Helicobacter winghamensis: A0Z60_00205
Help
Entry
A0Z60_00205 CDS
T07030
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
hwi
Helicobacter winghamensis
Pathway
hwi01501
beta-Lactam resistance
hwi01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hwi00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
A0Z60_00205
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
A0Z60_00205
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hwi02000
]
A0Z60_00205
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
hwi01504
]
A0Z60_00205
Transporters [BR:
hwi02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
A0Z60_00205
Antimicrobial resistance genes [BR:
hwi01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
A0Z60_00205
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Gp58
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOQ98076
LinkDB
All DBs
Position
complement(34108..37167)
Genome browser
AA seq
1019 aa
AA seq
DB search
MSKFAITHPISALMFVLALVFFGSDALRRLSVSLYPNVDVPVITITTVYPGANPEIVEGK
VTDRIEEAVSGIESLKKITSTSADSVSIVVVEFELEKDINIAANDVRDKISTISFGSEVK
SPIVEKFDVGGAPIVSLFITPKKPIKNTQELLELNLHTDLNVKPLIQRIKGVGKVNLVGY
LEREIKISPNPSALNKYNLSFSDIARAINAQNIEIDGGRLINEKREWKILTKADATSVQD
LGNILIAQGIKLSDIAVILDSTKEQRSFSNLATPQGSHSGILLEVQKITGANEIEIANSL
KAILPELQAMDEKYELHLVRDTTNYIKDTIAAVEFDLILGAFLAVFVVFVFLRNWRITFI
ASLSIPTSVMGVFALMYAFGMTLNLATMIAITLAIGIIIDDAIVVIENIYKKIENGEERK
KAAYDGVKEIGFALVAISCMLLAVFIPIANMSGVTGRFFTSFGITLAGAIVISYLVVITF
IPMLSARIVDTQAVNSRFYLWSEKYFKALEQFYLSVLGWVLRHKALVIGGILSVFVASLF
LVARLGIEFLPSEDKAEFDIKLVSKPGISLQEMQYQTLEIQEHLQTLSEMEYSILNIGFT
AEQKVYEAKIYVRLSPYNKRERSLKEIIESLRGDYKPFSERFKMEIAIIEIPQISLGEDD
SPLQMAIFSQNPNALASSVQKIQNLMEQSGKYLDIHTDVKAQTPQIRLKINRILAAQYGF
SAKEIAIALNSAFSGVQEVSYYRENGKEYNIVLLSPKKDSIVDISYLSLRNAQGQNVFLD
GLVEIEEVAAVTNVKRYDRQRSVMVYANLSENVSLGEATNYLEQNKAQWLEDGVHYKVEG
YAKYMQETNAAFVVAMVSALFLIYFILASLYESLLEPVIIMITLPLSFTGAFLALFLSGA
SLSLFSIMGLMLLMGLVGKNATLIIDVANEKREEGMDIDNAILHAGVLRLRPILMTTIAM
VFGMLPLALAGGAGSGIKSPMGIAMIGGLLVAMVLSLLIVPAFYKILAPLDTRLRKWYA
NT seq
3060 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaatttgctatcacgcatcctattagtgccttaatgtttgtattagctcttgtg
ttttttgggagtgatgcactaaggcgtttaagcgtttcgctttatcctaatgtcgatgtg
cctgtaattacaatcactaccgtttatcccggagcaaatccagagattgtagaaggaaag
gttacagataggatagaagaagcagttagtggaatagaatcgcttaagaaaatcacttcc
acaagtgctgatagtgtgagcattgttgtagtggagtttgagttagaaaaagatattaat
attgccgcaaatgatgtgcgcgataagatttctacaattagttttggaagcgaagttaaa
tctcccattgtggagaagtttgatgtaggtggtgcaccgattgtttcgctctttatcact
cccaaaaagcctataaaaaacacgcaagagctgttggaattaaatttgcacacagattta
aatgttaaacccttaattcagcggattaaaggtgtggggaaagtcaatttagttgggtat
ttagaaagagagattaaaattagtccaaatcctagcgcattaaacaaatataatcttagc
tttagtgatattgcacgcgcgattaatgcgcaaaacattgaaattgatggaggtcggcta
atcaatgaaaaaagagagtggaaaatcttaacaaaagccgatgctacaagtgtgcaagac
ttaggaaatatccttatcgcacaagggattaaactaagcgatattgcagttattttagat
tccacaaaagaacaaagaagcttttcaaatcttgcaacaccacaaggaagtcatagcgga
atcttactagaagtgcaaaaaatcacgggggcaaatgagattgaaattgctaattcttta
aaagccattttaccggagttgcaagcaatggacgagaagtatgaattacatcttgtgcgt
gatacgacaaattatattaaagatacgattgctgctgtggagtttgatttaattttagga
gcgtttttagctgtgtttgtggtgttcgtatttttgcgcaattggcgcattacctttatt
gcaagccttagtattcctacttctgtaatgggtgtttttgcgctgatgtatgcctttggt
atgacgctaaaccttgcaacaatgattgccataactcttgctattggaattattattgat
gatgctattgttgtgattgaaaatatttataaaaaaattgaaaatggagaagagcgcaaa
aaggcagcttatgatggggtaaaagagattggatttgctcttgtggcgatttcttgtatg
ctacttgccgtgtttattcctattgcaaatatgagtggggtaacagggcggttttttact
tcttttgggattacacttgctggtgcgattgtaatttcttatttagttgtgattaccttt
attccaatgctaagtgcgcgtattgtggatacacaggcagtaaatagtagattttatctt
tggagtgaaaaatactttaaggctttagagcaattttatctatctgtgttagggtgggtt
ttaaggcataaagcacttgtaataggtggaatcctaagcgtatttgtggcttctttgttt
ttggttgcgcgtttagggattgagtttttgccatcagaagacaaggcggagtttgatatt
aagctagttagcaagccaggaatttctttgcaagaaatgcaataccaaactttagagatt
caagaacatttgcaaactttaagtgaaatggaatatagtattttaaatattggatttact
gcggagcaaaaggtgtatgaagccaagatttatgtgcgtcttagcccttataacaagcgc
gaacgctcgcttaaagagattatagagtctttaagaggagattataagcctttttctgag
aggtttaaaatggagattgctattattgaaattccacaaattagtttgggtgaagatgat
tctcctttacaaatggcaattttctcacaaaatccaaatgcgcttgcaagtagcgtgcaa
aagattcaaaacttaatggagcaaagtggcaaatacctcgatattcacacagatgttaaa
gcgcaaacacctcaaattcgccttaaaattaatcgtattttagctgcacaatatggcttt
agtgctaaagagattgccattgctttaaatagtgcttttagtggcgtgcaggaagtttca
tattatagggaaaatgggaaagagtataacattgtattgttgagtcctaaaaaggattcc
attgttgatattagttatcttagtttaagaaatgcacaagggcaaaatgtatttttagat
gggcttgtggagattgaagaagtagcggcagttacaaatgtgaagcgttatgataggcaa
cgcagtgtgatggtgtatgcaaatttaagtgaaaatgtgagtttaggggaagctacaaat
tatttagagcaaaataaagcacaatggctagaagatggtgtgcattataaagtggaagga
tatgcaaaatatatgcaagaaacaaatgccgcctttgtggtagctatggtttcagctttg
tttttgatttatttcattttagcctccttgtatgagtcgcttttagagcctgtgattatt
atgataaccttgcctttgagttttacaggggcttttttggcgttgtttttaagtggagca
agtttgagtttgtttagcattatggggcttatgcttttaatggggcttgtaggtaagaat
gcaacgcttatcattgatgtggcaaatgagaagcgcgaagaggggatggatattgataat
gcaattttacacgcgggtgtgcttagattgcgtccaattttaatgacaaccattgcaatg
gtgtttggaatgttacctttagcgcttgctggtggagctggaagtgggataaaatcgcca
atggggatagcgatgattgggggattgcttgttgcaatggtgttaagcttgctaattgtg
ccagcgttttataagattttagcaccacttgatacgcgtttaagaaaatggtatgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
