggctttcatgtgtcagctgatgggagaaactgtgaagatatg
gacgaatgcagcatacggaatatgtgtcttaatggtatgtgcatcaatgaagatggaagc
tttaagtgcatttgcaaacctggtttccagttagctccagatggacgttactgcagagac
attgatgagtgtgaaacacctggaatatgcatgaatggacgttgtgtaaatatggaaggt
tctttccgatgcgattgcctccctggccttgctgtgggactggatggacgcgtgtgtgtt
gatacacatatgcgaagcacatgctatggtgaatacaggagaggtcaatgtgttaaacca
ttatcgggagcagttactaaatcagaatgttgttgtgccagcacggactatgcatttggg
gaaccttgcaggccttgtcctgcacaaagctcagatgagtaccatgctctttgtagcagt
ggcccaggcatcacagcagcaggaactgacatcaatgaatgtgcattggatcctgacata
tgtcccaatggaatctgtgaaaacctgcgtggaacgtacaaatgcatttgtaatgctggg
tatgaagttgactcgactggaaaaaactgcatagacattgatgaatgcgcgctaaacaga
ttactttgtgacaatggacaatgcagaaacacccctggcagctttacttgcacatgcccc
aagggatttgcctataagcctgagcagcaaacatgtgaagatattaatgagtgtgaatcc
aacccctgtattaatggagtgtgcaaaaatacccctggctcttttgtctgtgaatgttcc
tcggaaagcactttggatgcaacaagaaccatctgtattgagactgttaaaggcacttgt
tggcagagcattgtgaatgggaggtgtgaaataaatatcaatggggccactctaaagtca
cagtgctgttcctcactgggtgctgcttggggtagtccctgcattccttgtgatcgagac
ccagtttgttcaagaggatactcaaggataagaggcacacaatgtgaagatatcaatgag
tgtgaagtgttccctggagtgtgtactaatggacactgtgtcaatacgctgggatccttt
atttgccagtgccccactggaatgactttggatgcaactggacggaggtgtatcgatatt
cgtttggagtcatgctacttggatcacgatgatgaagactgcacaaaacccatcggaggg
cgacaccgactggatgcctgttgctgctctgtgggtgcagcctggggccctgactgtgac
gaatgccccacaaagggaacacctgaatatgaagctctttgcccaagacctggattttct
actcgaggagagattataaatgggaaaccattctacaaagacatcaatgaatgcaaaatg
atcccaagcctttgcacctatggaaaatgcagaaacaccattggaagtttccgatgtaaa
tgcgacagtgggtttgcccttgattctgaagaaagaaactgcacagatattgatgaatgt
cgcatctctcctgacctgtgtggccaagggctctgtgtcaacacacctggagactttcac
tgtgactgttttgaaggttatgaaagtggattcatgatgatgaaaaactgcatggacatt
gatgaatgtgaaaggaatcctctgttgtgcagagggggcgtgtgcataaacaccgaagga
agcttcagatgcgagtgccctccaggtcatcaattgtctccaaacatctctgcctgtata
gacattaatgaatgtgacctgagtataaatttgtgcagaaatggacgttgtgtcaacctc
attggaaagtatcagtgtgcctgcaaccctggatatcagtcaacacctgacaaattatat
tgtattgatattgatgaatgcgacatcatgaatggcggctgtgacaccttctgtacaaat
tcagaaggcagctatgagtgtagctgtagaccaggatttgcgctgatgccagaccacaga
acttgcactgatattgatgagtgtgaagacaatcctaacatctgtgatggtggccagtgc
acaaacatacctggagaatacagatgtctttgttatgatggattcatggcaactgatgac
atgaagagttgtttagatgttgatgaatgtgaactgaacaaggacatctgtttgagtgga
acttgtgagaatacaaaaggatcctttatctgtcactgtgatttgggatattctggtaaa
aaaggatcaactggttgcacagatattaacgaatgtgaaattggagcccataactgtgat
cggaatgctatctgtacgaacacagctggaagtttcaaatgcagttgcggtccgggttgg
attggagatggtatcaaatgtacagatctggatgaatgctccaatgggacacacacgtgc
agcccacatgcagattgcaaaaataccatgggatcataccgttgcctgtgcaaagaaggg
tacactggggatggattcacatgcacagatcttgatgaatgctcagaaaacctaaatctc
tgtgaaaatgggcagtgcctcaatgctccaggaggttatcgctgtgaatgtgacatggga
tttttgccaagtgaagatgggaaagcctgtgaagatattgatgagtgtacccttcctagc
atatgtgtctttgggacctgtcacaacctccctggcctgttccgatgtcagtgtgagaca
ggatacgaattggacagaagtggcggtaactgcacagacatcaacgagtgcgcagatccc
acaacttgtatgagtggcacttgtctcaacatcccaggcagttacacctgtgaatgccca
cctgactttgagctgaaccctactcgtgttggatgtgttgacacacgctctggccactgt
tacttggagattaaacctcgaggagacaatggagactcagcttgcagcaatgaaatcggg
attggggtttcgaagtcctcttgctgctgttctcttggcaaagcatgggggattccatgt
gaagcgtgcccagctgtgaactcaagtgactacaaggtgctctgtcctggaggagaagga
ttccgacccaatcctattacagttattttggaggatattgatgagtgcattgagctacct
ggactctgccaaggaggacaatgtatcaattcatttggtagctttcagtgtcagtgtcca
tccggctactacttgaatgaagatactcgagtatgtgatgacgttgatgaatgcatcacc
cctggcatctgtgggcctggcacttgctacaacaccatcggcaactacacctgtatttgt
cctcctgactacatgcaagtcaatggcgggaacaactgtatggatatgaggaggagtctg
tgctacagaaacttttatgctgacaatcaaacctgtgatggagagctgctttttaacatg
accaaaaaaatgtgctgctgttcctacaacattgggcgagcctggaatagaccgtgtgaa
caatgccccgtcccgagcactgatgaattttcaactctttgtggaagtcaaaggcctggt
ttcttcattgacatttacacagggttaccagttgatattgatgaatgccgtgagatccct
ggtatgtgtgagaatggggtctgcataaacctggtcggcagtttccgatgtgaatgtcca
ggaggattcatttacaatgagaagttactgatctgtgaagatattgatgaatgtcaaaat
gggcaggtgtgtcagcagcatgctgagtgcatcaacacaccagggagctaccgctgcgat
tgcaaacctggttatcggttcacgtcactaggctggtgtgttgatcgcgatgaatgtaaa
gagatgcccaatctctgtagccatggtacatgccatgaccaggatggaggctattactgc
acttgtgatactggattcaaaacaaatgatgacagaactatgtgtgtggatatcaatgaa
tgtgatcgagacccatgtggaaatggcacctgcaggaatactgtaggctctttcaactgc
cgctgtcatacaggattcatcctttctcacaataatgactgtatagatgttgatgaatgt
gccagtggaaatggaatgctgtgcagaaatggccggtgcatcaacacggttgggtctttc
cagtgtctctgcagtgatggctatgagatatctccagatggaagggtttgtgttgatatt
aatgagtgtgcattggatcctggtaaatgttcacctggtacatgtcaaaacctggatggt
tcatataggtgcatatgccctgttggatacagcctagataaggacaactgtattgatatt
gatgagtgtacagaagaggcaaacatctgtgtcttgggtacttgcagcaatactccaggc
agcttcacttgcttgtgtcctgaggggttcatagtgacctctgatggaagaagatgtaat
gatctgagaatgagctactgctttaccaaatttgaagaaggaaaatgtgtggttcccaaa
gccagaaaccattccaagcacgagtgctgctgcaatatgcgtggggaagggtggggtgag
ccatgtgaactgtgcccacaagaaggacaagaggcttataaggacatttgtccatttgga
tatggcattatgattggccctggtggtgaacccattgatgctgatgagtgcctagatcca
gacaactgtaaaaatgggcaatgcatcaacacagatggttccttccgctgcgagtgcccc
tttggttacgtaattcacggatctgaatgtgtcgatactgatgagtgctctgtaggaagc
ccgtgtggaaatggaacttgtaagaatattattggcagttttgaatgtacctgtgaggaa
gggtttgagccgggaccaatggtgacatgtgaagacataaacgaatgtgctcagaatcct
ctcctttgtgccttccgatgtgtgaatacatatggatcctatgaatgcaaatgtcctgct
ggctacatcctcagagaagacagaagaatgtgcaaagatcagaatgagtgtgaagaagga
attcatgactgtgactcaaagaacatggagtgtaaaaacctgattggcacatatatgtgc
atatgtggccctggatatcaacgcagaccagatggtgaagcttgcatagatgagaatgaa
tgccagacgaaacctgggatctgtgaaaatggacgctgtgtgaatacagtaggaaagtac
cgatgcgaatgtcatgatggtttcaacgccagtgcagatgagactgaatgcatagacaac
agagaaggctactgtttcacggaagtcctacagagtatgtgtcagattggatcaagcaac
aggaaccccgtgaccaaatctgaatgttgctgtgatggtgggcgaggatggggacccaac
tgtgagatctgccccttcttgggcactatagctttcaaaaaactttgtccttatggccgt
ggatacacaaccactggagcagatattgacgagtgcaaggttatccatgatgtttgccag
aatggaaactgtatcaatgaaagaggatcataccgctgtgactgtaaagatggctacact
acagatataacaggcactctttgcatagatctaaatgagtgcaaccagtcaccaaagcct
tgcaatttcatctgcaaaaatactgaagggagttttcagtgctcatgtccaaaaggatat
attttgcaagaagatgggagaagctgcaaagatcttgatgaatgtgcaaccaagcaacat
aactgccagttcctttgtgtcaacaccattgggggctttacttgtaaatgcccacctggg
tttactcaacatcattcagcatgtattgataacaacgaatgtgcttctgatgtcaatatt
tgtggatctaagggcatttgtcaaaacacaccaggaagcttcaattgtgaatgtcaacga
ggctttgcacttgaccagactggagccagctgtgaagacgttgatgaatgtgacggaaat
catcggtgccagcacggttgccagaacataattggaggatacaggtgtagctgcccacaa
ggatatctccagcactaccagtggaaccagtgtgtcgatgaaaatgaatgcctcagtgca
catatctgtggtggagcatcttgccacaacactttgggaagctacaaatgcatgtgccct
actggatatcacttcgagcagttcagtggagcatgccaagatgtaaatgagtgtggctct
tcacaagcaccctgcagctacggctgctcaaacacagaaggtggctatgtctgtggatgc
ccacctgggtacttcagagtaggacaagggcattgcgtttctggaatgggactgggcaag
ggtcatggccaggacttaccaatgagtggtgaagtagatgacaattcactttctccagaa
gcatgctatgactgcaagatcaatggctatcctaagagaggaaggaaacggcgaagcaca
aatgaaacagatgctcttgaggcagaggatctgcctgagatggagtcagctgttaatctt
gccagctgggatattgaaaaaccaaccaccttttctttcaacatctctgatcttgacaac
aaagatcgcatcttaaaactgatcccagctctcacaacactgacaaatcacaatcgatat
ttaatagaccatgggaatgaaggtggtttctttaggataaatcagaaagaagggataagt
ttccttcacttgacaaagaagaagcctgtgcctggaacctactcattacacatcagtagt
attccactctataaaaagaaggaactcaaccagcttgaagataaacatgacaaagactac
ctcagtggtgagctaggagacaacctgaaaatgaaaattgaaattttgcttcactaa
DBGET
integrated database retrieval system
