Leptosomus discolor (cuckoo roller): 104352122
Help
Entry
104352122 CDS
T08399
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
ldi
Leptosomus discolor (cuckoo roller)
Pathway
ldi04350
TGF-beta signaling pathway
ldi04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ldi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
104352122 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
104352122 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ldi00536
]
104352122 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ldi00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
104352122 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
EGF_PEAR1L
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104352122
NCBI-ProteinID:
XP_009956678
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2765 aa
AA seq
DB search
MCTCPNGQIAPSCGSKSIQHCNIRCMNGGSCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVCENGCLNGG
RCVAPNRCACTYGFTGPQCERDYRTGPCFTLVTNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWG
HPCEMCPAQPHPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGICQGGNCINTVGSFECKCPAGHK
FNEVTQKCDDIDECSTIPGICDGGECSNTVSSYFCKCPPGFYTAPDGLKCIDVRPGYCFS
SLTNGRCGNQLPQPLSKMQCCCDSGRCWSSGAATAPEMCPIRSTDEYRKLCTVAALLPAR
PDLPPGRPDVIPPPLLPGVYPPQQPEIVYPSRAPPPHVILPVNFTDYCQLFRHLCLNGRC
IPTPGSYRCECNKGFQLDVRGECIDVDECEKNPCISGDCVNTQGSYICQCRIGYQSTPTR
TECRDIDECLQNGRICNNGRCINTDGSFHCVCNAGFQVAADGKNCEDMDECSIRNMCLNG
MCINEDGSFKCICKPGFQLASDGRYCRDIDECETAGICMNGRCVNTDGSFRCECFPGLAV
GLDGRVCVDTHMRSTCYGGYKRGQCVRPLTGAVTKSECCCASTDYAFGEPCQPCPAQNSA
EYQALCSSGTGMTAGGNDINECLLDTDLCPNGRCENLHGTYKCICNPGYEVDSTGKNCID
IDECALNMLLCDNGQCRNTPGSFTCTCPKGFVYTPDLKTCEDIDECESNPCVNGVCKNTP
GSFACECSPESTLDTTRTICIETVKGTCWQNIVDGRCEININGATLKSQCCSSLGAAWGS
PCTPCERDPICQKGYSRIRGTLCEDVNECEVFPGVCTNGQCVNTLGSFVCQCPNGMTLDA
SGRTCLDIRLESCYLQHEDEQCTSQIPGRHRMDACCCSVGAAWGFECEECPLKGSPEFEA
LCPRGSGFSTKIEITGKPFSKDINECKMFPSLCTHGKCRNTIGSFKCRCDSGFALDSEER
NCTDIDECRISPDLCGQGICVNTPGDFECECFEGYESGFMMMKNCMDIDECQRNPLLCRG
GTCINTEGSFRCDCPPGHQISPNISACIDINECDLSTSLCRNGRCVNLIGKYQCACNPGY
QSTPDKLYCIDIDECSIMNGGCENFCTNSEGSYECSCKQGFALMPDHRTCTDIDECEDNP
NICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASEDMKTCIDVNECDLHPNICLSGTCENTKGSFICH
CDMGYSGKKGTTGCTDINECEIGAHNCDRHAICTNTAGSFKCSCSPGWIGNGIKCTDLDE
CSNGTHMCSPHADCKNTMGSYRCLCKEGYTGDGFTCTDLDECSENLNLCENGQCLNAPGG
YRCECDMGFLPSPDGKACEDIDECSLPNICVYGTCHNLPGLFRCECEVGYELDRSGGNCT
DVNECADPTTCISGTCVNTAGSYTCECPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIKTRGDNGG
TFCSNEIGVGVSKASCCCSLGKAWGVPCEQCPLVNTTEYKVLCPGGEGFRPNPITVILED
IDECQELPGLCQGGKCINTFGSFQCQCPSGYYLNEETRVCDDVNECDTPGICGPGTCYNT
VGNYTCICPPDYMQVNGGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNIG
RAWNKPCEQCPIPSTDEFSTLCGSQRPGFFIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGICINMV
GSFRCECPVGFFYNDKLLICEDIDECQNGPVCQQNAECVNTAGSYRCDCKPGYRFTSTGR
CTDRNECQEIPNICSHGQCIDTVGSFYCICHNGFKTNDDRTMCIDINECERDACGNGTCR
NTIGSFNCRCNLGFILSHNNDCIDVDECASGNGMLCRNGQCVNTIGSFQCLCNDGYEVAL
DGRTCVDVNECALDPGKCSPGTCQNLDGSFRCICPPGYVLQNDKCEDIDECVEQPEICAL
GTCSNTPGSFKCLCPEGFVLSSTGRRCQDLRVSYCFTKFEDGKCSVPKSRNHSKQECCCA
LKGQGWGDPCELCPEEADEAFRQICPFGIGILVGPGDARLDVDECLDPDNCKFGQCINTD
GSFRCECPYGYILQGAQCVDTDECAVGNPCGNGTCRNVVGGFECTCVEGFEPGPMMTCED
VNECIQNPLLCAFRCVNTFGSYECKCPAGYVLREDRRMCRDQNECEEGIHDCDSKQMECK
NLIGTYMCICGPGYQRRPDGEGCIDENECQTKPGICENGRCVNTVGSYRCECNEGFTVSD
AQNECLDNREGYCFTEVLQSMCQIGSSNRNSVTKSECCCDGGRGWGQNCEVCPFPGTVAF
KKLCPHGRGYMSNGADIDECKVIHDVCRNGECINERGSYRCHCNLGYTTDITGTLCIDLN
ECNESPKPCNFICKNTEGSFQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGG
FTCKCPPGFTQHHTACIDNNECATEINLCGAKGICQNTPGSFVCECQRGFSLDQTGLSCE
DVDECDGNHRCQHGCQNIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCHNTL
GSYKCMCPTGFQYEQFSGGCQDINECGSAQAPCSYGCSNTEGGYVCGCPPGYFRIGQGHC
VSGVGLGKGQGQELSLSGEVDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRKRRSTNETANEAEDQQE
LEPPISLASWDVEKAAVFSINISDLSNKDRILELLPALTTLTNHNRYLIDSGNEDGFFRI
NKKDGISYLHFTKKKPVPGNYSLQISSIPLYKKKELHQLEEKHDKDYLSGELGDNLKMKI
QILLH
NT seq
8298 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcacatgcccaaatggtcagatagccccctcctgtggttcaaaatcaatacaacac
tgtaacatccggtgcatgaatggaggtagctgcagtgatgaccattgcctctgtcagaag
ggatatacaggaacacactgtggacagcctgtctgtgaaaatggatgtctaaatggaggg
agatgtgtggctccgaaccgatgtgcttgcacatatggctttactggaccccagtgtgaa
agagattacaggaccggcccttgcttcactttggtaaccaaccagatgtgccagggacag
ctcagtggaatagtctgcacaaaaaccctttgctgtgcaacagttgggagagcatggggc
cacccctgtgaaatgtgtcctgcccagccgcatccctgccgccgaggtttcattccaaac
attcgaactggggcctgtcaagatgtggatgaatgccaagccatccctgggatctgtcaa
gggggaaattgcattaatactgttggatcttttgagtgcaaatgcccagctggacataag
tttaatgaagtgacacaaaaatgcgacgatattgatgaatgcagcaccattcctggaatc
tgtgatggaggagagtgttcaaacacggttagcagttacttctgcaagtgtcctccaggg
ttttatacagctcctgatggcttaaagtgcatagatgtgcgtcctggatactgcttctcc
tcgctgaccaacgggcgctgcggcaatcagctcccccagcctttgtccaaaatgcagtgt
tgctgtgacagtggccgatgctggtcttctggtgcagccaccgcaccagaaatgtgccca
atcagatccactgatgagtatcgcaaattgtgcacagtagctgcactgctgccagcaaga
cctgaccttcctccgggccgtcctgatgtcatcccgccaccactccttcctggtgtttac
cctcctcaacagccagaaattgtctatccatctcgggctccaccacctcatgtgatcttg
ccagtgaacttcactgactattgccaactattccgacatctctgccttaatgggcgctgt
attcccactcctgggagctaccgctgcgagtgcaacaaaggattccaactggatgttaga
ggggaatgcattgatgttgacgaatgtgaaaagaatccatgcatcagcggagactgtgtg
aacacccagggatcctacatatgccagtgtcgcataggatatcagagcaccccaactaga
accgagtgccgagacattgacgaatgtttgcagaatggtcgaatctgtaataatggacga
tgcataaatacagatggcagttttcactgtgtgtgtaatgctggctttcaagtggcagct
gatgggaaaaactgtgaagatatggatgaatgcagcataaggaacatgtgcctcaatggg
atgtgcatcaatgaagatggcagttttaaatgcatttgtaaaccagggttccagttagca
tctgatggacgctattgcagagacattgatgagtgtgagacagctggaatatgcatgaac
gggcgctgtgtgaacactgatggctctttcagatgtgaatgcttccctggccttgcagta
ggactggatggacgcgtgtgtgtcgacacacatatgcgaagcacgtgctatggtggctac
aagagaggacaatgtgtgagaccgttaaccggtgcagttacaaaatcagagtgctgttgt
gccagcactgactacgcctttggggagccttgtcagccctgcccagcacaaaattcagct
gaatatcaggctctgtgcagcagtggaactggtatgactgcaggaggaaatgatattaat
gagtgcttactggataccgatctctgtccaaatggaagatgtgagaatctgcatggaaca
tacaaatgtatttgtaaccctggatatgaagtggattcaactgggaaaaactgcattgac
attgatgaatgtgcactgaacatgctgctttgtgacaatgggcaatgcagaaatacccct
ggaagtttcacctgcacctgtccaaaaggatttgtatacactcctgacctaaagacatgt
gaagatattgatgagtgcgaatctaacccgtgcgttaatggggtgtgcaaaaacacgcca
ggctctttcgcttgtgaatgttctcctgaaagtactttggatacaaccagaactatctgc
atagaaactgttaagggtacctgttggcagaacatagtggatggaagatgtgaaataaat
atcaatggagcaactctgaagtcccaatgctgttcctcactgggtgctgcttggggaagc
ccatgtacaccgtgtgaacgagacccaatatgtcaaaagggatattcaagaataagagga
acattgtgtgaagatgtaaatgaatgtgaggtgtttcctggagtctgtacaaatgggcag
tgtgtcaataccttgggatcatttgtttgccagtgccccaatggaatgactttagatgct
tctggacggacatgtcttgacattcgcttggagagttgctacctgcaacatgaagatgag
caatgcacctcacaaataccaggccggcaccgaatggatgcttgctgctgttcagtgggg
gcagcgtggggctttgagtgcgaggagtgtcctctgaagggatcacctgaatttgaagct
ctttgtccaagaggatctgggttctcaacgaagatagagataactgggaaacctttctct
aaagatatcaatgaatgtaaaatgttccccagtctctgtacccatggaaaatgcagaaat
accattggcagttttaagtgtagatgtgacagtggatttgcccttgattctgaagagagg
aattgcacagatattgatgaatgccgcatctctcctgatctttgtggccaaggcatctgc
gtcaatacccctggagactttgaatgtgaatgttttgaaggctacgaaagtggatttatg
atgatgaaaaactgcatggacatcgacgagtgtcaacgcaatcctcttctctgccgaggt
ggcacctgcatcaacacagagggaagttttcgctgcgattgtcctccaggccatcagata
tcaccaaatatctctgcatgtatagacattaatgaatgtgacctaagcacgagcctgtgc
cgaaatggacgttgtgtcaacctgattggaaagtatcagtgtgcttgcaaccctggatat
cagtccacacctgacaagttatattgtattgatattgatgagtgcagtataatgaatggt
ggctgtgagaacttctgcacaaactcggagggcagctatgaatgtagctgtaaacaaggc
tttgcactcatgccagaccacaggacgtgcacggatattgatgagtgcgaagacaatcct
aacatctgtgatggaggccagtgtacaaacatcccaggagaatacaggtgtctttgctac
gatggattcatggcatctgaagacatgaagacttgcatagatgttaatgagtgtgatctg
catccaaacatctgtctgagtggaacctgtgagaatacaaaaggctcatttatctgtcat
tgtgatatgggatattcaggcaagaaaggcacaactggttgcacagatatcaatgagtgt
gaaattggagcccataactgcgatagacatgccatatgtacaaacacagcaggaagtttc
aaatgcagctgcagccctggctggattggaaatggtatcaagtgcacagatctggatgag
tgctccaatggaacccacatgtgcagcccacatgctgactgcaagaatacaatgggctct
taccgctgcctgtgtaaagaaggttatactggggatggcttcacctgtacagaccttgat
gaatgctcagaaaacttgaatctctgtgaaaatgggcagtgcctcaatgcccctggagga
tatcgctgtgaatgtgatatgggatttttgccaagtccagatgggaaagcatgtgaagat
attgatgagtgctcccttcctaacatctgtgtctacggtacttgtcataacctccctgga
cttttccgatgtgagtgtgaagtgggctacgagttggacagaagtggtggtaactgcaca
gatgttaatgaatgtgcagatcccacaacctgcattagtggcacgtgtgtcaatactgct
ggtagttacacctgtgagtgccctcctgatttcgagctgaatcccacccgagttggatgc
gttgatacacgatctggcaactgttacttggacattaaaactcgtggagataacggtggc
accttctgcagcaatgagattggagtgggtgtttccaaggcctcctgttgctgctccctg
ggcaaagcttggggagttccctgtgaacagtgcccgcttgtgaacacaactgaatataaa
gttctttgccctggaggggaaggattccgaccaaaccctattacagttatattagaagat
attgatgaatgtcaggaactgcctggactttgccaaggaggaaaatgtattaacacattt
ggtagcttccagtgtcagtgtccatcaggctactatttgaatgaagagactcgagtgtgc
gatgatgtgaacgagtgtgatacacctggcatttgtggacctggcacatgttacaatacc
gttgggaactatacctgcatctgtcctcctgattacatgcaagtcaatgggggaaacaac
tgcatggatatgagaagaagtctgtgttacagaaattactatgctgacaatcaaacctgt
gatggtgagctgctctttaatatgaccaagaaaatgtgctgctgttcctacaacattgga
cgtgcatggaataagccttgtgaacagtgtcctatcccaagcaccgatgaattctccaca
ctctgtggaagtcaaaggcctggcttcttcattgacatttatacaggattaccagttgat
attgatgaatgcagagagattcctggagtgtgtgaaaatgggatctgtataaacatggtt
ggcagcttccgatgcgagtgtcctgtgggtttcttctacaatgacaagctactgatctgt
gaagatattgatgaatgccaaaatggaccagtgtgtcagcaaaatgctgaatgtgtcaac
acagccggtagctaccgttgtgactgtaagcctggctacagattcacatcaactggccgc
tgcactgatcggaatgaatgtcaagaaattcccaatatctgcagccatgggcagtgtatt
gacactgttggaagtttctactgcatttgtcacaatggattcaagaccaatgatgacaga
acaatgtgtatagatattaatgagtgtgagagagatgcctgcggcaatggaacctgcaga
aacaccattggctctttcaactgccgctgcaatttggggttcatcctctcacacaacaat
gactgcatagatgtggatgagtgtgcaagtggaaatggaatgctctgcaggaacggtcag
tgtgtgaacacgatcgggtccttccagtgtctttgcaatgatggctacgaggtggctctg
gatggaaggacttgtgttgatgtcaatgagtgtgctctggatcctggaaaatgctcacca
ggcacatgtcagaacttggatgggtcgttcagatgtatctgtcctcctggatatgtcctg
cagaatgacaaatgtgaagacattgatgagtgtgtggaacagccagaaatttgtgccctg
ggcacttgcagcaacactccaggcagtttcaaatgtctgtgtccagaaggctttgtgttg
tcttccacaggaaggcgatgccaagatctgagagtaagttactgctttaccaaatttgaa
gatggaaaatgttctgtgccgaagtctcgaaaccactccaaacaagagtgttgctgcgcc
ttaaagggacaggggtggggagatccctgtgaactctgcccagaggaagcagatgaggcg
ttcagacagatttgtccatttggaattggcatccttgttggacctggtgacgcaagactg
gatgtggatgagtgccttgatccagataactgtaaatttgggcagtgtatcaacacagat
gggtctttccgctgtgaatgtccgtatggttacatcctacaaggagctcaatgtgtggat
actgatgaatgtgctgttggaaacccgtgtggaaatggaacttgcaggaatgtggtggga
ggttttgaatgcacctgcgttgagggatttgagcctggaccaatgatgacctgtgaagat
gtcaacgagtgcattcagaaccctctgctctgcgctttccgctgcgtgaacacttttgga
tcctacgaatgcaagtgccccgcagggtacgttctgcgagaggaccggagaatgtgcaga
gatcagaatgagtgtgaagaaggaattcatgactgtgactcaaaacagatggagtgcaaa
aacctaattggcacctatatgtgtatctgtggaccaggttatcagcgcagaccagatgga
gaaggctgtatagatgagaatgaatgtcagaccaaacctgggatctgcgagaatggccgt
tgtgtaaacacagtgggaagttacagatgtgaatgcaacgagggattcactgtcagtgac
gctcagaacgaatgccttgacaacagggagggctactgcttcactgaagtcttacaaagt
atgtgtcaaattggatcaagcaacaggaactctgtcaccaagtctgaatgctgctgtgac
ggtggccgaggctgggggcaaaactgcgaggtctgccccttcccaggcactgtggccttc
aagaagctttgccctcatggccgaggatacatgtctaatggagcagacattgatgagtgc
aaggttattcatgatgtttgccgtaatggggaatgcatcaatgagaggggatcttatcgt
tgtcattgcaaccttggctatactacagatataactggcactctttgcatagatctgaat
gaatgtaatgagtccccaaaaccttgcaatttcatctgcaaaaacacagaggggagcttc
cagtgttcatgtccgaaagggtacatcctgcaagaagatgggagaagctgcaaagatctt
gatgaatgtgcaacaaagcagcacaactgccagttcctttgcgtcaacactattgggggc
ttcacttgtaaatgtcctcctggattcactcagcaccatacagcctgcattgataataat
gagtgtgctactgaaatcaatttatgtggggcgaagggcatttgccagaatacaccagga
agttttgtttgtgagtgtcaacgtggcttctcactcgatcagactgggcttagctgtgaa
gatgttgatgaatgtgatggaaaccaccggtgtcagcacggctgccaaaatataattgga
gggtacaggtgtagctgcccacaaggatatctccagcattaccaatggaaccaatgtgtt
gatgaaaatgaatgtctcagtgcacacatttgtggaggagcgtcttgccacaatactttg
ggaagctataaatgtatgtgccctaccggatttcagtatgaacagtttagtggaggttgc
caagatatcaatgaatgcggttctgcacaagccccatgcagttatggttgttcaaatact
gaaggtggctatgtctgtggatgtccacctggttacttcagaataggacaaggacattgt
gtttctggagtggggctaggcaaaggtcaaggacaagagctttcactcagtggagaagta
gatgacaactccctctctccagaagcttgttatgaatgtaaaatcaatggctatcccaaa
agaggaaggaagcgcagaagcactaatgaaactgcaaatgaagcggaggatcagcaagag
ctggagccgccaatcagtctcgccagttgggatgttgagaaagcagcagttttctccatc
aacatctcggatctcagtaacaaagatcgcatcctggaactgcttcctgccctcacaaca
ctgacaaaccataaccgatatttaattgactccggaaatgaagacggtttctttagaatc
aataagaaggacgggataagttaccttcatttcacaaagaagaagccagtgcctggaaac
tattcattacaaatcagtagtattccactctataaaaagaaggaacttcaccagcttgaa
gagaaacatgacaaagactacctcagtggtgagctgggagataacctgaaaatgaaaatt
cagatattgcttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
