Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 105845628
Help
Entry
105845628 CDS
T01080
Symbol
LOC105845628
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC105845628 isoform X1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Pathway
hmg04350
TGF-beta signaling pathway
hmg04518
Integrin signaling
hmg04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
105845628 (LOC105845628)
09133 Signaling molecules and interaction
04518 Integrin signaling
105845628 (LOC105845628)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
105845628 (LOC105845628)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hmg00536
]
105845628 (LOC105845628)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hmg00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
105845628 (LOC105845628)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PK_Tyr_Ser-Thr
cEGF
FXa_inhibition
Pkinase
Plasmod_Pvs28
Haspin_kinase
ABC1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105845628
NCBI-ProteinID:
XP_047142380
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(47504778..47705018)
Genome browser
AA seq
1673 aa
AA seq
DB search
MSFKKKIYLKYITCIIHTWFLSKTNSIKHDTLTDNVNMVCPSTFETFQGSFVNRIAAYSF
DTQNGNYQMEGFIKSIDLSPSNLPNNSFNSSNGNGYIYAVGNGNNKLLISLTGNSYTDIE
NFDILISMAYEIKNGSYNLTLTSYHENSSPYYVQITNSSSYMWHIYNARFPVNGSFILNI
YGSGFGRLDDICLFQVCSEGYAFDYSVDKCKATSLQPFNTTTMQSLITKATEALTATTTK
DLIISMTYRLVENIATPLVNGKILAVLPSIEKEYLVSFDFYPNSIPNDMFYAVIRLTNTT
GINYASNGYHIPGIYLFSSGYLQIASSLNGNGFGFFNTYPISVKEWINIEISQILICEDY
VYRIKLNGNYVYLQINHQSQRFKNVTVYASDFSWPTDGLIKNLYVSTGNATTLTEPPNTV
AMKSTTITTVKAPTTTSSTDAPTTSKTINFITTTDDPIISTFYWLVKNFATPLVNGKILT
VLSSIEKEYLVSFEFYPNSFPPNGFYSIIRFTNISESDDIEYNVSSVYLHSSGSLLIASS
MNGDGFRYFNTDAIILKNWIIIEISQVLKCGQYVYTIKLNGVVVYVELNYQSQRFNKIRV
YAADITLPTDGYIKNLYVFNGNTNPCYYKNCYTSSYCSVVSGIAVCSCPNGFKLQSDTTT
CVHDPCYYKNCYNSDYCSVVSGIALCSCPNGYKLQSDNTTCVQDPCYFKKCYTLNYCSVV
LGIAMCSCPIGFKLQSDNITCLQDPCYLKNCYTSNYCSVLSGIAVCSCPIGFILQSDNTT
CIQDLCYYKNCYNSTYCSVVSGVAICSCAIGFKLQSDNTTCVQDPCYYKNCYNLTYCSVV
SSVAMCSCPIGLKLQSDNTTCVQDPCYYKNCYNSNYCSVVSGVAMCSCPIGFKLQPDSTI
CVQDPCYYKNCYSSNYCRVMSGYAVCSCPIGLKLQSDGITCVQDPCYYKNCYNLTYCSVV
SSVAMCSCPIGFKLQSDGTTCVQDPCHYKNCNTSNFCIVVSGIAVCSCPNGLKLQPDGIS
CVEDPCYFKNCYTLSYCNVVSGYAVCSCPNGFKLQSDGITCVLDPCYYKNCYNLYYCSVV
SGYAVCSCPIGFKLQPDNITCVQDPCYYKNCYNTTYCSVVSGVAMCSCPIGFKLQSDNTT
CVQDPCYYKSCYTSNYCSIVSGYAMCSCPIGFKLQFDNITCIQDPCYYKNCYTSNYCSVV
SGFAVCFCPNGFNLQSDNITCVKASLFSIELFNSKTAVIVIATLGVVLFVFIVIFAVTVV
LFKKKKKSQLPMANAFLQTIEYNNQVTSHETIADEWEIYPECFLIDKKIGGGAYSTVFMV
KINAKILSKTKHANRSIASLPALNKNCRSNVAVKFLKAGASQLEINDFKEEINIMKKIGY
HHNILNMLGCSTVKKPLCLVTEYMENGDLLQFLCDRRTTLQVQNDESIVYASTYQRSLER
PITTNSTTEAIYHDILLEDVEKITPRDLLSFAYQVASGMEYLSKINVVHRNLSASNILVG
AKKNVKISDFGLSRKIQNESQYIGNKIRHVPIKWMSIEALLDLVFMSYSDVWAFGVVLFE
IVTLGGTPYPTISNHKLLGFLKSGCRMDRPENCSTIIYNIMLHCWSEDPLQRPTFSELRN
HLEELLLQGGFYFSFDINENNVYYNATSFNHLPSETGNGSHEVERIRNAHITV
NT seq
5022 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccttcaaaaaaaaaatttacctcaaatatatcacttgtataatccatacttggttc
ttatctaagaccaattcaataaaacacgatactctgacagataatgttaacatggtgtgt
ccttcaacatttgaaacttttcaaggcagttttgtcaatcgtattgcagcatattctttc
gatactcaaaatggaaactatcaaatggaaggttttattaaaagtattgatctttcacct
tcaaaccttcccaacaattctttcaattcaagtaatggtaatggatacatctatgctgtt
ggtaatggaaataacaaacttcttataagcttaactggaaactcgtatacagatatagag
aattttgacattcttatatctatggcatacgaaattaaaaatggaagctataatttgaca
ttgacaagttatcacgagaatagttctccatattatgtacaaattactaattcatcctca
tatatgtggcacatttataatgcaagatttccagtcaatggtagtttcattttgaatatt
tatggttctgggtttggccgattagatgatatatgcttatttcaagtttgttctgaaggc
tatgcatttgattattcagttgataaatgcaaagcaacatctctgcagccttttaacact
accacaatgcaatctttgataacaaaagcaactgaagctctaacagcaacaacaactaaa
gatctaataatatctatgacatatcgacttgttgagaacatcgccactccattggttaat
ggaaagatacttgctgttttaccatcaattgaaaaagaatacttagtatcatttgatttc
tatccaaactcaattcctaatgatatgttttatgctgttattcgtttaactaatactaca
ggaattaattatgctagtaatgggtatcatattcctggcatttatttattttcaagcggt
tatttgcaaattgctagttctcttaatggcaatggatttggcttctttaatacgtatcct
atttcagtaaaagaatggataaatatagaaataagccagatactgatatgtgaagattat
gtatatagaattaaactaaatggtaattatgtttatttgcaaatcaatcatcaatctcaa
agatttaaaaatgttacagtatatgcttcagatttttcatggccaacagatgggttaatc
aaaaatctatatgtttctactggtaatgcaacaacattaactgaacctccaaacactgtt
gcgatgaaatctacaacaataactacagttaaagctccaacaacaacaagtagtactgat
gctccaacaacaagcaaaactataaattttataaccactactgatgatccaataatatct
acattttattggcttgtgaagaactttgcaactccgttggttaatggaaagattcttact
gttctatcatcaattgaaaaagaatacttagtatcatttgaattctatccaaactcgttt
cctcccaatggtttttattctattattcgtttcactaatatttctgaatctgatgacatt
gaatataatgtttctagtgtttatttacattcaagtgggagcttgctgattgcgagttcc
atgaatggagatggttttagatactttaacacagatgctattattttaaaaaattggata
attatagaaataagtcaagtattgaaatgtggacaatatgtttatacaattaaattaaat
ggtgttgttgtatatgtagaacttaactatcaatctcaaaggtttaacaaaattagagtt
tatgctgcagatattacattaccaacagatggctatataaaaaacttatatgtttttaat
ggaaatacaaatccatgttattataagaattgctacacttcaagttattgcagtgtggtg
tcaggtattgctgtgtgctcatgtccaaatggattcaaactgcagtctgataccacaaca
tgtgtacatgatccatgttattataaaaattgctacaattcagattattgcagcgtggtt
tcaggtattgctctgtgctcatgtccaaatggatacaaactgcagtctgataacacaaca
tgtgtacaagatccatgttattttaagaaatgctacactttaaattattgcagtgtagta
ttaggtattgctatgtgctcatgtccaattggatttaagctgcagtctgataacataaca
tgcttacaggatccatgttatttaaagaattgctacacttcaaattattgcagtgtgtta
tcaggtattgctgtgtgctcatgtccaattggattcatactgcagtctgataacacaaca
tgtatacaagatctatgttattataagaattgctacaactcaacttattgcagtgtggtg
tcaggtgttgctatatgttcatgtgcaattggattcaaactgcagtctgataacacaaca
tgtgtgcaagatccatgttattataagaattgctacaatttaacttattgcagtgtggtg
tcgagtgttgctatgtgttcatgcccaattggattgaaactgcagtctgataacacaaca
tgtgtacaggatccatgttattataagaattgctacaattcaaattattgcagtgtggtg
tcaggtgttgctatgtgttcttgcccaattgggttcaaactgcagcctgatagcacaatc
tgtgtgcaagatccatgttattataagaattgctactcatcaaattattgccgtgttatg
tcaggttatgctgtgtgctcatgtccaattggattaaaactgcagtctgatggcatcact
tgtgttcaggatccatgttattataagaattgctacaatttaacttattgcagtgtggtg
tcgagtgttgctatgtgctcatgtccaattggattcaaactgcaatctgatggcacaaca
tgtgtacaggacccatgtcattataagaactgcaacacttcaaacttttgtattgtggtg
tcgggtattgctgtctgctcatgtccaaacggattaaaactgcaacctgatggcatctca
tgtgtagaggatccttgttattttaagaattgctacactttaagttattgcaatgtagta
tcaggctacgcagtgtgctcgtgtccaaatggattcaaactgcaatcagatggcataaca
tgtgtactcgatccatgttattataagaattgctacaatttatattattgcagtgttgtg
tcaggttatgctgtgtgttcttgtccaattggattcaaattgcagcctgataacataaca
tgtgtacaagatccttgttattataagaattgctacaatacaacttattgcagtgtggtg
tcaggtgttgctatgtgttcatgtcccattggattcaaactgcagtctgataacacaact
tgtgtgcaagacccatgttattataagagttgctacacttcaaattactgcagtattgtg
tcaggttatgctatgtgctcatgtccaataggattcaaactgcagtttgataacataaca
tgtatacaagatccatgttattataagaattgctacacctcaaattattgcagtgtggta
tcaggttttgctgtgtgtttttgtccaaatggattcaatcttcagtctgataacataaca
tgtgtaaaagcttccttgttttcaatcgaactttttaacagcaaaacagctgttatcgtt
atagcaacactaggtgttgttttatttgtttttattgtaatttttgctgttactgttgtt
ttatttaaaaaaaaaaaaaaatctcaactaccaatggccaacgcatttcttcaaactatt
gaatataacaatcaagtaacatctcatgaaacaatagcagatgaatgggagatatatcca
gaatgcttcctaattgataaaaaaattggtggtggcgcatatagtactgttttcatggta
aaaataaatgcaaagattctttctaaaacaaaacatgcaaatcgatccatagcttctcta
cctgccctcaataaaaattgtagaagtaatgtggcagttaaatttttaaaagctggtgct
agtcaactagaaatcaatgattttaaggaagaaataaatatcatgaaaaaaattggatat
caccataatatattgaatatgcttggttgttctactgttaaaaaacctttatgcttagta
acagaatacatggagaatggtgatttgttgcagtttttatgtgacagacgtactacactt
caagttcagaatgacgaaagcattgtttacgcatcaacctatcaacgatctcttgagaga
ccaataactacaaattctacaacagaagcaatatatcatgacattcttcttgaagatgtt
gaaaaaattacacctagagatctgcttagttttgcataccaagttgcaagcggaatggaa
tatctatcaaaaataaatgtggttcatcgaaatctttctgcaagtaatattttagttggt
gctaagaaaaatgtaaaaatttcggattttggtttgtcacgaaaaatccaaaatgaatcg
caatacattggcaataaaattcgtcatgtaccaattaaatggatgtcaattgaagcactc
cttgatctagtattcatgtcatacagtgatgtttgggcgtttggtgttgttttatttgaa
atcgttactcttggtggaacaccttatccaacaataagtaatcataaacttcttggattt
ttaaagtctggttgcagaatggatcgaccagaaaattgttctactataatatacaacatc
atgctgcactgttggagtgaagatccgttacaacgcccaacattttcagaattacgaaac
catcttgaagaattattattacaaggcggtttttatttcagctttgatattaatgaaaat
aacgtgtattataatgctacctcctttaaccatctcccatctgaaacaggcaatggctcc
catgaagtagagagaatccgtaatgctcatataaccgtgtga
DBGET
integrated database retrieval system