Listeria ivanovii subsp. ivanovii WSLC 3010: JL52_05000
Help
Entry
JL52_05000 CDS
T03400
Name
(GenBank) multidrug transporter MatE
KO
K18908
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
lii
Listeria ivanovii subsp. ivanovii WSLC 3010
Module
lii_M00705
Multidrug resistance, efflux pump MepA
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lii00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lii02000
]
JL52_05000
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
lii01504
]
JL52_05000
Transporters [BR:
lii02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
JL52_05000
Antimicrobial resistance genes [BR:
lii01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MepA [MD:
M00705
]
JL52_05000
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIS64946
LinkDB
All DBs
Position
1035186..1036547
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MKQTDEFYLTKASIPKAIAHLSIPMMLGMSVGVIYNIINAFFIGMLHDTSMLTAVTLGLP
MFTILMAIGNMFGVGGGTYISRLLGKKENSQAKQVSAFVLYGSLALGIICASILGLMINP
VTHFLGADAASFLHTRNYTLALLICSPFIIANFALEQVVRAEGASKISMNGMFISTIVNL
IFDPLLILYFDFNVVGAAVSVGLASAFSLVYYAWYLEKKSAYLSIHFKWFRVTKGTISNV
FKIGVSELLLSLFLIVTTLILNYYSISYGEGVVAGFGVALRVVQLPEFICMGLYMGIIPL
LAYNYSAGNIARFEKAIRFTAISIGLIVLVISSLVFLFRFQVMHLFSESPSVIMLGVHIM
VAMLISSLFSGFTGLFTSTFQAIGKAIPATIMSVSQGIIFIPVIMLGQYYFGLVGVIWSL
TATEILTCIIGVTLFTIYNIKIASSTKAKDLAV
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaacagatgaattttatttaacaaaagcgagcattccaaaagcaatcgcacat
ttatcaatcccgatgatgcttgggatgtcggtaggtgttatctataatataattaatgcc
ttttttatcgggatgctgcacgacacatccatgctcacagcggtaacacttggacttccg
atgtttacgattttaatggcaatcggaaatatgtttggtgtaggagggggaacttatatt
tctcgtttacttggtaaaaaagaaaatagccaggcaaaacaggtttccgcatttgtactc
tatggtagtttggcgctggggataatttgtgcaagcatattaggattaatgattaatcca
gtaactcactttctgggagcagatgcagcaagctttttacacactagaaattatacatta
gcactattaatttgtagtccgtttattattgccaattttgcgttagagcaagtggttcgt
gcggaaggtgcctcgaaaatttcgatgaatggaatgtttattagcaccatcgttaatttg
atttttgatccgctgttgattttatattttgattttaatgtggttggagctgcagtttcg
gttggtttagctagtgccttctcgcttgtttattatgcttggtacttagagaaaaaaagt
gcttatttatccatccattttaaatggtttagggtcactaaagggacaattagtaatgtg
tttaaaattggtgtttctgaactgcttttatcattattcttaattgtaactaccttaatt
ttaaactattattcgattagttacggagaaggggttgtggctggttttggggtagcactt
cgcgtcgtacaattacctgaatttatttgtatggggctttatatggggataattccgcta
ttagcttacaattatagtgcaggaaatattgctaggtttgagaaagcgattcgttttaca
gcaataagtatcggtcttattgtcttggttatttcaagtttggtgttcttgttccgtttc
caagtgatgcatttatttagtgaaagcccaagtgtgatcatgctcggtgtacacattatg
gtcgcaatgttgatatcctctttatttagcggatttactggtctctttacgagtacgttt
caagcaattggaaaagcgattccggcgacgattatgtccgtttcgcaaggaattattttt
attccggtgattatgttaggtcagtattattttggcttagttggcgttatttggtcatta
actgcaacggaaatcctcacttgtattatcggtgtgacgcttttcacaatttacaatata
aaaatcgctagtagtacaaaagcaaaagacttagcagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
