Intestinibacter bartlettii: NQ514_02770
Help
Entry
NQ514_02770 CDS
T08452
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
ibr
Intestinibacter bartlettii
Pathway
ibr01501
beta-Lactam resistance
ibr01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ibr00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
NQ514_02770
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
NQ514_02770
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ibr02000
]
NQ514_02770
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
ibr01504
]
NQ514_02770
Transporters [BR:
ibr02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
NQ514_02770
Antimicrobial resistance genes [BR:
ibr01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
NQ514_02770
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Crescentin
C_GCAxxG_C_C
TPR_MLP1_2
FliJ
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWO81426
LinkDB
All DBs
Position
complement(508310..512002)
Genome browser
AA seq
1230 aa
AA seq
DB search
MLPKFSVKKPLTVFVAMILVLVLGVVSFTKMTTDLLPSMNLPYVIAYTPYPGASPEKVEN
TVTNPLEEVFSTVSGVENVTSISNENVSMVILEFSQDTNMDSAMIDLNGQVDLVKSKFDD
TVGSTTLMKLNPDMMPIMMVSVDVDGMSQEEISTYVNDEIIPSLERIEGVASVSATGLVE
SQLQITLDTDKIDSLNKKIKANINSELDKNEKKIDDGISKLDKSEKELDKKSQEQISKLS
EASVELESGLSQLSSAIAQIQMMDSVGDSLNPTISDAKKALNDSESKLKDFKNKLKIAEQ
NGLDTSILKENIASLESTIKTIKISIENAEKGLNSSSVSLGQLQAQQKELKSQKKQLETA
KSTLNQELTKASIKIIQGKAQLESAKQELNKSREEALKSADLSSKITPDMINSVLTAENF
SMPAGYVSDDTKQYSVKVGDKFTSIDQVEDLLLMSIDGIGDIYLKDIADIKYENNVSKSY
TNVNGNPGIMLSIEKTSTASTSSVCDKLNQTIDSLTNGNDKLHILSLMDQGIYIDMVINS
ILDNLLYGGILAIIVLLVFLRSIKPTVIIAFSIPMSLLFAVVLMYFTDISLNMISLSGLS
LGVGMLVDNSIVVIENIYRMRNNGVSRYKAAVYGAKQVSGAIFASTLTTICVFLPIVFTD
GITKQIFTDMGLTIAYSLIASLIIALTLVPCMASKLLTSADEKEHRWFDKFVDFYETLLE
KALNHKSIVLIGALILLCFAGFSATRMGTAFMPDMSSTQMTATISPKEGQELTDDDLQKI
SDDFVKIVGKIDDVEGVGAMNGSGTMIGMSSSGSSNSMSVYIVLKEDMKHSNKEIAKMIK
DDTSSLNCDISVNESTMDMGSMVGSGINIQIKGDNLDKLQDISKDMVDILKNTDGAIDIK
SSLDNSEVEQRVSVNKDEAMKYGLTVAQVYQQISEKLKSETTSTTITSNSNDLAVVIKNN
TSETTIKDLKLLEMKGTKNNKDAKVKLNKIATITNATTPASINHKNQTRYMTVSASVDED
HNIGLISRDIQSKIDDYNTPNGYEVELTGENETINSTMKDLVLMILLAIVFIYLIMVAQF
QSLLSPFIVMFTIPLAFTGGLLGLLVTRQILSVTSMLGFLILAGIVVNNGIVFVDYVNQL
RLDGVDKRTALLETGRARIRPILMTAMTTILAMSTMALGVGMGSELSQGLSIVTIGGLLY
ATLLTLFIVPILYDIFHRREMKKIIIDDED
NT seq
3693 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttaccaaaattcagtgtaaaaaaaccattaacagtattcgtagctatgattttagta
cttgttttaggtgttgtttcatttacaaaaatgacaactgatttgctacctagtatgaac
cttccttatgtaattgcatatactccatatcctggagcaagtcctgaaaaagttgaaaat
actgttacgaatcctttagaagaagttttctctacagtaagtggtgttgaaaatgttact
tctatatcaaatgaaaatgtaagtatggtcatacttgagttttcacaagatacaaatatg
gactctgcaatgatagaccttaatggacaagtcgatttagtcaaaagtaagtttgacgat
actgtaggttccactacccttatgaaattaaatccagatatgatgccgataatgatggtc
agcgtcgatgtggatggaatgtcccaagaagaaatctctacatatgttaatgatgaaatc
atacctagtttagagcgtattgaaggcgtcgcatcagtaagtgcaactggacttgtagaa
agtcagttacaaatcactttagacacggataaaatagattctctaaataaaaaaatcaaa
gctaatatcaattctgaattagataaaaacgaaaagaaaatagatgatggtatctctaaa
ttagacaaaagtgaaaaagaacttgataaaaaaagccaagaacagatatcaaaattatct
gaagctagtgttgaattagaatcaggtttatcccaattatcatctgctatcgctcaaatc
caaatgatggactcggttggagattctttaaatcctactatttctgatgctaaaaaggcc
cttaatgacagtgaatcaaaattaaaagattttaaaaataaattaaaaatcgctgaacaa
aacggtcttgatacttctatattaaaagaaaatatagcctctttagaatcaactataaaa
actataaaaatttctatagaaaatgcagaaaaaggattgaatagttcttcagtttccctt
ggccaactacaagctcaacaaaaagagttgaaatcccaaaagaaacaacttgaaacagca
aaatcaacattaaatcaagagctaacaaaagcttcaattaagattattcaagggaaagct
caacttgaatctgcaaaacaagaattaaataaatctagggaagaagcattaaaatcagct
gatttatcaagcaagattactcctgatatgattaactctgttcttacagcagaaaacttc
tctatgcctgcaggctatgtttctgatgatacgaaacaatattctgttaaagtcggtgat
aaatttacttctattgaccaagtcgaggatttacttcttatgtctatcgatggtattggt
gatatttatttaaaagacattgctgatattaagtatgaaaacaatgtaagtaaatcttat
acaaacgtaaacggaaacccaggtataatgttatctattgaaaaaactagtacagcatct
acttcttcagtctgcgataaattaaatcaaactatagattctttaactaatggaaacgat
aaattacatatcctttctctaatggatcaaggaatctatatagatatggttattaacagt
attttagacaacctactttatggtggtatattagcaataatcgtacttttagtattttta
agaagtattaaacctacagttataatagctttcagtatccctatgagtttattattcgca
gtagttttaatgtacttcacagatatatccctaaatatgatttcactatctggtttatcg
ctaggtgtaggtatgcttgtcgataacagtatagtcgttatcgaaaatatttatagaatg
agaaataacggggttagtagatataaagctgcagtttatggagctaaacaagtttccgga
gctatttttgcttctactttaacaactatatgtgtattcctaccaatagtatttactgat
ggtattacaaaacaaatatttacggatatgggacttactatagcatattcattaatcgca
agtttaataatagccttaactctagttccttgcatggcttcaaaattattaacttctgct
gatgaaaaagaacatagatggttcgataaatttgtagatttctatgaaacattactagaa
aaagcacttaatcataaatcaattgttcttattggtgcattaattcttttatgctttgct
ggatttagcgcaacaagaatgggaactgcatttatgcctgatatgagttcgacacaaatg
acagcgactatctctccaaaagaaggtcaagaacttacagatgatgatttacaaaaaatt
agtgatgacttcgttaaaatagtcggtaaaatcgatgatgttgaaggtgttggtgcgatg
aatggttctggaactatgattggtatgtcctcttctggttcttcaaatagtatgtctgtc
tatattgtattaaaagaagatatgaaacattcaaataaagaaattgccaaaatgataaaa
gacgatacttcttccttaaactgcgatatatcagtgaatgaatctactatggatatggga
agtatggtcggttctggaataaacattcaaattaaaggtgataatttggataaacttcaa
gatatatctaaagatatggtagatatattaaaaaatactgatggtgcaattgatataaaa
agtagtttagataattcagaagttgaacaacgtgtttctgttaataaagacgaagctatg
aaatacggccttacagttgctcaagtttatcaacaaatttccgaaaaattaaaatctgaa
acaacttctacaactataacttcaaatagtaacgatttagctgtagttataaaaaataat
acttctgaaacaacaataaaagatttaaaattattagaaatgaaaggtacaaaaaataat
aaagatgctaaagtaaaattaaacaaaatagctactataactaatgccactactccagca
tcaataaatcacaaaaaccaaactcgttatatgacagtatctgcatcagttgatgaagat
cacaacataggacttataagtcgtgatattcaatcaaaaattgatgattacaatactcct
aatggttatgaggttgaattaactggcgaaaatgaaacaataaatagtactatgaaggat
ttagttcttatgatacttcttgcaatagtgtttatttatttaataatggttgcccaattc
caatcactattatctccatttatcgtaatgttcactatccctcttgcatttactggaggt
ttattaggattgttagttacaagacaaatcttaagtgtaacatctatgcttggtttccta
attcttgctggtatagttgttaacaacggtatagtttttgtcgactatgtaaaccaatta
cgccttgatggtgttgataaacgaactgcattattagaaactggtcgagctcgtataaga
ccaatacttatgactgcaatgactacaatacttgctatgtcaactatggccctaggtgtt
ggtatgggttctgaattatcacaaggtttatctatagttacaatcggtgggttattatat
gccactttattaacattatttatcgttccaattttatacgatatcttccatagaagagag
atgaagaaaattataatagatgatgaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system