Haloimpatiens sporogenes: ACER0A_009875
Help
Entry
ACER0A_009875 CDS
T11656
Name
(GenBank) ATP-dependent RecD-like DNA helicase
Organism
hspg Haloimpatiens sporogenes
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_30
AAA_19
HHH_RecD2
OB_YrrC
SH3_13
UvrD_C_2
HHH_5
AAA_11
Viral_helicase1
PIF1
NAT10_TcmA_helicase
PhoH
SLFN-g3_helicase
AAA_22
DEAD
UvrD_C
NTPase_1
AAA_28
AAA_23
nSTAND3
HerA_C
SRP54
TraI_hel_assoc_N
HHH_2
IMS_HHH
Thymidylate_kin
AAA
AAA_29
RsgA_GTPase
NPHP3_N
T2SSE
UvrD-helicase
ABC_tran
AAA_16
ABC_ATPase
AAA_25
ATP_bind_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XMD27214
LinkDB
All DBs
Position
complement(2098737..2100944)
Genome browser
AA seq
735 aa
AA seq
DB search
MLDLQGVVQDIIFKNEENGYVVAKLEYKGKDETIVGCIPYIIEGQTLKMQGEWILHPKFG
QQFKVSSCEEVLPDSINGIEKYLSSGVISGIGTVTAKKIVEHFGEDTLDILDNDIDRLRE
IEGIGKKKIDLIRESYYKQREVKNIMVFLQTYGVTPNQCVKIYKRYGKESINTVKNNPYV
LTEDIWGIGFKTADKIARSLGIDKNSPFRIQSGVKYLINEFCSLGNTYMPLKKLVENAKD
ILLVDKDIIEKSIYDCALEGKLKIEEINEDLCAFNLIFYYSELNVTKKIITLSLVKHDNI
DINVENEIKEFEKNNDINFSPSQKEAIKGALDSGIEIITGGPGTGKTTIINCITEIFQKQ
GLSVFMAAPTGRAAKRMEEATGHEAKTIHRLLELGFGNSDEAMFSKGEESPLECDVVIID
EASMIDIILMNNLLKAIGIGTRVIIVGDVDQLPSVGPGNVLRDIIESNCVRVVRLKEIFR
QAKESMIIVNAHKINEGQMPTLNMKNNDFYFINEDDSNKILDTIVDLISSRLPRFNSKWN
KMEHIQILSPMRKGILGVENLNLRLQQVLNPPAEYKREREFRNYIFRVGDKVMQTKNNYS
IKWCKVDGSEEGVGVFNGDVGFVESIDKEEDRVTVVFDDDKRVIYDSMYLDELTLAYAMT
IHKSQGSEFPVVIMPMFIGAPLLMNKNLLYTGITRAKKLVVLVGSLKAVHFMINNDRSFE
RYSSLKWRISSILEE
NT seq
2208 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttggatttacaaggagttgttcaagatattatttttaaaaatgaagaaaatggctat
gttgtggcgaagctagaatataaaggaaaagatgagactatagttggatgcataccctat
ataatagagggacaaacacttaaaatgcaaggggagtggatattacatcctaaatttggg
cagcagtttaaggtgtctagctgcgaagaagtactacctgattctattaatggtatagaa
aaatatctatcatcaggcgtcatatctggaattggtacagtaactgctaaaaaaatagtt
gaacattttggtgaagatacgctagacatattagataatgatatagataggttaagggaa
atagagggtattggaaagaaaaagatcgatttgattagggagtcttattataaacaaaga
gaagtaaaaaatattatggtttttcttcaaacctatggtgttactccaaatcaatgcgtt
aaaatatataaaagatatggtaaagagtctataaatacagtaaaaaataatccttatgtt
cttacagaagatatatggggaatagggtttaaaactgcagataaaattgctagaagtctt
ggcattgataaaaattcaccttttagaatacaaagcggggttaaatatttgataaatgag
ttttgctctcttggaaatacatatatgccactaaaaaaattagttgagaatgcaaaggat
attcttttggtagataaagatattattgaaaagagcatctatgattgcgctttggaagga
aaattaaaaatagaagaaattaatgaggatttatgtgcttttaatttgatattttattat
tcggagcttaatgtaacaaaaaaaataataactttgtcgttggtgaaacatgacaatata
gatataaatgtagaaaatgaaattaaagaatttgaaaagaataatgacattaatttttct
ccttcacaaaaagaggctataaagggagctttagattcaggtatagaaataataactgga
ggtcctggcacgggaaagactacaataattaattgtataactgaaatatttcaaaagcaa
ggcctttccgtttttatggcagcacctacgggaagagctgcaaagagaatggaagaagca
acagggcatgaagctaaaactatacataggctattagaacttggattcggaaattctgat
gaagcaatgttttcaaagggggaggagagtcctttagaatgcgatgtggttattattgat
gaagcttcaatgattgatataatacttatgaataatcttttaaaggctataggtatagga
acaagagtaattattgttggagatgtagaccagctaccttcagtgggacctggaaatgta
ttaagagacattatagagagtaactgtgtaagggtagttaggcttaaggaaatatttaga
caggcaaaagaaagtatgattattgtaaatgcacataagattaatgaaggacaaatgcca
acattaaatatgaagaataatgatttttattttattaatgaagatgatagtaataaaatt
ttggataccatagttgacttgataagttctagacttcctaggtttaacagcaaatggaac
aagatggagcacattcaaatattgtctcccatgagaaaaggaattttaggtgtggaaaat
ttaaatcttagactgcagcaggttttaaatccaccagctgagtataaaagagaaagagaa
tttagaaattatatttttagggttggagacaaagttatgcaaactaaaaataattattct
ataaaatggtgtaaggtagatggaagcgaagaaggtgttggagtttttaatggcgatgta
ggttttgttgagagtatagataaggaagaggatagagttactgttgtttttgatgatgat
aaaagagttatttacgattctatgtatctagatgaattaactttagcttatgcaatgact
atacataaaagtcaaggaagtgaatttccagttgttattatgccaatgtttattggagct
ccacttcttatgaacaaaaatctactgtatactggcataacaagggcgaaaaaattagtt
gttttagtaggaagtttaaaagcagtgcattttatgataaataatgatagaagctttgag
agatattcctctttgaagtggagaataagtagtatattggaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
