Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly): 111690997
Help
Entry
111690997 CDS
T06013
Name
(RefSeq) cadherin-99C
KO
K16500
protocadherin-15
Organism
lcq
Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
03037 Cilium and associated proteins [BR:
lcq03037
]
111690997
04515 Cell adhesion molecules [BR:
lcq04515
]
111690997
Cilium and associated proteins [BR:
lcq03037
]
Primary cilia and associated proteins
USH complex and associated proteins
111690997
Cell adhesion molecules [BR:
lcq04515
]
Cadherins
Protocadherins
111690997
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
Cadherin_FAT4_N
RibLong
DUF3671
Big_9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111690997
NCBI-ProteinID:
XP_046804561
LinkDB
All DBs
Position
4:40373236..40572662
Genome browser
AA seq
1737 aa
AA seq
DB search
MSSSRTTKIFSYTCHQRITYLSALYLVFVLLLKCHKVAGVLGKSQMCEVETGQTNIILDI
EESRGDYIGQQTNPPELPIFGDPFTEIALDLVFPKGNPIFLLNGKKLQLLQPLDRDEENL
SHIVFQVSCTIRSTLKRRNIPIIVRVSDVNDNAPRFMNTPYEVTVPESTPVGTTIFRNIQ
ALDKDAGVNGLVEYFIVEGSTNTTEDEKMTIADGYGTFAISFPHQGQVTVAKTLDYEKIQ
RYYLTIVASDRARNVSERLSSTTTLTVNIADSDDLDPSFIYRGCVLLDGACINPEYTASV
PAGSLQGVLTVTPERIQAVDLDTISSPIRYSFASGMPGNYADYFEIDEQTGVLKQIKAVD
TSTAKKYDIIVKAEEVSTAKRFTTAKLTINVKPVDANPPVISASSVVGYVDENSPLGTRV
LDENGKPISFKTTDADLTEDDPKPDYIYELTTPSFEVTADSILVVNEEGLDRDPPAPGKY
KFQVVAREPKTNAASAPLSLTVILKDVNDNAPKLSMVPPVSITAGDGVRKVANVTATDND
EGANAVITYSIYHVSNNGMQKFYIDEQTGEIETRGRLLAGEQYSITVQASDIGGLSSQAI
VEVTVTPGPNTKPPKFVKPVYEVQVSEGAEINSTVTVVHAEDPENDPVIYSIISGNDLRQ
FAVGQESGVIAVIRKLDRESLTRYQLIVKAEDNGGLSSTATVNIKVTDINDKNPEFDEST
LPYVFHVDEGKAKAFVGIVHATDADEGINAEITYSVPNDIPFSINGSSGEIRTSVALDYE
KQNEYRFVVTAKDGAPDARLGTASVTVLVKDLPDEVPKFSDSRIDVRIPENEPDVTVATV
QAFDPDTMPEITYVIRKGATDLFKVNPQTGEIRTTKGLDYEKQKVHELIVGTIENDGNAA
GDTIKVVVEVEDRNDVRPVFVSVPEPVTVNDDQPIGAMIATMPAIDGDGSSPGNVVRYEM
VGRGKALKYFQVDPDTGAIRIRDELRKEEDTEYQVDIRAYDLGEPQLSSVATLPVFVRHL
LTDPNEDNMMEGRLDNGVIMSPESLGLAFSDDSYTTGVPETTGINATIKLIQVINSKKSV
KSNPGFKCEIIKGNDLGLFNVTQEDHGCGIKLIKHLDFENKTAHSLDLKLVSHKYFINPQ
KSTTTVKIIVQDENDNAPEFIYNRARGRKDTFYAVVTPEMDTDTPILQVRATDRDSGKFG
MIRYKIYDEEDNTLSTDNLPTSYFVMTEETGILRTAKSFREQTNFPKIFYVEARDNDGQE
MGSHRTRARIVINQITDLNRLSLVFSDATPNELRNQYAALEELFSEKTGGLITGIERFSN
RKFLNENGTILENPSATDVWFYLIDPKTETILQRNSSIVQETLLEPTARAELNFAASGVA
RATAEGIYPPIELKQVVQSKILPIAINDEVFPYTLIAISIIILILGIIGIIYICISWSKY
KNFKQRMRQYSTPSPTRYDPVIVNSQASNGGDTVANLKEYETQVLAMAVPPDGDDELQID
FSAKNHAFSLDNVSYITHKEHNGSSSGGQTSPSHSEATTATIATLRRNNNNNLNNMSANN
NINNHTMNNRQNTFNRTLEMNVRNNANPLAANGTLPGTLTLGRIKHQNSNHYQNGGYKLD
TVSRNNLANAQNNAYSTLGRRGNTFSNNNSNANNGAEMGANGELMTNTLGRNHQHNIQRG
YNEVPITNPLFQRSNGDLSHISPSNENVTFGKRDYGQMGFSYLNDLDRSEVETTTEL
NT seq
5214 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttccagccgcaccacaaaaatcttctcatacacctgccatcaacgtataacatat
ttatcagctttatatttagtttttgttttgctattaaaatgtcacaaagttgctggtgtt
ttaggcaaatcacagatgtgtgaagtggaaacgggacaaacaaatataatattggatata
gaggagagtagaggtgattatattggccaacaaacaaatccgcctgaattacccatattt
ggtgatccctttacggaaattgccttagatctagtctttcctaaaggtaatcctatattt
ctattaaatggcaaaaaattacagctgctacaaccgctggatagagatgaagaaaattta
agtcatattgtttttcaagtttcctgcaccatacgttccactcttaaacgccgcaatata
ccgattatagtgcgcgtgtctgatgttaatgataatgcacctcgattcatgaacacacct
tatgaggttaccgtgcctgagagtacaccagtgggtacaacaatatttcgtaatatacag
gcgctggataaggatgccggtgttaatggtctggtcgagtactttattgttgagggttct
acaaatactacagaagatgaaaagatgacaattgctgatggttatggcacgtttgccata
tcatttccccatcaaggccaggttactgttgctaaaacattggattacgagaaaatacaa
cgttactatttgacaattgtcgcatcggatcgtgcacgcaatgtttcagaacgtttgtcc
tccaccactaccctaacggtcaacatagccgattcagatgatttagatccatcgtttata
tatcgtggctgcgtactgctcgatggcgcctgtattaatccagaatatactgcttcagtg
ccagcagggtcattgcaaggtgtactcacagtgacacctgaaagaatacaagcagtagat
ttggatacaataagttcacccatacgttactcatttgctagcggcatgccgggaaattat
gcagattattttgaaatcgatgaacagacaggagtgctaaaacaaattaaagcggtagat
acctcaacggctaaaaagtatgatattatagttaaagccgaagaagtatccactgcgaaa
cggtttaccaccgctaaattaaccattaatgttaaaccagtagatgccaatccaccagtt
atatcggccagttcagttgtgggttatgtagatgaaaattctcccttaggaacccgagta
ttagatgagaatggtaaacctatatctttcaagactacagatgccgacttaactgaagat
gatccaaaaccagattatatttacgaattaacgacaccttcctttgaggtaactgccgat
agtattttagtggtaaatgaagaaggtttagatcgtgatcctccagctcctggaaaatac
aaattccaagtggtggcacgagaacctaaaaccaatgctgctagtgctcctttaagttta
actgttatactaaaagatgtaaacgataatgctcccaaattatcgatggttcctccagtg
tccattacagctggagatggcgtacgtaaagttgccaatgtgacagccaccgataatgat
gagggcgccaatgctgtgataacttactctatttatcatgtctccaataatggcatgcaa
aagttctatatcgatgaacagacgggagaaatagaaactcggggacgccttttggctgga
gaacagtatagtattacggtacaggcttcagatataggaggactttcatcgcaggctatt
gtagaggtaacggtaacacctgggcctaataccaagccaccgaagtttgttaaacctgtt
tatgaggtacaagttagtgagggagccgaaattaattctaccgttactgtggtgcatgct
gaagatcccgaaaatgatcctgtgatatattccataatatcgggtaatgatttaagacaa
tttgccgtaggccaagaatctggagttatagctgtgatacgtaaactggatcgtgaaagt
ttaacacggtatcagttaattgttaaggctgaagataatggaggtctttccagcaccgct
actgttaatatcaaggtcaccgatatcaacgataagaatccggaattcgatgaatccaca
ttgccttatgtgttccatgtagatgagggtaaggctaaagcttttgtgggtattgttcat
gccaccgatgcggatgaaggtataaatgccgaaattacctattccgtacccaatgatata
cctttttctattaatggttcctcgggagaaatacgtacgtccgtagctttggattatgaa
aaacaaaatgaatatcgttttgttgtcactgccaaggatggtgctcctgatgctcgtttg
ggtacagctagtgttacggttttggtcaaagatcttcccgatgaagtgcctaaattcagc
gattctcgtatagatgtgcgcataccagaaaatgaaccagatgttacggtggctacagta
caggcctttgatcctgatactatgccagaaataacatatgtgatacgcaaaggagctacc
gatctttttaaggttaatccccaaactggtgaaattagaacgactaagggtttggattat
gaaaaacaaaaggtccatgaactaattgtgggcaccatagagaatgatggcaacgcagct
ggggataccattaaagttgtggtagaggtagaagatcgcaatgatgtgcgtccggtattt
gtgtcggtacccgaaccggtaacagttaatgatgatcagcctataggtgccatgatagcc
actatgccagccatagatggtgatggttcttctccaggtaatgtggtacgctacgaaatg
gtgggtagaggtaaagctttgaaatatttccaagttgaccccgatactggtgccatacgt
atacgtgatgaattgcgcaaggaagaagacaccgaatatcaggtggacataagggcttac
gatttgggagagcctcaactgagttctgtagccactttaccggtatttgttagacactta
ctgaccgatcccaatgaggacaatatgatggagggccgtctagataatggtgtcataatg
tcccccgaaagtttgggtttggcatttagtgatgatagttatactactggagtgcctgaa
accactggcattaatgccaccattaagctgatacaagttattaactcaaagaaatcggtt
aaatcaaatcccggctttaaatgtgaaatcattaaaggcaatgatttgggtttgtttaat
gtaacccaagaagatcatggttgcggcataaaattaataaaacatttggattttgaaaat
aaaactgctcattctttagatttgaaattggtctctcataaatatttcattaatccacaa
aaaagtaccactacagttaaaattatagtgcaagatgaaaatgataatgcacctgaattt
atctacaatagggctcgaggtcgcaaagatactttctatgcagttgttacccccgaaatg
gatacagatacacccatattacaggtgcgagccaccgatcgggattcgggtaaatttggc
atgattcgctataagatatacgatgaggaagacaacactttaagcactgacaatttgccc
accagttattttgtcatgaccgaggaaacgggtattttacgtacggccaaatcattccgc
gagcaaacaaatttccccaagattttctatgtagaggctcgagacaacgatggtcaagaa
atgggttctcatcgtacacgagctcgcattgttattaatcaaattactgatttaaatcgc
ctttctctggtcttttctgatgctacacccaatgaattgcgcaatcaatatgccgcctta
gaagaattattttccgaaaagacaggcggtttaattacgggcatagaacgttttagcaat
cgtaaatttttaaatgaaaatggtactattttggaaaatccctcagccactgatgtttgg
ttttatcttattgatcctaaaacggaaactattctacagcgtaattcttccatagttcaa
gaaaccctattggaacctaccgcccgagcagaactgaattttgctgcctcaggtgtggcc
agagccacagcggagggtatttatccacccatcgaattaaagcaagtggtacaaagcaag
attttgcctatagctattaacgatgaagttttcccctatactttgatagcaatatcaatt
attatattgattttgggtataattggtatcatctatatttgcatttcttggtcaaagtac
aaaaactttaaacaacgcatgcgtcaatattccacccccagtccaacacgttatgatccc
gtcatagttaattctcaagcctctaatggtggtgatactgtagccaatctgaaagagtat
gaaactcaagttttagccatggcagtaccacctgatggtgatgatgaactgcaaattgat
ttcagtgctaaaaatcatgccttctccctagacaatgtgagttatataactcacaaagaa
cacaatggcagctcaagtgggggacaaactagtccttcacattccgaagctaccactgcc
accatagcaacactacgcagaaataacaacaataatttaaataatatgtcggccaataat
aatattaataatcataccatgaataatagacaaaatacttttaatcgtacattggaaatg
aatgtacgcaataatgctaatccattggcggccaatggaacactgccgggaactttaacg
ctgggtcgtattaaacatcaaaattctaatcattatcagaatggtggctataaattggat
acagtgagtcgtaataatttggcaaatgcccaaaataatgcgtacagtacattgggaaga
aggggcaatacttttagtaataataattccaatgccaacaatggcgctgaaatgggagct
aatggggagctaatgacaaatactttgggtaggaatcatcagcataatatacagcgggga
tataatgaagtgccaataacaaatccattatttcaaagatctaatggcgatttaagtcat
ataagtccttcaaatgaaaatgttaccttcggtaaacgggattatggtcaaatgggtttt
tcctatttaaatgatttagatcgctcagaagtcgaaacaacaaccgaattatga
DBGET
integrated database retrieval system
