Schleiferilactobacillus harbinensis: D1010_05920
Help
Entry
D1010_05920 CDS
T06855
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lhb
Schleiferilactobacillus harbinensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TMP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFR23014
UniProt:
A0A5P8M3Z4
LinkDB
All DBs
Position
1181698..1185129
Genome browser
AA seq
1143 aa
AA seq
DB search
MATIRSSIEIQDRFSSALSKLDSGLGNAGKGFDSLKGKLGGNIMGGLSNSINAVTSKTSS
LGSAFKSMLGANVIGNGISNTLGAVKNEIGGLIGDLGEASAVWKTFEGNMANMGKGPAEI
ASVKKQLQDYATETIYSASDMSSTYSQLAAVGTKNTTELVKGFGGLAAAAPEPAQAMKTL
SQQATQMAALPTVQWADFKLMLQQTPAGIAAVAKTMGKTTSQLVQNIQDGKVKTQDFFNA
ITKTGTSGAFTKMATEYKTVGQAMDGLREGVTNKLQGAFDRVSKVGINVISSLSDKIASI
NFDQIADNAFKAFATAKKWVTDFWSALVDTGAVKALSDAWGDVSVGLDFVKAAFNQIPDG
KKLNPIQMAAEGVGKAMKIAARAISAFGKWLQSLTPEQLVMIKDLAGKAVKAFIAWKVAK
KTVLPVVGIVAKLASKLSSLGKAGKGAEDAATKVGSLKQALAGGLNFGIKMAGIALVVAS
LALLAKSMQGIANAGPNAVTNMATFGGVVGGLAVVLGLMGKKLQASAGGIAVFAGAVGGM
ALAMTPLANTGEKGVAAMITFGVVVGALAGVFALLGGKLQASMAGIAVFGAAVSAMALAM
APLAATGMQGAIAMAAFGLVIAGLVIVFAVFGGALTAAIPAMLVFGVTMLMLGAAALLVG
AGMFLAGAGIALIAVSLPLVAQFGLSAAVGFLALAGSLLLLMPAALIAAVGLTMLFAASI
VAFAGLVMLMAGGLLAMTGLMMVMIGGMMAMVGLMLVFAMSMLAFTGLMMVMMGGMMAMT
GLMMVMVGGMMAMTGLIMVFAMAMMAFVGLVMLMAGGMMAMVGLMMVGVGAMVAMAGLML
VGVMALVAMAGIIALGAGAAVAAVGMALLGAATALVASKVRSIATNAAAAADSLETMVGA
VSVVKEGLSAIGDMASKAINSLVSAFQGGTGNAMAAGQALASAIGTGIQAGSASVMMASS
MLVMVAISRMRTGAAQAFSAGSMIGAGLAGGIMSQLGAVTAAADALVAQADKAVRAKADI
HSPSKLFGELGKFMSLGAAQGITDNLAPVAAAGSALSSAAYTGANSGGIGVGGSGSAGPS
YAPSSLGLAGNSSTTNNNQSDSRQVTVAPGAIVVNAATAQDGESIVRTIEDYLRGRADAG
LSS
NT seq
3432 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgacgattcgcagttctattgaaattcaagaccgcttctccagcgcactatccaag
ctggacagtgggctgggcaatgccggtaaaggatttgactcgctcaaaggcaagctcggc
gggaacatcatgggcggcctgagcaatagcattaacgcagtgaccagcaagacctcctcc
cttggtagtgcatttaagtcaatgctgggtgccaatgtgattggcaatggtatcagcaat
acacttggtgcagtcaagaacgagattggcggactgatcggcgacctcggtgaggcttct
gcggtgtggaaaacgttcgaaggtaacatggcaaacatgggtaaggggccggctgaaatt
gcatctgttaaaaagcagttgcaagactacgccacggagaccatttactcggcgtctgac
atgtcctccacgtattcccaactggctgctgtcgggacaaagaacaccactgagctggtt
aaagggttcggcggtctggccgcagcagctcctgagccagcccaggccatgaagacgttg
agccaacaagccacgcaaatggctgcgctaccgacagtccaatgggctgactttaagttg
atgctgcaacaaacccctgcgggtattgcggccgtggccaagacgatgggtaaaaccacg
tcacaactggttcaaaacatccaagatggcaaagttaagacgcaagacttcttcaatgcg
atcacgaaaactggtaccagcggcgcgttcacgaaaatggcgacggagtacaaaaccgtt
ggtcaagccatggacggactgcgggaaggggtgactaacaagctccaaggggcgtttgac
cgggtttccaaggtcgggattaacgtcatcagcagcttgtctgacaagattgcgtcgatt
aactttgaccagattgctgacaacgcatttaaggcgttcgccacagctaaaaagtgggtc
actgatttctggtctgcgttggttgataccggtgcagtcaaggctctctctgacgcctgg
ggtgatgtgtcggttggcttggatttcgtcaaggccgcgttcaatcagatacctgatggc
aagaaactcaacccgatccagatggctgctgaaggtgtcggcaaggcgatgaaaattgcg
gccagggctatcagcgcgtttggtaaatggctccaatccttgacgccagaacagctggtt
atgattaaggatctggctggcaaagcagttaaagcatttattgcctggaaagtcgctaag
aagactgtcctgcctgtagtcggcatcgtggccaagttggcgagtaagctgtcgtctctt
ggcaaagccggcaaaggtgcggaggatgccgccacaaaggtcgggagcctgaaacaagct
cttgccggcggtctcaattttggaatcaagatggcgggcattgcgttagttgtcgcgagt
ctcgctctgctggctaagtcgatgcaaggcattgccaatgctggtccgaacgctgtcact
aatatggcgacattcggcggtgttgttggtggactggctgttgtgctgggactcatgggc
aagaagctccaagcgagtgccggcggtattgctgtatttgctggcgcggttggcgggatg
gctttggctatgaccccgctggcgaacactggcgaaaagggcgttgctgcgatgatcacg
tttggcgtggtcgttggtgcgctggctggcgtattcgctctgctgggcggcaaacttcaa
gctagtatggccgggattgcagtgttcggcgcggcagtcagtgccatggcattagcgatg
gcaccgttggctgcgacgggtatgcaaggtgctatcgcgatggctgcatttggtttggtg
attgctggtctagtgattgtcttcgccgtgtttggtggtgcattaacggctgctattcca
gcgatgctggtattcggtgtcacgatgttgatgctgggcgcggcggcgttgctggtcggt
gctggcatgttcctcgctggtgctgggattgcactgattgcagtctcattgccactggtg
gctcaatttgggctgtcggctgcggtcgggttcctagcgttagctggctcactcttgttg
cttatgccggcagcgctcattgcagcagtcggtctgactatgctgttcgctgccagtatc
gtggcctttgcaggtctcgttatgctaatggctggcgggctgctcgctatgactggactc
atgatggtgatgatcggcgggatgatggcaatggtgggcttaatgctcgtctttgcaatg
tccatgctggctttcaccggattgatgatggtcatgatgggcggcatgatggccatgacg
ggcctgatgatggtcatggtcggtggcatgatggcgatgaccggattgatcatggtgttt
gccatggcgatgatggcttttgtcggactggtaatgctaatggccggcgggatgatggca
atggtcggtttaatgatggtcggcgtcggtgcaatggttgcgatggcgggcttaatgctc
gtcggggttatggctctcgtggcgatggccgggatcattgctctgggtgctggtgcagcg
gtcgctgctgttggcatggctctattaggagccgctacggcattggttgcgagtaaggtc
cggagcattgcaacgaatgcagccgctgcggccgacagcttagagacaatggtcggcgcg
gtctcagtcgttaaggaagggctcagcgccattggggatatggcttccaaagctatcaac
tcattggtgagtgccttccagggtggcactggaaatgcaatggctgctggtcaagcatta
gcgagtgcaatcggtactgggattcaagctggcagtgccagtgtgatgatggcttcctcc
atgctggtcatggtggctattagtcggatgcgcacgggtgctgctcaggcgttcagcgct
ggctctatgattggtgccggtctggctggcgggatcatgtcccaattgggtgctgtgacg
gctgcggccgatgcattggttgcacaagccgataaggcagtccgggccaaggcggatatt
cattcaccatcgaaactgttcggcgagttgggcaagttcatgtctctgggtgcggcccaa
ggcattacggacaatctggcgccagtggcagccgccgggagtgccctttctagcgctgca
tacacaggcgcgaatagtggtggtatcggtgtgggtggttccggtagtgctgggccctct
tacgcaccatcaagtttgggcctggccggtaatagcagtaccacgaataacaatcaatcg
gatagccggcaagtgacagtcgctccgggggccattgtggtcaatgcggcgacggcacaa
gacggtgaatcgattgtgcgcacgattgaagattatctgcgcggccgagctgatgccggt
ctgtcgagttag
DBGET
integrated database retrieval system
